分子實驗方法4:RNA的提取和cDNA合成
第一節 概 述 從真核生物的組織或細胞中提取mRNA,通過酶促反應逆轉錄合成cDNA的第一鏈和第二鏈,將雙鏈cDNA和載體連接,然后轉化擴增, 即可獲得cDNA文庫,構建的cDNA文庫可用于真核生物基因的結構、表達和調控的分析;比較cDNA和相應基因組DNA序列差異可確定內含子存在和了解轉錄后加工等一系列問題。總之cDNA的合成和克隆已成為當今真核分子生物學的基本手段。自70年代中葉首例cDNA克隆問世以來,已發展了許多種提高cDNA合成效率的方法,并大大改進了載體系統,目前cDNA合成試劑已商品化。cDNA合成及克隆的基本步驟包括用反轉錄酶合成cDNA第一鏈,聚合酶合成cDNA第二鏈,加入合成接頭以及將雙鏈DNA克隆到于適當載體(噬菌體或質粒)。 一、RNA制備 模板mRNA的質量直接影響到cDNA合成的效率。由于mRNA分子的結構特點,容易受RNA酶的攻擊反應而降解,加上RNA酶極為穩定且廣泛存在,因而在提取過程中要嚴......閱讀全文
cDNA的合成
一 原理 逆轉錄PCR?(RT-PCR) 具有靈敏度高、專一性好、簡便快捷等優點,其不僅是定量檢測微量樣品和表達水平低的基因的一種有效方法,同時也是從真核生物中獲得目的基因的一條重要途徑。 cDNA的合成是RT-PCR的重要環節。以mRNA為模板,在逆轉錄酶的催化下,隨機引物、oligo(dT)或基
植物RNA提取實驗
實驗方法原理 獨特的裂解液/β-巰基乙醇迅速裂解細胞和滅活細胞RNA酶,植物RNA助提劑PLANTaid幫助結合多糖多酚并通過離心去除,然后用乙醇調節結合條件后,RNA在高離序鹽狀態下選擇性吸附于離心柱內硅基質膜,再通過一系列快速的漂洗-離心的步驟,去蛋白液和漂洗液將細胞代謝物,蛋白等雜質去除,
動物RNA提取實驗
SV總RNA試劑盒提取法 Trizol試劑提取法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 SV Total RNA Isolation System (SV 總RNA
病毒RNA提取實驗
TE-飽和酚/氯仿提取法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 大多植物病毒RNA 為單鏈RNA ,并且其極性與mRNA 極性相同,植物病毒RNA 提取較為簡單,一般使用酚氯仿即可獲
真菌RNA提取實驗
液氮研磨法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 液氮研磨可裂解細胞,促使核蛋白體的解離,使RNA與蛋白質分離,并將RNA釋放到溶液中。當加入氯仿時,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚
真菌RNA提取實驗
實驗方法原理 液氮研磨可裂解細胞,促使核蛋白體的解離,使RNA與蛋白質分離,并將RNA釋放到溶液中。當加入氯仿時,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使RNA進入水相,離心后可形成水相層和有機層,這樣RNA與仍留在有機相中的蛋白質和DNA分離開。?實驗材料 菌絲體試劑、試劑盒 NaCl蒸餾水SDSTr
總RNA提取實驗
實驗方法原理 GTC和N-十二烷基肌氨酸鈉的聯合使用,將促使核蛋白復合體的解離,使RNA 與蛋白質分離,并將RNA 釋放到溶液中。而進一步從復合體中純化RNA ,則根據Chomc zynski和Sacchi的一步快速抽提法進行,采用酸性酚-氯仿混合液抽提。低pH值的酚將使RNA 進入水相
真菌RNA提取實驗
真菌RNA的提取可以:(1)用于真菌RNA干擾機制研究;(2)用于cDNA文庫構建等研究;(3)用于真菌分子生物學相應研究。實驗方法原理液氮研磨可裂解細胞,促使核蛋白體的解離,使RNA與蛋白質分離,并將RNA釋放到溶液中。當加入氯仿時,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使RNA進入水相,離心后可形成
病毒RNA提取實驗
實驗方法原理 大多植物病毒RNA 為單鏈RNA ,并且其極性與mRNA 極性相同,植物病毒RNA 提取較為簡單,一般使用酚氯仿即可獲得滿意結果。實驗材料 TMV病毒液試劑、試劑盒 TE-飽和酚:氯仿氯仿NaAc乙醇TE緩沖液雙菌水儀器、耗材 冷凍臺式離心機低溫真空干燥儀電泳儀電泳槽實驗步驟 一、實驗
病毒RNA提取實驗
病毒RNA提取可以:(1)用于RNA病毒復制機制研究;(2)用于反向遺傳學研究;(3)用于分子病毒學其他研究。實驗方法原理大多植物病毒RNA 為單鏈RNA ,并且其極性與mRNA 極性相同,植物病毒RNA 提取較為簡單,一般使用酚氯仿即可獲得滿意結果。實驗材料TMV病毒液試劑、試劑盒TE-飽和酚:氯
植物RNA提取實驗
直接研磨法 液氮研磨法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 通過裂解液β-巰基乙醇迅速裂解細胞和滅活細胞RNA酶,植物RNA助提劑PLANTaid幫助結合多糖多酚并通過離
動物RNA提取實驗
實驗方法原理 SV Total RNA Isolation System (SV 總RNA 純化系統)可在1小時內從組織、培養細胞和白細胞中提取純化完整總RNA,方法簡單、快速。該系統以膜為基礎,根據組織類型的不同,每次最多可純化60 mg 組織。系統包含DNase 處理步驟,直接在小離
總RNA提取實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 一些公司推出的總RNA 提取試劑盒,可以用來制備高質量的可用于建庫的RNA 。該總RNA 純化系統采用兩種著名的RNA 酶抑制劑,異硫氰酸弧(GTC)和β-巰基乙醇,加上整個操作都在冰浴下進行,這樣就能顯著降低RNA 的
反轉錄合成單鏈-cDNA-實驗
cDNA 合成反應的體積,依賴于所用的錨定-任意引物組合的數目。下面提供的方案,適用于 24 個引物組合和兩個樣品。對于更多的樣品和/或更多的引物組合,調整相應主體混合液的體積。本實驗來源于 PCR 實驗指南(第二版),作者:種康,瞿禮嘉。試劑、試劑盒RNART主體混合液儀器、耗材薄壁PCR管離心管
反轉錄合成單鏈-cDNA-實驗
試劑、試劑盒 RNART主體混合液儀器、耗材 薄壁PCR管離心管熱循環儀實驗步驟 一、材料1.核酸和寡核苷酸來自方案2的RNA為每個單獨的H-T11M引物,分別配制RT主體混合液蒸餾水 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?28.2ul5XRT緩沖液 ? ? ? ? ? ?
反轉錄合成單鏈-cDNA-實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 RNA RT主體混合液 儀器、耗材 薄壁PCR管 離心管 熱循環儀
RNA提取與RTPCR(4)
2.8 小量RNA檢測方法的提高 當僅有小量RNA時,RT-PCR尤其具有挑戰性。在RNA分離過程中加入的作為載體的糖元有助于增加小量樣品的產量。可以在加入Trizol的同時加入無RNase的糖元。糖元是水溶性的,可以同RNA保持在水相中以輔助隨后的沉淀。對于小于50mg的組織或106個培養細胞
cDNA第一鏈的合成的方法
所有合成cDNA第一條鏈的方法都要用依賴于RNA的DNA聚合酶(反轉錄酶)來催化反應,主要有兩個關鍵因素,一個是mRNA模板,另一個是反轉錄酶 。商品化反轉錄酶有從禽類成髓細胞瘤病毒純化到的禽類成髓細胞病毒(AMV)逆轉錄酶和從表達克隆化的Moloney鼠白血病病毒反轉錄酶基因的大腸桿菌中分離到的鼠
肝臟細胞RNA的提取原理、材料和方法
一.原理?RNA提取技術不僅是分子生物學技術的重要組成部分,也是功能基因組學科研技術的重要基礎。從RNA水平研究生物體內基因的調控機制,已成為分子生物學研究的一個重要手段。對某一生物或組織進行性狀研究,首先要獲得該性狀基因,從組織細胞中分離完整的RNA對于分子克隆和基因表達分析等實驗是至關重要的,如
cDNA合成技術
實驗材料RNA試劑、試劑盒α32PdNTPmRNA甲基氫氧化汞β-巰基乙醇RNase抑制劑引物01igo dTTris-HClMgCl2KCl逆轉錄酶EDTA酚-氯仿乙醇瓊脂糖HepesDTTDNA聚合酶核酸酶S1儀器、耗材SephadexG-100離心柱層析離心管恒溫水浴鍋電泳儀低溫離心機實驗步驟
cDNA合成技術
? ? ? ? ? ? 實驗材料 RNA 試劑、試劑盒 α32PdNTP mRNA 甲基氫氧化汞 β-巰
cDNA合成技術
實驗材料 RNA試劑、試劑盒 α32PdNTPmRNA甲基氫氧化汞β-巰基乙醇RNase抑制劑引物01igo dTTris-HClMgCl2KCl逆轉錄酶EDTA酚-氯仿乙醇瓊脂糖HepesDTTDNA聚合酶核酸酶S1儀器、耗材 SephadexG-100離心柱層析離心管恒溫水浴鍋電泳儀低溫離心機實
細胞RNA的提取方法
(一)細胞總RNA的提取1、6孔板細胞匯合度為90-100%時,取出無菌室,去其上清,用PBS洗兩次后,每孔加TRIZOL試劑 1 ml,搖勻,無菌罩內消化3-5 min。2、將各孔內消化好的細胞裂解液吸到一DEPC處理過的1.5 ml EP管中,加新開的氯仿0.2 ml,輕搖15 s。3、室溫靜置
TRIzol-RNA提取方法
研究基因的表達和調控時常常要從組織和細胞中分離和純化RNA。TRIzol RNA提取方法:(1)操作簡單的,提取方便,回收率高; (2)提取的RNA的質量高,對cDNA庫,RT-PCR和Northern?Blot等分子生物學實驗起著很重要的影響。實驗方法原理Trizol是一種新型總RNA抽提試劑,采
TRIzol-RNA提取方法
(一)試劑準備1.TRIzol試劑。2.氯仿3.異丙醇4.75%乙醇(DEPC H2O配制)5.DEPC H2O(二)操作步驟1. 樣品處理:(1)培養細胞:收獲細胞1-5×107,移入1.5ml離心管中,加入1ml Trizol,混勻,室溫靜置5min。(2)組織:取50-100mg組織(新鮮或-
提取病毒RNA方法
一、用異硫氰酸胍提取提禽流感病毒的詳細步驟,可參考(我提過N次做定量PCR都沒問題):1.取200ul樣品數+陰性對照+陽性對照個1.5ml滅菌eppendorf管2.加600ul異硫氰酸胍,然后加入對照和樣品,再加200ul氯仿,顛倒混勻3.13000rpm離心15min4.在第3步離心快結束時,
提取植物rna方法
提到RNA的提取,是不是充滿了心酸和無奈呀,抽提過程中已十分小心謹慎了,但是有時候還是會出現RNA污染、降解的悲劇。別怕,今天小編給您介紹一種新的RNA提取方法,比以前的方法更快、更有效和更可靠,讓您從此不用再擔心的RNA的抽提了。 眾所周知:獲得純凈、完整的RNA樣品,是對一種植物的活性基因
TRIzol-RNA提取方法
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 Trizol是一種新型總RNA抽提試劑,采用變性劑即內含異硫氰酸胍酚和β-巰基乙醇等變性物質,能迅速破碎細胞,抑制細胞釋放出的核酸酶。異硫氰酸胍屬于解偶劑,是一類強力的蛋白質變性劑,可溶解蛋白質,并使蛋白質二級結構消失,細胞結構
cDNA第二鏈的合成方法
cDNA第二鏈的合成方法有以下幾種:(1)自身引導法。合成的單鏈eDNA3’端能夠形成一短的發夾結構,這就為第二鏈的合成提供了現成的引物。當第一鏈合成反應產物的DNA—RNA雜交鏈變性后利用大腸桿菌DNA聚合酶I Klenow片段或反轉錄酶合成eDNA第二鏈,最后用對單鏈特異性的S1核酸酶消化該環,
植物總RNA的提取實驗原理和操作步驟
一、實驗目的通過本實驗學習從植物組織中提取RNA的方法二、實驗原理RNA是一類極易降解的分子,要得到完整的RNA,必須最大限度地抑制提取過程中內源性及外源性核糖核酸酶對RNA的降解。高濃度強變性劑異硫氰酸胍,可溶解蛋白質,破壞細胞結構,使核蛋白與核酸分離,失活RNA酶,所以RNA從細胞中釋放出來時不