微生物組大數據搜索引擎入選中國醫藥生物技術十大進展
目前，中科院青島生物能源與過程研究所研發的“微生物組大數據搜索引擎”（Microbiome Search Engine； MSE）入選“2016年中國醫藥生物技術十大進展”。 微生物組（又稱“菌群”）在人體中與生俱來，與人體健康息息相關。因此，對海量微生物組“大數據”的搜索與挖掘，有助于認識微生物組與疾病或生態災害的關系，從而服務于生態系統的精準健康、精準護理與精準營養。 MSE首先建立了針對元基因組數據的超高速比對算法和數字索引機制，通過機器學習等手段,自動建立基于菌群的疾病與生態災害的診斷與預測模型,從而計算“微生物組診斷與預警指數”，以判別菌群針對特定疾病的狀態和風險。青島生物能源所通過國際科技合作，借助MSE在世界上率先建立了基于人體共生菌群的口腔健康風險評估體系。目前正通過全國和國際范圍內的口腔菌群大數據分析，系統考察人種、年齡、地域、生活習慣等因素對于這一健康風險評估體系的影響。MSE正通過“生物高通量......閱讀全文
全球微生物組大數據搜索引擎上線
日前，中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞研究中心正式發布首個微生物組大數據搜索引擎——MSE（Microbiome Search Engine； http://mse.single-cell.cn），使得以整個微生物組為分析單元的智能搜索和大數據挖掘成為現實。 微生物組，又稱“菌群”。
微生物組大數據搜索引擎入選中國醫藥生物技術十大進展
目前，中科院青島生物能源與過程研究所研發的“微生物組大數據搜索引擎”（Microbiome Search Engine； MSE）入選“2016年中國醫藥生物技術十大進展”。 微生物組（又稱“菌群”）在人體中與生俱來，與人體健康息息相關。因此，對海量微生物組“大數據”的搜索與挖掘，有助于認
微生物所發表中國微生物組數據平臺
10月26日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在線發表中國科學院微生物研究所微生物資源與大數據中心、世界微生物數據中心馬俊才團隊題為gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the ar
全球最大的海洋微生物組數據庫建立
9月4日，《自然》在線發表中外科學家的合作成果，該成果建立了全球最大的海洋微生物組數據庫，從中發掘塑料降解酶、基因編輯工具、抗菌肽等重要基因資源。山東大學微生物技術國家重點實驗室教授李盛英為文章共同通訊作者，助理研究員劉琨為文章共同第一作者。 微生物已在生物制造、生物醫藥、生物農業、環境治理等
全球最大的海洋微生物組數據庫建立
9月4日，《自然》在線發表中外科學家的合作成果，該成果建立了全球最大的海洋微生物組數據庫，從中發掘塑料降解酶、基因編輯工具、抗菌肽等重要基因資源。山東大學微生物技術國家重點實驗室教授李盛英為文章共同通訊作者，助理研究員劉琨為文章共同第一作者。該成果在《自然》報道? ?山東大學供圖微生物已在生物制造、
LHC物理學家用數據搜索粒子
世界上最強大的粒子對撞機還沒有發現新的物理學成果，現在一些物理學家正在轉向另一種策略。 一種曾經備受爭議的粒子物理學方法已經進入了大型強子對撞機（LHC）的主流隊伍。目前，LHC主要的ATLAS實驗已經正式支持這種方法—— 一種通過機器創建的進行大量數據搜索的替代方法，作為其探測超越粒子物理標
基于微生物組大數據的疾病檢測方法來了
微生物組具有服務疾病診治與生態監控的巨大潛力，但是其影響因素錯綜復雜。如何通過菌群檢測實現快速精準的疾病診斷呢？中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞中心發明了基于菌群大數據搜索的疾病檢測方法，為此共性問題提供了原創的解決方案。該工作于3月17日在線發表于mSystems（美國微生物學會會刊）
微生物組測序分析的一大問題
BMC Biology雜志上的一項研究指出，許多已發表的微生物組研究其實受到了污染，錯誤的報告了來自于環境的雜菌。研究人員認為，在臨床樣本中檢測到出人意料的細菌時，不應過早將其于疾病聯系在一起。 我們機體內生活著不計其數的微生物，它們組成的生態系統就是微生物組。微生物組參與了許多重要的機體功能
研究開發基于菌群大數據搜索的新疾病檢測方法
基于菌群大數據搜索引擎實現疾病檢測的原理 微生物組具有服務疾病診治與生態監控的巨大潛力，但是其影響因素錯綜復雜。如何通過菌群檢測實現快速精準的疾病診斷呢？中科院青島生物能源與過程研究所單細胞中心發明了基于菌群大數據搜索的疾病檢測方法，為此共性問題提供了原創解決方案。該研究成果近日在線發表于《美國微
生物信息學數據庫和軟件的搜索實驗
實驗方法原理熟練掌握上網搜索生物信息學數據庫和軟件的方法及技能。實驗材料電腦實驗步驟一、搜索生物信息學數據庫或者軟件數據庫是生物信息學的主要內容，各種數據庫幾乎覆蓋了生命科學的各個領域。核酸序列數據庫有GenBank，?EMBL，?DDB等，蛋白質序列數據庫有SWISS-PROT，?PIR，OWL，
青島能源所微生物組大數據分析工具開發獲進展
元基因組是當前微生物組大數據最主要的存在形式之一。由于元基因組數據的復雜性、異質性以及指數級增長的體量，從中深度且快速發掘微生物群落結構和功能上的變化規律，一直是業界的一個重要技術瓶頸。近日，中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞研究中心發表了元基因組高性能計算分析軟件Parallel-MET
華大參與：復雜宏基因組數據的新分析法
當前分析宏基因組數據的大多數方法，都依賴于與參考基因組的對比，但是許多環境中的微生物多樣性遠遠超過了參考數據庫所覆蓋的范圍。將復雜的宏基因組數據從頭劃分為特定的生物學實體（如特定的菌株或病毒），在很大程度上仍然是一個未解決的問題。 在2014年7月6日的《Nature Biotechnolog
使用NIST庫搜索Xevo－TQGC系統數據以鑒定分析物
目的：證明Xevo? TQ-GC系統生成的EI譜圖可以與 NIST標準數據庫v17中對應的譜圖進行很好的 匹配。 背景：EI GC-MS是一種用于未知物分析的成熟技 術。尤其是EI的特性之一能夠可重現地生成 豐富的特征碎裂模式，這對于成功使用EI數 據鑒定未知化合物十分重要。由于EI碎
使用NIST庫搜索Xevo－TQGC系統數據以鑒定分析物
目的：證明Xevo? TQ-GC系統生成的EI譜圖可以與 NIST標準數據庫v17中對應的譜圖進行很好的 匹配。 背景：EI GC-MS是一種用于未知物分析的成熟技 術。尤其是EI的特性之一能夠可重現地生成 豐富的特征碎裂模式，這對于成功使用EI數 據鑒定未知化合物十分重要。由于EI碎
蘇曉泉團隊開發出基于微生物組大數據的疾病檢測方法
微生物組具有服務疾病診治與生態監控的巨大潛力，但是其影響因素錯綜復雜。如何通過菌群檢測實現快速精準的疾病診斷呢？中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞中心發明了基于菌群大數據搜索的疾病檢測方法，為此共性問題提供了原創的解決方案。該工作于3月17日在線發表于mSystems（美國微生物學會會刊）
“百萬微生態”計劃將構建全球最大人體微生物組數據庫
2019年10月26日，“百萬微生態”國際合作計劃（MMHP）在深圳第14屆國際基因組學大會（ICG-14）上正式啟動，來自中國、瑞典、丹麥、法國、拉托維亞等多國科學家將合作開展微生物宏基因組研究，致力于在未來三至五年內對100萬份來自腸道、口腔、皮膚、生殖道等器官的微生物組樣品進行測序分析，繪
數據標注優秀案例集之四十七－|－云藏搜索引擎藏文信息處理數據標注
云藏搜索引擎藏文信息處理數據標注 申報單位：海南藏族自治州藏文信息技術研究中心 推薦單位：青海省數據局 一、案例簡介 藏文信息處理面臨語言結構復雜、標注標準缺失、數字化資源不足等問題。本案例通過系統化數據標注技術，構建高質量藏文語料庫，賦能藏文信息化行業，推動藏文自然語言處理技術的進步和實用
Nature：藥物對腸道微生物組的影響比人們想象的要大
我們是生活在地球上用藥最多的幾代人之一。2型糖尿病、肥胖和冠狀動脈疾病等心臟代謝性疾病的發病率持續上升，并共同構成了全世界最高的死亡原因。受影響的人往往不得不連續數月甚至數年每天服用多種藥物。 如今，在一項新的研究中，位于德國海德堡的歐洲分子生物學實驗室（EMBL）的Peer Bork團隊與一
青島能源所提出“微生物組影響指數”
微生物組是微生物在自然界的存在形式，與人體、空氣、土壤與海洋的健康息息相關。因此，微生物組科學與產業已經成為國際科技合作與競爭的“戰略高地”。然而，大數據挖掘工具的匱乏，阻礙著微生物組研究從“數據分析”向“數據科學”的跨越。2010年，來自43個國家的500多名研究人員聯合啟動了“地球微生物組計
融智生物發布全球首個商用化生物組學微生物質譜數據庫
近日，融智生物宣布建設完成基于全新生物組學理念的微生物質譜數據庫。這是全球首次發布商品化生物組學微生物質譜數據庫。 傳統上，基于不同的細菌或真菌內蛋白組成分特別是核糖體蛋白有顯著的差異，對核糖體蛋白組的質譜測試，可用于快速、高準確度鑒定微生物。基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜（MALDI-TO
【限時促銷】百科網“搜索”煥新顏－廣告大促前20名
親愛的家人們：客戶的每一次搜索都代表了一個需求，來到分析測試百科網的客戶，就更是您鎖定的精準目標。今日，搜索已不再僅是鎖定目標，豐富的形式更賦予它對品牌力的完美展現。更精準，變幻形式，更多鏈接，彰顯品牌實力，分析測試百科網“搜索”頻道換新顏，快來看看有哪些功能特性？1. 可維護的廣告內容多，鏈接多，
李小兵教授：微生物組學是影響未來的三大科技之一
近日，由中國廣告主協會標準與認證咨詢專業委員會承辦，多家行業研究機構協辦的2019年中國廣告主大會“標準與認證服務發展論壇”在杭州舉行。國家工程實驗室教授、黔酸寶生物實驗室主任李小兵 國家工程實驗室教授、黔酸寶生物實驗室主任李小兵出席論壇，并發表“標準與認證是中國大健康產業發展的基石”主題演講
百度、360搜索大戰升級－搜索引擎市場或變局
?? 8月中旬，周鴻祎宣布推出綜合搜索業務后，搜索引擎市場領頭羊百度的“太平”日子即將終結。 28日晚，百度低調反擊360，趁夜“圍堵”其搜索業務。昨天下午4點多，奇虎360發聲明稱要建設一個安全、干凈、有效競爭的互聯網搜索市場。百度有關負責人接
世界微生物數據中心落戶微生物所
在近日召開的第12屆國際菌種保藏大會上，經過大會專家委員會評審并經世界菌種保藏聯合會理事會審議通過，中國科學院微生物研究所在眾多的競爭者中脫穎而出，成為世界微生物數據中心（World Data Center for Microorganisms, WDCM）新的主持單位。 W
碳衛星獲取首組觀測數據
記者2月23日從中科院獲悉：中國首顆全球二氧化碳監測科學實驗衛星（簡稱“碳衛星”）已成功獲取首批觀測數據。 碳衛星于2016年12月22日在酒泉衛星發射中心成功發射入軌。經過平臺測試、載荷加熱排污等一系列工作后，有效載荷于今年1月12日成功開機，13日轉入在軌觀測任務模式并獲取首批觀測數據。
研究構建綿羊和山羊腸道高質量微生物基因組數據庫
近日，西北農林科技大學羊遺傳改良與生物育種團隊攜手國內外多家科研機構，在綿羊和山羊腸道微生物基因組數據庫構建及腸道粘蛋白和多糖代謝功能菌種挖掘方面取得進展，研究成果發表在Microbiome上。研究團隊在全國范圍內的32個羊場收集了來自21個綿羊和山羊品種共計320個腸道樣本，分別構建了包含1.6億
暨南大學最新文章：制定蛋白質組“開放式搜索”質控標準
生物質譜具有高通量、高靈敏度的分析特點，是蛋白質組學研究的核心技術之一。基于數據庫搜索的肽段質譜圖譜鑒定方法是目前最有效和最廣泛使用的蛋白質鑒定方法，然而僅有25%的圖譜能被該方法識別。生物質譜具有高通量、高靈敏度的分析特點，是蛋白質組學研究的核心技術之一。基于數據庫搜索的肽段質譜圖譜鑒定方法是目前
Google向美國區域的搜索實驗室用戶開放搜索生成體驗
在GoogleI/O之后注冊了搜索實驗室的美國用戶現在可以開始使用一些早期實驗，包括SGE（搜索生成體驗）、代碼提示和添加到表單。如果你想嘗試這些功能，你可以通過訪問這個網站注冊，如果你已經注冊，還可以在那里查看你的等待名單狀態。該公司表示，其生成性人工智能驅動的搜索將使搜索更容易，用戶將能夠更快地
缺乏數據使用指導原則，基因組數據共享遇阻
基因組數據共享將生物醫學研究推向快車道，但向公共領域發布的現有數據指南一方面承認免費和無條件使用數據的重要性，另一方面還未能解決這種重要性與數據生產者首次發布數據的“權利”之間的關系。 在美國能源部聯合基因組研究所負責人Nikos Kyrpides看來，這種自相矛盾導致了數據生產者和數據使用
雅虎推出搜索瀏覽服務Axis
盡管雅虎公司近來負面新聞不斷，但它近日新推出的搜索瀏覽服務Axis卻讓人頗有“小清新”的感覺，贏得不少積極評價。 據雅虎的演示視頻介紹，Axis可以讓用戶在輸入搜索詞后，跳過傳統的鏈接列表，將最接近的搜索結果以一排水平的網頁縮略圖顯示。雖然縮略圖實質上還是搜索結果列表，但用戶界面和體