染色質重塑因子PKL在RNA介導的DNA甲基化中的功能
5月31日，《基因組生物學》（Genome Biology）雜志在線發表了中國科學院上海生命科學研究院植物逆境生物學研究中心張蘅研究組題為The developmental regulator PKL is required to maintain correct DNA methylation patterns at RNA-directed DNA methylation loci 的研究論文。該研究揭示了染色質重塑因子PKL在RNA介導的DNA甲基化過程中的重要調控作用。 在植物中，RNA介導的DNA甲基化（RdDM）是一種重要的建立全新DNA甲基化式樣和轉錄基因沉默的機制，通過小干擾RNA（siRNA）與支架RNA（scaffold RNA）的堿基配對引導DNA甲基轉移酶到特定的位點進行全新DNA甲基化。RdDM在外源基因沉默、維持基因組穩定性、生殖細胞DNA甲基化模式建立等生物學過程中起重要作用，解析其分子機理對......閱讀全文
PLoS－Genet：何新建等模式植物擬南芥研究獲進展
2014年1月22日，北京生命科學研究所何新建實驗室在《PLOS Genetics》雜志在線發表題為“The SET domain proteins SUVH2 and SUVH9 are required for Pol V occupancy at RNA-directed DNA me
甲基化試驗有助于區分原發腫瘤類型
未知性癌癥（CUP）在轉移性腫瘤患者中占比10%，然而這些癌癥的原發腫瘤位置通常無法確定。由于無法分辨究竟是哪種腫瘤類型，這些患者的生存率很低。 “傳統方法只能鑒定30%不明病灶的轉移性腫瘤的原發腫瘤位置，一些分子生物學方法可以提高這一比例，但往往造價昂貴，并且，所使用的RNA樣本比較脆弱容易
關于基因表達的轉錄調控介紹
基因表達的轉錄調控可分為三種主要途徑：1）遺傳調控（轉錄因子與靶標基因的直接相互作用）；2）調控轉錄因子與轉錄機制相互作用，3）表觀遺傳調控（影響轉錄的DNA結構的非序列變化）。 通過轉錄因子直接調控靶標DNA表達是最簡單和最直接的轉錄調控改變轉錄水平的方法。基因的編碼區周圍通常都具有幾個蛋白
基因表達的轉錄調控的介紹
可分為三種主要途徑： 1）遺傳調控（轉錄因子與靶標基因的直接相互作用）； 2）調控轉錄因子與轉錄機制相互作用； 3）表觀遺傳調控（影響轉錄的DNA結構的非序列變化）。 通過轉錄因子直接調控靶標DNA表達是最簡單和最直接的轉錄調控改變轉錄水平的方法。基因的編碼區周圍通常都具有幾個蛋白質結合
RNA甲基化研究
近期華人科學家辛辛那提大學陳建軍教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修飾在正常和惡性造血過程中的重要作用，表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信號軸在髓系分化以及白血病發生過程中的作用。該研究于2018年1月發表在干細胞頂級期刊《Cell Steam Cell》（影響因子：
RNA甲基化測序
1、NSUN2影響m5C在HEK293細胞中整體分布情況NSUN2被報道是RNA甲基轉移酶，能使tRNAs和mRNA發生m5C甲基化修飾。為了探究NSUN2對HEK293細胞mRNA m5C甲基化修飾的影響。作者利用CRISP/Cas9技術敲減NSUN2（NSUN2-/-HEK293細胞）后進行
植物轉錄起始調控機制研究獲進展
在國家自然科學基金面上項目和青年項目的資助下，中國科學院華南植物園研究員陳琛團隊聯合廣東省農業科學院研究員劉軍、加拿大農業部倫敦研發中心研究員崔玉海在植物轉錄起始調控機制研究方面取得新進展。相關研究近日發表于《核酸研究》（Nucleic Acids Research）。? 轉錄復合體將DNA轉錄
華南植物園關于植物轉錄起始調控機制的研究獲進展
轉錄復合體將DNA轉錄為RNA，是遺傳信息由細胞核向細胞質轉遞的基礎。由于核小體與基因組的緊密結合，轉錄復合體需克服核小體障礙進而確保功能基因的表達。染色質重塑復合體（Chromatin Remodeler）被認為在轉錄過程中發揮了重要作用。這類蛋白復合體能通過水解ATP來調控核小體的組成和分布
華人科學家發現DNA甲基化關鍵調節因子
《科學》基因表達調控新突破： DNA甲基化對哺乳動物發育至關重要。本研究利用DNA甲基化報告子敲入技術，對人類胚胎干細胞進行全基因組CRISPR-Cas9篩選。發現QSER1基因是發育相關基因二價啟動子和準備狀態增強子的關鍵保護因子，尤其是位于DNA甲基化峽谷內的基因。研究確定了QSER1和T
什么是表觀遺傳學
是研究不涉及DNA序列改變的基因表達和調控的可遺傳修飾，即探索從基因演繹為表型的過程和機制的一門新興學科。遺傳學是指基于基因序列改變所 致基因表達水平變化，如基因突變、基因雜合丟失和微衛星不穩定等。而表觀遺傳學則是指基于非基因序列改變所致基因表達水平變化，如DNA甲基化和染色質構象變化等；表觀基因組
植物DNA甲基化的調控研究獲重要進展
近日，中國科學院華南植物園農業與生物技術中心研究員陳琛、副研究員王昌虎團隊與合作者，在國家自然科學基金面上項目和青年項目、廣州市科技計劃項目的資助下，對植物DNA甲基化的調控研究取得重要進展。相關成果發表于《自然-通訊》（Nature Communications）。DNA甲基化是表觀遺傳修飾中的一
植物DNA甲基化的調控研究獲重要進展
近日，中國科學院華南植物園農業與生物技術中心研究員陳琛、副研究員王昌虎團隊與合作者，在國家自然科學基金面上項目和青年項目、廣州市科技計劃項目的資助下，對植物DNA甲基化的調控研究取得重要進展。相關成果發表于《自然-通訊》（Nature Communications）。 DNA甲基化是表觀遺傳修
DNA損傷修復信號通路相關因子ATRX
該基因編碼的蛋白含有一個atpase/螺旋酶結構域，因此屬于染色質重塑蛋白的swi/snf家族。這種蛋白被發現經歷了細胞周期依賴性磷酸化，它調節其核基質和染色質的結合，并表明它參與有絲分裂的間期基因調節和染色體分離。該基因突變與X連鎖精神發育遲滯（XLMR）綜合征有關，通常伴有α-地中海貧血（ATR
ATRX基因編碼功能及結構描述
該基因編碼的蛋白含有一個atpase/螺旋酶結構域，因此屬于染色質重塑蛋白的swi/snf家族。這種蛋白被發現經歷了細胞周期依賴性磷酸化，它調節其核基質和染色質的結合，并表明它參與有絲分裂的間期基因調節和染色體分離。該基因突變與X連鎖精神發育遲滯（XLMR）綜合征有關，通常伴有α-地中海貧血（ATR
ATRX基因突變與藥物因子介紹
該基因編碼的蛋白含有一個atpase/螺旋酶結構域，因此屬于染色質重塑蛋白的swi/snf家族。這種蛋白被發現經歷了細胞周期依賴性磷酸化，它調節其核基質和染色質的結合，并表明它參與有絲分裂的間期基因調節和染色體分離。該基因突變與X連鎖精神發育遲滯（XLMR）綜合征有關，通常伴有α-地中海貧血（ATR
實體腫瘤檢測ATRX基因介紹
該基因編碼的蛋白含有一個atpase/螺旋酶結構域，因此屬于染色質重塑蛋白的swi/snf家族。這種蛋白被發現經歷了細胞周期依賴性磷酸化，它調節其核基質和染色質的結合，并表明它參與有絲分裂的間期基因調節和染色體分離。該基因突變與X連鎖精神發育遲滯（XLMR）綜合征有關，通常伴有α-地中海貧血（ATR
Cell子刊：染色質重塑與脂肪肝
研究人員發現了將碳水化合物轉化為脂肪的關鍵基因，該基因有望作為脂肪肝、糖尿病和肥胖癥治療的潛在靶點。 加州大學伯克利分校的科學家們揭示了機體將碳水化合物轉化為脂肪的分子機制，他們在研究中發現BAF60c基因會導致脂肪肝。研究顯示，即使飲食中含糖量高，缺乏BAF60c基因的小鼠依然不能將碳水
基因表達的調控
轉錄調控可分為三種主要途徑：1）遺傳調控（轉錄因子與靶標基因的直接相互作用）；2）調控轉錄因子與轉錄機制相互作用，3）表觀遺傳調控（影響轉錄的DNA結構的非序列變化）。通過轉錄因子直接調控靶標DNA表達是最簡單和最直接的轉錄調控改變轉錄水平的方法。基因的編碼區周圍通常都具有幾個蛋白質結合位點，具有調
基因表達的調控模式介紹
轉錄調控可分為三種主要途徑:1)遺傳調控(轉錄因子與靶標基因的直接相互作用);2)調控轉錄因子與轉錄機制相互作用,3)表觀遺傳調控(影響轉錄的DNA結構的非序列變化)。通過轉錄因子直接調控靶標DNA表達是最簡單和最直接的轉錄調控改變轉錄水平的方法。基因的編碼區周圍通常都具有幾個蛋白質結合位點,具有調
裴端卿組綜述DNA去甲基化的級聯調控模型
中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院裴端卿課題組綜合近期體細胞重編程過程中TET相關DNA去甲基化的研究進展【1】和之前的相關研究，對細胞命運變化過程中的DNA甲基化模式重排過程和級聯調控模型進行了調研，提出偶聯TET進行DNA去甲基化可能是轉錄因子打開染色質的一種基本模式，該綜述以The Bat
植物轉錄起始調控機制研究獲進展
在國家自然科學基金面上項目和青年項目的資助下，中國科學院華南植物園研究員陳琛團隊聯合廣東省農業科學院研究員劉軍、加拿大農業部倫敦研發中心研究員崔玉海在植物轉錄起始調控機制研究方面取得新進展。相關研究近日發表于《核酸研究》（Nucleic Acids Research）。 轉錄復合體將DNA轉錄
逆境中心等揭示以DTF1為中心的DNA甲基化調控新機制
5月1日，國際學術期刊《美國科學院院刊》(Proceedings of the National Academy of Sciences) 在線發表了中科院上海生命科學研究院上海植物逆境生物學研究中心朱健康課題組和北京生命科學研究所何新建課題組的學術論文DTF1 is a core co
Cancer－Discov－|－結直腸癌分子亞型的表觀遺傳基礎和特征轉錄因子
北京大學湯富酬及周鑫共同通訊在Cancer Discovery（IF 28）在線發表題為“Single-cell chromatin accessibility analysis reveals the epigenetic basis and signature transcription f
基因沉寂的作用
這個“原則”就是目前尚沒有真正完全清楚的“組蛋白密碼”（Histone Code)。能夠與甲基化組蛋白結合的蛋白質有sir1/2/3/4，這是一組被稱為"Silencing Informative Repressor"的蛋白，其中，Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶，而Sir1/3/4則負責與甲基化
關于基因沉寂的作用介紹
這個“原則”就是目前尚沒有真正完全清楚的“組蛋白密碼”（Histone Code)。能夠與甲基化組蛋白結合的蛋白質有sir1/2/3/4，這是一組被稱為"Silencing Informative Repressor"的蛋白，其中，Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶，而Sir1/3/4則負責與甲
基因沉寂的作用
這個“原則”就是目前尚沒有真正完全清楚的“組蛋白密碼”(Histone Code)。能夠與甲基化組蛋白結合的蛋白質有sir1/2/3/4,這是一組被稱為"Silencing Informative Repressor"的蛋白,其中,Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶,而Sir1/3/4則負責與甲基化
基因沉寂的作用
這個“原則”就是目前尚沒有真正完全清楚的“組蛋白密碼”（Histone Code)。能夠與甲基化組蛋白結合的蛋白質有sir1/2/3/4，這是一組被稱為"Silencing Informative Repressor"的蛋白，其中，Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶，而Sir1/3/4則負責與甲基化
朱健康院士PNAS發布表觀遺傳新成果
來自中國科學院上海植物逆境生物學研究中心、美國普渡大學的研究人員證實，在擬南芥雜交種中甲基化互作需要RNA介導的DNA甲基化（RdDM），并受到遺傳變異的影響。 中國科學院上海植物逆境生物學研究中心主任朱健康（Jian-Kang Zhu）是這篇論文的通訊作者。朱教授是植物抗逆生物學領域世界級領
揭露CG甲基化的遺傳性和相互作用
將表觀遺傳標記（例如DNA甲基化）靶向特定位點的能力在基礎研究和作物植物工程中都很重要。但是，靶向DNA甲基化的遺傳性，其如何影響基因表達以及正確建立所需的表觀遺傳特征尚不清楚。 2021年5月25日，浙江大學劉琬璐及加利福尼亞大學洛杉磯分校Steven E. Jacobsen共同通訊在Nat
簡述組蛋白修飾種類、位點及其意義
1、種類：染色質的共價修飾主要是組蛋白的修飾。2、組成核小體的組蛋白八聚體的組蛋白H3和H4是蛋白酶修飾的主要位點。3、意義：Mi22NHRD由核心(HDAC1、HDAC2、RBAP46?RBAP48)+Mi2、MTA1?MTA2、MBD3組成,其中MBD3含有MBD樣序列,與甲基化DNA有低親和力