帶你解析腫瘤預后模型研究套路

　　研究背景

　　頭頸部鱗狀細胞癌（HNSCC）是全球人類第六大最常見的惡性腫瘤，超過50％的HNSCC確診患者處于晚期。免疫系統的失衡在以免疫抑制性疾病為特征的HNSCC的發展中起著至關重要的作用。因此，應進一步探索腫瘤免疫微環境（TIME）的調節機制，以確定可精確預測預后及優化免疫療法的有效生物標志物。

　　N6-甲基腺苷（m6A）是對mRNA的最常見轉錄后修飾，在轉錄后調控中起著至關重要的作用。m6A甲基化的表觀遺傳修飾通過調節相關癌基因或抑制基因的mRNA表達水平來影響腫瘤的發展。腫瘤中m6A甲基化水平主要取決于m6A甲基化調節因子的表達。m6A甲基化與細胞內甲基轉移酶（“Writers”）和脫甲基酶（“Erasers”）的表達高度相關，而結合蛋白（“Readers”）通過結合m6A甲基化位點發揮特定作用。

　　研究意義

　　該研究旨在系統地評估HNSCC中m6A

　　相關基因與預后，程序性死亡配體1（PD-L1）和TIME的相關性。通過研究HNSCC中m6A相關基因的表達模式，預后價值以及對TIME的影響，以改善預后風險分層并促進HNSCC患者的治療決策。

　　研究思路

　　1、HNSCC中m6A

　　相關基因的表達上調作者首先基于TCGA數據庫系統研究了HNSCC與相鄰正常對之間15個m6A相關基因的表達模式。在HNSCC和正常組織中，m6A相關基因的表達水平具有顯著差異。“Writers”（即KIAA1429，METAL3，RBM15，WTAP，ZC3H13和METTL16），“Readers”（即HNRNPC，YTHDC1，YTHDF1，YTHDF2和YTHDF3）和“Erasers”（ALKBH5和FTO）的表達水平在HNSCC組織中顯著高于正常鄰近組織，表明m6A 相關基因在HNSCC的發展中具有重要的生物學作用。

　　2、基于m6A相關基因的HNSCC亞型分類與臨床特征相關分析根據m6A相關基因的表達水平，通過聚類分析，499例HNSCC患者被分為兩個亞型，即cluster1（m6A相關基因表達上調）和cluster2（m6A相關基因表達下調）。兩種亞型之間的臨床病理特征分析發現，cluster2與低的腫瘤WHO分類相關，cluster2的免疫評分高于cluster1。cluster2的總生存期（OS）和無病生存期（DFS）高于cluster1。這些結果表明，由m6A相關基因表達定義的聚類亞型與HNSCC患者的異質性密切相關。