BioRad和Illumina聯合開發新型的單細胞測序系統

　　近日，Bio-Rad公司和Illumina公司達成合作協議共同開發針對單細胞的新一代測序工作站，單細胞分析領域在過去幾年里發生著翻天覆地地變化，而兩家公司的這項合作也將會對很多競爭性技術的企業帶來一定影響。

　　Illumina公司 CEO Jay Flatley在本周舉辦的摩根大通(JP Morgan)醫療會議上表示，這項合作被預期將會為單細胞分析帶來一種具有成本效益、端到端、高通量且具有一定規模性的平臺，公司這項合作計劃預期將在2016年早些時候完成。我們認為結合兩家公司的技術和知識產權將會為整個市場提供基本的產品需求。

　　一旦這種新型工作站系統啟動，其就會在短短幾個小時時間內，以每個細胞1美元的價格來對10000個細胞進行分析。目前，公司并沒有披露大概的總運行時間。基于這項合作協議，Bio-Rad公司也將開發出QX200儀器的修正版本及可產生微滴的試劑盒，這種微滴中將包括單細胞和條形碼珠子。

　　Bio-Rad公司高級副總裁Annette Tumolo在郵件中告訴GenomeWeb，公司目前正在開發新型儀器，這種新型儀器將利用公司的核心微滴分區技術來包裹細胞；在細胞裂解及細胞RNA同微滴中的珠子進行雜交后，乳濁液就會破碎，而且在一系列的樣品準備步驟后，混合液就會進入到一種由Illumina公司開發的無菌文庫準備過程中。測序過程完成后，數據就會流入到Illumina公司的BaseSpace平臺中，BaseSpace是一種基于云服務的平臺，其可以提供第三方及內部開發的生物信息學應用程序，以便被分析及報告。

　　Flatley表示，這種工作站將會為整個市場提供最具有整合性的端到端的單細胞解決方案，同時在未來也會被進行有效的擴張來包括很多新型的應用；這項商業性的合作計劃將會利用合作雙方公司各自的渠道，即利用Bio-Rad公司銷售修飾化液滴的生成工具，同時利用Illumina公司銷售所有耗材，包括單一試劑盒中的液滴盒子（droplet cartridge）。

　　兩家公司目前在這項計劃中已經取得了初步的進展，很多概念驗證實驗目前都已經進行了，而且樣本中的細胞純度都超過了90%，即包含了450個單一的細胞，利用大部分的RNA-seq方法都證明這些細胞具有良好的一致性。Illumina公司目前主要集中于圍繞數字流體來改善開發工具的標準化；Flatley說道，目前公司的目的就是為第三方開發者提供新技術，從而幫助其利用數字流體技術來開發新的應用。

　　目前在單細胞中進行的大量工作都很有必要利用小細胞數量來進行，而科學家們所開發的新型工作站也將會抑制這些細胞集群擴展成為大的細胞集群；早在2014年，Bio-Rad公司就已經收購了基于液滴測序的公司GnuBio，旨在進行臨床新一代測序系統的商業化用途。但此次同Illumina公司進行合作與前者并無關聯。

　　目前在單細胞測序領域有很多公司，值得注意的是富魯達（Fluidigm）公司是第一個開發并且進行產品推廣的供應商；該公司發言人Howard High表示，我們在很多公司的公告中都發現他們都計劃進入這個市場；該公司預計未來還有很多公司將會進入到這個飛速增長的市場中，從而擴大許多可用的解決方案。

　　目前富魯達公司的C1系統可以幫助科學家快速分離、處理并且對單一細胞的基因組進行分析，該系統可以同時分析多達800個細胞，還可以進行單細胞的mRNA測序，靶向DNA測序，進行全外顯子組測序及基因組測序，同時還可以進行靶向基因表達及miRNA的表達特性研究。

　　與此同時富魯達公司還在瑞典和澳大利亞形成了全球的伙伴聯盟來開啟單細胞基因組中心；BD公司最近也發起了對但細胞基因組的細胞分類及分析研究，Qiagen公司同Cell Microsystems公司也達成了合作協議來開發分離且分析單細胞的商業化技術，同時WaferGen公司也早在去年10月份發起了一種名為ICell8的用于單細胞基因組學研究的單細胞系統。

　　Cellular Research公司的Resolve系統預期會在2016年推出，該系統將和Illumina及Bio-Rad公司聯合推出的工作站非常相似，用于對每細胞一美元的多達10000個細胞進行分析。