深圳先進院實現醫學數據在生物DNA分子中存儲
5月29日，中國科學院深圳先進技術研究院研究員姜青山、高級工程師黃小羅、中國農業科學院深圳農業基因組研究所戴俊彪研究員等聯合在Small Methods發表最新研究成果。研究人員設計了一種名為"EDS"的DNA存儲方法，通過改進編碼模型、引入冗余核苷酸和設計索引技術，實現了醫學磁共振成像（MRI）數據的可靠歸檔和檢索。醫學MRI數據是診斷、治療規劃和疾病監測等多種領域的重要工具。利用DNA存儲技術保存醫學MRI數據將有助于人類健康管理。通過DNA存儲，可以確保這些重要數據在數千年內安全保存并精確恢復，從而保證了這些重要數據的長期存儲，為研究疾病進展和治療效果提供了重要數據支撐。該工作中，研究團隊通過三個關鍵組成部分實現了醫學MRI數據的歸檔。首先，研究團隊設計了一種新穎的分塊策略，解決了旋轉編碼導致的數據丟失問題。其次，提出了一種基于規則的四進制轉碼方法，滿足生化約束條件并確保可靠的數據映射。最后，設計了一種......閱讀全文
Science：宏基因組研究挑戰DNA編碼規則
人們一直認為DNA編碼的指令是所有生命通用的，例外情況極少。但本期Science雜志上的一項新研究顯示，自然界中的生物又一次打破了既定的規則。 美國能源部聯合基因組研究所的Edward Rubin領導研究團隊，獲得來自1776種環境（包括17個人體區域）的微生物宏基因組數據，以便在其中尋找重編
“垃圾DNA”或是編碼DNA的“衛士”
“垃圾DNA”的概念是在上世紀70年代提出來的，用來形容那些基因組中不是編碼蛋白質的DNA序列，而在學術上被稱為非編碼DNA序列。 由于當時的科學家普遍認為有生物學意義的蛋白質才是決定生物性狀的關鍵，而且也沒有一種好的理論和技術手段來解釋這些“垃圾”存在的原因，于是“垃圾DNA”這一觀念便形
“垃圾DNA”或是編碼DNA的“保鏢”
"垃圾DNA"的概念源自上世紀70年代，用來形容基因組中不是編碼蛋白質的DNA序列，在學術上被稱為非編碼DNA序列。 非編碼DNA"開關說"究竟是個啥？ 科學家們發現，人類基因組中包含多達400萬個基因開關和功能調節因子，它們的載體便是"垃圾DNA"。這強烈地沖擊了"DNA序列=生物性
基因組所開發出編碼蛋白質DNA序列并行比對工具ParaAT
中國科學院北京基因組研究所基因組科學與信息重點實驗室“百人計劃”章張研究員，帶領其團隊成功開發出“編碼蛋白質DNA序列并行比對工具—ParaAT（Parallel Alignment and back-Translation）”。該研究成果發表在Biochemical and Biop
基因檢測DNA分析
DNA分析主要用于識別單個基因異常引發的遺傳性疾病，如亨廷頓病等。DNA分析的細胞來自血液或胎兒細胞。
自閉癥或因父親基因突變－非編碼區DNA結構變體潛藏禍端
《科學》雜志官網近日消息稱，一項探索非編碼DNA的新研究發現，調節基因活性區域的改變也可能導致自閉癥，令人驚訝的是，這些變化傾向于從非自閉癥的父親那里繼承而來。 過去十年中，研究人員已經發現了數百種可能影響大腦發育，從而增加自閉癥風險的基因變異，但這些變異主要來自直接編碼蛋白質的DNA中。此外
DNA編碼分子庫為藥物發明提供便利
隨著DNA編碼分子庫持續擴大以及新的篩選方法不斷開拓未知生物學領域，DNA編碼分子庫將成為制藥行業研發新藥的支柱之一。 在美國馬薩諸塞州沃爾瑟姆市一座混凝土建筑的二樓，一臺普通實驗室冰箱的塑料盒子里放著一根透明試管，里面則含有天文數字尺度的混合物。這個分子庫里冷凍的是由總部位于英國倫敦的制藥公
DNA編碼化學庫新技術助推藥物研發
科技日報訊?（記者張夢然）近年來，科研人員雖然在分子療法開發方面取得了重要進展，但新發現的活性物質數量依然不足。現在，美國哈佛大學和瑞士蘇黎世聯邦理工學院共同開發的DNA編碼化學庫（DEL）技術提供了新的解決方案。該技術能在幾周內自動化合成并測試數十億種化合物，還能用于生產更大的藥物分子，這類藥物將
調整基因編碼蛋白的檢測
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DNA發現之前的基因
三一學院地處都柏林的中心，它那灰色的三層新古典主義建筑環繞在草坪和運動場周圍。校園的最東頭是另一棟灰色建筑，落成于1905年，則是另一種截然不同的風格。那是菲爾茲杰拉德大樓，或者依據其門楣上刻的字叫物理實驗樓。這棟樓的最頂層是一個演講廳，1943年2月第一個周五的傍晚，約有400余人聚集在這里，
DNA（基因）檢測－Southern－Blot
DNA（基因）檢測－Southern BlotDNA吸印轉移1．室溫下將電泳后的瓊脂糖凝膠浸入500ml溶液A中，搖動30分鐘后換500ml新鮮溶液A再搖30分鐘，使DNA雙鏈堿變性。溶液A：5M NaCl?????300.0ml10M NaOH????50.0mlH2O?????????650.0
Nature：復雜生命難道不需要非編碼DNA？
非編碼DNA僅占據絲葉貍藻基因組3%的組成成分，這是否證明了對于復雜生命來說，非編碼DNA并不需要呢? 自從科學家們首次發現超過95%的人類基因組是由非編碼元件組成以來(非編碼元件是指不會編碼任何特殊蛋白質的 DNA 片段)，他們就一直致力于了解這種所謂的“垃圾” DNA 的作用。在過
利用DNA編碼化合物庫實現新藥研發
2016年12月9日Robert A. 等研究者發表在《Nature Reviews Drug Discovery》上的一篇標題為《DNA-encoded chemistry： enabling the deeper sampling of chemical space》的論文引起了世界范圍新藥
CAST基因編碼功能及結構描述
該基因編碼的蛋白質是一種內源性鈣蛋白酶（鈣依賴半胱氨酸蛋白酶）抑制劑它由一個N-末端結構域L和四個重復的鈣蛋白酶抑制結構域（結構域1-4）組成，參與淀粉樣前體蛋白的蛋白水解。calpain/calpastatin系統參與許多膜融合事件，如神經囊泡胞吐、血小板和紅細胞聚集編碼的蛋白質也被認為會影響編碼
GAPDH基因編碼功能及結構描述
這個基因編碼甘油醛-3-磷酸脫氫酶蛋白家族的一個成員。編碼的蛋白質已被鑒定為一個月光蛋白的基礎上，它能執行機械上不同的功能該基因產物在糖代謝過程中起著重要的產能作用，在無機磷和煙酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD）的存在下，可逆的氧化磷酸化作用。編碼的蛋白質在細胞核中還具有尿嘧啶DNA糖苷酶活性此外，這種蛋
CASR基因編碼功能及結構描述
這個基因編碼的蛋白質是一種質膜G蛋白偶聯受體，能感覺到循環鈣濃度的微小變化。編碼的蛋白質將這些信息與細胞內的信號傳導途徑結合起來，這些信號傳導途徑可以調節甲狀旁腺激素的分泌或腎離子的處理，因此這種蛋白質在維持礦物離子的穩態中起著至關重要的作用該基因突變是家族性低鈣血癥、新生兒重度甲狀旁腺功能亢進和常
POLE正相關基因編碼功能描述
該基因編碼DNA聚合酶epsilon的催化亞單位。這種酶參與DNA修復和染色體DNA復制。該基因突變與結直腸癌12和面部畸形、免疫缺陷、利維多和身材矮小有關。This gene encodes the catalytic subunit of DNA polymerase epsilon. The
CROT基因編碼功能及結構描述
這個基因編碼肉堿/膽堿乙酰轉移酶家族的一個成員。編碼的蛋白質將4，8-二甲基壬酰基-CoA轉化為相應的肉堿酯這種酯交換反應發生在過氧化物酶體中，是將長鏈酰基-CoA分子從過氧化物酶體轉運到細胞質和線粒體所必需的。因此，蛋白質在脂質代謝和脂肪酸β氧化中起作用。已經描述了選擇性剪接的轉錄變體。[由ref
FANCI基因編碼功能及結構描述
fanconi貧血互補組（fanc）目前包括fanca、fancb、fancc、fancd1（也稱為brca2）、fancd2、fance、fancf、fancg、fanci、fancj（也稱為brip1）、fancl、fancm和fancn（也稱為palb2）。先前定義的組fanch與fanca相
ENG基因編碼功能及結構描述
該基因編碼一種同二聚體跨膜蛋白，是血管內皮的主要糖蛋白。該蛋白是轉化生長因子β受體復合物的一個組成部分，它與beta1和beta3肽具有高親和力。該基因突變導致遺傳性出血性毛細血管擴張癥，也稱為Osler-Rendu-Weber綜合征1，常染色體顯性遺傳性多系統血管發育不良這個基因也可能與子癇前期和
ITGAL基因編碼功能及結構描述
ITGAL編碼整合素αL鏈整合素是由α鏈和β鏈組成的異二聚體膜蛋白含有α整合素的I-結構域與β2鏈（ITGB2）結合形成整合素淋巴細胞功能相關抗原-1（LFA-1），在所有白細胞上表達LFA-1通過與其配體ICAMs 1-3（細胞間粘附分子1-3）的相互作用，在白細胞間粘附中發揮中心作用，并在淋巴細
FASLG基因編碼功能及結構描述
這個基因是腫瘤壞死因子超家族的成員編碼的跨膜蛋白的主要功能是通過與fas結合誘導細胞凋亡。Fas/FasLG信號通路是免疫系統調節的關鍵，包括T細胞的活化誘導的細胞死亡（AICD）和細胞毒性T淋巴細胞誘導的細胞死亡。它也與一些癌癥的進展有關。該基因缺陷可能與系統性紅斑狼瘡（sle）有關。另外，已經描
常見癌基因編碼蛋白的檢測
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FANCL基因編碼功能及結構描述
這個基因編碼泛素連接酶，它是范科尼貧血互補組（FANC）的成員。這一組的成員通過組裝成一個共同的核蛋白復合物而不是通過序列相似性來聯系。該基因編碼互補群L的蛋白，該蛋白介導FANCD2和FANCI的單泛素化。范科尼貧血是一種遺傳異質性隱性疾病，其特征是細胞遺傳不穩定、對dna交聯劑過敏、染色體斷裂增
FUS基因編碼功能及結構描述
該基因編碼異質核核糖核蛋白（hnrnp）復合物的多功能蛋白成分。hnRNP復合物參與mRNA的前剪接和全加工mRNA向細胞質的輸出該蛋白屬于FET家族的RNA結合蛋白，參與了包括基因表達調控、基因組完整性維護和mRNA/microRNA處理在內的細胞過程選擇性剪接導致多個轉錄變體該基因缺陷導致肌萎縮
DBT基因編碼功能及結構描述
支鏈α-酮酸脫氫酶復合物（BCKD）是一種線粒體內酶復合物，參與支鏈氨基酸異亮氨酸、亮氨酸和纈氨酸的分解bckd復合物被認為是由24個轉酰酶（e2）亞基和相關的脫羧酶（e1）、脫氫酶（e3）和調節亞基組成。這個基因編碼轉酰酶（E2）亞單位該基因突變導致楓糖尿病，2型。已經描述了選擇性剪接的轉錄變體，
ATM基因編碼的概念和特點
ATM基因編碼的蛋白屬于PI3/PI4激酶家族，這種蛋白是一種重要的細胞周期檢查點激酶，通過磷酸化調控下游一系列重要蛋白，包括抑癌蛋白p53和BRCA1、檢查點激酶CHK2、檢查點蛋白RAD17和RAD9以及DNA修復蛋白NBS1。ATM和與其密切相關的蛋白ATR被認為是在細胞周期調控以及DNA損傷
KDR基因編碼功能及結構描述
KDR所編碼的蛋白也命名為血管內皮生長因子受體-2（Vascular endothelial growth factor receptor-2，VEGFR-2)，是血管生長因子重要信號轉導的重要受體，迄今已發現的VEGF信號轉導的主要受體包括fms樣酪氨酸激酶VEGFR-1，即Flt- 1，胎兒肝激