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  • antiCRISPR沉默CRISPRCas9系統的分子機理

    中國科學院生物物理研究所王艷麗課題組和加拿大多倫多大學Karen Maxwell課題組的合作論文Inhibition of CRISPR-Cas9 ribonucleoprotein complex assembly by anti-CRISPR AcrIIC2 在《自然-通訊》(Nature Communications)雜志在線發表。該工作報道了2.45埃的apo AcrIIC2和2.28埃的結合了Neisseria meningitides Cas9 (Nme1Cas9) BH domain的AcrIIC2復合物晶體結構,結合體內和體外實驗,系統闡述了anti-CRISPR蛋白AcrIIC2沉默CRISPR-Cas9系統的分子機理。王艷麗課題組一直致力于CRISPR-Cas系統抗病毒作用機理的研究,前期研究揭示了一系列重要的CRISPR-Cas系統的作用機理(Nature 2014, Cell 2015, Cell R......閱讀全文

    竊取CRISPR的免疫“黑客”

      英屬哥倫比亞大學的研究人員發現,一種感染主要淡水細菌的病毒使用“偷來”的CRISPR劫持宿主的免疫系統。這種病毒黑客在控制宿主免疫系統之后,迅速給系統打上補丁,以確保其他黑客無法闖入。這項研究發表在美國微生物學會旗下的mBio雜志上。  細菌一直在與病毒或入侵核酸進行斗爭,為此它們演化出了多種防

    CRISPR功能研究入門指南

      基因組測序讓我們意識到,人類基因組只有一小部分被翻譯成蛋白質。其實我們基因組的80%會轉錄成RNA,但這些轉錄本大多不生成蛋白質。近年來人們發現非編碼RNA往往與人類疾病有關,不過絕大多數非編碼RNA的功能還是未知的。CRISPR/Cas9在這方面可以起到重要的作用。  CRISPR激活(CRI

    CRISPR分子診斷技術(五)

    25 ? DETECTR達到了aM水平的靈敏度和≤7個堿基的特異性。例如,它能準確地檢測出受試者攜帶的是哪種亞型的HPV。圖片來源:參考資料2和1026 ??在同期Science論文中,張鋒團隊從三個方面著手完善SHERLOCK:多重化、定量化和去熒光。先說多重化:他們挑選了來自兩個不同菌株的Cas

    FEBS發布CRISPR技術特刊

      《FEBS Journal》雜志近日發布了一份介紹如何使用CRISPR/Cas9的特刊,它包含9篇綜述文章,由知名研究人員撰寫,包括哈佛大學的George Church和Norbert Perrimon,西班牙阿利坎特大學的Francisco Mojica,以及Sloan Kettering紀念

    CRISPR分子診斷技術(一)

    本篇為“連環畫”系列中的第二篇。“連環畫”中的每一篇都會介紹一個最新生物醫藥技術或趨勢。以圖畫為主,文字為輔。雖然無法做到系統全面,但希望能給讀者帶來一些啟發。每篇文章只代表作者個人的觀點或解讀,與禮來亞洲基金的投資決定無關。1 ???脊椎動物的免疫系統分為先天免疫(或非特異性免疫),和獲得性免疫(

    CRISPR分子診斷技術(七)

    39 ??加上Cas9,它們為分子診斷和基因編輯提供了多樣靈活的工具。圖片來源:參考資料240??? CRISPR分子診斷技術并不是只有Doudna和張鋒兩家在開發。2019年3月,在Keck Graduate Institute任職的Kiana Aran博士與合作者在Nature Biomedic

    CRISPR可以做分子診斷

    CRISPR-Cas系統背景回放面對噬菌體的威脅,細菌進化出了一套專門針對噬菌體或外源性遺傳物質的CRISPR-Cas免疫系統。CRISPR全稱為“簇狀、規律間隔的、短回文重復序列”(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repe

    CRISPR分子診斷技術(六)

    34 ???不是所有的塞卡病毒都一樣。2017年9月, 中科院遺傳所的許執恒團隊和軍事醫學科學院的秦成峰團隊在Science上報導,prM蛋白的一個突變(S139N)增加了塞卡病毒的傳染性,并引起更嚴重的小頭癥和更高的致死率。在該論文發表后一周內,Sabeti團隊和張鋒團隊就設計、開發出幾個能區分出

    CRISPR分子診斷技術(三)

    13 ???或許是因為LbuC2c2的特異性和非特異性剪切活性遠遠高于LshC2c2的相應活性, Doudna團隊意識到LbuC2c2可以被用來構建高特異性、高靈敏度的RNA檢測方法。若想檢測出某一特定序列的RNA分子,先將與其互補的crRNA和LbuC2c2蛋白組裝,再加上一些報告RNA分

    CRISPRCas9-原理

    CRISPR/Cas技術是什么?CRISPR/Cas系統是一種原核生物的免疫系統,用來抵抗外源遺傳物質的入侵,比如噬菌體病毒和外源質粒。同時,它為細菌提供了獲得性免疫:這與哺乳動物的二次免疫類似,當細菌遭受病毒或者外源質粒入侵時,會產生相應的“記憶”,從而可以抵抗它們的再次入侵。CRISPR/Cas

    CRISPR分子診斷技術(四)

    19 ???由于其高靈敏度和特異性,CRISPR診斷技術或CRISPR-Dx可以有很多用途:病毒檢測和病毒亞型區分,病菌識別和耐藥性基因確認,即時檢測(POCT), 患者基因分型,以及癌癥突變分析和液體活檢。這篇論文也初步展示了CRISPR-Dx在這些方面的應用前景。圖片來源:參考資料320???比

    CRISPR華裔牛人不止張鋒-此學者連發Nature等文章改進CRISPR

      作為納斯達克CRISPR“第一股”Editas公司的聯合創始人之一,哈佛大學化學與化學生物學教授、Howard Hughes醫學研究所研究員David R. Liu也是著名的CRISPR科研人員,據稱這位教授是一位從來沒有做過博士后的年輕教授,他早年畢業于哈佛大學,1999年在加州大學伯克利校區

    媲美CRISPRCas9,-新CRISPR-工具探知90%的基因編輯領域

      2類CRISPR–Cas系統,例如Cas9和Cas12,已被廣泛用于靶向真核基因組中的DNA序列。但是,代表自然界中所有CRISPR系統90%的1類CRISPR-Cas系統在基因組工程應用中仍未開發。杜克大學(Duke University)的生物醫學工程師利用此前未被探索的CRISPR技術,精

    CRISPR先驅獲得新突破:開發更安全的CRISPRCas9基因療法

      人們一直希望用CRISPR-Cas9基因編輯技術治療甚至治愈復雜的神經疾病。帕金森病、亨廷頓舞蹈病和阿爾茨海默癥的現有藥物只能緩解癥狀,無法阻止疾病的發展。“但對于確定了致病基因的疾病來說,基因編輯技術有望永久終止其進程,”加州大學伯克利分校Jennifer Doudna實驗室的博士后Brett

    CRISPR先驅獲得新突破:開發更安全的CRISPRCas9基因療法

    人們一直希望用CRISPR-Cas9基因編輯技術治療甚至治愈復雜的神經疾病。帕金森病、亨廷頓舞蹈病和阿爾茨海默癥的現有藥物只能緩解癥狀,無法阻止疾病的發展。“但對于確定了致病基因的疾病來說,基因編輯技術有望永久終止其進程,”加州大學伯克利分校Jennifer Doudna實驗室的博士后Brett S

    Science關注CRISPR重要新成果

      亨廷頓氏病(Huntingtons disease)是由破壞大腦的突變蛋白引起的一種神經系統疾病,早期表現為情緒波動及不可控制的抽搐,最終可發展成癡呆甚至死亡。在美國大約有3萬人受累于這一疾病,當前沒有治愈的方法。現在一種許多人相信能獲得諾貝爾獎的基因編輯新方法,被證實可在小鼠體內有效阻止缺陷蛋

    Cell:CRISPR解答細胞代謝謎題

      眾所周知,線粒體是我們細胞中的發電廠,它利用呼吸作用來釋放我們食物中的能量,捕獲三磷酸腺苷(ATP)分子中的能量。  在發表于7月30日《細胞》(Cell)雜志上的兩篇研究論文中,來自麻省理工學院的研究人員揭示出了增殖細胞,包括腫瘤細胞需要線粒體呼吸作用的原因。盡管有許多其他的途經可以生成ATP

    盤點2017年CRISPR技術突破

    圖片來源于網絡    CRISPR技術日新月異,研究人員不僅為這種精確且相對易于操作的基因編輯技術尋找新的應用,而且也在進一步的完善這種技術,賦予它更多新的功能,今年CRISPR引人注目的技術突破包括:  RNA編輯  雖然人體很多疾病是來自于DNA,但是由于基因承載著生命最根源的信息,因此直接對D

    CRISPR基因編輯動物引爭議

    隨著CRISPR基因編輯技術的不斷進步,科學家已將其應用于馬、綿羊、豬等動物的遺傳改良。英國《自然》網站在日前的報道中指出,經過基因編輯的豬和綿羊等動物,正逐漸在農業領域獲得認可。這些技術可提升動物的性狀表現,為人類提供更安全、優質的肉類產品。但經CRISPR技術改造的馬,卻被馬球比賽拒之門外。專家

    CRISPR的新前沿:編輯RNA

      基因編輯工具CRISPR令科學家們修改DNA的能力發生了革命性的變化,如今,該工具的一種新的版本能對RNA進行靶向修改。編輯RNA而不是DNA有若干優點,例如,它能減輕與DNA相關的在倫理方面的顧慮,它能為科學家在活體生物中提供更為精確的編輯時間框架(如在關鍵性的發育期中)。在這里,David

    Nature:擺弄CRISPR的生物黑客

      完全未接受過正規的科學訓練,但這卻并未能阻止Johan Sosa去涉足最強大的一種分子生物學工具。3年前,科學家們開發出了這一稱作為CRISPR的技術來靶向改造DNA。Sosa現已利用CRISPR完成了幾項試管實驗。他希望下周能夠在酵母中嘗試這種方法,并在遲些時候將之應用于模式植物擬南芥。  C

    用CRISPR迅速鎖定致病突變

      CRISPR/Cas技術可以實現定向基因組編輯,快速生成轉基因動物模型用于研究人類遺傳疾病。德國科學家們利用外顯子測序和CRISPR/Cas基因組編輯,在短時間內鑒定了一種人類肢體缺陷的致病突變。這項成果發表在一月十一日的Genome Research雜志上。  細菌一直在與病毒或入侵核酸進行斗

    國際期刊評論CRISPR基因療法

      在醫療領域,基因編輯技術可以更加準確、深入地了解疾病發病機理和探究基因功能,可以改造人的基因,達到基因治療的目的等。今年五月份,來自中山大學的遺傳學,在世界上首次嘗試使用CRISPR–Cas9基因組編輯技術,修改來自人類胚胎的疾病相關DNA,從而引發了科學界的激烈爭論。這篇論文發表在五月份的《P

    CRISPR讓腫瘤細胞自我抑制

      近日,一項新研究發現,CRISPR-Cas9基因組編輯系統能將一個促進小鼠腫瘤生長的細胞信號轉變為縮小腫瘤的信號。相關論文9月5日在線發表于《自然—方法》期刊。  真核細胞(包括植物和動物細胞)的存活和凋亡由它們收到的調控其基因表達的信號決定。在這一實驗中,深圳大學第一附屬醫院劉宇辰及同事使用了

    Nature-Biotechnology:CRISPR再獲重要改良

      Broad研究所的研究團隊日前開發了一個獨特的CRISPR-Cas9基因控制系統。該系統只需要催化活性的Cas9,就能在同一個細胞中敲除和激活不同基因。這一重要成果發表在十月五日的Nature Biotechnology雜志上,文章的通訊作者是Broad研究所Silvana Konermann,

    Science關注CRISPR重要新成果

      亨廷頓氏病(Huntingtons disease)是由破壞大腦的突變蛋白引起的一種神經系統疾病,早期表現為情緒波動及不可控制的抽搐,最終可發展成癡呆甚至死亡。在美國大約有3萬人受累于這一疾病,當前沒有治愈的方法。現在一種許多人相信能獲得諾貝爾獎的基因編輯新方法,被證實可在小鼠體內有效阻止缺陷蛋

    CRISPR基因編輯的臨床之路

      CRISPR基因編輯技術不僅是炙手可熱的研究技術,也在最短的時間內走出實驗室,邁向臨床。今年6月,美國NIH的重組DNA顧問委員會已經給美國的第一例臨床試驗開了綠燈。研究人員計劃用CRISPR/Cas9來增強癌癥療法。  早些年,基因編輯作為一種治療工具,曾遭遇重大失敗,特別是18歲的Jesse

    CRISPR“剪刀”改變蟻群種系

      基因編輯技術CRISPR革新了基因研究方式。目前,該技術已被廣泛用于修飾單細胞生物體及復雜生物體內的特殊細胞類型。近日,兩個獨立的研究組報告稱,他們使用CRISPR處理了螞蟻卵,從而改變了整個蟻群的種系。相關論文近日發表于《細胞》雜志。  “這些研究證明人們也可以改變螞蟻的遺傳基因。”其中一篇論

    -Crispr技術:蹣跚起步-漸成新寵

      1月30日,《細胞》雜志網站報道,全球首對靶向基因編輯猴子已在中國出生,科學家采用的是最新基因編輯技術Crispr,可以對目標DNA進行插入、刪除或重寫,類似計算機編輯文字一樣讓科學家對物種的基因進行編輯,而且成功率一般可提高到30%,甚至50%。美國哈佛大學的George Church說,

    Nature發表CRISPR重要新成果

      來自佐治亞大學的研究人員報告稱,他們利用CRISPR/Cas9技術對可引起腹瀉病——隱孢子蟲病的單細胞微小寄生蟲隱孢子蟲(Cryptosporidium)進行了遺傳改造,由此開創了研究這類病原體的全新時代。他們發表在《自然》(Nature)雜志上的研究結果,最終將幫助學術界和產業界開發出針對隱孢

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