科學家揭示蛋白質折疊構象過程
據發表在20日《美國國家科學院院刊》上的一項最新研究,美國科學家通過將數據轉換為聲音,揭示了氫鍵是如何在極短時間內促成蛋白質構象,并將氨基酸轉化為功能性折疊蛋白質的過程,為研究蛋白質從未折疊狀態到折疊狀態時發生的氫鍵事件序列提供了獨特視角。為更好了解蛋白質折疊是如何進行的,科學家必須首先確定一串氨基酸如何在細胞的水環境中轉變為最終形式。這一變化過程其實發生得非常快,大約在70納秒到2微秒之間。氫鍵的本質是半徑小又帶正電的氫原子靠得很近時所產生的吸引力。這種相對較弱的吸引力能將蛋白質中不同氨基酸上的原子排列在一起。折疊蛋白質將在其內部形成氫鍵,也與其周圍的水分子形成一系列氫鍵。在此過程中,蛋白質會不斷嘗試不同的構象,這些構象都是蛋白質在形成最終3D結構過程中的“中間形態”。在達成最終構象途中,蛋白質有時會進入“死胡同”,然后它會倒退,直到偶然發現另一條路。為此,研究人員想到將數據聲音化。這是一種將分子數據轉換為聲音的方法,這樣他們......閱讀全文
科學家揭示蛋白質折疊構象過程
據發表在20日《美國國家科學院院刊》上的一項最新研究,美國科學家通過將數據轉換為聲音,揭示了氫鍵是如何在極短時間內促成蛋白質構象,并將氨基酸轉化為功能性折疊蛋白質的過程,為研究蛋白質從未折疊狀態到折疊狀態時發生的氫鍵事件序列提供了獨特視角。為更好了解蛋白質折疊是如何進行的,科學家必須首先確定一串氨基
科學家揭示蛋白質折疊構象過程
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/5/523020.shtm據發表在20日《美國國家科學院院刊》上的一項最新研究,美國科學家通過將數據轉換為聲音,揭示了氫鍵是如何在極短時間內促成蛋白質構象,并將氨基酸轉化為功能性折疊蛋白質的過程,為研究蛋白質從
科學家揭示蛋白質折疊構象過程
據發表在20日《美國國家科學院院刊》上的一項最新研究,美國科學家通過將數據轉換為聲音,揭示了氫鍵是如何在極短時間內促成蛋白質構象,并將氨基酸轉化為功能性折疊蛋白質的過程,為研究蛋白質從未折疊狀態到折疊狀態時發生的氫鍵事件序列提供了獨特視角。 為更好了解蛋白質折疊是如何進行的,科學家必須首先確定
利用小分子極性光切割測定G四重折疊結構的構象
動物所利用小分子極性光切割footprinting測定G-四重折疊結構的構象 基因組中可以形成G-四重折疊結構的序列分布非常廣泛,這些結構對諸如癌基因表達的影響使得其成為藥物治療的可能靶點。研究生理條件下基因組雙鏈DNA中的G-四重折疊結構的結構對尋找和設計靶向藥物具有非常重要的指導意
構象異構體的分子鏈構象
晶體中的高分子鏈構象晶體中的分子鏈構象有螺旋形構象、平面鋸齒形構象等。1、兩個原子或基團之間距離小于范德華半徑之和時,將產生排斥作用。2、分子鏈在晶體中的構象,取決于分子鏈上所帶基團的相互排斥或吸引作用的情況。3、有規立構高分子鏈在形成晶體時,在條件許可下總是盡量形成時能最低的構象形式。4、基本結構
什么是構象?
構象(conformation),有機化學的一個重要概念。最簡單的構象分析建立在乙烷分子上。最重要的構象分析則是建立在環己烷上的構象分析。
構象的概念
構象(conformation),有機化學的一個重要概念。最簡單的構象分析建立在乙烷分子上。最重要的構象分析則是建立在環己烷上的構象分析。
鏈折疊性質
鏈折疊現象對結晶聚合物的行為非常重要,因而必須仔細考察鏈折疊結晶的情況。首先,一般認為,在許多聚合物中,鏈折疊沒有多大的困難。對聚合物分予模型的麥察表明,大多數聚合物分子都會折疊起來,比較容易形成一種很致密的足以嵌砌到晶體表面的折疊,但是,化學結構比較復雜的聚合物,如主鏈上有龐大側基或環以及分子鏈為
β折疊的定義
在β折疊中,兩條以上氨基酸鏈(肽鏈),或同一條肽鏈之間的不同部分形成平行或反平行排列,成為“股”。
β折疊的結構
肽平面之間呈手風琴狀折疊,股與股之間會通過氫鍵固定,但氫鍵主要在股間而不是股內。氨基酸殘基的R側鏈分布在片層的上下。β折疊層并不是平的,因為側鏈的存在使得它看上去像手風琴一樣波紋起伏。(英語pleated)這樣每一股會更緊密排列,氫鍵更容易建立。氫鍵的距離為7埃。在蛋白質結構中β折疊通常會用箭頭表示
β折疊的結構
肽平面之間呈手風琴狀折疊,股與股之間會通過氫鍵固定,但氫鍵主要在股間而不是股內。氨基酸殘基的R側鏈分布在片層的上下。β折疊層并不是平的,因為側鏈的存在使得它看上去像手風琴一樣波紋起伏。這樣每一股會更緊密排列,氫鍵更容易建立。氫鍵的距離為7埃。在蛋白質結構中β折疊通常會用箭頭表示。肽鏈的氮端在同側為順
β折疊的作用
能形成β折疊的氨基酸殘基一般不大,而且不帶同種電荷,這樣有利于多肽鏈的伸展,如甘氨酸、丙氨酸在β折疊中出現的幾率最高。免疫球蛋白有大量的β折疊層。另一種常見的蛋白質模序是α螺旋和三種不同的β轉角。不屬于一個模序的蛋白質一級結構部分被稱之為不規則螺旋。這些部分對蛋白質的空間構象非常重要。
細胞化學詞匯RNA構象
中文名稱:RNA構象英文名稱:RNA conformation定 義:RNA分子的空間結構,構象改變并不導致共價鍵的斷裂和生成。應用學科:生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)
RNA構象的結構特點
中文名稱RNA構象英文名稱RNA conformation定 義RNA分子的空間結構,構象改變并不導致共價鍵的斷裂和生成。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)
β轉角的特定構象介紹
β-轉角的特定構象在一定程度上取決與他的組成氨基酸,某些氨基酸如脯氨酸和甘氨酸經常存在其中,由于甘氨酸缺少側鏈(只有一個H),在β-轉角中能很好的調整其他殘基的空間阻礙,因此是立體化學上最合適的氨基酸;而脯氨酸具有環狀結構和固定的角,因此在一定程度上迫使β-轉角形成,促使多肽自身回折且這些回折有助于
什么是船型構象?
船型構象(boatconformation)是環已烷能保持正常鍵角的一個構象。從船型的Newman式中可看出,兩對碳原子2,3和5,6的構象是重疊式的,這四個碳原子幾乎在同一平面內,碳原子1,4則處于該平面的同一側,其氫原子間的距離只有0.183nm,小于范氏半徑之和(0.240nm)。因此,船型構
β-轉角的特定構象特點
β-轉角的特定構象在一定程度上取決與他的組成氨基酸,某些氨基酸如脯氨酸和甘氨酸經常存在其中,由于甘氨酸缺少側鏈(只有一個H),在β-轉角中能很好的調整其他殘基的空間阻礙,因此是立體化學上最合適的氨基酸;而脯氨酸具有環狀結構和固定的角,因此在一定程度上迫使β-轉角形成,促使多肽自身回折且這些回折有助于
椅型構象的概念
在環已烷中,六個碳原子不在同一個平面內,碳碳鍵之間的夾角為109.5°,沒有環張力,因此環很穩定。環已烷由于環的翻轉可以形成多種構象,其中,椅型和船型這兩種典型的構象最為重要。船型構象能量高,不能穩定存在,而椅型構象能穩定存在。
什么是椅型構象?
椅型構象(chairconformation)是環已烷最穩定的構象,其中2,3,5,6四個碳原子在同平面內C( 1)和C(4)分別位于該平面的上下方,C(1)像椅背,C(4)像椅腳。沿著碳碳鍵依次看過去,相鄰兩個碳原子上的鍵都處于鄰交叉式的位置,所有的鍵角都接近正常的四面體角,非鍵原子間的距離(0.
順向構象的定義
中文名稱順向構象英文名稱cisoid conformation定 義有機分子中單鍵為順式的構象。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),總論(二級學科)
鏈折疊的結構
鏈折疊,是指凱勒(Keller)提出的折疊鏈模型。即分子鏈頃向于聚集在一起形成鏈束,分子鏈規整排列的鏈束細而長,表面能很大,不穩定。會自發的折疊成帶狀結構。也有一種說法是鏈折疊是直接以單根分子鏈(而不是鏈束)進行的。單晶的電子衍射圖研究認為分子鏈的方向是垂直于晶片表面,鏈在晶片厚度范圍內來回折疊。
β折疊的結構特點
在β折疊中,兩條以上氨基酸鏈(肽鏈),或同一條肽鏈之間的不同部分形成平行或反平行排列,成為“股”。
折疊基因檢測作用
通過基因檢測,可向人們提供個性化健康指導服務、個性化用藥指導服務和個性化體檢指導服務。就可以在疾病發生之前的幾年、甚至幾十年進行準確的預防,而不是盲目的保健;人們可以通過調整膳食營養、改變生活方式、增加體檢頻度、接受早期診治等多種方法,有效地規避疾病發生的環境因素。基因檢測不僅能提前告訴我們有多高的
β折疊的主要作用
能形成β折疊的氨基酸殘基一般不大,而且不帶同種電荷,這樣有利于多肽鏈的伸展,如甘氨酸、丙氨酸在β折疊中出現的幾率最高。免疫球蛋白有大量的β折疊層。另一種常見的蛋白質模序是α螺旋和三種不同的β轉角。不屬于一個模序的蛋白質一級結構部分被稱之為不規則螺旋。這些部分對蛋白質的空間構象非常重要。
折疊酶的結構
LIFs的結構由三部分組成N-末端跨膜疏水結構域,中間一段富含脯氨酸和丙氨酸的高度可變的中間鉸鏈區與C-末端催化結構域。LIFs通過N-末端的疏水跨膜結構域錨定在內膜上,使Q-末端的活性結構域游離于周質中。N-末端的疏水跨膜結構域對其折疊活性沒有影響,主要是負責將LIFs錨定在內膜上,防止其與脂肪酶
“阿爾法折疊3”來了
科技日報北京5月8日電?(記者張夢然)《自然》8日報道了結構生物學最新進展——阿爾法折疊3的問世。它能以高準確率預測蛋白質與其他生物分子相互作用的結構。這種用計算機解析蛋白質與其他分子復雜相互作用的能力,將拓展人們對生物過程的理解,并有望推動藥物研發。阿爾法折疊于2020年問世,它和迭代版阿爾法折疊
折疊酶的作用
目前研究最為廣泛的是脂肪酶特異折疊酶(lipase specific foldase,LIFs),此類酶多存在于革蘭氏陰性菌中輔助相應的脂肪酶進行二級結構的折疊,通過降低折疊過程中的能障與構象改變為靶蛋白的正確折疊提供必要的空間立體信息而幫助其活性構象的形成。研究證明,脂肪酶在無LIFs存在下可進行
重折疊的定義
中文名稱重折疊英文名稱refolding定 義解折疊或錯折疊的結構,重新變成有活性的立體結構的過程。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),總論(二級學科)
線性烷烴構象的結構特點
線性烷烴構象(linear alkane conformation),擁有交錯式(staggered)、重疊式(eclipsed)與間扭式(gauche)。乙烷是最簡單的含有C-C單鍵的化合物,如果乙烷分子中的一個碳原子不動,另一個碳原子圍繞C-C鍵旋轉時,則一個碳原子上的三個氫原子相對另一個碳原子
RNA構象的基本信息
中文名稱RNA構象英文名稱RNA conformation定 義RNA分子的空間結構,構象改變并不導致共價鍵的斷裂和生成。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)