10月27日,發表在Science雜志上題為“The epigenetic landscape of T cell exhaustion”的論文中,Dana-Farber 癌癥研究所、哈佛醫學院、加州大學伯克利分校等機構的科學家們發現,在慢性病毒感染的小鼠中,不同于能夠有效對抗感染或癌癥的T細胞,“耗竭(exhausted)”T細胞受一組不同的分子回路(molecular circuits)控制。
這一研究結果提出了增加CAR-T療法持久力的一種途徑。
“耗竭”T細胞究竟是什么?
多年以來,科學們一直知道,與完全致力于對抗疾病的功能性T細胞相比,“耗竭”T細胞有著不同的基因模式。但兩者之間這些差異的實際程度仍不清楚。其中,一個比較明顯的區別是,“耗竭”T細胞會表達PD-1。這一分子能夠發揮“剎車”功能。研究發現,利用檢查點抑制劑阻斷PD-1能夠修復這類T細胞的癌癥殺傷“熱情”。
這一研究的共同通訊作者Nicholas Haining說:“耗竭T細胞表現出了各種各樣的功能缺陷。它們沒有‘火力’摧毀癌癥或病毒感染細胞。我們思考的問題是,究竟耗竭T細胞代表的是一種不同類型的T細胞,還是它們只是功能性T細胞的‘昏睡’版?”
借助慢性感染小鼠模型,研究人員利用一種稱為ATAC-seq的新技術描繪了耗竭CD8+T細胞和功能性CD8+ T細胞的基因組調控區。結果發現,耗竭T細胞和功能性T細胞基因組這一區域的“景觀”從根本上是不同的。這表明,兩種類型的細胞使用不同的“路線圖”控制它們的基因活性。
改善CAR-T療法
隨后,研究人員測試了,是否刪除(借助“魔剪”CRISPR/Cas9技術)一段刺激PD-1產生的調控區,會降低這一蛋白的表達。結果證明,答案是肯定的。研究者們認為,這一研究結果有望為改善CAR-T療法提供可能。
CAR-T技術目前的一個不足是,回輸到患者體內后,T細胞傾向于變成“耗竭”狀態。結合這一研究,科學家們在設計CAR-T細胞時,還可以刪除導致PD-1或其它“耗竭基因”過度表達的遺傳線路(genetic wiring)。這一改進有望讓CAR-T更加積極的、持久的攻擊腫瘤。
同日另一篇Science
同日,發表在Science雜志上另一篇題為“Epigenetic stability of exhausted T cells limits durability of reinvigoration by PD-1 blockade”的論文中,來自賓夕法尼亞大學、Dana-Farber癌癥研究所、哈佛醫學院等機構的科學家們調查了阻斷PD-1檢查點能否重塑(rewired)“耗竭”T細胞,使它們從表觀遺傳學的角度,更像功能性T細胞。結果發現,雖然功能獲得(gain of function)確實短暫發生了,但表觀遺傳學方面很大程度上是未改變的。
Haining認為,這表明,檢查點阻斷所帶來的益處,是來自于“耗竭”T細胞的短暫復蘇,而不是它們狀態的永久性改變。“我們需要繪制耗竭T細胞和功能性T細胞調節區的綜合地圖。這將幫助T細胞成為更加有效的癌癥殺手。”他說。
8月2篇Nature重要研究成果
關注免疫療法的小編注意到,今年8月,Nature雜志也在同一日發表了兩篇“耗竭”T細胞相關的重要成果。在題為“Defining CD8+ T cells that provide the proliferative burst after PD-1 therapy”的論文中,來自埃默里大學醫學院的科學家們發現,耗竭T細胞可以被分為兩組:一組在病毒感染的小鼠接受PD-1阻斷抗體治療后,能夠爆發式地增殖;另一組則缺乏這種增殖的能力。
研究人員還發現,一種叫做TCF1的基因對小鼠中PD-1響應T細胞(PD-1-responsive T cells)的產生和維護非常重要。PD-1響應T細胞具有與記憶T細胞或干細胞樣(stem-like)細胞相似的分子特征。此外,科學家們還對多個PD-1響應T細胞表面的共刺激分子和受體進行了分類,它們可能會成為藥物靶點。[詳細]
在另一篇題為“Follicular CXCR5-expressing CD8+ T cells curtail chronic viral infection”的論文中,中國科學家小組定義了一種新的CD8+T細胞亞群。研究證實,在慢性病毒感染期間,Id2/E2A軸驅動病毒特異性CD8 T細胞分化為不同的CXCR5+和CXCR5-亞群。
CXCR5-CD8+ T細胞位于T細胞區(T cell zone),受嚴重原位抑制性微環境的影響,表現出嚴重的耗竭(exhaustion)。相比之下,CXCR5+CD8+ T細胞會遷移到B細胞濾泡中。這一區域的抑制性微環境較弱,有效防止了這類細胞效應器功能的快速損失。考慮到慢性病毒感染和癌癥之間很大程度上共享了T細胞耗竭機制,這項研究可能為癌癥免疫療法帶來新的曙光。
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