暨南大學報道造血干細胞發育單細胞lncRNA動態表達圖譜

　　 來自暨南大學基礎醫學院蘭雨課題組、中國醫學科學院基礎醫學研究所余佳課題組、軍事醫學科學院附屬醫院（現為解放軍總醫院第五醫學中心）劉兵課題組合作發表研究論文“Combined Single-Cell Profiling of lncRNAs and Functional Screening Reveals H19 is Pivotal for Embryonic Hematopoietic Stem Cell Development”，首次報道了造血干細胞發育全程的單細胞長鏈非編碼RNA（lncRNA）動態表達圖譜，發現單細胞長鏈非編碼RNA圖譜繪制結合功能篩選揭示H19對于造血干細胞發育至關重要。

　　這一研究成果公布在Cell Stem Cell雜志上，文章第一作者為周杰、張琳琳、徐嘉悅、劉思琪和馬艷妮。

　　研究人員首次報道了造血干細胞發育全程的單細胞長鏈非編碼RNA（lncRNA）動態表達圖譜，并鑒定出調控造血干細胞體內產生的重要功能lncRNA分子，這是繼2016年劉兵、湯富酬課題組合作采用單細胞孵育誘導移植，成功實現了單個造血干細胞前體（pre-hematopoietic stem cell，pre-HSC）的高效捕獲，同時聯合單細胞轉錄組測序技術，系統揭示了造血干細胞發育全程的分子特征（Nature，2016）之后，在造血干細胞發育調控領域的又一項重要的研究進展。

　　研究首次描繪出造血干細胞發育全程的單細胞lncRNA分子動態表達圖譜。系統揭示了lncRNA的時空表達特征、與蛋白編碼基因（mRNA）的表達相關性、進化保守特征，同時發現lncRNA相較于mRNA能更好的甄別不同時空造血干細胞相關群體的異質性，并通過與重要mRNA的共定位、共表達分析進行了lncRNA功能預測。

　　進而，研究人員通過深入分析及體外功能實驗篩選出6個可能在胚胎造血發育中發揮作用的lncRNA。利用條件基因敲除策略，進一步闡明了lncRNA-H19對于AGM區HSC發生的重要作用。機制上，lncRNA-H19的缺失使得重要造血轉錄因子（包括Runx1及Spi1等）的啟動子區域高甲基化以致表達下調，最終導致血管內皮細胞向造血干細胞前體轉化嚴重阻滯。

　　這項研究將為全面理解lncRNA調控重要生物學過程的機制提供重要啟示；造血干細胞發育全程的單細胞lncRNA圖譜也將為發育和再生研究提供基礎性的數據和參考。