蠕蟲／胚胎流式分選系統斑馬魚體內藥物自動化高通量...
蠕蟲/胚胎流式分選系統-斑馬魚體內藥物自動化高通量篩選儀器的發展和驗證得益于基因組學、組合化學和高通量篩選技術的發展，利用小分子靶位進行藥物篩選研究，取得了長足的進步。但這種藥物篩選的方法，成功率只有不足3%，而且可以研究的已知靶位點十分有限。因此，尋找更好的藥物模型進行藥物的檢測和篩選是迫切需要解決的重大問題之一。一些整體生物個體提供了很好的選擇。基于生物體進行的藥物篩選方法，其優勢是基于完整的生物個體進行化合物的篩選，而不是在人工模擬的條件下進行。 斑馬魚的體積很小，斑馬魚胚胎是透明的，能夠滿足自動化高通量篩選的要求。斑馬魚為藥物篩選提供了一個理想的生物體模型。本文的研究者開發了能夠使用斑馬魚進行體內化合物高通量篩選的系統Union Biometrica-蠕蟲/胚胎流式分選系統。 研究者利用斑馬魚驗證了心臟毒性檢測和血管生成抑制劑的藥物篩選兩種研究，能夠在系統平臺自動化實現。有效提高了藥物篩選的成功率。 蠕蟲/胚胎流式分選系......閱讀全文
蠕蟲/胚胎流式分選系統斑馬魚體內藥物自動化高通量...
蠕蟲/胚胎流式分選系統-斑馬魚體內藥物自動化高通量篩選儀器的發展和驗證得益于基因組學、組合化學和高通量篩選技術的發展，利用小分子靶位進行藥物篩選研究，取得了長足的進步。但這種藥物篩選的方法，成功率只有不足3%，而且可以研究的已知靶位點十分有限。因此，尋找更好的藥物模型進行藥物的檢測和篩選是迫切需要解
高通量研究脊椎動物多維表型的方法（二）
??3.顱面畸形三維重建與評估：每條斑馬魚幼體，記錄高達320幀的圖像，通過三維重構技術，形象化展示了斑馬魚幼體軟骨復雜表型。圖像顯示的層析效果圖充分顯示了三種不同藥物處理后的5dpf斑馬魚幼體的顱面骨骼變化。三種藥物是：retinoic acid（視黃酸）、cyclopamine（環巴胺）和flu
模式生物高通量多維表型研究方法概述（二）
3.顱面畸形三維重建與評估：每條斑馬魚幼體，記錄高達320幀的圖像，通過三維重構技術，形象化展示了斑馬魚幼體軟骨復雜表型。圖像顯示的層析效果圖充分顯示了三種不同藥物處理后的5dpf斑馬魚幼體的顱面骨骼變化。三種藥物是：retinoic acid（視黃酸）、cyclopamine（環巴胺）和flu
蘇州醫工所微小模式生物流式成像研究取得進展
模式生物是生命科學研究中的理想研究材料，生命科學領域的發展依賴于模式動物資源的開發與利用，以斑馬魚、線蟲、渦蟲等為代表的微小模式動物，在基于生命體活體表征的疾病模型藥物篩選中發揮著越來越重要的作用。然而，目前在利用微小型模式動物開展科學研究過程中主要以手工分揀篩選和利用傳統顯微鏡進行局部成像為主
斑馬魚胚胎DNA的制備
材料和試劑1.????????蛋白酶K（羅氏03115836001）2.??????? 1M的Tris，pH值8.33.??????? 氯化鉀4.??????? 吐溫20（10％，EMD4 biosciences，655207）5.??????? NP40（10％，Merck，492018）設備1.
斑馬魚胚胎細胞的培養
成纖維細胞飼養層 原代培養 細胞系 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 通過用鏈酶蛋白酶除去絨毛膜、用添加成分的 FGF 培養液培養細胞和采用不同的胰蛋白酶消化
高通量研究脊椎動物多維表型的方法（一）
Nature Communications 4, February 12, 2013, Article number:1467, doi:10.1038/ncomms2475?Carlos Pardo-Martin, Amin Allalou, Jaime Medina, Peter M. Eimo
模式生物高通量多維表型研究方法概述（一）
摘要：動物個體內，多數由基因突變與生物活性分子所引發的復雜生理應答機制，無法使用細胞培養模型進行預測，而動物水平研究卻進展緩慢。本研究中，我們利用微米分辨率的高通量光學投影層析成像系統，結合高效的大顆粒流式分選系統（Union Biometrica），實現了脊椎動物的整體多維度掃描。系統以前
方案27.6－斑馬魚胚胎細胞的培養
成纖維細胞飼養層 原代培養 細胞系 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 通過用鏈酶蛋白酶除去絨毛膜、用添加成分的 FGF 培養液培養細胞和采用不同的胰蛋白酶消化
通過流式細胞儀研究斑馬魚胚胎中細胞周期分析
[精華提要]結合綠色熒光蛋白表達的細胞周期分析廣泛的用于研究綠色熒光蛋白標記的細胞的細胞周期分布。這個方案是一種用綠色熒光蛋白標記的斑馬魚胚胎來分析細胞周期的方法。材料與試劑1.??????? PBS（Invitrogen公司14040）2.??????? 胎牛血清3.??????? 乙醇4.???
LSFIS助力蘇州醫工所在斑馬魚高通量三維成像研究獲進展
斑馬魚胚胎具有通體透明特點，適于光學顯微鏡下的活體觀測。光片顯微技術（Light-sheet microscopy）是一種新型的三維成像方式，具有光毒性小、掃描速度快等特點。針對斑馬魚、線蟲等毫米級模式生物，光片成像需復雜的樣品準備流程，且由于視場限制，獲得全胚胎的三維數據往往需要多區域成像與拼接，
斑馬魚胚胎細胞的培養——原代培養
實驗方法原理收集胚胎，除去絨毛膜，用胰蛋白酶分散胚胎細胞，然后在胚胎成纖維細胞飼養層上培養從斑馬魚囊胚和原腸期胚獲得的原代細胞。實驗材料鏈酶蛋白酶E用D-PBSA配制1%胰蛋白酶和1mmol L EDTA胚胎成纖維細胞飼養層人重組白血病抑制因子試劑、試劑盒LDF基礎培養液LDF原代培養液LDF維持培
斑馬魚胚胎細胞的培養——細胞系
實驗材料鏈酶蛋白酶E用D-PBSA配制1%胰蛋白酶和1mmol L EDTAZEM-2細胞（或等同物）試劑、試劑盒LDF基礎培養液LDF原代培養液LDF維持培養液D培養液Holtfreter緩沖液實驗步驟鱒魚胚胎提取物：(a)收集胚胎（受精后 28 天的 Shasta Rainbow 或其他鱒魚種系
斑馬魚的胚胎原位雜交試驗實錄
收集斑馬魚的胚胎，在Holfretor水中培養，到達所需要的發育時期時，用蛋白酶去除卵膜，用4%多聚甲醛固定，在4℃保存，二十四小時后用50%甲醇2%多聚甲醛溶液洗，然后換成甲醇，在-20C 保存，待用（兩天和兩天以上的胚胎需要用雙氧水處理，去除色素。或者使用苯锍脲稀溶液培養，可阻斷色素的形成）原位
斑馬魚
一、概述斑馬魚是生長在印度、巴基斯坦淡水河流中的一種硬骨魚（鯉魚），成年魚全身僅長4－5厘米，因全身橫向分布著一道一道褐色的斑馬線而得名。斑馬魚很容易在實驗室飼養，一般3個月就可以達到生殖成熟期，雌魚每次產卵200枚左右，一生可產卵數千枚，斑馬魚所產之卵經24小時即可胚胎發育成熟，仔魚期只有1個月。
斑馬魚為何作為高內涵篩選HCS的模式動物？
有兩種有效的篩選方法，廣泛用于早期藥物發現中的化合物分選。這些方法包括高通量篩選 （HTS）?和高內涵篩選 （HCS）。雖然前者從大量新藥候選藥物中快速有效地分選有用的化合物，但HCS使用基于成像的多參數分析來鑒定可能影響這些藥物療效的化合物。?在本文中，您將了解什么是HCS，使用的不同方法以及常見
以斑馬魚胚胎為模型－研究胚胎發育早期的自我保護機制
當生物體遇到藥物或化學污染物入侵時，它會應激性地提高自身轉化及外排能力，從而盡快將外源物降解或排出體外，從而實現自我保護，這一作用也被稱作生物體的外源物抵御作用。由于該作用決定了藥物或污染物在體內的停留時間，從而影響了藥物藥效或化學污染物毒性的發生，因而受到藥物學及環境毒理學研究的廣泛關注。
斑馬魚——CRISPR高通量基因功能研究新平臺
近日，來自美國NIH的研究人員進行了一項研究，他們利用CRISPR-CAS9技術靶向斑馬魚特定DNA序列進行基因功能探索和人類治病基因的發現研究，相關研究成果在線發表在國際學術期刊genome research。 在這項研究中，研究人員發現利用基因編輯技術CRISPR-CAS9進行斑馬魚基因靶
－Nat－Commun：斑馬魚可用于癲癇藥物篩選
化學藥物Clemizole在“Dravet綜合癥”的一個斑馬魚模型中能有效防止癲癇類發作。在Nature Communications上發表的這一發現確認了一個新方法，后者有可能被用來識別癲癇病的另類療法。 “Dravet綜合癥”是一種從嬰兒時期開始的嚴重癲癇，以嚴重的、自發的和復發的
“超級再生”動物激發人類醫療靈感
在受傷后，一些渦蟲幾乎可以再生體內的所有細胞，墨西哥鈍口螈可以重建整個四肢和部分大腦，斑馬魚可以修復斷裂的脊髓，綠安樂蜥則能重新長出尾巴。魚類、兩棲動物、爬行動物和蠕蟲展現的再生能力令研究人員著迷已久，而大多數哺乳動物卻不具備這種能力。如今，由于基因組學、蛋白質組學和單細胞成像技術的進步，科學家能夠
胚胎和成年斑馬魚眼情的組織學準備
INTRODUCTIONThis protocol describes the histological preparation of embryonic and adult zebrafish eyes. The methods described here can be easily adapt
斑馬魚胚胎細胞的培養——成纖維細胞飼養層
實驗方法原理通過用鏈酶蛋白酶除去絨毛膜、用添加成分的 FGF 培養液培養細胞和采用不同的胰蛋白酶消化篩選成纖維細胞，用原腸胚期斑馬龜的胚胎成纖維細胞制備飼養層 [ Sun et al., 1995a ]。實驗材料鏈酶蛋白酶E用D-PBSA配制1%胰蛋白酶和1mmol L EDTA受精后8h的胚胎FB
組織靶向性胚胎嵌合體—斑馬魚囊胚細胞移植
真核生物的基因調控比原核生物復雜得多。這是因為這兩類生物在三個不同水平上存在著重大的差別：①在遺傳物質的分子水平上，真核細胞基因組的DNA含量和基因的總數都遠高于原核生物，而且 DNA不是染色體中的唯一成分，DNA和蛋白質以及少量的RNA構成以核小體為基本單位的染色質；②在細胞水平上，真核細胞的染色
Nature：系統解析斑馬魚參考基因組
斑馬魚(Zebrafish)是研究發育生物學的新興模式動物。斑馬魚由于具有飼育容易、胚胎透明、體外受精、突變種多、遺傳學工具成熟等諸多優點，近年來已成為研究脊椎動物發育與人類遺傳疾病的新興模式動物。 近日，英國桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)
C13C4.5/Spinster，一種進化上保守的蛋白作用于脂肪代謝...
C13C4.5/Spinster，一種進化上保守的蛋白作用于脂肪代謝而對線蟲生育能力做出調控Union BioMetrica COPAS 大顆粒流式系統應用C13C4.5/Spinster，一種進化上保守的蛋白作用于脂肪代謝而對線蟲生育能力做出調控C13C4.5/Spinster, an evo
COPAS流式分選系統簡介及其在藥物篩選方面的應用
微型模式動物、模式植物種子、大體積細胞及微球的分選在生命科學研究中有著非常廣泛的應用，但是由于這些對象體積太大，普通流式細胞儀難以對其進行分選，而手工鏡下分選耗時耗力、效率低下、準確性難以保證，因此一種自動化大體積微粒分選系統應運而生，它就是本文介紹的COPASTM多參數生物微粒分析與分選系統。 ?
應用模式動物斑馬魚開展農藥環境毒理的研究（一）
在未涉及正文分析介紹及闡述之前，首先給大家分享一個關于斑馬魚研究的框架圖：從框架圖可以看出，該研究的目的及主要思路是：評估福美鋅（ziram）對斑馬魚發育的影響，主要從形態學、行為、生理學和分子四大方面來進行探討。毋庸置疑，這也是今天將與大家分享的一篇使用Noldus（諾達思）的DanioVisio
斑馬魚之后，CRISPR再探哺乳動物胚胎發育史
Researchers have used gene-editing to track the cell-by-cell development of a mouse embryo.Credit: Agnieszka Jedrusik and Magdalena Zernicka-Goetz
使用人類疾病模型生物斑馬魚的高通量成像實驗
為什么使用斑馬魚進行篩選? 目前，基于斑馬魚的篩選由于花費，通量和倫理原因作為一種哺乳動物篩選的替代受到歡迎。斑馬魚由于其與人類的高度生物相似性，成為一種有用的藥物開發模型。在個體學和器官形成研究中體現了其主要器官系統與人類極其相似，且斑馬魚和人類的相似度高達 70 - 80%。斑馬魚由于其繁殖力強
顯微注射泵系統選購方案建議（二）
此系列數顯氣動皮升注射泵主要應用前景為：1.魚類遺傳學研究應用：●用于斑馬魚、青鳉、中華鱘、黑斑原鮡等魚類卵細胞及魚類幼體的核酸類物質、染料、功能蛋白、慢病毒等的注射；●用于海洋生物如珊瑚蟲等的遺傳學研究；2.腦科學研究的應用：●用于光遺傳學研究中慢病毒等物質的動物顱內精確注射；●用于神經回路研究中