董孟秋·科學:蛋白質組學新技術
來自美國斯克利普斯研究所(Scripps Research Institute)Salk生物研究院,加州大學圣地亞哥分校的研究人員利用一種蛋白定量分析新方法對長壽命線蟲進行了研究,發現了能延長和縮短壽命的蛋白。這對于進一步豐富蛋白定量研究方面來說意義重大。這一研究成果公布在《Science》雜志上。 文章的第一作者是來自斯克利普斯研究所的Andrew Dillin實驗室的董孟秋(Meng-Qiu Dong,音譯)。 原文檢索:Science 3 August 2007:Vol. 317. no. 5838, pp. 660 - 663 DOI: 10.1126/science.1139952Quantitative Mass Spectrometry Identifies Insulin Signaling Targets in C. elegans[Abstract] 僅僅知道蛋白質的身份并不足以對蛋白質給出最終定論,......閱讀全文
定量蛋白質組學的誕生
在現代研究技術,如熒光顯微鏡,流式細胞儀和蛋白質芯片技術中,抗體仍然扮演著非常重要的角色。但依賴于抗體的蛋白質檢測存在一些缺點,其中最大的限制就是,抗體的可用性和質量差別很大。一些大規模項目,比如人類蛋白質圖譜(Human Protein Atlas),Antibodypedia,以及美國NIH
蛋白質組學質譜分析
Proteomics Primer1. Proteomics2. 2-D PAGE3. Immobilised pH gradients (IPGs)4. Mass spectrometry5. Principles of mass spectrometry6. Matrix assisted la
蛋白質組學入門問題集錦
1 . HPLC 靈敏度不夠的主要原因及解決辦法 樣品量不足:解決辦法為增加樣品量 樣品未從柱子中流出:可根據樣品的化學性質改變流動相或柱子 樣品與檢測器不匹配:根據樣品化學性質調整波長或改換檢測器 檢測器衰減太多:調整衰減即可。 檢測器時間常數太大:解決
定量蛋白質組學方法分類
1 背景和意義從生命活動的直接執行者——蛋白質的角度研究生命現象和規律(特別是疾病防治和病理研究)已成為研究生命科學的主要手段。而這些研究往往離不開對細胞、組織或器官中含有蛋白質種類和表達量的研究。對處不同時期、不同條件下蛋白質表達水平變化的研究,識別功能模塊和路徑,監控疾病的生物標志物,這些研究都
蛋白質組學的研究內容
主要有兩方面,一是結構蛋白質組學,二是功能蛋白質組學。其研究前沿大致分為三個方面: ①針對有關基因組或轉錄組數據庫的生物體或組織細胞,建立其蛋白質組或亞蛋白質組及其蛋白質組連鎖群,即組成性蛋白質組學。 ②以重要生命過程或人類重大疾病為對象,進行重要生理病理體系或過程的局部蛋白質組或比較蛋白質組學
蛋白質組學實驗技術大全
每一個領域的發展都是基于技術的進步和革新,蛋白質組學亦然。蛋白質的可變性和多樣性等特殊性質導致了蛋白質研究技術遠遠比核酸技術要復雜和困難得多,但正是這些特性參與和影響著整個生命過程。在開始實驗之前,先看看這篇技術簡介吧。一?蛋白質與DNA相互作用在許多的細胞生命活動中,例如DNA復制、mRNA轉錄與
蛋白質組學鑒定技術流程
蛋白質組(Proteome)的概念,蕞早由澳大利亞Macquarie大學的Wilkins和Williams于1994年首先提出的,是指一個基因組(Genome),或一個細胞、組織表達的所有蛋白質。蛋白質組學(Proteomics)以細胞、組織或生物體全體蛋白質為研究對象,通過高通量的色譜質譜聯用技術
蛋白質組學的樣品制備
想要研究蛋白質,首先要得到高度純化且具有生物活性的目的物質,因此,蛋白樣品的制備是重要前提。蛋白提取的質量和效果對后續的研究分析有重要影響。不同種類的樣本在制備過程中,存在一些差異,要根據樣本特征調整實驗方案和操作細節。基本原則樣品處理盡量簡單,減少蛋白損失;盡量避免蛋白的降解;盡可能提高樣品蛋白的
蛋白質組學入門問題FAQ
常見問題———?HPLC 篇?1 . HPLC 靈敏度不夠的主要原因及解決辦法?樣品量不足:解決辦法為增加樣品量?樣品未從柱子中流出:可根據樣品的化學性質改變流動相或柱子?樣品與檢測器不匹配:根據樣品化學性質調整波長或改換檢測器?檢測器衰減太多:調整衰減即可。?檢測器時間常數太大:解決辦法為降低時間
蛋白質組學不能被基因組和轉錄組取代
基因和蛋白并不存在嚴格的線性關系ORF并不預示一定存在相應的功能性基因mRNA水平并非與蛋白質的表達水平對應翻譯后修飾及同工蛋白質(isforms)等現象在基因水平無從表現
質譜技術幫助科學家發現蛋白質組學重要成果
最近,來自瑞士和荷蘭的科學家,對在22種不同生長條件下大腸桿菌表達的蛋白質,進行了定量和定性分析。確定了超過2300個蛋白質,其中一些處于每個細胞一個副本的平均水平。由此產生的數據集描述了細胞中大多數(> 90%)的蛋白質量,對細胞生物學家來說這將是一個寶藏。相關研究結果發表在十二月出版的《Na
【網絡研討會】蛋白質組學/脂質組學研究進展
自從精準醫學概念提出以來,組學研究一直都是全球最熱的研究領域,其技術在臨床醫學、生物醫藥和食品安全等領域都占據十分重要的作用。2016年初,中國發起了精準醫學研究專項課題,目標在2017年至2019年構建重大疾病的預防診斷和治療大數據平臺,推動一批精準治療藥物和分子檢測產品進入國家醫保目錄。同時
中國蛋白質組學世界領先
2003年12月15日,由中國科學院院士賀福初牽頭的“人類肝臟蛋白質計劃”(HLPP)啟動,這是我國領導的第一項重大國際合作計劃,也是第一個人類組織/器官的蛋白質組計劃。 北京蛋白質組研究中心主任、蛋白質組學國家重點實驗室副主任秦鈞告訴《中國科學報》記者,十余年來,HLPP經歷了三代更迭,從第
《自然方法學》:可視蛋白質組學
瑞士聯邦技術學院的研究人員開發出一種在問號鉤端螺旋體(Leptospira interrogans)這種病原體中定位蛋白復合物的新方法,稱為“可視蛋白質組學”。文章發表在本期的《自然-方法學》上。 活細胞中的生化進程分為多個功能單元,它們在細胞內有著特定的時間和空間分布。一般來說,這些單元
蛋白質組學技術的功能介紹
“讀”,在字典里的意思是識取、讀取,放在蛋白研究中可以理解為對生物樣本中未知單一蛋白或復雜蛋白的篩選、鑒定或者定量檢測。自2003年4月14日人類基因組計劃(HGP)宣告完成以來,基因組研究取得了舉世矚目的成就。基因組學雖然在基因活性和疾病的相關性方面為人類提供了有力證據,但實際上絕大多數疾病并不是
定量蛋白質組學方法分類介紹
【蛋白研究系列專題】-4丨定量蛋白質組學方法,您值得擁有 1 背景和意義 從生命活動的直接執行者——蛋白質的角度研究生命現象和規律(特別是疾病防治和病理研究)已成為研究生命科學的主要手段。而這些研究往往離不開對細胞、組織或器官中含有蛋白質種類和表達量的研究。對處不同時期、不同條件下
總裁專訪-|-蛋白質組學新里程
2020年是蛋白質組學發展關鍵的一年,全球新冠疫情突顯了蛋白質組學在應對公共衛生危機中的臨床應用。人類可以從這次新冠疫情中汲取許多經驗,毫無疑問地,這些將在未來幾年內影響蛋白質組學發展。近日,Technology Networks與布魯克·道爾頓生命科學質譜執行副總裁Rohan Thakur博士
蛋白質組學相關問題與解答
1.為什么通過elisa、WB能檢測到的蛋白在itraq實驗中沒有檢測到? 人血漿中的蛋白是有上萬種的,而一般質譜只能檢測到五六百種,也就是說只占了其中的百分之幾,這是普遍現象,說明咱們的方法是不存在問題的;其次,ELISA/WB與質譜相對來說靈敏度不一樣,前者具有放大效應,因為其間會用
蛋白質組學技術的功能介紹
“讀”,在字典里的意思是識取、讀取,放在蛋白研究中可以理解為對生物樣本中未知單一蛋白或復雜蛋白的篩選、鑒定或者定量檢測。 自2003年4月14日人類基因組計劃(HGP)宣告完成以來,基因組研究取得了舉世矚目的成就。基因組學雖然在基因活性和疾病的相關性方面為人類提供了有力證據,但實際上絕大
定量蛋白質組學的研究內容
1.蛋白質鑒定:可以利用一維電泳和二維電泳并結合Western等技術,利用蛋白質芯片和抗體芯片及免疫共沉淀等技術對蛋白質進行鑒定研究。 2.翻譯后修飾:很多mRNA表達產生的蛋白質要經歷翻譯后修飾如磷酸化,糖基化,酶原激活等。翻譯后修飾是蛋白質調節功能的重要方式,因此對蛋白質翻譯后修飾的研究對
Nature年度技術:定向蛋白質組學
時近歲末,各大雜志接連進行了年終盤點,此前出版的《Nature》雜志也對2012年進行了回顧,評點了2012年的科技進展,科技政策以及重要人物,中國科學家王俊入選了人物篇。同時《Nature Methods》也盤點了今年與明年的技術熱點,選出了2012年度技術成果:定向蛋白質組學(targe
蛋白質組學研究-可投哪些期刊?
????蛋白質作為功能的直接行使者,已經被科研工作這廣泛應用于不同領域中,目前蛋白組學有很多優秀的科研成果,在各個領域及期刊上發表,其中也不乏CNS在內的頂級期刊。那我們的蛋白組學文章可以投哪些期刊呢?了解已發表文章的情況可以幫助我們很好的解決這個問題。這里,我們以“Proteomics”為關鍵詞,
魯克在-timsTOF-4D蛋白質組學和表觀蛋白質組學平臺上擴展
在蛋白質組論壇| EuPA 2022,布魯克公司(納斯達克股票代碼:BRKR)宣布擴展了更深層次的蛋白質組學和表觀蛋白質組學覆蓋的能力,包括使用創新的 TIMScore 算法增強磷酸肽分析,該算法現在是基于 GPU 的新 PaSER 2022 平臺的一部分。新的 TIMScore 算法利用機器學
2025蛋白質組學大會之聚焦化學蛋白質組學,開啟精準藥物發現新紀元
2025年10月13日下午14點在廣州白云國際會議中心嶺南國際會堂,第12屆AOHUPO大會暨第8屆AOAPO大會暨π-HuB國際大科學計劃第三屆全球峰會暨第13屆CNHUPO大會“Chemoproteomics and Drug Discovery”(化學蛋白質組學與藥物發現)分會場7精彩開啟
Cell提出一個新“組學”:蛋白質代謝小分子互動組學
科學家們提出了一個新的“組學”——一個處理蛋白質和小分子之間相互作用的互動組學(protein-metabolite interactomics)。此前系統生物學家專注于基因組學或蛋白質組學,現在他們日益發現了蛋白質-代謝小分子之間相互作用的重要性。 基因組學針對的是生物體基因的系統分析,而蛋
基因組學與蛋白質組學兩大巨頭建立合作
AB Sciex和Illumina公司近日聯手推出OneOmics? 計劃,其目的是在云計算環境中結合新一代蛋白質組學(NGP)和新一代測序(NGS)的工具。作為此計劃的一部分,Illumina的應用商店BaseSpace將托管AB Sciex的SWATH? 蛋白質組學云工具,這使得BaseSp
蛋白質組學之逆襲,深度注釋基因組
申請課題缺創新點?撰寫論文沒思路?急著畢業時間緊?別怕,對于吉凱,一切都是套路!更有甚者,對于宇宙終極難題:“屌絲如何逆襲白富美?”老司機黃博也有一套經典案例分享給大家。 從前,在生物學研究領域,有一個白富美叫基因組學(Genomics),她有一項強大的技能:DNA測序,憑借這項技能,她完
第381次香山科學會議研討“蛋白質組學:前沿和挑戰”
賀福初、張玉奎、 秦鈞擔任會議執行主席以“蛋白質組學:前沿和挑戰”為主題的第381次香山科學會議10月12—13日在北京舉行。軍事醫學科學院賀福初研究員、中科院大連化學物理所張玉奎研究員、美國貝勒醫學院秦鈞副教授擔任會議執行主席。 蛋白質組學的應用日益廣泛。蛋白質組學技術的迅速發展,其學
人類蛋白質組計劃2.0和蛋白質組學驅動的精準醫學
“如果說抗生素的發明引發了第一代醫學治療技術革命,影像學和分子醫學的發展引發了第二代醫學診斷技術革命,那么,由蛋白質組學驅動的精準醫學,勢必帶來精確診斷與精準治療統一的第三代醫學革命。人類蛋白質組計劃2.0將在國際范圍部署建立蛋白質組學驅動的精準醫學技術體系和行業標準,進一步提升對重大、疑難疾病
布魯克4D蛋白質組學新技術斬獲HUPO-2020科學技術獎
摘要prm-PASEF?方法大幅提高4D-靶向蛋白質組學定量能力Matthias Mann 實驗室利用dia-PASEF?、超低流量Evosep色譜和TIMS/PASEF裝置的進一步的改進實現單個細胞鑒定超過1000種蛋白質布魯克獲得Albert Heck實驗室的PhoX交聯劑許可,caps-P