半制備規模單鏈RNA純化
引言寡核苷酸合成是非常高效和高產率的過程。在固相載體上進行寡核苷酸反應的典型產率為每耦合階98~99.5%。在典型的多階寡核苷酸合成中,雜質聚集在一起,即使是一般大小的21基體寡核苷酸的總產率也達到67~90%,較長鏈的寡核苷酸的產率相應較低。研究人員通常需要使用純度高于初步合成混合物的材料。因此,用于基因敲除、基因分型和診斷目的寡核苷酸通常需要在合成后進行純化。適合實驗室規模寡核苷酸純化的經濟可行的解決方案很少,而現有的方法(比如離子交換色譜分析法和聚丙烯酰胺凝膠電泳法)通常比較繁瑣和費時。在本應用說明書中,我們介紹了一種成本低、速度快的中等數量材料的純化方法,單次進樣載量高達140 nmoles,采用沃特世 ACQUITY UPLC?系統和寡核苷酸分離技術(OST)色譜柱化學技術可達到95%以上的最終純度。所提出的純化規模與標準的寡核苷酸合成規模匹配良好(50至250 nmol)。下述方法可在15至30分鐘時間內......閱讀全文
半制備規模單鏈RNA純化
寡核苷酸合成是非常高效和高產率的過程。在固相載體上進行寡核苷酸反應的典型產率為每耦合階98~99.5%。在典型的多階寡核苷酸合成中,雜質聚集在一起,即使是一般大小的21基體寡核苷酸的總產率也達到67~90%,較長鏈的寡核苷酸的產率相應較低。研究人員通常需要使用純度高于初步合成混合物的材料。因此,
半制備規模單鏈RNA純化
引言寡核苷酸合成是非常高效和高產率的過程。在固相載體上進行寡核苷酸反應的典型產率為每耦合階98~99.5%。在典型的多階寡核苷酸合成中,雜質聚集在一起,即使是一般大小的21基體寡核苷酸的總產率也達到67~90%,較長鏈的寡核苷酸的產率相應較低。研究人員通常需要使用純度高于初步合成混合物的材料。因此,
半制備規模單鏈RNA純化(一)
Sean M. McCarthy and Martin GilarWaters Corporation, Milford, MA, U.S.引言寡核苷酸合成是非常高效和高產率的過程。在固相載體上進行寡核苷酸反應的典型產率為每耦合階98~99.5%。在典型的多階寡核苷酸合成中,雜質聚集在一起,即使是一
半制備規模單鏈RNA純化(二)
圖2中所示被選中的餾份收集窗表示不同的質量負荷。峰值采集后,樣品可以根據需要對等分和干燥,以便長期儲存。TEAA的揮發性使離子對緩沖組分的去除非常容易。溶劑蒸發后被純化的寡核苷酸實際上是不含鹽的。?UPLC條件純化RNA寡核苷酸的純度通過ACQUITY UPLC系統來驗證。如圖3所示,我們的純化方法
單鏈RNA的結構特點
中文名稱單鏈RNA英文名稱single-stranded RNA;ssRNA定 義只含有一條鏈的RNA分子。生物體中絕大部分RNA是單鏈RNA,形成二級結構時,是既有單鏈、又有雙鏈結構域的RNA分子;只有某些RNA病毒是由兩條鏈互補而成的雙鏈RNA。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與
細胞化學詞匯單鏈RNA
中文名稱:單鏈RNA英文名稱:single-stranded RNA;ssRNA定 義:只含有一條鏈的RNA分子。生物體中絕大部分RNA是單鏈RNA,形成二級結構時,是既有單鏈、又有雙鏈結構域的RNA分子;只有某些RNA病毒是由兩條鏈互補而成的雙鏈RNA。應用學科:生物化學與分子生物學(一級學科)
單鏈RNA的基本信息
中文名稱單鏈RNA英文名稱single-stranded RNA;ssRNA定 義只含有一條鏈的RNA分子。生物體中絕大部分RNA是單鏈RNA,形成二級結構時,是既有單鏈、又有雙鏈結構域的RNA分子;只有某些RNA病毒是由兩條鏈互補而成的雙鏈RNA。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與
單鏈RNA的基本信息介紹
一般來說生物學家是根據RNA能否直接起mRNA作用而分成正鏈ssRNA病毒與負鏈ssRNA病毒兩種。 (1)正鏈RNA病毒(如脊髓灰質炎病毒)的ssRNA可直接起mRNA作用,轉譯早期蛋白質,包括RNA多聚酶和抑制宿主細胞合成代謝的調控蛋白。然后在RNA多聚酶的作用下,以ssRNA(正鏈)為模板
純化RNA實驗——從組織中純化總RNA
實驗材料組織試劑、試劑盒RNA 抽提緩沖液氯仿實驗步驟1. 從動物取下組織,直接進行第 2 步或在液氮中快速冷凍新鮮解剖的組織。冷凍后的組織可以貯存在 -70℃。2. 組織(0.05~0.3 g)在 2.0 ml RNA 抽提緩沖液中勻漿。3. 每管加 200 μl 氯仿,混合均勻,冰浴 15 分鐘
研究揭示正單鏈RNA病毒編碼小蛋白新策略
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510524.shtm
Science:重大進展!開發出單鏈DNA/RNA折紙術
DNA折紙術科學家們正在夢想著各種各樣的比人的頭發小一千倍的形狀,并希望這些形狀有朝一日引發計算、電子學和醫學變革。 如今,在一項新的研究中,來自美國亞利桑那州立大學和哈佛大學的研究人員在DNA納米技術上取得一項重大的新進展。他們開發出的一種被稱作單鏈折紙術(single-stranded o
純化RNA實驗
從培養的細胞中純化總RNA 從組織中純化總RNA ? ? ? ? ? ? 實驗材料 細胞
利用-Marligen-總-RNA-快速純化系統純化總-RNA-實驗
由 Marligen Biosciences 提供的 Rapid Total RNA System 可從各種樣品中提取 RNA,且產量和質量非常穩定。本實驗來源于 PCR 實驗指南(第二版),作者:種康,瞿禮嘉。試劑、試劑盒乙醇β-巰基乙醇儀器、耗材轉子-定子均化器或類似設備Marligen Rap
純化RNA實驗——從培養的細胞中純化總RNA
實驗材料細胞試劑、試劑盒RNA 提取緩沖液變性液水飽和酚儀器、耗材培養皿Falcon 2063 管實驗步驟1. 取 1 個細胞已長滿的 100 ml 培養皿,吸出培養液,加 2 ml RNA 提取緩沖液,用橡膠刮棒刮下細胞。RNA 提取緩沖液:變性液,20 mlβ-巰基乙醇,0.144 ml2 mo
利用-Marligen-總-RNA-快速純化系統純化總-RNA-實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 乙醇 β-巰基乙醇 儀器、耗材 轉子-定子均化器或類似設備 Marligen Ra
利用-Marligen-總-RNA-快速純化系統純化總-RNA-實驗
試劑、試劑盒 乙醇β-巰基乙醇儀器、耗材 轉子-定子均化器或類似設備 Marligen Rapid Total RNA System實驗步驟 一、材料1.緩沖液、溶液和試劑乙醇,70%和100%β-巰基乙醇2.特殊設備轉子-定子均化器或類似設備3.其他Marligen Rapid Total RNA
RNA提取與純化
實驗概要掌握RNA提取的基本技術,了解RNA提取過程中的各種注意事項。實驗原理RNA提取是分子生物學實驗中難度較大的實驗技術。?RNA提取和DNA提取有類似的地方,因為它們都是核酸,都具有較好的水溶性。提取RNA首先破碎細胞,然后用提取液將RNA溶出,反復抽提去除蛋白質,加入乙醇沉淀RNA,將RNA
分離純化總RNA
1)??????用酸性酚-硫氰酸胍-氯仿提取純化組織和細胞中的RNA1.??????選取從組織細胞或細胞中提取RNA的適宜方法組織a.???????分離組織并立即置于液氮中。b.??????將約100 mg冰凍組織含液氮的研缽中,用研棒研磨。研磨過程中可加入液氮使組織保持冰凍狀態。c.???????
新型跨界侵染植物與真菌負單鏈RNA病毒被發現
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519441.shtm西北農林科技大學植物保護學院教授孫麗英課題組發現了一種新型跨界侵染植物與真菌的負單鏈RNA病毒(VmNSRV1),相關研究成果近日發表在PNAS上。 ???該研究發現的新型真菌
新型跨界侵染植物與真菌負單鏈RNA病毒被發現
西北農林科技大學植物保護學院教授孫麗英課題組發現了一種新型跨界侵染植物與真菌的負單鏈RNA病毒(VmNSRV1),相關研究成果近日發表在PNAS上。???該研究發現的新型真菌病毒VmNSRV1分離自蘋果樹腐爛病的病原菌(Valsa mali)。(課題組供圖)該研究發現的新型真菌病毒VmNSRV1分離
使用-Trizol-純化-RNA-實驗
RNA 分離的酚基試劑的生產以 Chomczynski 方案為基礎。這些方案在從富含 RNA 酶的組織如胰腺中獲取 RNA 時最有用。這里介紹的是隨 Invitrogen 的 Trizol 試劑出售的方案的摘要,經 Invitrogen 允許做了修改。本實驗來源于 PCR 實驗指南(第二版),作者:
使用-Trizol-純化-RNA-實驗
實驗材料 磨細的組織試劑、試劑盒 Trizol氯仿異丙醇乙醇DEPC處理過的水實驗步驟 一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑Trizol(Invitrogen)氯仿異丙醇乙醇,75%,用焦碳酸二乙酯(DEPC) 處理過的水配制DEPC 處理過的水2. 細胞和組織50~100 mg 已磨細的組織二、方法1
使用-Trizol-純化-RNA-實驗
? ? ? ? ? ? 實驗材料 磨細的組織 試劑、試劑盒 Trizol 氯仿 異丙醇 乙醇
Poly(A)+RNA的分離純化
1)??????Poligo(dT)-纖維素層析法提取poly(A)+RNA裝柱與填柱1.??????取oligo(dT)-纖維素0.5~1.0 g,用0.1 mol/L NaOH重懸。2.??????用oligo(dT)-纖維素(0.5~1.0 ml柱體積)灌注DEPC處理過的一次性柱子(或塞以無
RNA的分離與純化
包括Northern雜交在內的許多分子生物學實驗均是以RNA為材料,mRNA的制備也需要一定質量的總RNA樣品,RNA的數量、純度與完整性將直接影響這些實驗的結果。RNA中rRNA的數量最多,占總量的80%~85%;tRNA及核內小分子RNA占15%~20%;mRNA僅占1%~5%。由于各種rRNA
生物素化寡聚脫氧胸苷鏈親和素磁珠純化帶-Poly(A)+RNA
試劑、試劑盒 GTC 抽提緩沖液 稀釋緩沖液 β-巰基乙醇 無 RNase 水 20XSSC 0.5XSSC 1XPBS。儀器、耗材 親和素-磁珠 (SA-PMP)生物素標記的 oligo(dT) 探針 磁架 75℃ 水浴50 ml 無菌 Corex 離心管 15 ml 螺旋蓋錐形離心管 Tissu
生物素化寡聚脫氧胸苷鏈親和素磁珠純化帶-Poly(A)+RNA
用磁性微球代轉纖維索作為介質,這種方法比較常用且已商品化。試劑、試劑盒GTC 抽提緩沖液稀釋緩沖液 β-巰基乙醇無 RNase 水20XSSC0.5XSSC1XPBS。儀器、耗材親和素-磁珠 (SA-PMP)生物素標記的 oligo(dT) 探針磁架75℃ 水浴50 ml 無菌 Corex 離心管1
生物素化寡聚脫氧胸苷鏈親和素磁珠純化帶-Poly(A)+RNA
生物素化寡聚脫氧胸苷-鏈親和素磁珠純化帶 Poly(A)+RNA ? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 GTC 抽提緩沖液 ? 稀釋
雙鏈RNA抑癌原理
雙鏈RNA抑癌原理是通過構建對癌癥細胞特異蛋白轉錄后得到的mRNA的反義RNA,從而通過堿基結合使得該蛋白表達被阻斷而最終導致癌細胞正常代謝通路受阻等,絕非所謂的食用后能夠起到抑癌作用;
?雙鏈RNA病毒的特點
雙鏈RNA病毒有兩個特點:一是它的基因組為10-12條雙鏈RNA分子;二是它有雙層衣殼,而沒有囊膜。病毒的RNA-RNA 聚合酶存在于髓核中,在該聚合酶的作用下病毒基因組轉錄正鏈RNA,它們自髓核逸出。它們既能作為mRNA,又能作為病毒基因組的模板。MRNA翻譯結構蛋白,裝配內層衣殼后,正鏈RNA進