二代測序鑒定鋁脅迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆（Glycine soja）是世界上種植面積最廣的作物之一。相比于栽培大豆，野生大豆能夠更好地適應自然環境的脅迫如干旱，堿，鹽脅迫。對野生大豆的性狀進行系統研究，將有助于栽培大豆的遺傳改良。近日，華南農業大學亞熱帶農業生物資源保護與利用國家重點實驗室年海教授領銜的課題組聯合使用第二代高通量測序技術對鋁脅迫下野生大豆miRNA及其靶基因進行鑒定和系統分析，新發現了一批的野生大豆miRNA和其作用的靶基因*。該研究成果發表在10月刊的BMC Plant Biology上。 MicroRNA（miRNA）是一類調控真核生物廣泛生理過程的內源性非編碼小RNA，它的調控作用是通過降解靶mRNA或是阻礙其翻譯來實現。植物miRNA通常與其靶基因完全或是近乎完全匹配，引起mRNA的降解。在植物中，miRNA參與調控發育全過程以及對生物或非生物脅迫的應答。要確定miRNA的功能就必須首先鑒定它們的靶基因。降解組測序是近來興......閱讀全文
二代測序鑒定鋁脅迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆（Glycine soja）是世界上種植面積最廣的作物之一。相比于栽培大豆，野生大豆能夠更好地適應自然環境的脅迫如干旱，堿，鹽脅迫。對野生大豆的性狀進行系統研究，將有助于栽培大豆的遺傳改良。近日，華南農業大學亞熱帶農業生物資源保護與利用國家重點實驗室年海教授領銜的課題組聯合使用第二代高通量測
二代測序鑒定鋁脅迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆(Glycine soja)是世界上種植面積最廣的作物之一。相比于栽培大豆，野生大豆能夠更好地適應自然環境的脅迫如干旱，堿，鹽脅迫。對野生大豆的性狀進行系統研究，將有助于栽培大豆的遺傳改良。近日，華南農業大學亞熱帶農業生物資源保護與利用國家重點實驗室年海教授領銜的課題組聯合使用第二代
BMC－Plant－Biology測序鑒定鋁脅迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆（Glycine soja）是世界上種植面積最廣的作物之一。相比于栽培大豆，野生大豆能夠更好地適應自然環境的脅迫如干旱，堿，鹽脅迫。對野生大豆的性狀進行系統研究，將有助于栽培大豆的遺傳改良。近日，華南農業大學亞熱帶農業生物資源保護與利用國家重點實驗室年海教授領銜的課題組聯合使用第二代高通
如何預測和鑒定miRNA的靶基因
免疫沉淀當然，確定miRNA與mRNA之間的互作，我們還有更直接的方法，那就是從實驗上尋找物理相互作用。我們可以利用RNA誘導沉默復合物（RISC）中的Argonaut（AGO）蛋白的抗體進行免疫共沉淀（co-IP）。目前更先進的方法是通過紫外線照射以交聯復合物，然后開展深度測序以鑒定發現的RNA，
江蘇農科院：miRNA調控茄科抗鹽脅迫
茄科包括許多重要的蔬菜作物，它們經常遭受鹽脅迫。microRNA（miRNA）已被發現參與調控植物的基因表達來應答鹽脅迫。然而，幾乎沒有關于茄科植物miRNA參與此類應答的報道。由江蘇省農業科學院蔬菜研究所莊勇副研究員領銜的課題組采用小RNA測序技術對此展開了深入分析，研究成果發表在近期的Int
四川農大：揭示miRNA調控玉米穗發育機制
microRNA(miRNAs)是一類內源性的非編碼小RNA，在植物的多種生理過程中發揮重要調控作用，包括代謝，激素反應，轉座子的表觀遺傳控制，脅迫應答。在模式植物如水稻和擬南芥中已進行了廣泛的miRNA研究。在玉米中，脅迫應答相關miRNA和其靶基因的研究也已開展過很多。然而，關于miRNA參
二代測序及其應用
二代測序為高通量測序，采用微珠或高密度芯片邊合成邊測序，代表有454，solexa，solid，高通量，可一次獲得數G數據，相對與第三代，都仍然需要擴增的方法放大信號，擴增后再檢測。二代測序應用如下：1、Illumina 原理：橋式PCR+4色熒光可逆終止+激光掃描成像。2、Roche 454：油包
二代測序及其應用
二代測序為高通量測序，采用微珠或高密度芯片邊合成邊測序，代表有454，solexa，solid，高通量，可一次獲得數G數據，相對與第三代，都仍然需要擴增的方法放大信號，擴增后再檢測。二代測序應用如下：1、Illumina 原理：橋式PCR+4色熒光可逆終止+激光掃描成像。2、Roche 454：油包
miRNA調控植物對鎘的應激反應
土壤中的重金屬污染是一個世界范圍內嚴重的環境問題，主要是由于一些人為活動，如采礦，工業活動和有機磷的使用等造成。土壤中鎘（Cd）可以很容易地被植物吸收，從而導致各種中毒癥狀，如降低生物量，葉片失綠，抑制根系生長，發生形態學改變，甚至植株死亡。大量研究表明，在植物中，microRNA（miRNA）參與
華南農大：miRNA調控植物對鎘的應激反應
土壤中的重金屬污染是一個世界范圍內嚴重的環境問題，主要是由于一些人為活動，如采礦，工業活動和有機磷的使用等造成。土壤中鎘（Cd）可以很容易地被植物吸收，從而導致各種中毒癥狀，如降低生物量，葉片失綠，抑制根系生長，發生形態學改變，甚至植株死亡。大量研究表明，在植物中，microRNA（miRNA
高通量快速驗證miRNA靶基因
盡管現在人們可以越來越準確地預測microRNA的沉默效果，但還是需要高通量而且準確的直接驗證技術來驗證microRNA的沉默效果。microRNA 這個在生物科學史上具有重要意義的小分子，在2008年又一次成為了世人矚目的焦點。microRNA通過與目標mRNA的3’UTR區域結合來阻止其翻譯
南師大：聯合分析魚類缺氧適應機制
瓦氏黃顙魚（Pelteobagrus vachelli）是亞洲知名的經濟魚類。然而，突然缺氧會導致其死亡。研究魚類缺氧適應的分子機制，不僅有助于理解魚類物種和缺氧信號通路的演變，也將指導缺氧耐受魚種的培育。盡管如此，對于魚類miRNA與mRNA的基因調控網絡，以及缺氧應答相關的信號通路仍然知之甚
什么是基因二代測序
第二代測序為高通量測序，采用微珠或高密度芯片邊合成邊測序，代表有454，solexa，solid，高通量，可一次獲得數G數據，相對與第三代，都仍然需要擴增的方法放大信號，擴增后再檢測。第二代測序技術的核心思想是邊合成邊測序（Sequencing by Synthesis），即通過捕捉新合成的末端的標
測序解析miRNA調控害蟲發育機制
小菜蛾（Plutella xylostella）是全球范圍內嚴重危害十字花科作物生長的鱗翅目害蟲，據估計每年造成的損失和防治成本達到40-50億美元。最近的轉錄組分析和基因組測序為了解小菜蛾適應環境脅迫的分子機制提供了一個極好的機會。盡管Etebari等1發現了在寄生脅迫下二齡幼蟲中的一組miRNA
科學家通過對野生大豆基因研究發現新型耐鹽基因
由香港中文大學、華大基因等單位聯合完成的野生大豆W05的全基因組測序工作，通過對野生大豆重要農業性狀關聯基因研究，發現了新的耐鹽基因。7月10日，最新研究成果于《自然通訊》雜志在線發表。 大約6000至9000年前，我國就開始進行野生大豆的馴化。馴化過程中，大豆的栽培種丟失了很多與環境適應相關
中國農大:測序解析miRNA調控害蟲發育機制
小菜蛾（Plutella xylostella）是全球范圍內嚴重危害十字花科作物生長的鱗翅目害蟲，據估計每年造成的損失和防治成本達到40-50億美元。最近的轉錄組分析和基因組測序為了解小菜蛾適應環境脅迫的分子機制提供了一個極好的機會。盡管Etebari等1發現了在寄生脅迫下二齡幼
單基因檢測和二代測序
在肺癌患者中，有一批攜帶驅動基因突變的患者，在治療上可以針對突變的基因采用靶向治療。在預后上，這部分患者也往往具有較長的生存期。目前，指南推薦了9個靶向治療的相關基因，他們分別是：EGFR、ALK、ROS1、Her2、KRAS、MET、RET、BRAF和最近一年剛進入指南的NTRK基因。為了識別這一
我國科學家獲多年生野生大豆高精度基因組圖譜
日前，國際植物學領域著名期刊《自然—植物》在線發表了山東農業大學張大健教授課題組在大豆基因組研究領域取得的新成果。該團隊首次獲得了多年生野生大豆的高精度基因組圖譜，填補了大豆屬泛基因組的空白，解析了大豆進化歷程，高效準確挖掘了大豆基因組的結構變異，拓寬了大豆分子育種可利用的基因資源，為大豆遺傳基礎解
我國科學家獲多年生野生大豆高精度基因組圖譜
日前，國際植物學領域著名期刊《自然—植物》在線發表了山東農業大學張大健教授課題組在大豆基因組研究領域取得的新成果。該團隊首次獲得了多年生野生大豆的高精度基因組圖譜，填補了大豆屬泛基因組的空白，解析了大豆進化歷程，高效準確挖掘了大豆基因組的結構變異，拓寬了大豆分子育種可利用的基因資源，為大
第二代基因測序的意義
基因測序只是基因檢測的方法之一，其又叫基因譜測序，是國際上公認的一種基因檢測標準。?基因測序廣為人知的還有針對唐氏綜合征篩查的無創產前基因檢測。只需要孕婦5毫升血，通過化驗血液中甲型胎兒蛋白（AFP）、人類絨毛膜促性腺激素（β-hCG）的濃度，就可以算出胎兒出現唐氏綜合征的危險性。最近公眾關注的H7
學者提出參與香蕉冷脅迫響應的級聯工作模型
中國科學院華南植物園果蔬保鮮技術研發與利用團隊在國家自然科學基金、廣東省自然科學基金等項目的資助下，在由microRNA介導的香蕉冷脅迫響應級聯調控方面取得新進展。近日，相關成果發表于《分子園藝》（Molecular Horticulture）。 防控冷害一直是水果保鮮產業的技術難題，而解析冷
二代測序技術
人們常說“事后諸葛亮”，可見“料事如神”是一個讓人艷羨的能力。現代科技的發展讓人們無限接近這種能力，天氣預報就是現代人諸多“料事如神”本領中的一種，不斷進步中切實提高了生活品質與舒適度。個人體會進步主要體現在兩個方面：1.越來越說人話。印象里小時候聽天氣預報感覺聽的是中文，但是這些中國話想表達什么聽
二代測序原理
第二代測序（Next-generation sequencing，NGS）又稱為高通量測序（High-throughput sequencing），是基于PCR和基因芯片發展而來的DNA測序技術。我們都知道一代測序為合成終止測序，而二代測序開創性的引入了可逆終止末端，從而實現邊合成邊測序（Seque
－達安基因：發力第二代基因測序產品
7月2日，國家食品藥品監督管理總局首次批準注冊的第二代基因測序診斷產品。基因測序隨即受到市場熱捧，基因測序領域龍頭企業的達安基因隨后也公告了公司第二代基因測序診斷產品“高通量測序儀及試劑醫療器械”注冊申請進展。 公告顯示，“半導體測序系統”已完成注冊檢驗及臨床試驗，并已向廣東省食品藥品監督管理
大豆基因組重測序表明:野生大豆遺傳多樣性更高
“中原有菽，庶民采之。”五千年前，華夏始祖將野生大豆馴化，變成今天的“五谷”之一。而今，一項被稱為“大豆回家”的基因組研究計劃在其故鄉中國取得突破。 11月15日，由香港中文大學、華大基因研究院、農業部基因組重點實驗室、中國農業科學院等單位合作完成的《31個大豆基因組重測序揭示遺傳多樣性和
二代基因測序試點單位在試什么？
導讀：2015年4月，衛計委公布了二代基因測序共20家試點單位，雖然試點單位已經確定，但行業內部依然處于迷茫階段。究竟什么樣的基因測序服務才是臨床和患者最需要的？臨床醫生對于二代測序又持怎樣的態度？ 2014年初，國家衛計委和食藥監督管理總局共同出臺文件叫停二代基因測序服務，并著手推進試點工
IDT收購密歇根二代基因測序前處理大廠
IDT收購Swift Biosciences公司，該公司專注于開發學術、轉化和二代臨床測序(NGS)的前處理研究。 將IDT的高質量NGS產品與Swift Biosciences公司前處理產品的組合，為科學家提供了更高效研究的方案。 據美國商業新聞社訊，Integrated DNA Te
青島能源所在植物miRNA合成調控領域取得進展
在不同的生長發育階段和受到外界生物、非生物脅迫時，生物體需要精細地調控基因的表達水平。近年來，microRNA (miRNA)在基因精細調控中的作用越來越被重視。miRNA在真核生物中普遍存在，是21-24個核苷酸的非編碼小RNA分子, 通過負調控mRNA靶基因的轉錄后表達水平影響動植物的生長發
SMA1基因調控miRNA合成－－改善產量品質和環境適應性
?? 近日，中國科學院青島生物能源與過程研究所李勝軍研究組與中科院遺傳發育所李云海研究組、內布拉斯加大學于彬實驗室合作，利用生物化學、分子生物學和遺傳學的手段，鑒定了SMA1調控miRNA合成的重要功能。 該研究首次揭示了SMA1基因調控miRNA合成的新功能，也將為利用生物技術的手段改善農
《cell》：miRNA是逆境的捍衛者？
現有許多數據說明microRNAs (miRNAs) 除了在發育方面的重要作用以外，在許多逆境應答（stress responses）中也扮演了重要角色。讓人驚訝的是miRNAs這一通常抑制靶基因轉錄表達的小分子，也許在逆境中成為了表達的激活因子，其中的機制也許就是通過逆境中，miRNA/Argon