產研結合的典范：苦味素從科學發現到產業轉化之路
《韓非子·外儲說左上》有云 ：“夫良藥苦于口，而智者勸而飲之，知其入而已己疾也”，良藥苦口由此而來。最近，國內研究團隊揭開了這類“苦口良藥”的神秘面紗，成果相繼發表在Nature Genetics（2013）、Science（2014）和Nature Plants（2016）等國際知名學術期刊上。研究者通過研究黃瓜發現：黃瓜苦味正是由三萜化合物葫蘆素C導致的，葫蘆素是一類高度氧化的四環三萜化合物，僅在葫蘆科植物中（黃瓜、西瓜和甜瓜等）發現，苦是這類化合物最顯著的特點，因此，葫蘆素也叫苦味素。極低量的葫蘆素（0.1 mg/L）就能引起明顯的苦味，比典型的苦味劑咖啡因還要苦100倍左右。圖1.苦味素的來源-黃瓜 苦味素的發現對黃瓜育種和抗腫瘤藥物開發具有重大的意義。植物的生長面對各種外界生物脅迫和非生物脅迫，極苦的苦味素是最佳的防御武器，可用來抵御病蟲害的侵入。因此，苦味素是保護植物的 “綠色農藥”。科學家通過黃瓜功能基因組研......閱讀全文
全基因組及轉錄組測序案例分析
案例：應用全基因組測序和 RNA 測序來描繪常見的變異型免疫缺陷綜合癥（CVIDs）的基因圖譜 背景：常見的變異型免疫缺陷綜合癥（CVIDs）是機體免疫應答反應中不能產生抗體的最主要原因。CVIDs 變異度很高，大概 5% 的病人是由基因改變引起的。 目的：利用 Illumina HiSeq25
蛋白質組學不能被基因組和轉錄組取代
基因和蛋白并不存在嚴格的線性關系ORF并不預示一定存在相應的功能性基因mRNA水平并非與蛋白質的表達水平對應翻譯后修飾及同工蛋白質（isforms)等現象在基因水平無從表現
基因組所發布全轉錄組關聯研究知識庫
近日，中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）國家基因組科學數據中心（NGDC）開發的全轉錄組關聯研究知識庫正式上線。該研究成果以“TWAS Atlas: a curated knowledgebase of transcriptome-wide association studies”為題在
與轉錄組學和蛋白組學比較，代謝組學有何優點
那年夏天Forever與轉錄組學和蛋白組學比較,代謝組學有以下優點：①代謝組學放大了基因和蛋白表達的微小變化,從而使檢測更容易；②代謝組學的研究不需建立全基因組測序及大量表達序列 標簽(EST)的數據庫,且代謝產物的種類要遠小于基因和蛋白的數目.③ 由于給定的代謝產物在每個組織中都是一樣的,所以研究
轉錄組測序和全轉錄組測序的區別
全轉錄組廣義上是指細胞在特定狀態下所能轉錄出來的?所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA?。借助高通量測序技術，可以全面獲取樣本中轉錄產物信息，結合競爭性內源RNA ( ceRNA)機制， 進行聯合分析，深入挖掘轉錄水平調控網絡。轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有
產研結合的典范：苦味素從科學發現到產業轉化之路
《韓非子·外儲說左上》有云 ：“夫良藥苦于口，而智者勸而飲之，知其入而已己疾也”，良藥苦口由此而來。最近，國內研究團隊揭開了這類“苦口良藥”的神秘面紗，成果相繼發表在Nature Genetics（2013）、Science（2014）和Nature Plants（2016）等國際知名學術期刊上
Nature子刊發布重磅測序技術：基因組和轉錄組平行測序
四月二十七日的Nature Methods雜志上發布了一項引人注目的測序技術，G&T-seq（Genome and Transcriptome Sequencing）。該技術能夠實現大規模的DNA和RNA平行測序，同時展現單個細胞的基因組序列和基因活性。 研究人員用G&T-seq對220個小鼠
基因組所等RNA甲基化表觀轉錄組學研究獲進展
2014年1月，中國科學院北京基因組研究所基因組變異與精準生物醫學實驗室“百人計劃”研究員楊運桂研究組，與中國科學院動物研究所“百人計劃”研究員劉峰研究組合作開展的“m6A甲基轉移酶復合物鑒定”研究，發現了WTAP(wilms'tumour 1-associating protein)
轉錄組測序原理
而轉錄組測序即是利用高通量測序技術，將細胞或組織中的全部或部分mRNA, miRNA, lnc RNA 進行測序分析的技術。通過RNA-seq，也就是轉錄組測序，可以幫助我們了解各種比較條件下所有基因的表達差異包括：正常組織與腫瘤組織；藥物治療前后的表達差異；發育過程中，不同發育階段，不同組織的表達
－Cell特輯：從基因組到代謝組學——癌癥標記物的進展
“Cell Press Selections”是由Cell出版社推出的一份推薦文章集合手冊，主要介紹某個生命科學研究領域最新的進展及突出成果。相關特輯內容包括研究論文，評論性文章以及snapshots，涉及了同一領域的方方面面，更為重要的是這些文章由贊助商贊助，可以免費獲取。 癌癥生物標記物是
Nature－Genetics：基因組其實是這樣轉錄的
在人類基因組中大約儲存著兩萬個基因和數千個調控元件。基因編碼蛋白質合成的信息，其他基因組元件負責調節基因活性和執行其他功能。所有這些DNA編碼信息都需要被復雜的分子機器讀取，并轉換為細胞能使用的信息。 人們一般認為，讀取基因就和讀一個語句差不多。讀取機器被多種序列引導到基因的起始位置，然后從左
RNA測序技術如何繪制全基因組轉錄終止？
近日，南方科技大學生命科學學院翟繼先團隊利用納米孔單分子RNA測序技術繪制了擬南芥全基因組水平轉錄終止圖譜。該方法能同時捕獲包括已轉錄過polyA位點的 readthrough轉錄本、完成3’末端切割的5’或3’切割產物、以及已完成或正在進行多腺苷酸化（polyadenylation）的轉錄本在
類轉錄化學藥物誘導型基因組編輯和轉錄激活系統
生物學變化多受到高度動態的分子事件調控，為了更精確的理解并研究這些過程，應用條件性可誘導的技術手段是十分必要的。此前，得到廣泛應用的藥物誘導技術之一是通過配體結合激發雌激素受體蛋白（ER）從細胞質到細胞核的轉運。在沒有激素配體的情況下，ER與熱激蛋白（hsp90）結合定位于細胞質中；一旦與配體結
代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹
什么是代謝組學？代謝組學是用來解決什么問題的？ 代謝組學（Metabonomics/Metabolomics）是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科，是研究關于生物體被擾動后（如基因的改變或環境變化后）其代謝產物（內源性代謝物質）種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生
代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹
什么是代謝組學？代謝組學是用來解決什么問題的？ 代謝組學（Metabonomics/Metabolomics）是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科，是研究關于生物體被擾動后（如基因的改變或環境變化后）其代謝產物（內源性代謝物質）種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生
代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹
什么是代謝組學？代謝組學是用來解決什么問題的？ 代謝組學（Metabonomics/Metabolomics）是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科，是研究關于生物體被擾動后（如基因的改變或環境變化后）其代謝產物（內源性代謝物質）種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生
代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹
什么是代謝組學？代謝組學是用來解決什么問題的？? ? ? ?代謝組學（Metabonomics/Metabolomics）是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科，是研究關于生物體被擾動后（如基因的改變或環境變化后）其代謝產物（內源性代謝物質）種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生
植物葉綠體基因組可以全部轉錄的新機制
葉綠體是地球上綠色植物把光能轉化為化學能、供給地球上的其它生物能量來源的重要細胞器，對葉綠體的功能和葉綠體基因組轉錄機制的研究一直以來是全球細胞生物學家、遺傳學家和分子生物學家孜孜以求的研究熱點。中國科學院昆明植物研究所研究員高立志帶領的研究團隊，歷時五年，通過對三種高等植物（水稻、玉米和擬南芥
誰在先？“雞基因組”和“雞蛋基因組”
是先有雞還是先有雞蛋？這個問題相當惱人，恐怕很難說清楚。現在，研究人員回答了與這個問題一樣惱人的問題：是人類基因組中的成千上萬的長重復DNA片段中，那個是第一個產生的？那些被復制了？ 這個答案發表在10月7日的《自然·遺傳學》雜志上。該研究給出了人類基因組中DNA重復片段復制的第一個進化證據，這種
轉錄物組的定義
轉錄組也稱“轉錄物組”。是一個基因組轉錄的所有RNA。
轉錄組高通量測序
（第二代高通量測序技術-454） 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下，其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titaniu
轉錄物組的定義
轉錄組也稱“轉錄物組”。是一個基因組轉錄的所有RNA。
轉錄組測序流程步驟
以真核轉錄組測序為例，實驗流程為總RNA提取-mRNA分離-建庫試劑-定量-文庫回收-橋式擴增-上機測序；項目分析流程為數據產出數據=數據去雜-轉錄組拼接-SSR分析及SNP分析-基因功能注釋-基因表達差異分析-差異基因表達模式聚類-差異基因富集分析。
轉錄組高通量測序
（第二代高通量測序技術-454） 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下，其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titaniu
轉錄組高通量測序
（第二代高通量測序技術-454） 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下，其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titaniu
轉錄組高通量測序
（第二代高通量測序技術-454） 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下，其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titanium第二代
“基因組規模系統代謝育種”項目取得重要進展
微生物制造技術在降低環境污染、促進可再生資源替代化石資源方面有著良好的發展前景。而我國微生物制造產業水平與國際差距明顯，主要原因在于工業菌種水平低下，某些重要的氨基酸、化工醇等產品長期依賴進口。發展微生物的基因組規模系統代謝育種技術改造工業菌種，是加速我國工業菌種性能提升的重要前提。 由安徽
千年基因總部助力韓國人胃癌基因組及轉錄組研究
千年基因總部Macrogen助力研究者完成了韓國人胃癌基因組及轉錄組微衛星突變的研究，該研究的基因組和轉錄組測序于Macrogen通過ISO9001 & ISO13485 & CLIA認證的國際最高質量標準的大型基因組學實驗室完成，研究成果于6月4日發表于Genome Research。
代謝組服務介紹??
代謝組學是繼基因組學和蛋白質組學之后新近發展起來的一門學科，是系統生物學的重要組成部分。基因組學和蛋白質組學分別從基因和蛋白質層面探尋生命的活動，而實際上細胞內許多生命活動是與代謝物相關的，如細胞信號（cell signaling）、能量傳遞等都是受代謝物調控的。代謝組學正是研究代謝物——在某一
空間轉錄組和單細胞轉錄組測序聯合應用的典型案例
單細胞轉錄組測序技術的如火如荼，伴隨著空間轉錄組測序技術的蓬勃發展，可以看到，在現有的高通量檢測技術領域，這兩種技術已為科學研究的發展提供了前所未有的技術支撐。從2019年單細胞多組學被評為《Nature Methods》年度技術進展，到2020年空間轉錄組技術也被評為年度技術進展，相信在接