全基因組測序的竹亞科及生物學性狀的比較基因組學研究
禾本科（禾草）是被子植物最大科之一，約有12000種，是水稻、小麥、玉米等人類糧食和牲畜飼料的主要來源，也為人類提供了加工淀粉、制糖、釀酒、造紙、編織和建筑等方面的重要原料。同時，禾本科又是植物遺傳學和基因組學研究的模式類群。竹亞科（竹子）是禾本科的12個亞科之一，與早熟禾亞科、稻亞科組成BOP支系，是該科適應森林生境的一個主要分支。竹類植物多數種類植株高大、生長迅速，營養生長周期長達幾十年，最長可達120年，且開花后即成片死亡。竹子作為“木質化的禾草”（woody grass）和獨特開花性狀而備受關注，但由于研究難度大，一直是禾本科研究的一個薄弱環節。竹亞科具有豐富的物種多樣性，約有1500種，包括以染色體基數為12、不同倍性的四個分支，即二倍體的草本竹類（2n=20-24）、四倍體的溫帶木本竹類（2n=46-48）、四倍體的新熱帶木本竹類（2n=40-48），以及六倍體的舊熱帶木本竹類(2n=70-72)。然而，木本竹類......閱讀全文
全基因組測序的竹亞科及生物學性狀的比較基因組學研究
禾本科（禾草）是被子植物最大科之一，約有12000種，是水稻、小麥、玉米等人類糧食和牲畜飼料的主要來源，也為人類提供了加工淀粉、制糖、釀酒、造紙、編織和建筑等方面的重要原料。同時，禾本科又是植物遺傳學和基因組學研究的模式類群。竹亞科（竹子）是禾本科的12個亞科之一，與早熟禾亞科、稻亞科組成BOP
解碼“基因組學之父”桑格：測序，測序，測序
“桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’，他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎，徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、 有一天，65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗，轉身走出實驗室，宣布自己正式退休。那一年是1983
－Science：宏基因組學測序技術
宏基因組學技術(Metagenomic approaches)正快速拓寬我們對微生物代謝能力(microbial metabolic potential)的認識。 長期以來，對微生物(microorganism)功能開展的研究主要依賴的都是以在實驗室里培養的單一物種(individua
昆明植物所完成六種木本竹子葉綠體基因組全序列的測定
竹亞科（Bambusoideae）隸屬于禾本科（Poaceae），全世界共分布有一千余種。木本竹子因種類數目多，形態性狀復雜多變及多年生一次性開花等原因而成為系統發育學研究難點。隨著新一代測序技術的興起，系統發育基因組學為解決這類困難類群的系統發育關系帶來了曙光。 中國科學院昆明植物研究所李德
宏基因組學技術測序木乃伊的肺結核基因組
來自華威大學的研究者使用宏基因組學技術發現215年之久的木乃伊的肺結核基因組。 由Mark Pallen帶領的研究團隊試圖用技術來發現組織學標本中的肺結核的DNA。 宏基因組學是一種從樣本中檢測DNA序列的技術，并且樣本不需要培養或擴增。這種方法避免了與細菌培養或DNA擴增
云南省禾本科種質資源與基因組學省創新團隊通過認定
6月6日，由云南省科技廳主持，邀請有關專家，對“中國科學院昆明植物研究所禾本科種質資源與基因組學省創新團隊”進行認定，經專家組認真審查有關認定資料，聽取了團隊帶頭人李德銖的工作匯報。 專家組認為，該創新團隊通過三年的實施培養，建立了有國際影響力的禾本科植物的比較功能基因組學與進化基因組學研
測序技術發展過快？基因組學千萬大獎告吹
X獎基金會近日決定取消了獎金高達1000萬美元的基因組學Archon X獎(Archon Genomics X Prize)，因為基因組測序成本的直線下降已使得競爭毫無意義。 X獎基金會的主席兼CEO Peter Diamandis在上周四宣布了關閉競賽的決定。他表示，這是因為如今
昆明植物所竹亞科青籬竹族的系統發育和進化研究獲進展
竹亞科青籬竹族 (Arundinarieae) 約有32屬600種，既包括了全球經濟價值最高的竹種如毛竹，也包括了箭竹、方竹、冷箭竹等國寶大熊貓賴以生存的主食竹種，分布于亞洲、非洲和北美溫帶和亞熱帶地區，東亞是該族的現代分布中心。青籬竹族具有多樣化的形態特征，比如，地下莖包括單軸型、合軸型和復軸
新一代測序將如何改變法醫基因組學
Bruce Budowle博士是北德克薩斯大學健康科學中心(UNTHSC)應用遺傳學研究所的執行主任。自2009年成立以來，該研究所集中了一大批致力于完善遺傳學方法的知名科學家，以增強幾個研究領域，包括法醫DNA。在UNTHSC的法醫科學項目(全美只有14個)
采用新一代測序法的宏基因組學研究
直到不久之前，宏基因組學研究還因為高費用、低流通量以及在應用Sanger-方法克隆步驟中出現的結果不準確而受到限制。而今借助于新一代序列測定方法即可獲得宏基因組樣品全面的圖像。宏基因組學研究（metagenomics）是指研究一種復雜微生物群體在其生命空間的全部基因信息。研究的主要目的在于刻畫
昆明植物所利用第二代測序儀測定鐵竹線粒體基因組
同動物的線粒體基因組相比，植物的線粒體基因組有著十分獨特的進化方式，如具有較大的基因組、極低的分子進化速率和相對較頻繁的基因組結構上的變異等特性。目前，植物線粒體基因組大都通過傳統的Sanger法進行測序，需要耗費大量的人力和物力，嚴重限制了植物線粒體基因組的測序，進而導致對其獨特進化方式的研究
三代測序的DNA提取和宏基因組學分析（二）
優勢與局限這種DNA提取方法已被優化用于從人類糞便樣本中提取高分子量(HMW)DNA，但也已在模擬微生物群落和細菌分離株上得到驗證。我們希望該方案可以適用于其他樣品類型，盡管可能需要對裂解前和裂解后步驟進行修改以解釋特定于樣品的制備和污染物清除的問題是必要的。機械裂解方法（如珠子擊打）仍然是連續裂解
三代測序的DNA提取和宏基因組學分析（一）
改進的人類腸道微生物組的高分子量DNA提取，納米孔測序和宏基因組學裝配Improved high-molecular-weight DNA extraction,nanopore sequencing and metagenomicassembly from the human gut microb
“葫蘆科作物功能基因組學”獲國家杰青基金資助
日前，國家自然科學基金委員會正式公布了2022年國家杰出青年科學基金資助立項，青島農業大學園藝學院教授張忠華“葫蘆科作物功能基因組學”項目獲國家自然科學基金杰出青年科學基金資助。這實現了青島農業大學自主培養國家級科技人才隊伍的重大突破。張忠華，現任青島農業大學園藝學院院長，國家杰出青年科學基金獲得者
基因組學分析揭示
英國《自然》雜志18日在線公開的一篇基因組學論文顯示，來自西伯利亞阿爾泰山脈東部尼安德特人的祖先，和現代人祖先的相遇與交融繁殖可能比原先認為的更早。已有證據顯示，尼安德特人在47000年到65000年前在非洲之外就向現代人貢獻了遺傳物質。這項新研究還顯示，大約在10萬年前，現代人和尼安德特人之間
橫斷山高山竹類的快速輻射演化和物種多樣性的形成機制
高山竹類是竹亞科青籬竹族（溫帶木本竹類）一個獨特的分支，包括箭竹屬（Fargesia）、玉山竹屬（Yushania）、筱竹屬（Thamnocalamus）、香竹屬（Chimonocalamus）、冷箭竹屬（Sarocalamus，即“alpine Bashania”），以及Bergbambos，
澳大利亞CSIRO機構與中科院將在植物基因組學進行合作
據GenomeWeb記者報道，2011年3月10日—澳大利亞聯邦科學與工業研究組織（CSIRO）今天宣布，將在下周與中科院共同探索在植物基因組研究上的合作計劃。 這項研究合作，將重點放在水稻和小麥農作物上。水稻和小麥將同玉米一并成為在世界上種植最廣泛的三大農作物；來自兩個研
昆明植物所揭示竹類植物生活史轉變和物種多樣化遺傳機制
多倍化或稱基因組加倍是植物演化史上的永恒主題，廣泛發生于被子植物（有花植物）的各個演化階段，特別是在與重要地史和氣候事件相關的演化節點上，并伴隨著整個被子植物和諸多大科大屬的興起。然而，在亞基因組水平上，關于多倍化如何促進植物適應性演化以及物種多樣性形成的認識仍然不足。現有研究集中在新近（五百萬年內
美印藥物基因組學與癌癥基因組學檢測商業化
美國Companiondx實驗室擬與健康信息技術服務商Enable Healthcare合作，向醫生推廣藥物基因組學檢測；印度癌癥醫學公司HCG宣布建立一個新的腫瘤基因中心，旨在下代測序技術能夠幫助定位腫瘤，從而提高化療和放療的效率和響應率 美國藥物基因組學檢測商業化 Companiondx實驗
臺風“山竹”“溫比亞”因過于“兇殘”被除名
記者2月27日從中國氣象局獲悉，正在召開的臺風委員會第51次會議上，臺風“山竹”“溫比亞”被正式除名。 據介紹，1997年在香港舉行的臺風委員會第30次會議決定，西北太平洋和南海的熱帶氣旋采用具有亞洲風格的名字命名，分別由世界氣象組織所屬亞太地區的柬埔寨、中國、朝鮮、中國香港、日本、老撾、中國
新的DNA測序技術將促進對基因結構和功能的探索
今天在此間開幕的“二00七年國際基因組學大會”透露，新近問世的DNA測序法已經在基因組研究中得到了廣泛的應用，使基因表達的精確度達到數字化,揭示了染色質組蛋白的新功能。?? 全世界二百多位專家學者，在為期四天的會上將交流新近問世的DNA測序技術的最新進展，探討基因組學和基因測序技術在生命科學研究
Science專題：癌癥基因組學
在2001年完成人類基因組測序后，許多的研究人員立即將目光放到了利用這些信息來更好地了解遺傳學上。最近，越來越多的研究確定了表觀遺傳學在癌癥的發生、形成及發展過程中起效應。從鑒別與遺傳性癌癥相關的單基因變異的前基因組時代轉向，測序技術的進步使得研究人員能夠利用全基因組方法來檢測基因組間的差異，以
毒理基因組學的定義
毒理基因組學(toxicogenomics)是從多基因、全基因組水平研究毒物作用與基因表達的相互影響。其研究內容主要包括3個方面:促進環境應激原與疾病易感性關系的理解、闡明毒性分子機制、篩選和確認與疾病和毒物暴露相關的生物標志物(biomarkers)。
藥物基因組學的定義
藥物基因組學(pharmacogenomics),又稱基因組藥物學或基因組藥理學,是藥理學的一個分支,定義為在基因組學的基礎上,通過將基因表達或單核苷酸的多態性與藥物的療效或毒性聯系起來,研究藥物如何由于遺傳變異而產生不同的作用。
華大智造宣布超高通量基因測序儀落地南澳基因組學中心
2023年4月27日，華大智造宣布超高通量基因測序儀DNBSEQ-T7落地南澳基因組學中心（SAGC），該中心將基于DNBSEQ-T7測序平臺開展各項科學研究，助力全面推動澳大利亞基因組學研究發展和成果轉化。??南澳基因組學中心成立于2020年7月，是國際領先的基因組學中心之一，致力于支持整個澳洲及
Oxford－Nanopore便攜式高通量測序儀，打開基因組學新市場
Oxford Nanopore Technologies（“Oxford Nanopore”）推出PromethION 2（“P2”）Solo測序儀，這是全球可及性最高的高通量測序設備，有可能大大提高針對人類遺傳學和其他更大數據集的準確、快速和負擔得起的測序的可及性。 P2 Solo是市場上唯
基因組測序
如果樓主指的是人類基因組計劃，那時用的方法叫做雙脫氧終止法，也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中，DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸）來作為原料，但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的，但與普通PCR不同，它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的
基因組所參加國際基因組ENCODE計劃取得系列研究成果
? 近日，國際科學界宣布“DNA元素百科全書”(簡稱ENCODE)計劃獲得了迄今最詳細的人類基因組分析數據，并以30余篇論文的形式同時發表在Nature、Science、Genome Research、Genome Biology等一系列高水平的SCI學術期刊上。ENCODE被認為是繼“人類基
科學家揭示木本竹類獨特性狀演化之謎
“竹子開花，立馬搬家”——我國一些地區傳言，竹子開花之后不就后死亡，預示著壞事發生。從科學的角度來看，傳言不攻自破。竹子分為木本竹類和草本竹類，只有木本竹類開花后死亡。木本竹類莖稈高大，木質化程度高、營養生長幾十甚至上百年，最長的可達120年，之后才開花死亡。相比之下，草本竹類一般僅幾十厘米高，木質
Verogen基于NGS新一代測序技術的法醫基因組學解決方案...
Verogen基于NGS新一代測序技術的法醫基因組學解決方案的應用NGS新一代測序技術VS傳統CE測序技術在過去的30年中，法醫DNA檢測一直依賴于CE毛細管電泳測序技術進行片段長度多態性的檢測。然而CE測序技術具有檢測位點少、樣品消耗量大、不能檢測線粒體DNA等缺點，當DNA樣本量有限時，法醫分析