中國BIGD躋身國際生物組學數據庫
測序技術的發展將生命科學領域帶入組學時代，海量的數據產出成為常態。組學是將基因、蛋白及代謝物等生物分子以整體為單位進行系統性的研究，基因組學、蛋白質組學和代謝物組學等相應產生。相較于此前以個體為單位的研究，組學最主要的特征就是大數據。隨著組學數據的產出，搭建組學數據庫，實現海量信息的存儲、整合及共享，成為一項重要任務。 目前，在國際上被認可的生物組學數據中心主要有美國的NCBI、歐洲的EBI及日本的DDBJ。要想在國際期刊發表論文，需要先將自己的原始數據提交到這三個官方指定的數據庫中。這種情況表面上有利于國際科學數據的資源整合與共享，實際上卻對中國的科學研究發展帶來了很大的影響：這不僅影響了數據提交時的效率，更重要的是在數據下載時還會遇到各種限制，中國的科學家始終不能做自己數據的主人。 中國的生物組學數據產量約占全球的40%，是數據產出大國，卻沒有一個能夠被國際認可的數據庫系統，不得不將自己寶貴的數據資源交給他人代管。 ......閱讀全文
成都生物所研究構建易變山羊草首個轉錄組數據庫
易變山羊草(2n=4x=28, UUSvSv, Ae. variabilis syn. Triticum peregrinum (Hack In J. Fraser) Marie & Hackel)是小麥的近緣物種，與小麥進行遠源雜交時可產生可育后代，是小麥育種改良的重要資源。人們除了從
首個近完整黃瓜基因組及多組學綜合數據庫發布
近日，中國農業科學院蔬菜花卉研究所葫蘆科蔬菜遺傳育種創新團隊在黃瓜基因組學方面取得重要進展，首次完成接近完整的黃瓜參考基因組組裝和基因注釋，搭建了第一個黃瓜多組學綜合數據庫。相關研究成果發表在《分子植物》（Molecular Plant）上。 黃瓜是葫蘆科的重要經濟蔬菜作物。黃瓜基因組中有近3
首個近完整黃瓜基因組及多組學綜合數據庫發布
近日，中國農業科學院蔬菜花卉研究所葫蘆科蔬菜遺傳育種創新團隊在黃瓜基因組學方面取得重要進展，首次完成接近完整的黃瓜參考基因組組裝和基因注釋，搭建了第一個黃瓜多組學綜合數據庫。相關研究成果發表在《分子植物》（Molecular Plant）上。黃瓜參考基因組“9930”和核心種質資源。中國農科院蔬菜所
布魯克US－HUPO會議最新發布|－4D免疫肽組學、4D糖組學、血蛋白組學、實時數據庫檢索重大升級
· Novor V2.0軟件采用了一種針對HLA肽段優化的先進機器學習算法，能從從頭測序的多肽中發掘免疫肽段信息，并進一步提升鑒定水平 · TwinScapeTM結合iRTTM標準多肽的數字化監測技術智能反饋功能確保 timsTOF最高性能 – 遠遠超出“正常運行時間” · 新型glyco-
首個近完整黃瓜參考基因組及多組學綜合數據庫發布
近日，中國農業科學院蔬菜花卉研究所葫蘆科蔬菜遺傳育種創新團隊在黃瓜基因組學方面取得重要進展，首次完成接近完整的黃瓜參考基因組組裝和基因注釋，搭建了第一個黃瓜多組學綜合數據庫。相關研究成果發表在《分子植物（Molecular Plant）》（IF5 year = 21.4）上。黃瓜（Cucumis s
2025蛋白質組學大會之模式生物蛋白質組
2025年10月13日14:00-16:00，模式生物蛋白質組分論壇成功舉辦。論壇云集圣保羅大學、中國科學院昆明動物研究所、國家蛋白質科學中心（北京）、中國科學院大連化學物理研究所、湖南師范大學、東北林業大學、南方海洋科學與工程廣東省實驗室（廣州）、湖北工業大學等10余家國內外高校及科研機構的頂尖專
“系統生物學與遺傳組學”研討會在京開幕
3月31日，由中國科學院和德國拜耳作物集團共同主辦的“系統生物學與遺傳組學”研討會在京開幕。中國科學院副院長李家洋出席開幕式并致辭。 李家洋首先代表中科院對研討會的順利召開表示了祝賀。李家洋回顧了中科院與拜耳集團自2001年簽署雙邊框架協議以來的合作歷程和成果，并表示中科院愿意將
中國人群首個急性髓系白血病組學全景數據庫問世
中國科學院上海藥物研究所研究員李佳團隊、譚敏佳團隊、周宇波團隊及海軍軍醫大學第一附屬醫院血液內科主任醫師楊建民團隊，對101名中國急性髓系白血病（AML）患者來源的樣本進行了全面的多組學分析，提供了中國人群的首個基因組、轉錄組、蛋白質組、磷酸化蛋白質組與體外藥敏數據的AML組學全景數據庫，并整合
聯川生物與布魯克深入交流，共同推進蛋白質組學和代謝組學快速發展
2025年8月14日杭州，杭州聯川生物技術股份有限公司（以下簡稱“聯川生物”）與布魯克公司（以下簡稱“布魯克”）在聯川生物進行交流和洽談深入合作。 聯川生物作為多組學科研服務行的領軍企業，近年來以其高質量的組學數據為發展的驅動力，在組學科研服務業務快速增長。布魯克以持續開發領先的分析技術為使命
與轉錄組學和蛋白組學比較，代謝組學有何優點
那年夏天Forever與轉錄組學和蛋白組學比較,代謝組學有以下優點：①代謝組學放大了基因和蛋白表達的微小變化,從而使檢測更容易；②代謝組學的研究不需建立全基因組測序及大量表達序列 標簽(EST)的數據庫,且代謝產物的種類要遠小于基因和蛋白的數目.③ 由于給定的代謝產物在每個組織中都是一樣的,所以研究
“百萬微生態”計劃將構建全球最大人體微生物組數據庫
2019年10月26日，“百萬微生態”國際合作計劃（MMHP）在深圳第14屆國際基因組學大會（ICG-14）上正式啟動，來自中國、瑞典、丹麥、法國、拉托維亞等多國科學家將合作開展微生物宏基因組研究，致力于在未來三至五年內對100萬份來自腸道、口腔、皮膚、生殖道等器官的微生物組樣品進行測序分析，繪
首個免疫衰老多組學數據庫設立
記者12月17日從中國科學院基因組所（國家生物信息中心）了解到，該所研究員張維綺團隊、鮑一明團隊與中國科學院動物研究所研究員劉光慧、曲靜研究組合作，建立了免疫衰老領域首個多組學數據庫Immunosenescence Inventory，旨在為整合和分析與免疫衰老相關數據提供一體化平臺。隨著全球人口老
基因組學探究沙棘放線菌固氮生物學機制
沙棘是胡頹子科沙棘屬落葉性灌木，其根部與放線菌共生固氮，適應缺水少肥的華北及西北貧瘠地區，是防風固沙功臣；其果實富含維生素C及黃酮等活性物質，是健康飲品的原料供給者；具有重要的生態和經濟價值。 近日，《新植物學家》（New Phytologist）在線發表了來自中科院植物分子科學卓越創新中心
推進后基因組時代物理生物學探索
5月7日~8日，科學與技術前沿論壇在中科院學術會堂召開，此次論壇的主題為“后基因組時代的物理生物學”。歐陽鐘燦、郝柏林、陳潤生、歐陽頎等多名來自全國各大高校和科研院所的院士和學者出席了此次論壇，并發表了主題演講。 本次論壇召集人中科院院士楊玉良表示，上世紀末以來，生命科學獲得了飛速發展，積累了
研究指出基因組學引領生物育種變革
記者從近日舉行的第五屆國際農業基因組會議暨深圳國際食品谷研討會上獲悉，現代農業研究已邁入生物組學大數據時代，特別是基因組學及其衍生技術在生物育種中發揮著重要的引領作用。 基因組學是對生物體所有基因進行集體表征、定量研究及不同基因組比較研究的一門交叉生物學學科。基因組學主要研究基因組的結構、功能
北京基因組所開發表觀組關聯分析數據庫
近日，由中國科學院北京基因組研究所國家基因組科學數據中心開發的人類表觀組關聯分析數據庫EWAS Data Hub正式上線。該項研究成果以EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata 為題在國際學術期刊《核
基因組所完成開發RiceWiki數據庫
近日，中國科學院北京基因組研究所章張研究員課題組與北京理工大學、中國林業科學研究院及華中農業大學合作開發完成RiceWiki數據庫。該數據庫是基于維基百科的水稻基因信息平臺，是可編輯且內容公開的公眾注釋系統。研究成果在Nucleic Acids Research雜志發表。 水稻是人類重
研究開發表觀組關聯分析數據庫
近日，由中國科學院北京基因組研究所國家基因組科學數據中心開發的人類表觀組關聯分析數據庫EWAS Data Hub正式上線。該項研究成果以EWAS Data Hub： a resource of DNA methylation array data and metadata 為題在國際學術期刊《核
代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹
什么是代謝組學？代謝組學是用來解決什么問題的？ 代謝組學（Metabonomics/Metabolomics）是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科，是研究關于生物體被擾動后（如基因的改變或環境變化后）其代謝產物（內源性代謝物質）種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生
代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹
什么是代謝組學？代謝組學是用來解決什么問題的？? ? ? ?代謝組學（Metabonomics/Metabolomics）是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科，是研究關于生物體被擾動后（如基因的改變或環境變化后）其代謝產物（內源性代謝物質）種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生
代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹
什么是代謝組學？代謝組學是用來解決什么問題的？ 代謝組學（Metabonomics/Metabolomics）是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科，是研究關于生物體被擾動后（如基因的改變或環境變化后）其代謝產物（內源性代謝物質）種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生
代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹
什么是代謝組學？代謝組學是用來解決什么問題的？ 代謝組學（Metabonomics/Metabolomics）是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科，是研究關于生物體被擾動后（如基因的改變或環境變化后）其代謝產物（內源性代謝物質）種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生
肝臟生物學中單細胞和空間組學技術的成果與挑戰
近期，中國科學院上海營養與健康研究所李虹研究組在《肝臟病學雜志》（Journal of Hepatology）上，發表了題為Single-cell and spatially resolved transcriptomics for liver biology的綜述文章。該文章闡述了前沿的單細胞
基因組學：將數字信息轉化為生物學功能
優勢 ·????? 同時檢測克隆和定量熒光標記---使用表現型篩選克隆 ? ·????? 從加樣、涂布到挑取完全自動化工作流程 ? ·????? 從樣品涂布到挑取、復制和重排記錄并追蹤樣品數據 ? ·????? 每天準確挑取超過30000個篩選到的克隆，效率>98% ? 美國能源部聯合基因組研究所（
全基因組測序的竹亞科及生物學性狀的比較基因組學研究
禾本科（禾草）是被子植物最大科之一，約有12000種，是水稻、小麥、玉米等人類糧食和牲畜飼料的主要來源，也為人類提供了加工淀粉、制糖、釀酒、造紙、編織和建筑等方面的重要原料。同時，禾本科又是植物遺傳學和基因組學研究的模式類群。竹亞科（竹子）是禾本科的12個亞科之一，與早熟禾亞科、稻亞科組成BOP
北京基因組所發布表觀基因組數據庫MethBank－3.0
中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0，并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題，在線發表在Nucleic Acids Rese
北京基因組所發布表觀基因組數據庫MethBank－3.0
中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0，并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題，在線發表在Nucleic Acids Rese
PNAS打開基因組生物學的黑盒子
最近，美國佛羅里達州立大學、貝勒醫學院和哈佛大學-麻省理工學院Broad研究所的科學家們，開辟了人類遺傳學中一個鮮為人知的領域。相關研究結果發表在7月18日的《PNAS》雜志。 在這項研究中，研究人員表明，一條不活躍的X染色體上的一段不尋常的DNA重復序列，實際上對于這種女性特有的遺傳現象的整
《PLoS生物學》：老鼠全基因組測序圖公布
最新一期的開放存取的《公共科學圖書館·生物學》(PLoS Biology)雜志上，美國、英國和瑞典的研究人員公布了老鼠的全基因組測序圖。老鼠成為繼人類之后第二個完成全基因組測序的哺乳動物。 在對人類和老鼠的基因測序圖進行綜合性比較后，研究人員發現兩者之間的遺傳差異要比人們預想的大得多。老鼠
如何通過代謝組學發現新的生物標志物
重癥肌無力(Myasthenia gravis，MG)是一種慢性的、讓人逐漸疲乏無力的自體免疫疾病，臨床上表現為隨意肌的受累。如果不加以治療，重癥肌無力的癥狀會加重甚至導致死亡。目前，對于重癥肌無力還沒有發現較穩定的生物標志物。因此，迫切需要一種新的診斷方法和生物標志物來提高重癥肌無力的診斷和治