首個百億級可部署基因組基礎模型發布
10月23日，在第二十屆國際基因組學大會上，華大生命科學研究院與之江實驗室聯合發布了首個百億參數可部署的基因組通用基礎模型（Genos）。這一針對人類基因組深度優化的基因組基礎模型，可支持高達百萬堿基對的超長上下文分析，并實現單堿基分辨率的精準識別，有望為臨床疾病診斷、個人基因組解讀及前沿科學研究帶來突破性變革。相關研究成果于22日發表于GigaScience。基因組學領域內的現有模型大多基于一到兩個參考基因組進行訓練，難以捕捉人類豐富的遺傳多樣性。而Genos則系統整合了人類泛基因組參考聯盟、人類基因組結構變異圖譜計劃等多個權威公開資源，首次匯聚了全球范圍內636個“端粒到端粒”級別的高質量人類基因組作為訓練數據。這些數據覆蓋了全球不同人群，旨在從源頭減少數據偏見，更全面地代表人類遺傳多樣性。基因組的語言極其復雜，一個微小的單堿基突變，其影響可能由百萬堿基之外的“遙遠”調控元件決定。這要求模型既要有“顯微鏡”般的單堿基精度，又......閱讀全文
首個百億級可部署基因組基礎模型發布
10月23日，在第二十屆國際基因組學大會上，華大生命科學研究院與之江實驗室聯合發布了首個百億參數可部署的基因組通用基礎模型（Genos）。這一針對人類基因組深度優化的基因組基礎模型，可支持高達百萬堿基對的超長上下文分析，并實現單堿基分辨率的精準識別，有望為臨床疾病診斷、個人基因組解讀及前沿科學研究帶
動物模型基礎
第一部分 動物模型的分類一、按產生原因分類（一）自發性動物模型（Spontaneous Animal Models）是指實驗動物未經任何有意識的人工處置，在自然情況下所發生的疾病。包括突變系的遺傳疾病和近交系的腫瘤疾病模型。突變系的遺傳疾病很多，可分為代謝性疾病、分子疾病和特種蛋白質合成異常性疾病。
智能CT基礎模型助力放療精準決策
宮頸癌是威脅女性健康的重大疾病，對于局部晚期患者，雖然標準的同步放化療能讓約70%的患者獲得無病生存，但仍有近三分之一面臨復發轉移風險。為提高治療成功率，臨床開始探索強化治療策略，但這些方案在改善生存的同時也帶來更高的毒性和費用負擔。因此，如何在治療前精準識別出真正需要強化治療的高風險患者，既確保他
核小體模型的建立基礎和研究
人們接著用化學交聯、高鹽分離組蛋白，以及X衍射等方法進一步研究組蛋白多聚體的結構、排列以及怎樣和DNA結合的，從而建立了核小體模型。1984年Klug和Butler進行了修正。核小體的構造可用圖表示：每一個核小體結合的DNA總量為200bp左右，一般在150~250變化范圍（micrococcal
細胞化學基礎葉綠體基因組－－cpDNA
葉綠體基因組在很多方面與線粒體基因組的結構是相似的。葉綠體DNA（cpDNA）是雙鏈環狀，缺乏組蛋白和超螺旋。cpDNA中的GC含量與核DNA及mtDNA有 很大的不同。因此可用CsCl密度梯度離心來分離cpDNA。每個葉綠體中cpDNA的拷貝數隨著物種的不同而不同。但都是多拷貝的。這些拷貝位于類核
蛋白質結構和功能的基礎模型
蛋白質設計程序使用在體內環境中驅動蛋白質的分子力的計算機模型。為了使問題易于解決，蛋白質設計模型簡化了這些作用力。盡管蛋白質設計程序相差很大，但它們必須解決四個主要的建模問題：設計的目標結構是什么，目標結構允許什么樣的靈活性，搜索中包括哪些序列，以及將使用哪個力場來分數序列和結構。目標結構蛋白質功能
全球首個百億級遙感解譯基礎模型發布
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/10/531092.shtm
具身智能基礎模型研究取得系列進展
具身智能作為人工智能向物理世界延伸的關鍵形態，對推動機器人實現自主理解與行動具有重要意義。當前，“視覺—語言—動作”模型在短任務中表現良好，但在復雜連續任務中易受局部觀測、環境擾動及動作累積誤差影響，導致階段性動作合理但整體目標偏離，限制了其在開放環境中的穩定執行與泛化應用。近期，中國科學院重慶綠色
香港首個自主研發基礎大模型初步完成
中新社香港4月14日電 (記者 戴夢嵐)第二屆香港國際創科展日前在香港會議展覽中心開幕。香港科技大學首席副校長兼“香港生成式人工智能研發中心”(HKGAI)主任郭毅可在展會上接受記者采訪時透露，由HKGAI訓練、香港首個自主研發的基礎大模型已初步完成。郭毅可表示，該大模型支持中文和英語，將為香港人工
廣州首個基礎大模型“黃埔星”正式問世
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/515970.shtm1月12日，第二屆粵港澳大灣區（黃埔）國際算法算例大賽頒獎典禮、第三屆啟動會暨大模型圓桌論壇在廣東廣州開發區、廣州市黃埔區舉辦。活動當天，10個賽道共計80支隊伍登上粵港澳大灣區（黃埔
人造器官模型為乙肝藥物開發打下基礎
乙型肝炎病毒（HBV）感染目前無法治愈，它在全球影響幾億人。由于缺乏能用于測試潛在療法的模型，治療領域發展緩慢。近日，倫敦帝國理工學院（Imperial College London）的科學家們在人造器官模型中測試了病毒感染，這一成功有望加速該領域研究。相關論文已發表在《Nature Commu
科研人員開發出RNA基礎語言模型
在真核生物中，RNA轉錄、剪接、翻譯和降解等生物學過程受到順式調控元件、RNA結構和反式作用因子的調控。解析RNA多層次調控，對研究基因表達分子機制和設計RNA藥物具有重要意義。但是，由于調控復雜和數據量不足，構建RNA調控的預測模型面臨挑戰。 近日，中國科學院上海營養與健康研究所研究員張國慶
大型研究為癌癥基因組分析奠定基礎
12月9日，國際癌癥基因組協會（ICGC）在著名的《Nature Communications》雜志，發表了一篇令人瞠目的文章，它為即將到來的癌癥基因組學研究時代，奠定了基礎。該項目，是由Centro Nacional de Analisis Genómico (CNAG-CRG)和German
相分離調控線粒體基因組空間秩序的模型
中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員劉興國團隊聯合清華大學、南方科技大學、北京大學、香港中文大學等科研人員，研究發現線粒體基因組與其結合蛋白，利用生物分子最基礎的自發聚集的相分離性質，調控線粒體類核的組裝以及轉錄的復雜過程，構建了首個相分離調控線粒體基因組結構與功能的模型。相關研究10月28日在
新思路！學者使用基礎模型化解小樣本學習問題
如何讓模型算法僅利用“少量、低質量的有標注樣本”，就能實現或接近“大量、高質量、有標注數據的樣本”所能達到的結果，是小樣本學習領域的關鍵問題。為此，之江實驗室前沿基礎研究中心博士后邵帥為小樣本計算研究提出了新思路。他的思路是，通過利用已有基礎模型資源的優勢潛力，實現下游任務中小樣本測試數據的精準分類
新思路！學者使用基礎模型化解小樣本學習問題
如何讓模型算法僅利用“少量、低質量的有標注樣本”，就能實現或接近“大量、高質量、有標注數據的樣本”所能達到的結果，是小樣本學習領域的關鍵問題。為此，之江實驗室前沿基礎研究中心博士后邵帥為小樣本計算研究提出了新思路。 他的思路是，通過利用已有基礎模型資源的優勢潛力，實現下游任務中小樣本測試數據的
專著《樹鼩基礎生物學與疾病模型》出版
在國家863計劃課題的支持下，中國科學院昆明動物研究所聯合中國科學技術大學等7家單位的專家學者共同編著《樹鼩基礎生物學與疾病模型》。該書較全面地介紹了樹鼩基礎生物學和疾病模型研究相關領域的最新進展與發展趨勢，其中許多研究成果屬于首次報道。 中國科學院副院長張亞平院士為本專著作序，全書分為樹鼩
以硅膜為基礎分離基因組－DNA－實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 PBS Na2 HP04 KH2PO4 NaCl KC1 消化液 MasterMix 蛋白酶 K
以硅膜為基礎分離基因組－DNA－實驗
硅化學法已成為從小鼠尾剪取物、動物組織和組織培養細胞等樣品中純化高質量基因組 DNA 的方法之一。Wizard SV 基因組 DNA 純化體系是利用一個充有固相硅的濾膜來純化 基因組 DNA 的。本實驗來源于 PCR 實驗指南（第二版），作者：種康，瞿禮嘉。試劑、試劑盒PBSNa2 HP04KH2P
以硅膜為基礎分離基因組－DNA－實驗
試劑、試劑盒 PBSNa2 HP04KH2PO4NaClKC1消化液 MasterMix蛋白酶 K儀器、耗材 自動定位器P250 盒裝吸頭 平板密封條Vac-Man96 真空裝置 真空泵實驗步驟 一、材料1.緩沖液、溶液和試劑1XPBS(用于組織培養細胞）將下列試劑溶解于1L消毒的去離子水中，高壓滅
研究系統揭示番木瓜馴化的基因組基礎
近日，中國熱帶農業科學院熱帶生物技術研究所/熱帶作物生物育種全國重點實驗室分子設計育種研究團隊在番木瓜優良基因資源挖掘和馴化性狀基因組選擇方面取得進展。研究構建兩個表型差異的兩性株栽培品種的高質量基因組及其單倍型分型的性別決定區（SDRs），破譯了番木瓜果實產量和品質性狀逐步選擇及其兩性株性狀獨特起
提出相分離調控線粒體基因組空間秩序的模型
中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員劉興國團隊聯合清華大學、南方科技大學、北京大學、香港中文大學等科研人員，研究發現線粒體基因組與其結合蛋白，利用生物分子最基礎的自發聚集的相分離性質，調控線粒體類核的組裝以及轉錄的復雜過程，構建了首個相分離調控線粒體基因組結構與功能的模型。相關研究1
AI模型“Evo”：揭開基因組“密碼全書”新篇章
《科學》雜志15日發布了一項突破性研究成果：美國斯坦福大學Arc研究所團隊利用人工智能（AI），開發出一種大規模基因組基礎模型“Evo”，翻開了生命的“密碼全書”。該模型采用先進架構，能夠以前所未有的精度，解析和設計從分子層面到整個基因組級別的DNA、RNA及蛋白質序列。其不僅能夠預測突變對細胞內部
首個！百億級遙感解譯基礎模型“空天·靈眸”發布
9月21日，在第一屆空天信息技術大會上，中國科學院空天信息創新研究院（空天院）研究員付琨團隊聯合鵬城實驗室，正式發布自主研制的百億級遙感解譯基礎模型——“空天·靈眸”3.0版，這是迄今為止全球首個百億參數級空天一體遙感解譯基礎模型。近年來，我國遙感數據獲取能力不斷增強，已進入遙感大數據時代，人工智能
全球首個跨物種大腦空間轉錄組基礎模型發布
7月11日，由臨港實驗室牽頭，聯合上海科學智能研究院、上海交通大學、東京大學國際神經智能研究中心等多家單位，共同發布了全球首個跨物種大腦空間轉錄組基礎模型BrainBeacon。生命科學中的細胞“語言”由DNA、RNA、蛋白質和基因表達等分子“詞語”構成。開發基于這種特殊“語言”的人工智能（AI）細
全球首個跨物種大腦空間轉錄組基礎模型發布
7月11日，由臨港實驗室牽頭，聯合上海科學智能研究院、上海交通大學、東京大學國際神經智能研究中心等多家單位，共同發布了全球首個跨物種大腦空間轉錄組基礎模型BrainBeacon。生命科學中的細胞“語言”由DNA、RNA、蛋白質和基因表達等分子“詞語”構成。開發基于這種特殊“語言”的人工智能（AI）細
黃瓜變異組研究奠定全基因組設計育種基礎
中國農業科學院蔬菜花卉研究所領導的國際黃瓜變異組研究團隊，對115個黃瓜品系進行深度重測序，構建了包含360多萬個位點的全基因組遺傳變異圖譜，為全面了解黃瓜進化及多樣性提供了新思路，并為全基因組設計育種打下了基礎。相關成果10月20日在線發表于《自然·遺傳學》雜志。 據國際黃瓜基因組計劃首
細胞化學基礎藍藻和葉綠體基因組的比較研究
原核的藍藻和真核植物（包括其他藻類）中的葉綠體，都同樣進行放氧的光合作用，這為人類和整個生物界提供了賴以生存的食物、氧氣、能源和原料。對葉綠體和藍藻的細胞結構和分子生物學特性作分析，證明真核生物的葉綠體可能起源于藍藻祖先的內共生。這使藍藻在20多年來已成為光合作用研究的模式生物。藍藻基因組的作圖和測
遙感跨模態基礎模型關鍵技術研究項目獲批
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500252.shtm近日，科技創新2030—“新一代人工智能”重大項目中的“遙感跨模態基礎模型關鍵技術研究”項目獲批。 ???為落實國務院印發的《新一代人工智能發展規劃》總體部署，科技部啟動實施科
新的谷氨酸棒桿菌基因組規模代謝網絡模型
谷氨酸棒狀桿菌（Corynebacterium glutamicum），是重要的工業微生物之一，被廣泛應用于氨基酸、有機酸、維生素和生物能源等的工業化生產。作為工業生產菌種，谷氨酸棒桿菌具有耐受高強度發酵的魯棒性、環境適應性強等特點。該菌的基因組測序已完成，遺傳操作系統正在被不斷地完善。目前，谷