植物多組學比較和進化研究平臺發布
近日,西北農林科技大學生命科學學院馬闖教授團隊發布了植物多組學數據跨物種比較和進化研究的在線分析平臺,相關成果發表在Molecular Biology and Evolution上。進化是植物性狀遺傳多樣性和適應生存環境的基礎,而基因變異是物種進化的源動力。隨著后基因組時代高通量技術的發展和應用,在DNA、RNA、蛋白等多個層面產生了大量的植物組學數據,為深入研究植物基因變異和物種進化機制提供了豐富的實驗資源。由于不同來源的多組學數據具有規模大、維度高、噪音大、異質性強等特點,給數據的有效整合和植物進化研究造成了極大的障礙。為了解決上述問題,研究團隊歷時五年成功研發了用于植物多組學數據跨物種比較和進化研究的IPOP平臺。該項研究涉及苔蘚、單子葉和雙子葉三大類植物物種,收錄了包括群體基因組、三維基因組、染色質可及性、轉錄組、DNA修飾、RNA修飾、組蛋白修飾等多維度的組學數據,采用統一標準化的流程對組學特征進行質量控制和整合分析,......閱讀全文
犬科動物多組學資源庫iDog-2.0建立
近日,國家生物信息中心研究員趙文明團隊與昆明動物研究所副研究員柳延虎團隊合作,發布犬科動物多組學資源庫iDog 2.0,提供了更加全面的多組學數據資源及更加豐富的在線分析工具,為全球犬類研究者提供更高質量的數據服務。家犬是自然界中種內遺傳多樣性最為豐富的物種之一,也是研究人類遺傳性疾病的重要動物模型
多組學數據庫“齊聚薈”-助力油菜“全能”競技
油菜產業集觀賞、蜜源、生態、經濟作物等多種功能于一身,是新興的“全能選手”。圍繞油菜,我國科學家近年來實現了從理論、技術、產品到轉化的鏈式創新,推動了我國油菜基礎研究與應用步入世界第一方陣。 然而,如何將基礎研究中長期積累的資源和多組學數據優勢轉化成育種優勢,仍是當前乃至未來很長一段時期油
大咖云集,共襄單細胞多組學及空間組學線上峰會
2009年,第一篇單細胞mRNA測序的文章的發表,標志著單細胞轉錄組測序的時代正式來臨。2013年,單細胞測序技術被《Nature Methods》評為年度技術。同年,《Science》將單細胞測序列為年度最值得關注的六大領域榜首,認為該技術將改變生物界和醫學界的許多領域。 目前,基于單細胞技
GCMS+多組學軟件包高效開展合成生物學代謝途徑分析
?合成生物學領域是備受關注的新興領域。通過設計和構建新的生物系統,或者改造現有的生物系統,合成生物技術能夠實現生物體的功能改造和新功能的創造。合成生物學在醫藥領域具有巨大的應用潛力。通過合成基因組和基因編輯技術,設計特定的藥物合成途徑,并改造微生物,使其能夠高效地生產藥物及中間體。這對于藥物開發和生
大咖云集,共襄單細胞多組學及空間組學線上峰會
2009年,第一篇單細胞mRNA測序的文章的發表,標志著單細胞轉錄組測序的時代正式來臨。2013年,單細胞測序技術被《Nature Methods》評為年度技術。同年,《Science》將單細胞測序列為年度最值得關注的六大領域榜首,認為該技術將改變生物界和醫學界的許多領域。 目前,基于單細胞技
中海油田多組學測序分析檢測采辦計劃公告
中海油田服務股份有限公司多組學測序分析檢測采辦計劃公告,為便于供應商及時了解項目采辦信息,現將(多組學測序分析檢測)的采辦計劃公開如下: 本次公開的采辦計劃是本項目采辦工作的初步安排,實際采購應以相關采購公告和采購文件為準,所有提供和反饋的信息只作為項目采辦參考。 本次公告有效期是(2023
帕金森病食蟹猴多組學研究獲重要進展
廣東省科學院動物研究所研究員饒軍華團隊與江南大學教授陳建歡團隊及其合作者,在國家自然科學基金、廣東省非人靈長類研究重點實驗室等項目的資助下,開展的帕金森病食蟹猴多組學研究取得重要進展。相關成果近日在線發表于《npj 生物膜和微生物組》(npj Biofilms and Microbiomes)。帕金
如何選擇技術方法來進行單細胞多組學研究
現階段,科學家們已經開始以單細胞分辨率組合多層信息。這些“多組學”技術可以更仔細地觀察細胞之間的可變性,更清楚地識別特定細胞及其功能。分析基因組DNA揭示了單細胞基因組,甲基化組織或染色質,而分析RNA和蛋白質則能分別產生轉錄組和蛋白質組數據。如何做出選擇有了這么多種的檢測方法可供選擇,研究人員還需
空間多組學質譜技術-讓微觀世界更“清晰”
2023年4月26-27日,由中國科學院高能物理研究所主辦,中國科學院高能物理研究所測試中心、中國科學院納米生物效應與安全性重點實驗室、中國科學院-香港大學金屬組學與健康和環境聯合實驗室承辦的“空間多組學質譜技術研討會”及“AFADESI空間代謝組學高級研修班“成功舉辦。 此次研討會及研修班邀
布魯克公司(BRKR)收購-Biocrates-以擴展多組學解決方案
布魯克公司(Bruker Corporation,股票代碼:BRKR)近日宣布收購總部位于奧地利因斯布魯克的代謝組學定量分析全球領導者——Biocrates Life Sciences AG。此次交易的財務條款未予披露。這一進展彰顯了兩家公司對多組學技術的共同熱忱。Biocrates長期致力于支持并
單鏈DNA測序技術助力獲取游離核酸多組學數據
游離DNA(cfDNA)是指游離在細胞外的DNA,存在于血漿、血清或尿液等體液中。cfDNA的片段組學特征可用于微創、實時、動態地監測生理和病理狀態,在腫瘤早篩與復發監測、母嬰健康、器官移植、感染疾病等領域具有廣闊的應用前景。高通量測序技術是表征cfDNA片段組學特征的主要手段,其中,雙鏈DNA文庫
空間多組學質譜技術-讓微觀世界更“清晰”
2023年4月26日,由中國科學院高能物理研究所主辦,中國科學院高能物理研究所測試中心、中國科學院納米生物效應與安全性重點實驗室、中國科學院-香港大學金屬組學與健康和環境聯合實驗室承辦的“空間多組學質譜技術研討會”成功舉辦。此次研討會邀請了國內外相關領域的專家學者和企業代表共同探討空間多組學質譜技術
植物學實驗——莖
【目的】 掌握雙子葉植物莖的次生結構, 了解周皮的發生和組成,掌握單了葉植物莖的結構。 【實驗內容】 (一)雙子葉植物莖的次生構造: 椴樹莖1,2,3年 木槿莖徒手切片(二)周皮的發生和組成 (三)單子葉植物莖的結構 小麥
Cell-Res重點論文:單細胞表觀多組學測序技術最新突破
2017年6月16日,北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
科學家發布生物進化與多組學綜合分析軟件
隨著二代測序成本的不斷降低以及三代、四代測序技術的快速發展,越來越多生物物種的全基因組序列被解讀出來,多組學數據呈現爆發性增長的態勢。然而,數據的高效挖掘和深度解析卻是生物學家面臨的又一難題。為了解決這一難題,中國科學院上海營養與健康研究所隸屬的中科院計算生物學重點實驗室和中科院北京基因組研究所
我國首個以牧草為主的多組學數據庫平臺建立
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/505990.shtm美洲狼尾草一類的小米(millets)是抗非生物脅迫能力強、營養豐富的禾本科優質牧草及粗糧。它可保證生活在極端氣候條件地區人們的糧食安全,并為其它作物提供與耐非生物脅迫有關的遺傳資源。
Cell-Res重點論文:單細胞表觀多組學測序技術最新突破
2017年6月16日,北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
多組學技術整合新進展,聚焦慢病診療技術突破
?——功能代謝組學在慢病中的轉化應用國際研討會為深化功能代謝組學與脂質組學技術研究前沿的學術對話,推進多組學技術整合在慢性疾病領域的創新轉化,中國科學院大連化學物理研究所于2025年4月25日-27日舉辦“功能代謝組學在慢病中的轉化應用國際研討會”。會議以“功能代謝組學的技術革新與慢病診療轉化”為主
總裁視角:見所未見-布魯克推動多組學和質譜成像革新
——布魯克生命科學質譜總裁 Rohan Thakur博士專訪 多組學是生命科學、轉化醫學等領域的前沿學科,布魯克timsTOF自發布以來持續創新,開創了4D-組學、空間定位組學、單細胞蛋白組學等研究領域,獲得全球用戶的廣泛好評,取得了令人矚目的研究成果。在第70屆ASMS大會上,布魯克隆重發布了t
碧迪醫療與NanoString戰略合作,推動單細胞空間多組學
2022年12月1日,上海——今日,全球領先的醫療技術公司碧迪醫療與全球空間生物學的先鋒NanoString聯合宣布,將在單細胞空間多組學領域開啟戰略合作,結合雙方優勢,為國內基礎科研、臨床研究和生物醫藥研發提供一站式的技術工具和服務。此次合作將把國際領先的單細胞多組學和空間組學技術相結合,著眼于面
timsTOF-Pro和PASEF一雙慧眼-探究更多組學奧秘
離子淌度技術發展幾十年,布魯克這個致力于挑戰極限的公司,2016年一出手就推出業界最高淌度分辨的timsTOF質譜,在完成硬件的挑戰后,布魯克同德國馬普研究所的Matthias Mann合作PASEF技術,于去年HUPO推出了timsTOF Pro,在蛋白質組學領域刷新了“鳥槍”法鑒定的速度、靈
AB-SCIEX攜手Illumina創建世界首個多組學云計算平臺
摘要 : 2014年10月13日,中國北京 ?-生命科學分析儀器技術發展的全球領導者AB SCIEX和Illumina(納斯達克:ILMN)今天聯合宣布雙方將針對OneOmics?項目開展獨家合作,將基于SWATH?的新一代蛋白質組學(NGP)和新一代測序(NGS)工具在云計算環
大咖面對面丨金屬組學為空間多組學注入元素成像新維度
——專訪中國科學院高能物理研究所王萌研究員導語 在生物醫學研究領域,“空間組學”如同一把鑰匙,正從新的視角揭示生命的奧秘。從基因組、蛋白質組到代謝組,科學家們不斷拓展多組學的邊界。而中國科學院高能物理研究所王萌研究員及團隊,將“空間金屬組”作為空間組學的新維度,憑借高靈敏的質譜成像技術,為癌癥診療
植物表型成像系統植物表型和植物表型組學的概念
植物表型分析是理解植物基因功能及環境效應的關鍵環節,隨著植物功能基因組學和作物分子育種研究的深入,傳統的表型觀測已經成為制約其發展的主要瓶頸,而高通量的植物表型組分析技術和植物表型組學研究是解決這一困境的有效途徑。雖然植物表型組分析正在成為國內外研究的熱點,相關概念仍然較為模糊,阻礙了這一新興學
植物系統學實驗:苔蘚植物門(Bryophyta)
一、目的要求通過對代表種類的觀察,掌握蘚綱植物的形態、構造、生活史,了解不同的生活型。 二、實驗材料葫蘆蘚屬、金發蘚屬等十幾個屬的配子體,生活的原絲體,孢蒴縱切、孢子體、精子器縱切. 三、實驗內容和方法1.取葫蘆蘚(Funaria)配子體和孢子體,觀察下列內容 : (1) 配子體形態:矮小,高約1—
植物學技術:植物原生質體的制備
原生質體是指植物細胞去掉細胞壁的裸露部分。它在培養條件下,①具有再生細胞壁,進行連續的細胞分裂并再生成完整植株的能力;②具有攝取外源大分子、細胞器,以及細菌,病毒的能力,因此是進行遺傳操作,基因轉移的好材料;③通過同種和異種植物的原生質體融合,可產生異核體,實現體細胞雜交,培育出新品種。?實驗原理去
植物系統學實驗:苔蘚植物門(Bryophyta)
一、目的要求 通過對代表種類的觀察,掌握蘚綱植物 ?的形態、構造、生活史,了解不同的生活型。 二、實驗材料 葫蘆蘚屬、金發蘚屬等十幾個屬的配子體,生活的原絲體,孢蒴縱切、孢子體、精子器縱切. 三、實驗內容和方法 1.取葫蘆蘚(Funaria)配子體和孢子體,觀察下列內容
植物細胞學的概念
植物細胞學(Plant Cell Biology,或傳統上的plant cytology),是研究植物細胞結構的科學,是廣義的形態學的一部分,也是細胞學的一個分支。植物細胞學以植物細胞作為研究對象,利用生物學、化學和物理學等研究方法來研究細胞層級的生命活動。
植物學實驗——莖(二)
【目的】掌握雙子葉植物 ?莖的次生結構,了解周皮的發生和組成,掌握單了葉植物莖的結構。 【實驗內容】(一)雙子葉植物莖的次生構造:椴樹莖1,2,3年木槿莖徒手切片(二)周皮的發生和組成天竺葵莖接骨木的皮孔(三)單子葉植物莖的結構小麥玉米莖的次生結構維管形成層的產生:束中形成層:原形成層轉變而成 束