青藏高原特有物種白唇鹿腸道微生物組成及生態過程研究

　　白唇鹿（Cervus albirostris）是鹿科（Cervidae）白唇鹿屬（Przewalskium）下的唯一物種，僅分布在青藏高原地區，是青藏高原特殊地質地理條件下形成的特化種。自20世紀60年代，為逐步恢復野生白唇鹿種群數量并維持鹿茸的可持續利用，白唇鹿被人工養殖。長期的養殖過程發現，部分圈養個體處于亞健康狀態，具體表現為潛在病原體增加，腸道微生物多樣性減少，特定的腸道微生物功能減弱，患病風險增加。

　　為探討圈養對白唇鹿腸道微生物群落結構和生態過程的影響，中國科學院西北高原生物研究所動物進化適應與瀕危物種保護學科組基于16S rRNA V3-V4區測序，利用QIIME2流程方法，對圈養和野生白唇鹿糞便微生物結構和組成進行分析。結果表明，圈養白唇鹿腸道菌群中厚壁菌門（Firmicutes）相對豐度低于野生種群，而擬桿菌門（Bacteroidetes）相對豐度高于野生種群；在屬水平上，條件致病菌和果膠分解菌相對豐度較高。PCoA分析表明野生白唇鹿和圈養白唇鹿的腸道菌群組成和功能存在顯著差異。零模型、中性群落模型和生態位寬度聯合分析表明，圈養通過提高確定性過程的貢獻，改變了其腸道微生物群落的生態組裝過程。研究表明，圈養能夠通過持續施加選擇性壓力而改變白唇鹿腸道微生物，從而對其宿主產生潛在的不利影響。該研究為瀕危物種的保護生物學研究提供了新的研究手段和視覺。

　　相關研究成果以Captivity Shifts Gut Microbiota Communities in White-Lipped Deer (Cervus albirostris)為題，發表在Animals上。研究工作得到中科院青海省人民政府三江源國家公園聯合研究專項等的支持。

白唇鹿腸道微生物群落組成及成分差異分析

白唇鹿腸道微生物群落生態過程分析