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  • 橡膠樹HeveaDB基因組數據庫平臺完成測試

    日前,中國熱帶農業科學院“橡膠樹等主要熱帶作物功能基因組學研究”創新團隊負責搭建的橡膠樹HeveaDB基因組數據庫平臺(hevea。catas。cn)上線運行,并在國際橡膠研究與發展委員會(IRRDB)各成員國間開展測試工作。經過1個月的測試,數據庫平臺各項指標保持穩定,運行可靠,達到預期效果。圖片來源于網絡 近年來,隨著基因組測序技術的進步,已有四個國家(馬來西亞、泰國、中國和日本)獨立繪制并公開發表了橡膠樹基因組草圖,其中由中國熱帶農業科學院橡膠研究所完成的草圖版本質量最高。同時還產生了大量轉錄組數據。這些數據亟需一個整合的數據平臺來儲存、分發和共享,并進行二次挖掘利用。 2017年召開的IRC2017國際橡膠會議提出要搭建橡膠樹基因組數據中心的計劃。在IRRDB理事會上,中國熱科院代表經過爭取,獲得了牽頭搭建橡膠樹基因組數據中心的任務,并由“橡膠樹等主要熱帶作物功能基因組學研究”創新團隊承擔開發工作。經過努力,創新......閱讀全文

    科學家繪制出橡膠樹基因組草圖

      日本和馬來西亞研究人員合作成功繪制出橡膠樹基因組草圖,這將有助于培育更加高產的橡膠樹,提高天然橡膠的產量。  日本理化學研究所日前發布一份公報說,該研究所和馬來西亞理科大學的研究人員對東南亞廣泛栽種的橡膠樹品種“PRIM600”進行了基因組測序,繪制出的基因組草圖包含了超過93.7%的橡膠樹基因

    橡膠樹HeveaDB基因組數據庫平臺完成測試

    本報訊 日前,中國熱帶農業科學院“橡膠樹等主要熱帶作物功能基因組學研究”創新團隊負責搭建的橡膠樹HeveaDB基因組數據庫平臺(hevea.catas.cn)上線運行,并在國際橡膠研究與發展委員會(IRRDB)各成員國間開展測試工作。經過1個月的測試,數據庫平臺各項指標保持穩定,運行可靠,達到

    橡膠樹HeveaDB基因組數據庫平臺完成測試

      日前,中國熱帶農業科學院“橡膠樹等主要熱帶作物功能基因組學研究”創新團隊負責搭建的橡膠樹HeveaDB基因組數據庫平臺(hevea。catas。cn)上線運行,并在國際橡膠研究與發展委員會(IRRDB)各成員國間開展測試工作。經過1個月的測試,數據庫平臺各項指標保持穩定,運行可靠,達到預期效果。

    中國獲首個染色體級別橡膠樹參考基因組圖譜-利于育種

      從中國科學院昆明植物研究所獲悉,由該所及云南省熱帶作物科學研究所、華南農業大學基因組學與生物信息學研究中心組成的聯合研究團隊,歷經6年,利用單分子實時測序(SMRT)和Hi-C技術,在國際上首次獲得了達到染色體級別的高質量巴西橡膠樹優良品種GT1的參考基因組序列,并揭示大戟植物基因組的染色體進化

    一國際研究小組將精度達93.7%的橡膠樹基因組草圖繪出

      日本理化學研究所的一個國際研究小組成功繪制出精度達93.7%的橡膠樹基因組草圖。  該研究小組對東南亞廣泛栽種的帕拉橡膠樹品種“PRIM600”進行了基因組測序。他們首先利用約100個堿基短序列信息以99%以上精度進行解讀的“Illumina”方法,與7000個堿基長序列信息以85%精度解讀的“

    一國際研究小組將精度達93.7%的橡膠樹基因組草圖繪出

      日本理化學研究所的一個國際研究小組成功繪制出精度達93.7%的橡膠樹基因組草圖。   該研究小組對東南亞廣泛栽種的帕拉橡膠樹品種“PRIM600”進行了基因組測序。他們首先利用約100個堿基短序列信息以99%以上精度進行解讀的“Illumina”方法,與7000個堿基長序列信息以85%精度解讀的

    歷時6年-獲首個染色體級別的橡膠樹參考基因組圖譜

      記者16日從中國科學院昆明植物研究所獲悉,由該所及云南省熱帶作物科學研究所、華南農業大學基因組學與生物信息學研究中心組成的聯合研究團隊,歷經6年,利用單分子實時測序(SMRT)和Hi-C技術,在國際上首次獲得了達到染色體級別的高質量巴西橡膠樹優良品種GT1的參考基因組序列,并揭示大戟植物基因組的

    我國獲得國際首個染色體級別的橡膠樹GT1參考基因組圖譜

      記者16日從中國科學院昆明植物研究所獲悉,由該所及云南省熱帶作物科學研究所、華南農業大學基因組學與生物信息學研究中心組成的聯合研究團隊,歷經6年,利用單分子實時測序(SMRT)和Hi-C技術,在國際上首次獲得了達到染色體級別的高質量巴西橡膠樹優良品種GT1的參考基因組序列,并揭示大戟植物基因組的

    染色體級別橡膠基因組研究揭秘乳膠生物合成

       橡膠樹是大戟科植物。在植物界大約2500種產膠植物中,橡膠樹產生的以聚異戊二烯為主要功能成分的天然膠乳約占全球天然橡膠的98% 以上。圖片來源于網絡  比起可能造成巨大環境污染的人工合成橡膠產業,天然橡膠因其良好的彈性、伸展性、耐老化等綜合理化性能而具有不可替代性,是任何國家必須具備的重要戰略

    科學家獲取染色體級別的高質量橡膠樹參考基因組圖譜。

       橡膠樹(Hevea brasiliensis (Willd. ex A. Juss.) Muell. Arg. )是大戟科(Euphorbiaceae)植物。在植物界大約2,500種產膠植物中(如杜仲Eucommia ulmoides Oliver和橡膠草 Taraxacum kok-sagh

    高精度完整基因組助橡膠育種駛入“快車道”

      橡膠樹是天然橡膠的主要來源。“橡膠樹育種面臨的主要困難在于周期長和效率低,通過常規育種方法將多抗、高產性狀聚合往往需要30~40年。”中國熱帶農業科學院橡膠研究所研究員程漢告訴《中國科學報》。  然而,目前已發表的橡膠樹基因組序列均存在未進行單倍型解析、序列缺失不連續、著絲粒和端粒序列未進行正確

    科研人員在橡膠樹種質遺傳多樣性和產膠進化研究上取得新進展

    目前橡膠生產上的主要栽培品種均可追溯到來自橡膠樹屬(Hevea)巴西橡膠樹(H. brasiliensis)種內的22株1876(年)魏克漢種質,遺傳資源狹窄是橡膠樹雜交育種進展緩慢的一個重要因素。同時,在橡膠樹屬的其他種,以及巴西橡膠樹種內的野生種質中報道存在豐富的產膠、抗病、速生和耐旱等重要農藝

    探究“產膠”奧秘:橡膠樹育種有望突破瓶頸期

    100多年前,源自巴西的22株橡膠樹魏克漢種質材料被引種到全球各產膠國,培育了很多高產品種。然而,栽培橡膠樹這狹窄的遺傳背景導致其如今的育種進入了瓶頸期。橡膠林鳥瞰。熱科院橡膠所供圖在此背景下,中國熱帶農業科學院橡膠研究所副研究員方永軍,攜手海南大學三亞南繁研究院研究員唐朝榮、蘭州大學生態學院教授劉

    給300多橡膠樹重測序后,他們終于發現產量密碼

    原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/506120.shtm?將近150年前,橡膠樹被英國人魏克漢引種到英國的邱園,開啟了人工馴化歷程。近日,中國熱帶農業科學院橡膠研究所教授田維敏團隊聯合中國科學院遺傳與發育生物學研究所研究員李家洋院士團隊和梁

    我國率先完成杜仲基因測序

      中國林業科學研究院經濟林研究開發中心消息:該中心杜紅巖團隊、烏云塔娜團隊聯合中國熱帶農業科學院橡膠研究所李德軍團隊及山東貝隆杜仲生物工程有限公司高瑞文團隊,歷時五年,合作完成了杜仲基因測序項目。成果在國際知名學術期刊《分子植物》上在線發表。此舉使我國成為世界上首個完成杜仲基因測序的國家。圖片來源

    橡膠樹育種路上的“石頭”能數清了

      橡膠樹是重要的熱帶經濟作物,其生長狀況直接關系到天然橡膠產量與品質。石細胞作為樹皮中具有代表性的機械組織,其分布特征與橡膠樹的抗逆性和生理發育密切相關。分割技術對準確識別石細胞并提取其結構參數具有重要意義,有助于加快橡膠樹的表型分析進程,提升分子育種效率和橡膠林管理的智能化水平。  然而,當前橡

    我國科學家完成杜仲基因測序

      近日,我國科學家研究獲得杜仲高質量基因組序列并解析了杜仲環境適應及膠生物合成機制。圖片來源于網絡  天然橡膠與石油、煤炭和鋼鐵并稱為四大工業原料,是關系國計民生的基礎產業和重要戰略物資。杜仲是傳統的名貴中藥材,也是我國特有的產膠植物。在眾多產膠植物中,杜仲產業化前景最大,極具開發潛力。近日,中國

    橡膠樹花青素合成調控研究獲進展

    近日,中國熱科院橡膠所在橡膠樹花青素生物合成的轉錄調控方面取得重要進展,相關成果發表于《工業作物和產品》。該成果不僅豐富了對橡膠樹花青素合成轉錄調控的認識,也為橡膠樹遺傳轉化體系提供了高效的選擇標記。橡膠樹葉片的發育過程可分為古銅期、變色期、淡綠期和穩定期四個階段。研究團隊通過高效液相色譜分析發現一

    橡膠樹花青素合成調控研究獲進展

      近日,中國熱科院橡膠所在橡膠樹花青素生物合成的轉錄調控方面取得重要進展,相關成果發表于《工業作物和產品》。該成果不僅豐富了對橡膠樹花青素合成轉錄調控的認識,也為橡膠樹遺傳轉化體系提供了高效的選擇標記。  橡膠樹葉片的發育過程可分為古銅期、變色期、淡綠期和穩定期四個階段。研究團隊通過高效液相色譜分

    今夏最熱門的基因組測序研究,中國學者再立新功

      大千世界無奇不有,這都是進化的功勞。大航海時代,科學家們揚帆遠航去探索大自然的神奇造化。如今,科學家們正在測序技術的幫助下進一步揭示生命的奧秘。The scientist雜志對近期最熱門的一些基因組測序成果進行了盤點,我國學者參與的兩項測序研究格外引人注目。  種屬:虎鯨(Orcinus orc

    我國研究發明出橡膠樹籽苗芽接育苗技術

    工作人員在海南橡膠樹氣刺微割技術示范基地割膠。  經過20多年的研究,我國熱帶農業科研人員在橡膠樹傳統芽接育苗技術的基礎上,研究發明出橡膠樹籽苗芽接育苗技術。這標志著我國橡膠樹優良品種籽苗芽接育苗技術達到了國際領先水平。  記者從中國熱帶農業科學院獲悉,該院科研人員這些年開展了橡膠樹

    防治橡膠樹割面干涸研究有了新發現

    原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514917.shtm近日,中國熱帶農業科學院橡膠研究所死皮機理與防控團隊在橡膠樹割面干涸發生機制研究方面取得新進展,解析了橡膠樹割面干涸發生的ceRNA(競爭性內源RNA)調控網絡,進一步增進了對橡膠樹

    橡膠樹樹干輪廓信息自動化提取方面獲進展

    原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503706.shtm近日,中國熱帶農業科學院橡膠研究所(以下簡稱橡膠所)機械裝備與自動化團隊在橡膠樹樹干輪廓信息提取方面獲得新進展,成功提取了橡膠樹樹干輪廓曲線及其表面特征信息,不僅能提升割膠裝備樹干輪廓

    科學家破譯“橡膠草”基因組

      天然橡膠是與石油、鋼鐵、煤炭并重的世界四大工業原料之一,而中國是天然橡膠消費大國,目前對外依賴度超80%。記者從中國科學院遺傳與發育生物學研究所了解到,我國科學家已成功繪制出橡膠草基因組草圖。該成果將加快橡膠草替代橡膠樹,成為新的橡膠“生產者”的進程。  據了解,巴西三葉橡膠樹一直是天然橡膠的主

    中科院等完成橡膠草基因組序列解析

       中國科學院遺傳與發育生物學研究所李家洋研究組與中國農業科學院、中國熱帶農業科學院等合作,在橡膠草基因組序列解析方面取得重要進展,標志著以橡膠草作為模式植物進行天然橡膠合成研究進入后基因組時代。研究成果近日在線發表在權威學術期刊《國家科學評論》(National Science Review)雜

    新發現橡膠樹是“機會主義的”水分攝取者

      三葉橡膠樹原是亞馬遜的熱帶雨林樹種,其生長需要充足的熱量和分配均勻的降水,大致分布于10°N~10°S,最高海拔600m。近半個多世紀以來,由于人們對橡膠需求量的劇增,其已被引種到了東南亞、南美、非洲的許多高緯、高海拔地區。對西雙版納地區而言,近30年來最顯著的土地利用變化就是大面積的熱帶雨林被

    版納植物園發現橡膠樹是“機會主義的”水分攝取者

      三葉橡膠樹原是亞馬遜的熱帶雨林樹種,其生長需要充足的熱量和分配均勻的降水,大致分布于10°N~10°S,最高海拔600m。近半個多世紀以來,由于人們對橡膠需求量的劇增,其已被引種到了東南亞、南美、非洲的許多高緯、高海拔地區。對西雙版納地區而言,近30年來最顯著的土地利用變化就是大面積的熱帶雨林被

    科學家揭開橡膠樹乳管天然生物反應器奧秘

    近日,中國熱帶農業科學院橡膠研究所研究員晁金泉團隊聯合開展橡膠樹乳管的靶向代謝組研究,系統闡明橡膠樹150年馴化過程中代謝物變化模式,鑒定到數個調控高附加值代謝物合成的關鍵基因,對充分發掘橡膠樹乳管的“生物反應器”功能、助力我國天然橡膠產業的提質增效有重要的指導意義。相關研究成果發表在《植物學報(英

    全是因為這種被聯合國稱為生物武器的病菌

      不知道大家有沒有去過南美旅行。如果你搜索一下我國來往南美任何地方的航班,會發現沒有直飛的航班,總要在某處中轉,旅行時間總是超出一天。  實際上不僅是我國,東南亞大多數國家都沒有直飛南美的航班。這背后的原因是一種看不見的生物,而這種生物也被聯合國列為生物武器,它就是橡膠南美葉疫病菌。  和石油類似

    我國科學家獲得全球首個純合基因編輯橡膠苗

    近日,中國熱帶農業科學院橡膠研究所組培與轉基因團隊在全球率先獲得了橡膠樹CRISPR/Cas9純合基因編輯橡膠苗。相關研究成果在線發表于《經濟作物和產品》(Industrial Crops and Products)。橡膠樹基因編輯植株:上排為嵌合植株;下排為純合植株。中國熱科院供圖該團隊前期已實現

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