PacBio三代單分子測序獲表觀遺傳研究新發現
來自福建農林大學海峽聯合研究院林學中心等處的研究人員發表了題為“Comprehensive profiling of rhizome-associated alternative splicing and alternative polyadenylation in moso bamboo (Phyllostachys edulis)”的文章，采用PacBio第三代單分子測序，并結合RNA-seq和PAS-seq (polyadenylation site sequencing)，全面解析了選擇性拼接和選擇性多聚腺苷酸化在毛竹地下莖組織生長發育中的調控。 這一研究成果公布在植物學權威期刊The Plant Journal雜志上，通訊作者為福建農林大學馬留銀副教授與顧連峰教授，第一作者為王濤濤、王匯源及蔡大偉。 毛竹是生長最快的植物之一，福建是毛竹的主要產區，研究其快速生長機制具有重要的理論意義和實際應用價值。毛竹地下莖系......閱讀全文
PacBio三代單分子測序獲表觀遺傳研究新發現
來自福建農林大學海峽聯合研究院林學中心等處的研究人員發表了題為“Comprehensive profiling of rhizome-associated alternative splicing and alternative polyadenylation in moso bamboo (P
毛竹：探秘地球的前世今生
??地球是人類居住的唯一場所，為人類提供了生活必需的糧食、水、能源和礦產資源，同時也給人類帶來了諸如火山、地震、海嘯等災難。人類如同向往太空一樣，對地球的深部充滿著好奇。 地球科學是一門古老而又年輕的科學，自人類在地球上誕生、繁衍和發展以來，就對自己賴以生存的地球進行了不倦的探索。從地球的起源到
科技助力，浙江安吉百萬畝毛竹林變成“綠色銀行”
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502831.shtm浙江安吉是我國著名的竹鄉，竹林總面積超百萬畝，每年的竹業總產值達數百億，曾經以全國1.8%的立竹量，創造了全國20%的竹業總產值。隨著我國經濟社會的轉型升級，曾經依靠賣竹子就能發家致富
地空學院毛竹教授當選美國礦物學會會士
近日，美國礦物學會(Mineralogical Society of America, MSA)主席Mickey E. Gunter教授致信地空學院毛竹教授，祝賀她當選為美國礦物學會會士(MSA Fellow)。 美國礦物學會是全球最具影響力的地學學術組織之一，創立于1919年，今年正值美國礦
羅氏聯手PacBio打造NGS診斷產品
美國Pacific Biosciences公司周三宣布與羅氏診斷簽訂一項協議，以PacBio的SMRT技術為基礎開發診斷產品。包括前期、里程碑和供應付款在內，羅氏將向PacBio支付7500萬美元。 羅氏選擇了PacBio公司的SMRT技術 去年，羅氏曾向 Illumina發起收
PacBio單分子測序最新科研動態
DNA基因測序技術從上世紀70年代起，歷經三代技術后，目前已發展成為一項相對成熟的生物產業。測序技術的應用也擴展到了生物、醫學、制藥、健康、農林、園藝、花卉、環保、法醫等許多領域，并成為一項與我們衣食住行密切相關的高技術產業。據最新統計，2012年全球基因測序市場的產值已超過百億，按最近幾年增長
PacBio單分子測序最新科研動態
DNA基因測序技術從上世紀70年代起，歷經三代技術后，目前已發展成為一項相對成熟的生物產業。測序技術的應用也擴展到了生物、醫學、制藥、健康、農林、園藝、花卉、環保、法醫等許多領域，并成為一項與我們衣食住行密切相關的高技術產業。據最新統計，2012年全球基因測序市場的產值已超過百億，按最近幾年增長速度
PacBio推出小而強大的測序系統
之前，人們一直在猜測Pacific Biosciences可能會推出小型的單分子測序儀，但PacBio從未給出肯定的答復。而在2015年9月的最后一天，PacBio給了人們一個驚喜，突然宣布推出Sequel測序系統。Sequel系統保留了SMRT技術的優點，與現有的PacBio RS II系統相
PacBio助力感染菌株基因組重測序
Andrew Kasarskis博士是Icahn基因中心遺傳與基因組中心的副主任。他目前領導著一些專攻治療和診斷的合作項目，而他自己的研究也主要在病原體檢測，藥物基因組學，睡眠與遺傳的關系幾個方面展開。在加入西奈山之前，他曾經就職于PacBio，Sage Bionetworks和Merck。他有
PacBio如何獲得又長又準確的reads
Pacific Biosciences公司近日以單分子環形一致性測序（CCS）為基礎開發出一種方案，能夠在Sequel測序平臺上生成高度準確的長reads。這種方法有望克服短讀長測序的讀長不足以及長讀長測序的準確性有限的問題。 這篇題為“Highly-accurate long-read se
PacBio完成大型基因組測序項目
什么叫PacBio技術應用到大型基因組測序項目中會大打折扣，在哪個環節大打折扣?提出這個問題的讀者幾乎都是抱有同樣的心態，盡管大多數讀者都基本認同了，如果為了得到Finishing Genome，那么PacBio無論技術和成本，理論上都是最低的，但即使這樣，客觀成本還是高的嚇人，而假如將就D
中國科大地空學院毛竹教授當選美國礦物學會會士
近日，美國礦物學會(Mineralogical Society of America, MSA)主席Mickey E. Gunter教授致信地空學院毛竹教授，祝賀她當選為美國礦物學會會士(MSA Fellow)。 美國礦物學會是全球最具影響力的地學學術組織之一，創立于1919年，今年正值美國礦
中國科大地空學院毛竹教授當選美國礦物學會會士
近日，美國礦物學會(Mineralogical Society of America, MSA)主席Mickey E. Gunter教授致信地空學院毛竹教授，祝賀她當選為美國礦物學會會士(MSA Fellow)。 美國礦物學會是全球最具影響力的地學學術組織之一，創立于1919年，今年正值美國礦
PacBio第三季度儀器銷售強勁
美國Pacific Biosciences公司在上周宣布，其第三季度的收入同比增長178%，環比增長81%。 這家單分子測序技術公司今年Q3的營業收入達到2060萬美元，而去年Q3為740萬美元，今年Q2為1140萬美元。這也超過了華爾街預計的1720萬美元。 在這一季度，產品收入為680萬
PacBio推出首款檢測DNA堿基修飾的軟件
美國第三代測序公司Pacific Biosciences近日宣布推出一個獨特的解決方案，可利用PacBio? RS測序儀檢測與表觀遺傳學調控和DNA損傷相關的DNA堿基修飾。 DNA堿基修飾(如甲基化)在多個生物進程中扮演了重要角色，包括生長和衰老、免疫、細菌致病性以及疾病發展。Pac
PacBio全新Sequel－II系統助力入侵物種的鑒定
對于美國葡萄園和蘋果園的園主來說，斑衣蠟蟬（spotted lanternfly）簡直是噩夢一般的存在。這種貪婪的食客吸食葡萄、蘋果等70多種植物的汁液。若任其蔓延，將會造成數百億美元的損失。 不過好消息是，美國農業部的科學家近日已利用PacBio新推出的Sequel II測序系統，對一只田間
研究發現大氣氮沉降提高我國毛竹林生態系統固碳能力
近日，由浙江農林大學省部共建亞熱帶森林培育國家重點實驗室教授宋新章領銜的一項研究成果發表在《科學進展》雜志上。該研究首次系統揭示了大氣氮沉降對毛竹林凈碳匯效益的影響特征和作用機制。 據介紹，氮是植物生長所必需的重要元素。由于人類工農業生產活動的快速發展造成的大氣氮沉降量激增，已成為全球環境變化
PacBio首次確認一種疾病大片段缺失突變
二代測序為生命科學研究帶來了翻天覆地的變化，但是越來越多研究表明這種短讀長測序 (short-read sequencing, SRS)雖然高通量，成本低，然而對于串聯重復序列、高GC/AT序列、高度多態性區域、高度同源區域以及大片段結構變異的檢測能力非常有限，難以全方位的捕捉基因組的變化。據估
魚和熊掌兼得，PacBio獲得高度準確的長reads
如今，人類基因組的測序已經達到群體規模，但仍需要結合不同的測序技術（短讀長和長讀長），才能覆蓋各種類型的遺傳變異。這無疑增加了測序項目的成本和復雜度。為此，Pacific Biosciences公司的研究人員開發出一種方案，能夠在Sequel測序平臺上產生高度準確的長reads。 如今，人類基
土壤養分速測儀分析竹林土壤與竹筍產量的關系
毛竹筍用竹林因為其經濟效益高，周期短等特點，已經成為毛竹林經營的主要方式之一。毛 竹林每年春季都出春筍，在實際生產中必須考慮使竹林地充分培育優質竹材、減少退筍量。分析比較不同土壤養分條件下毛竹和竹筍的生長情況，確定最適宜竹林生 長的土壤肥力，為發展竹產業、營造毛竹林提供基礎數據,對促進林業和地方經濟
繼英國之后，Illumina收購PacBio再受美國監管機構反對
當地時間2019年12月17日，美國聯邦貿易委員會（Federal Trade Commission，FTC）宣布已授權采取行動，以阻止Illumina提出的以12億美元收購PacBio的交易。 FTC在一份尚未公開的行政申訴中表示，Illumina試圖通過“合并作為新生競爭威脅的PacBio
PacBio－Q3收入下降，但儀器安裝創新高
Pacific Biosciences公司在上周四收市后宣布，其第三季度的收入同比下降33%，因為去年第三季度收到了羅氏的1000萬美元里程碑付款，而今年沒有。這家單分子測序公司第三季度的總收入為1390萬美元，低于華爾街預計的1580萬美元。 在今年第三季度，PacBio的產品收入（包括儀
Illumina斥資12億美元收購PacBio－加速基因測序行業整合
2018年11月1日，Illumina公司宣布收購Pacific Biosciences公司。Illumina將以后者每股8美元的價格以全現金交易的形式收購該公司。這一價格比Pacific Biosciences在2018年10月31日市場收盤時的30個交易日成交量加權平均股價溢價71%，按完全
國際大合作，竹子快速生長的生物學機制
竹子是世界上生長速度最快的植物之一，如毛竹(Phyllostachys edulis)生長速度最快時每天可達114.5厘米。竹子為何有如此快的生長速度，其生物學機制如何？一直是植物學界科研人員頗感興趣但仍不清楚的科學問題。 近日，南京林業大學竹類研究所教授魏強課題組聯合美國康奈爾大學、國際竹藤中
中科院、國家林業局Nature子刊發布測序新草圖
來自國家林業局、中科院上海生命科學研究院的研究人員成功地繪制出了速生非木材森林物種毛竹(moso bamboo)的基因組草圖，從而為研究和遺傳改良毛竹提供了一個寶貴的資源。相關成果發布在2月24日的《自然遺傳學》(Nature Genetics)雜志上。 國家林業局的江澤慧(Zeh
PacBio－RS－II測序儀革新HLA檢測分型技術[創新技巧]
PacBio RS II測序系統一經推出，其長讀長、單分子堿基分辨率及無GC偏好性的特征即受到廣大研究者的推崇，尤其是在HLA檢測分型領域，國際上權威HLA檢測分型機構相繼引進PacBio RS II測序技術進行相關服務或試劑盒的研發，推起了PacBio在HLA研究應用領域的高潮。His
PacBio－RS－II測序儀革新HLA檢測分型技術[創新技巧]
PacBio RS II測序系統一經推出，其長讀長、單分子堿基分辨率及無GC偏好性的特征即受到廣大研究者的推崇，尤其是在HLA檢測分型領域，國際上權威HLA檢測分型機構相繼引進PacBio RS II測序技術進行相關服務或試劑盒的研發，推起了PacBio在HLA研究應用領域的高潮。 His
PacBio單分子測序揭示丹參葉綠體DNA修飾的相互作用
2014年6月10日，中科院藥用植物研究所（IMPLAD）劉昶團隊在《PLOS ONE》雜志上發表了利用PacBio測序技術揭示丹參（Salvia miltiorrhiza）葉綠體DNA修飾之間復雜相互作用的相關文章，該文章報道了丹參葉綠體中編碼及非編碼RNA的表達情況。這也是國內PacBio第
PacBio測序有望掀起下一場遺傳診斷的革命
從一代到二代再到三代，近年來測序技術的發展勢不可擋。單分子測序也逐漸表現出它的優勢，在測序舞臺上發揮著舉足輕重的作用。近日，比利時魯汶大學和瑞典烏普薩拉大學的研究人員在《Nucleic Acids Research》發表綜述文章，介紹了PacBio SMRT測序技術在臨床中的應用。 文章簡單回
2022年PacBio營收1.28億美元，繼續專注長度條測序
Pacific Biosciences近日發布2022年財政報告，由于用戶等待該公司最新的 Revio 長讀長測序儀導致其他測序儀器需求下降，其 2022 年第四季度收入同比下降 24%。2022年收入1.28億美元，較上年1.31億降低1.7%；凈虧損3.14億美元。第四季度概況 第四季度總