創新計算框架揭示癌癥“進化策略”
西班牙巴塞羅那生物醫學研究所團隊開發出一種名為DiffInvex的創新計算框架,其可追蹤健康細胞轉變為腫瘤,以及腫瘤在化療過程中的基因進化壓力。DiffInvex被應用于超過11000個樣本,涵蓋了大約30種不同組織類型的人類癌癥和健康組織的基因組數據,成功識別出導致腫瘤對治療“負隅頑抗”的路徑,并指出了哪些基因可能引發耐藥性。該研究結果發表于最新一期《自然·通訊》雜志。 正如物種在世代間適應環境一樣,人體內的細胞在其生命周期中也會積累DNA變化。雖然大多數變化是無害的,但某些“驅動”突變會賦予細胞生長優勢,可能導致癌癥的發生。而化療本身作為一種選擇壓力,促使細胞進一步發生基因改變,最終可能導致腫瘤復發。 盡管化療仍然是當前癌癥治療的核心手段之一,但許多腫瘤最終都會產生耐藥性。由于化療會引起新的DNA損傷,并且患者往往需要接受多種藥物聯合治療,因此要明確究竟是什么原因讓癌細胞在化療中存活下來。這一直是非常巨大的挑戰。 ......閱讀全文
創新計算框架揭示癌癥“進化策略”
西班牙巴塞羅那生物醫學研究所團隊開發出一種名為DiffInvex的創新計算框架,其可追蹤健康細胞轉變為腫瘤,以及腫瘤在化療過程中的基因進化壓力。DiffInvex被應用于超過11000個樣本,涵蓋了大約30種不同組織類型的人類癌癥和健康組織的基因組數據,成功識別出導致腫瘤對治療“負隅頑抗”的路徑
無人駕駛測試驗證計算框架系統問世
近日,西安交通大學與清華大學、中科院自動化所等單位合作,在《科學—機器人學》上發表論文,報道了該聯合研究團隊歷經10年實現的一種無人駕駛測試與驗證的平行計算框架及其系統。 實現無人駕駛是人工智能領域面臨的重大挑戰之一,應對這一挑戰需要發展一種新的圖靈測試方法,以測試和驗證無人車對復雜交通場景的
量子計算機與超級計算機“協同學習”框架發布
記者13日從安徽省量子計算工程研究中心獲悉,支持量子計算機和超級計算機“協同學習”的量子機器學習框架——VQNet2.0發布,該框架可與量子計算操作系統深度結合,支持同時調度量子和經典計算資源進行機器學習的訓練與預測。 本次發布的量子機器學習框架由合肥本源量子計算科技有限責任公司開發。據安
創新計算框架在蛋白質設計方面獲突破
在今年諾貝爾化學獎表彰計算蛋白質設計領域的重大進展后,美國能源部阿貢國家實驗室團隊宣布開發出一種名為MProt-DPO的創新計算框架,該框架利用人工智能(AI)和世界頂尖的超級計算機,推動蛋白質設計取得新突破。這一成就標志著向AI自主科學發現邁出了重要一步。利用MProt-DPO框架,科學家設計了一
癌癥基因組——癌癥研究和云計算的里程碑
圖片來源:https://www.nature.com/articles/d41586-020-00308-w 2001年,人類基因組計劃完成,整個計劃花費約30億美元,1985年提出,1990年正式啟動,歷經十余年。腫瘤是最熱門的研究領域之一,該領域的研究者們一直希望可以借助測序手段去表征腫瘤的
科學家提出深度學習框架用于發現癌癥中的新突變
全基因組染色質構象捕獲技術(Hi-C技術)已被證明是檢測人類基因組中結構變異(SVs)的一種有效方法。然而,目前能夠使用Hi-C數據進行全范圍檢測SVs的算法一直缺乏。目前的方法只能在不太理想的分辨率下,識別染色體間易位和長距離染色體內SVs(>1 Mb)。美國西北大學范伯格醫學院研究人員基于深
siRNA表達框架
siRNA表達框架(siRNA expression cassettes,SECs)是一種由PCR得到的siRNA表達模版,能夠直接導入細胞進行表達而無需事前克隆到載體中。這個方法最早是由Castanotto和其同事采用,包括一個RNA polⅢ啟動子,一段發夾結構siRNA,一個RNA pol I
科學報告:化學計算能夠預測癌癥的發生
最近,賴斯大學的科學家們開發出了一種鑒別癌前體細胞何時會變成成熟的癌癥的方法。 血液中的生物標記物可能會揭示出突變的細胞是否已轉向形成腫瘤,以及這一過程可能需要多長時間(取決于癌癥類型)。這可以使患者意識到他們生病之前面臨的風險。 在最近一項研究中,Anatoly Kolomeisky與博士
左小磊等合作開發基于DNA框架的多維癌癥診斷分子分類器
準確反映臨床行為的疾病分子分類奠定了精準醫療的基礎。計算機內分類器的發展加上基于DNA反應的分子實現標志著更強大的分子分類的關鍵進步,但處理多種分子數據類型仍然是一個挑戰。 2023年3月27日,上海交通大學左小磊作為通訊作者在Nature Nanotechnology在線發表題為“DNA-f
計算機程序可以診斷和定位血液樣本中的癌癥
美國研究人員開發了一種計算機程序,可以在檢測癌癥的同時從患者的血液樣本中識別癌癥病灶在身體中的位置。該研究項目公開發表在近期出版的《基因生物學》期刊上。 來自加利福尼亞大學洛杉磯分校的聯合作者周茉莉教授表示:“癌癥的非侵入性診斷很重要,因為它能夠診斷早期癌癥,癌癥越早被確診,病人被治愈的幾率就
計算機技術還能幫助揭示癌癥惡化的分子機制!
近日,費城兒童醫院(CHOP)領導的一項研究揭示了蛋白質可變剪切與促癌基因之間的聯系。相關結果發表在《PNAS》雜志上。 文章作者,計算與基因組學中心主任Xing博士說:“我們的研究為癌癥驅動基因與選擇性剪接之間的關系提供了見解,這些發現可用于指導靶向可變剪接的癌癥療法的發展”。 選擇性剪接
大腦組織的新框架
“功能性磁共振成像顯示大腦有一個全球一致的空間結構,但科學家們還沒有就正確的方式來編目這種結構達成共識。我們證明,少量的時空模式可以完成這項工作,”加州大學洛杉磯分校神經科學和人類行為研究所大腦連接與認知實驗室主任、精神病學和生物行為科學教授?Lucina Uddin說。該實驗室的統計學家、該研究的
人類激酶計算機模型有望幫助開發新型癌癥療方法
近日,一項刊登在國際雜志Journal of Chemical Information and Modeling上的研究報告中,來自加州理工州立大學的科學家們通過研究開發了一種人類MEK1蛋白計算機模型,MEK1是科學家們有望開發多種人類癌癥療法的潛在藥物靶點。圖片來源:theconversat
關于siRNA表達框架的介紹
siRNA表達框架(siRNA expression cassettes,SECs)是一種由PCR得到的siRNA表達模版,包括一個RNA pol Ⅲ啟動子,一段發夾結構siRNA,一個RNA pol Ⅲ終止位點,能夠直接導入細胞進行表達而無需事前克隆到載體中。和siRNA表達載體不同的是,SE
框架斷路器機構故障
框架斷路器機構故障往往由于機構不緊湊,彈簧和連桿配合不好,或者彈簧錯位,甚至掉落,造成手動電動都合不上閘,在檢查時仔細觀察各機械部件有沒有脫落、變形損壞,進行相應的復位調整修復。如連桿大件損壞無法修復的,只能聯系廠家派技術人員修理或更換相關部件。
siRNA表達框架的技術特點
siRNA表達框架(siRNA expression cassettes,SECs)是一種由PCR得到的siRNA表達模版,包括一個RNA pol Ⅲ啟動子,一段發夾結構siRNA,一個RNA pol Ⅲ終止位點,能夠直接導入細胞進行表達而無需事前克隆到載體中。和siRNA表達載體不同的是,SECs
新型計算模型有望向癌癥個體化療法邁進一步
-近日,一項刊登在國際雜志EbioMedicine上的研究報告中,來自赫爾辛基大學等機構的科學家們通過研究開發了一種新型計算模型—結合重要性評分(CES,Combined Essentiality Scoring)模型,其能準確識別出癌細胞中必要的基因,從而幫助開發新型抗癌藥物。 圖片來源:U
siRNA表達框架制備方法的特點
siRNA表達框架(siRNA expression cassettes,SECs)是一種由PCR得到的siRNA表達模版,包括一個RNA pol Ⅲ啟動子,一段發夾結構siRNA,一個RNA pol Ⅲ終止位點,能夠直接導入細胞進行表達而無需事前克隆到載體中。和siRNA表達載體不同的是,SECs
框架式斷路器的安裝
1安裝的環境要求 斷路器應安裝在干燥、無塵、無侵蝕性氣體、無爆炸危險介質的環境中,不能受到撞擊。如環境滿足不了這種條件,就應相應提高成套設備的防護等級。溫度、濕度、海拔環境要求見下表 項目 規范 周圍溫度 –5℃~+40℃且24h平均值不超過+35℃ 相對濕度 最高溫度為+40℃時,空氣
《公眾科學素質測評指標框架》發布
11月30日,以“提升科學素質 共建綠色家園”為主題的2021世界公眾科學素質促進大會在京舉辦。大會發布了世界公眾科學素質組織籌委會2021形成的主要工作成果《公眾科學素質測評指標框架》,旨在服務、指導不同國家和地區以“開放、信任、合作”的態度,對公眾科學素質進行科學測量和精準施策。公眾科學素質的測
NFC芯片選型設計及電路框架
RFID 作為一項專業度較高的技術,在一些公司,可能還會專門招聘專業的 RFID 工程師。本篇闡述的涉及到的只是基本選型設計、電路框架,關于 RFID 天線調試、低功耗檢卡調試等,后續再其他篇章會繼續更新! NFC(Near Field Communication)芯片選型: 主
框架斷路器怎么處理13868302777
框架斷路器主要用于保護低壓電氣設備,使之免受過電流、欠電壓、短路等不正常情況下的危害,正常條件下也可作為線路的不頻繁操作之用。框架斷路器也稱萬能式斷路器。這種斷路器一般都有一個鋼制的框架。所有的零部件均安裝在框架內,其容量較大,并可裝設多種功能的脫扣器的較多的輔助觸頭,由不同的脫扣器組合可以構成不同
研究提出“植物菌根協同”新框架
在全球森林退化加劇與氣候變化威脅的背景下,以提升地上碳儲量為目標的森林恢復策略面臨著土壤碳庫恢復滯后、生態系統多功能性提升不足等問題。中國科學院華南植物園科研團隊聯合德國、美國、捷克、荷蘭和意大利等國家的研究人員,系統闡述了植物-菌根共生體在地下碳庫形成與生態系統多功能性維持中的核心調控作用,并
納米中空陶瓷框架結構堅韌耐壓
據物理學家組織網近日報道,天然藻類等有機物的輕量骨架的堅韌度完勝由同樣材料制成的產品。科學家們一直懷疑,這種差異同生物材料的層次式體系結構有關——以二氧化硅為基礎的生物骨架由不同的結構元件構成,其中有些元件僅為幾納米。現在,美國科學家通過制造出納米中空陶瓷框架模擬了這一結構,并且發現,盡管這種微
中德聯合研發出蛋白晶體框架材料
近日,德國亥姆霍茲柏林研究中心和復旦大學江明院士課題組將伴刀豆球蛋白A與輔助分子(碳水化合物)以及羅丹明連接起來,幫助蛋白質對稱排列,聯合研究開發出了一種全新的材料——蛋白質晶體框架材料,形成高度穩定的晶體,而且形成了可控制的互穿網絡。在這一過程中,碳水化合物首先與蛋白結合,然后羅丹明開始二聚化
寧夏食藥檢驗檢測框架初步形成
3月16日,在寧夏食品藥品監管業務能力建設工作會議上,自治區食藥監局局長武曉平表示,我區將下大力氣改進食藥監管面臨的技術能力不足等問題。 據悉,目前全區共有食品藥品檢驗檢測機構22家,基本可以涵蓋“四品一械”生產、流通、消費等各個環節。同時,新組建的審評認證中心填補了我區食品藥品生產經營準入
恒溫恒濕箱-6-個主要框架
恒溫恒濕箱可以進行高溫、低溫、濕度等試驗,那么這些環境模擬是通過哪些部件,通過什么原理實現的呢? 控制器 控制器關鍵是溫度和濕度傳感器。溫度感應器運用較多的是鉑電組和熱電阻。 環境濕度的測量法有二種:干濕球溫度計法和固態硬盤電子式控制器立即測量法。恒溫恒濕箱固態硬盤控制器比濕區球法的測量精
歐盟第七框架計劃會在布魯塞爾召開
歐盟第七框架計劃“食品、農業和生物技術”領域信息和項目對接會在布魯塞爾召開 據國家科學技術部網2007年12月17日報道:為加強中歐在歐盟第七框架“食品、農業和生物技術”領域內的合作,增進中國科研人員對歐盟第七框架的了解,提高我國科研人員在歐盟中長期科研計劃中的參與度,中國歐盟科技合作促進辦公室
siRNA表達框架制備siRNA的方法介紹
siRNA表達框架(siRNA expression cassettes,SECs)是一種由PCR得到的siRNA表達模版,包括一個RNA pol Ⅲ啟動子,一段發夾結構siRNA,一個RNA pol Ⅲ終止位點,能夠直接導入細胞進行表達而無需事前克隆到載體中。和siRNA表達載體不同的是,SECs
新版《中國綜合地層和時間框架》發布
近日,由中國科學院院士、中科院南京地質古生物研究所研究員沈樹忠、戎嘉余主編的《中國科學:地球科學》專輯《中國綜合地層和時間框架》正式出版。這是對本世紀以來中國地層學研究進展的一次綜合性整理和總結,專輯中發布的中國高精度綜合地層框架,可為全球或區域地層深化研究、各省區開展大比例尺地質填圖工作,以及