Science突破性成果:鳥瞰細胞RNA
如同在房地產中一樣,在生物學中位置也很重要。活化基因的mRNAs戰略性定位在整個活體組織中,它們的位置往往幫助調控了細胞和組織的生長及發育方式。然而為了同時分析許多的mRNAs,科學學家們不得不將細胞碾磨成漿,這使得他們沒有好的辦法精確確定這些mRNAs在細胞內的定位。 現在,哈佛大學Wyss生物啟發工程研究所和哈佛醫學院的一個研究小組,與Allen腦科學研究所展開協作開發了一種新方法,使得科學家們能夠在完整細胞中同時確定數以千計mRNAs和其他類型RNAs的定位——測定堿基序列來鑒別它們,并揭示出它們在做什么。 研究人員將這種方法命名為熒光原位RNA測序(FISSEQ),其有可能促成早期癌癥診斷揭示出看似健康組織中驅動癌癥的分子改變。并有可能追蹤癌癥突變以及它們對于現代靶向療法的反應,并揭示出一些更安全、有效的治療靶點。 該方法還有可能幫助生物學家們了解胚胎發育過程中組織的微妙變化——甚至幫助繪制出人類大......閱讀全文
LavaAmp:隨時隨地復制NDA序列
LavaAmp,一臺小到可以別在褲腰帶上、能夠隨時隨地復制DNA序列的鏈式反應儀。圖片來源:staticflickr.com LavaAmp的樣機是用金屬薄片做成的,一端有個小小的圓筒形突起部分,上面繞著兩根細導線。你可以用5號電池給它供電,或者直接把它連接到筆記本電腦上的USB接口也行。La
細胞化學詞匯自主復制序列
ARS(autonomously replicating sequence)。在真核生物中發現的一類能啟動DNA復制的序列,含有一個AT富集區。最早在酵母中分離得到,隨后在其它真核生物中也發現了ARS序列的存在。這些序列是在人工合成的環形質粒中作為復制器起作用的。
自主復制序列的定義和作用
ARS(autonomously replicating sequence)。在真核生物中發現的一類能啟動DNA復制的序列,含有一個AT富集區。最早在酵母中分離得到,隨后在其它真核生物中也發現了ARS序列的存在。這些序列是在人工合成的環形質粒中作為復制器起作用的。
基因復制速率的概念
比較基因組研究結果表明基因復制在大多數研究的物種中都很常見。這可以通過人類 或果蠅的基因組中的可變拷貝數(拷貝數變異)來證明。但是,很難衡量這種復制發生的速率。最近發現秀麗隱桿線蟲中的基因復制率大約為10-7復制/基因/代,即在1000萬個蠕蟲的群體中,每一代將有一個基因重復。該速率比該物種中每個核
基因復制的其他功能
復制基因的另一個可能的命運是兩個拷貝同樣可以自由地積累退行性突變,只要任何一方突變造成的缺陷能由另一個拷貝補充,這種現象稱為中性的“亞功能化”。這兩個基因都不會丟失,因為它們現在都執行重要的非冗余功能,但最終都無法實現新功能。亞功能化可以通過中性過程發生,其中突變積累既沒有害處也沒有益處。但是,在某
基因的復制與表達
? 生物的遺傳物質基礎是核酸(nucleic acid),它也是基因的基本結構,它們的化學組成分子結構符合遺傳物質的穩定性、連續性及多樣性的要求。 (一)核酸的化學組成 核酸結構的基本單位是核苷酸(nucleic acid),每個核苷酸由1個磷酸、1個五碳糖和1個堿基3部分組成。核酸有兩類:
重疊基因的調控序列
①在5′端轉錄起始點上游約20~30個核苷酸的地方,有TATA框(TATA box)。TATA框是一個短的核苷酸序列,其堿基順序為TATAATAAT。TATA框是啟動子中的一個順序,它是RNA聚合酶的重要的接觸點,它能夠使酶準確地識別轉錄的起始點并開始轉錄。當TATA框中的堿基順序有所改變時,mRN
復制型基因的克隆方法
將目的基因仍保留在染色體以外的克隆系統稱為復制型基因克隆系統,以區別整合到染色體上的整合型克隆系統。盡管有大量不同的噬菌體,但所有已知的乳球菌復制型克隆系統都是由質粒構建的。乳球菌遺傳學研究證明,乳球菌含有數量不等的質粒,多則十幾個。它們當中一些編碼重要的代謝物質,為了分析和克隆這些基因,以及了解它
基因序列儀的分類介紹
根據電泳類型分為平板型電泳和毛細管電泳兩類:1. 平板型電泳:平板型電泳的凝膠灌制在兩塊玻璃板中,聚合后厚度一般小于0.4mm或更薄,因此又稱為超薄片層凝膠電泳。是經典的電泳技術,具有樣品判讀序列長(600-900bp)、一塊凝膠板上可同時進行多個樣品測序的優點。2. 毛細管電泳:將凝膠高分子聚合物
功能基因cDNA序列的分析
(一) cDNA序列的測定一.原理DNA 序列測定技術,目前主要是根據Sanger 等提出的酶法和Maxam和Gilber 提出的化學降解法,這兩種方法的原理大致相同。這里主要介紹Sanger 的酶法——雙脫氧鏈終止法。雙脫氧鏈終止法是Sanger 等人于1977 年建立起來的。它是利用了2'
什么是基因的核心序列?
中文名稱核心序列英文名稱core sequence定 義重復序列共有的核苷酸序列。應用學科遺傳學(一級學科),分子遺傳學(二級學科)
關于復制型基因的克隆介紹
將目的基因仍保留在染色體以外的克隆系統稱為復制型基因克隆系統,以區別整合到染色體上的整合型克隆系統。盡管有大量不同的噬菌體,但所有已知的乳球菌復制型克隆系統都是由質粒構建的。 乳球菌遺傳學研究證明,乳球菌含有數量不等的質粒,多則十幾個。它們當中一些編碼重要的代謝物質,為了分析和克隆這些基因,以
基因復制的主要功能
基因復制是遺傳創新和進化創新的來源。基因復制也產生遺傳冗余,每個基因的第二拷貝通常沒有選擇壓力,這樣的話,即使發生突變, 其突變對其宿主生物也沒有有害影響。如果某個基因的一個拷貝發生了影響其原始功能的突變,則第二個拷貝可以作為“備份”并繼續正常運行。因此,復制的基因比功能性單拷貝基因能更快地累積突變
基因組序列草圖的概念
中文名稱基因組序列草圖英文名稱draft genome sequence定 義已測定序列占到90%以上、測序精度在1%的基因組序列圖。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)
割裂基因的調控序列種類介紹
①在5′端轉錄起始點上游約20~30個核苷酸的地方,有TATA框(TATA box)。 TATA框是一個短的核苷酸序列,其堿基順序為TATAATAAT。TATA框是啟動子中的一個順序,它是RNA聚合酶的重要的接觸點,它能夠使酶準確地識別轉錄的起始點并開始轉錄。當TATA框中的堿基順序有所改變時,
什么是基因的間插序列?
中文名稱間插序列英文名稱intervening sequence;IVS定 義基因間或基因內的非編碼序列。應用學科遺傳學(一級學科),分子遺傳學(二級學科)
解析現代月季基因組序列
科學家研究現代月季基因。圖片來源:monticelloshop.org 近日,法國農業科學研究院、里昂大學、法國國家科學研究中心的研究人員解密了現代月季的基因組序列。現代月季擁有獨特的顏色與香味,廣受稱贊,這項研究幫助人們從分子角度了解這背后的基因和代謝流程。4月30日,相關論文在線刊登于《自然
常見的幾種基因復制的原因介紹
天然基因擴增,也稱為染色體復制,或基因復制,是生物分子進化過程中產生新遺傳物質的主要機制。它指的是任何含有基因的DNA片段的復制。基因復制可能源于DNA復制和修復錯誤,也可能源于自私遺傳元件的偶然捕獲。常見的幾種基因復制的原因包括:異位重組(重組過程的交叉發生在非同源位點)、逆轉錄事件、非整倍性、多
常見的基因復制的原因有哪些?
常見的幾種基因復制的原因包括:異位重組(重組過程的交叉發生在非同源位點)、逆轉錄事件、非整倍性、多倍性和復制滑動(滑鏈錯配)。
DNA微陣列檢測基因表達水平及識別基因序列
Schena等1996年用擬南芥光調基因微陣列,以不同器官中的mRNA為探針,檢測其基因表達水平,結果表明葉mRNA的表達水平是根的500倍。Shelon等1996年將釀酒酵母基因組DNA克隆制成微陣列,用6條最大染色體和10條最小染色體DNA探針分別標記上紅,綠熒光標記進行雜交檢測,結果表明9
首次測定玉米蛇基因組序列
在現有的5000種哺乳動物中,有超過100種已經進行了基因組測序,但是,只有9種爬行動物(在10000個物種當中)的基因組對科學界來說是可用的。最近,瑞士日內瓦大學(UNIGE)的一個研究小組,構建了一個大的數據庫,其中就包括一種爬行動物——玉米蛇的新基因組測序,這種蛇越來越多地被用來了解爬行動
結構基因的側翼序列的介紹
1、前導區和尾部區 此二區被轉錄并參與成熟mRNA的組成,但不被翻譯,前者位于轉錄起始點和第一外顯子之間,相當于mRNA5’端的非翻譯區(5’UT);后者位于最末外顯子和終止子之間,相當于mRNA3’端非翻譯區(3'UT)。前導區和尾部區轉錄后的相應序列在mRNA中起維持mRNA穩定性的
3000株水稻基因序列公開發表
近日,3000株水稻基因組測序文章在GigaScience正式發表,且整套水稻基因序列以可引用形式在該雜志的附屬開放獲取數據庫GigaDB中公開。 該項目產生的數據是目前已公開水稻序列數據量的四倍。該成果標志著3000株水稻基因組項目第一階段的完成,主要由中國農業科學院、國際水稻研究
基因序列揭示非洲人早期歷史
人類在非洲的早期歷史正日益成為人們關注的焦點。一項新的研究對源自這片大陸的十幾個族群的180個基因組進行了研究,其中一些基因組之前從未被分析過。 初步研究結果表明,在4萬多年前,其中兩個族群(桑人和巴卡人)的規模相當于當時其他族群的兩倍,并且這兩個族群生活在中東部非洲或南部非洲。 研究人員在
如何設計基因cds序列的pcr引物
提取細胞總RNA然后用試劑盒反轉錄成cDNA,用cDNA作為模板擴增基因的CDS區,然后想要轉染進細胞中。比如MYOD1基因,首先在NCBI找到它的mRNA序列,然后找到它的CDS序列,全部復制下來,在primer5.0中。正向引物直接從CDS的第一個核酸開始(比如18bp),反向引物從CDS最后一
概述釀酒酵母的基因組序列
1996年6月,在國際互聯網的公共數據庫中公布了釀酒酵母的完整基因組順序,它被稱為遺傳學上的里程碑。因為首先,這是人們第一次獲得真核生物基因組的完整核苷酸序列;其次,這是人們第一次獲得一種易于操作的實驗生物系統的完整基因組。 [10] 在釀酒酵母測序計劃開始之前,人們通過傳統的遺傳學方法已確定
關于復制子的基因級的介紹
為了正確的遺傳,一個細菌復制子需要以下功能:1、起始復制的過程。2、控制起始的頻率。3、將復制的染色體分到子細胞中去。前兩種功能都是原點來行使。分配可能是一種獨立的功能,但在原核系統中通常與鄰近原點的序列有關。真核生物的原點不行使分配的功能,它只與復制有關。 根據一個普遍的規律,含有原點的DN
至少復制幾次可以得到獨立的目的基因?
至少復制3次才能得到獨立的目的基因.
馬鈴薯基因組序列框架圖全球發布
中國科學家的創新性思路助推測序工作提前完成 9月23日,由14國科學家組成的“國際馬鈴薯基因組測序協作組”分別在北京、阿姆斯特丹、倫敦、紐約、利馬等地同時宣布了馬鈴薯基因組序列框架圖的完成。此次公布的馬鈴薯基因“藍圖”繪制工作的中國參與單位主要來自中國農業科學院蔬菜花卉所和深圳華大基因研究院。
科學家首次發現重度抑郁基因序列
【新聞事件】:本周《自然》發表了一篇重要論文。在分析5303例漢族女性重度抑郁患者和5337名對照的DNA序列后發現兩個和重度抑郁相關的基因序列。一個緊靠SIRT1,另一個是LHPP的內含子。這是科學家第一次把重度抑郁和某個基因序列可靠地聯系在一起,為以后藥物開發打下基礎。 【藥源解析】:抑郁