表達譜芯片的介紹與應用
基因表達譜芯片可使是科研工作者實現在MRNA水平上同時平行研究成百上千乃至上萬條基因的表達關系。 它與傳統的研究基因表達的方法(如差異cDNA文庫篩選、Northern blot和PCR)相比較,可為使用者節省大量的研究經費和時間并獲得范圍更廣、更具有關聯性的研究結果。它的主要用途是用于大規模分析一定的生物對象在特定生物過程中(如疾病、發育、分化、凋亡等)基因表達變化的全面信息.目前已經廣泛應用于基因表達檢測、基因功能研究、新基因識別、藥物靶點篩選、藥物作用機理和毒理、疾病相關基因和生物標記物等眾多研究領域。 相關背景資料main 基因表達譜芯片的原理a1 簡單地說就是在一塊有多聚賴氨酸包被的硅片上或其它固相支持物(如玻璃片、硅片、聚丙烯膜、硝酸纖維素膜、尼龍膜等,但需經特殊處理:作原位合成的支持物在聚合反應前要先使其表面衍生出羥基或氨基——視所要固定的分子為核酸或寡肽而定,并與保護基建立共價連接;作點樣用......閱讀全文
表達譜芯片的介紹與應用
基因表達譜芯片可使是科研工作者實現在MRNA水平上同時平行研究成百上千乃至上萬條基因的表達關系。 它與傳統的研究基因表達的方法(如差異cDNA文庫篩選、Northern blot和PCR)相比較,可為使用者節省大量的研究經費和時間并獲得范圍更廣、更具有關聯性的研究結果。它的主要用途是用于大規模分
表達譜芯片的介紹與應用
基因表達譜芯片可使是科研工作者實現在MRNA水平上同時平行研究成百上千乃至上萬條基因的表達關系。 它與傳統的研究基因表達的方法(如差異cDNA文庫篩選、Northern blot和PCR)相比較,可為使用者節省大量的研究經費和時間并獲得范圍更廣、更具有關聯性的研究結果。它的主要用途是用于大規
microRNA-芯片與表達譜芯片的聯合應用
microRNA 芯片與表達譜芯片的聯合應用——探究胃癌細胞株的原發性耐藥的分子機制藥物耐受是腫瘤治療領域的一大難題,一般分為兩種類型:其一為原發性耐藥,即先前未經治療的腫瘤細胞天生就對某種藥物不敏感;其二是獲得性耐藥,指經過治療的腫瘤細胞再次接受該藥物治療時變得不敏感。 目前, 國際上許多科研
表達譜基因芯片實驗
表達譜基因芯片可應用于:(1)疾病診斷;(2)新藥開發;(3)環境保護。實驗方法原理按照預定位置固定在固相載體上很小面積內的千萬個核酸分子所組成的微點陣陣列。在一定條件下,載體上的核酸分子可以與來自樣品的序列互補的核酸片段雜交。如果把樣品中的核酸片段進行標記,在專用的芯片閱讀儀上就可以檢測到雜交信號
生物芯片技術應用與基因表達水平的檢測
用基因芯片進行的表達水平檢測可自動、快速地檢測出成千上萬個基因的表達情況。謝納(M.Schena) 等用人外周血淋巴細胞的cDNA文庫構建一個代表1046個基因的cDNA微陣列,來檢測體外培養的T細胞對熱休克反應后不同基因表達的差異,發現有5個基因在處理后存在非常明顯的高表達,11個基因中度表達增加
蛋白質芯片技術應用與基因表達的篩選
基因表達的篩選AngelikaL.等人從人胎兒腦的cDNA文庫中選出92個克隆的粗提物制成蛋白質芯片,用特異性的抗體對其也進行檢測,結果的準確率在87%以上,而用傳統的原位濾膜技術準確率只達到63%。與原位濾膜相比,用蛋白質芯片技術在同樣面積上可容納更多的克隆,靈敏度可達到pg級。
miRNA與表達譜芯片聯合應用揭秘IFNa抗病毒作用新機制
復旦大學上海醫學院基礎醫學院教育部、衛生部醫學分子病毒學重點實驗室主任袁正宏課題組,聯合應用Exiqon miRNA芯片和Agilent表達譜芯片,發現干擾素-a誘導細胞分泌外胞體傳遞具有抗病毒作用的miRNA和mRNA等活性分子,從而發揮抗病毒活性的新機制。該成果2013年7月7日正式發表于
miRNA與表達譜芯片聯合應用,揭秘IFNa抗病毒作用新機制
復旦大學上海醫學院基礎醫學院教育部、衛生部醫學分子病毒學重點實驗室主任袁正宏課題組,聯合應用Exiqon miRNA芯片和Agilent表達譜芯片,發現干擾素-a誘導細胞分泌外胞體傳遞具有抗病毒作用的miRNA和mRNA等活性分子,從而發揮抗病毒活性的新機制。該成果2013年7月7日正式發表于國際權
表達譜基因芯片實驗操作流程
一、試劑1. TRIzol2. 異丙醇3. 氯仿4. 75%乙醇(RNase-free)5. Milli-Q水(RNase-free)6. 無水乙醇7. dNTPs8. Cy5-dCTP和Cy3-dCTP9. 雜交試劑110. 標記試劑I11. 雜交試劑212. 標記試劑II13. 反轉錄酶14.
生物芯片入門(三):基因表達譜芯片實驗操作1
待檢測樣品制備生物樣品往往是非常復雜的生物分子混合體,除少數特殊樣品外,一般不能直接與芯片反應,必須將樣品進行生物處理。從血液或活組織中獲取的DNA/mRNA樣品在標記成為探針以前必須擴增以提高閱讀靈敏度,但這一過程操作起來卻有一定的難度。比如在一個癌細胞中有成千上萬個正常基因的干擾,雜合癌基因的檢
蛋白質芯片對于基因表達的篩選的應用
從人胎兒腦的cDNA文庫中選出92個克隆的粗提物制成蛋白質芯片,用特異性的抗體對其也進行檢測,結果的準確率在87%以上,而用傳統的原位濾膜技術準確率只達到63%。與原位濾膜相比,用蛋白質芯片技術在同樣面積上可容納更多的克隆,靈敏度可達到pg級。
DNA-芯片的制備與應用
DNA 芯片的制備與應用DNA 芯片的出現,是生物技術領域的一次革命,雖然現在無法預知它帶給我們的變化。但由于它在人類基因組計劃,基因表達和藥物篩選等方面的潛在用途。目前已有越來越多的公司和研究機構加入到DNA芯片的設計與開發。DNA芯片技術集成了集成電路制造,照相平板印刷,DNA合成,探針的熒光標
多通道微流控芯片質譜聯用接口的研究與應用
2015年10月17日,第二屆全國質譜分析學術報告會在浙江大學紫荊港校區體育館盛大開幕,在5位院士的精彩報告后,多位學者做了高水平的大會報告。 清華大學林金明教授:多通道微流控芯片-質譜聯用接口的研究與應用 清華大學林金明教授做題為《多通道微流控芯片-質譜聯用接口的研
Stem-Cells發表利用NimbleGen表達譜芯片研究腫瘤干細胞-文章
中山大學生命科學院腫瘤與干細胞研究室創建人張雁教授,帶領其研究小組發現TGF-β信號和缺氧信號會誘導骨肉瘤細胞去分化,成為腫瘤干細胞,并利用NimbleGen表達譜芯片分析腫瘤干細胞和腫瘤細胞的基因圖譜,尋找與腫瘤干細胞等相關的關鍵分子。該研究成果發表于Stem Cells。 研究背景:
The-Plant-Cell:利用Agilent表達譜芯片研究茉莉酸調控擬南...
The Plant Cell:利用Agilent表達譜芯片研究茉莉酸調控擬南芥抗冷害反應和作用機制中國科學院西雙版納熱帶植物園余迪求課題組致力于研究改良農作物抵抗外源逆境因子脅迫的重要功能基因及其信號分子。最新研究發現,植物激素茉莉酸能夠提高擬南芥抗凍害反應,并利用Agilent表達譜芯片,挖掘茉莉
Stem-Cells發表利用NimbleGen表達譜芯片研究腫瘤干細胞新...
Stem Cells發表利用NimbleGen表達譜芯片研究腫瘤干細胞新文章中山大學生命科學院腫瘤與干細胞研究室創建人張雁教授,帶領其研究小組發現TGF-β信號和缺氧信號會誘導骨肉瘤細胞去分化,成為腫瘤干細胞,并利用NimbleGen表達譜芯片分析腫瘤干細胞和腫瘤細胞的基因圖譜,尋找與腫瘤干細胞等相
全基因組表達譜芯片應用于TMED3調控原發性肝細胞癌...
全基因組表達譜芯片應用于TMED3調控原發性肝細胞癌(HCC)的轉移機制研究原發性肝細胞癌(HCC)肝內外轉移是導致臨床手術后病人預后較差的重要原因之一。由于目前臨床上尚缺乏有效的靶向治療肝癌的化療藥物,尋找治療HCC轉移的有效靶點一直是科學家關注的重點。來自東方肝膽外科醫院周偉平教授,第二軍醫大學
蛋白芯片制作與應用(4)-液態芯片
液態芯片原理編碼微球:分別用不同配比的兩種熒光染料將直徑5.6μm的聚苯乙烯微球(Beads)染成不同的熒光色,從而獲得多達100種經熒光編碼的微球。?交聯探針、抗體或抗原:把針對不同檢測物的核酸探針、抗體或抗原以共價方式結合到特定熒光編碼的微球上。?檢測反應:先把針對不同檢測物的、用不同熒光色編碼
轉錄組測序與轉錄表達譜測序的異同
轉錄組測序可以得到特定條件下所有mRNA轉錄本的豐度信息,從而發現新的轉錄本和可變剪接體基因表達譜(gene expression profile):指通過構建處于某一特定狀態下的細胞或組織的非偏性cDNA文庫,大規模cDNA測序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群體組成,從而描繪該特
DNA芯片技術的原理與應用
DNA芯片技術就是指在固相支持物上原位合成寡核苷酸或者直接將大量的DNA探針以顯微打印的方式有序地固化于支持物表面,然后與標記的樣品雜交,通過對雜交信號的檢測分析,即可獲得樣品的遺傳信息。是伴隨“人類基因組計劃”的研究進展而快速發展起來的一門高新技術。通俗地說,基因芯片是通過微加工技術,將數以萬計、
基因芯片的應用與展望
一、基因芯片產生背景人類基因組計劃(HGP)是人類為了認識自己而進行的一項最偉大和最具影響的研究計劃。 人類基因組測序的“工作草圖”即將向全球公布,預計在2003年完成全序列分析。此外,還測定了80萬個cDNA片斷(ESTs),相當于4-5萬個基因,占7-10萬個人類總基因的50%左右。目前
鞠熀先:質譜傳感概念與芯片構建及其定量檢測應用
分析測試百科網訊 2020年9月14日,由中國質譜學會(中國物理學會質譜分會)主辦,分析測試百科網和中國質譜學會網承辦的2020年中國質譜學會質譜網絡研討會(2020 CMSS)正式開幕。本屆質譜網絡研討會正值中國質譜學會成立40周年,按報告內容涉及領域包括生命科學與組學、藥物藥理毒理分析、元素
安捷倫科技公司推出新型人類基因表達譜微陣列芯片
安捷倫科技公司推出新型人類基因表達譜微陣列芯片 覆蓋人類基因間長鏈非編碼 RNA 區域 2012 年 5 月 22 日,安捷倫科技公司(紐約證交所: A)推出了 Agilent SurePrint G3 人類基因表達譜 v2 微陣列芯片,該芯片是唯一基于博德研究所最新公布的人
全表達譜的定義
中文名稱全表達譜英文名稱global expression profile定 義反映待檢樣品中所有基因的表達情況的圖譜。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)
蛋白芯片制作與應用(1)-液態芯片原理
液態芯片原理編碼微球:分別用不同配比的兩種熒光染料將直徑5.6μm的聚苯乙烯微球(Beads)染成不同的熒光色,從而獲得多達100種經熒光編碼的微球。?交聯探針、抗體或抗原:把針對不同檢測物的核酸探針、抗體或抗原以共價方式結合到特定熒光編碼的微球上。?檢測反應:先把針對不同檢測物的、用不同熒光色編碼
基因芯片的制備、應用與前景
摘要:基因芯片技術是90年代中期以來快速發展起來的分子生物學高新技術,是各學科交叉綜合的嶄新科學。其原理是采用光導原位合成或顯微印刷等方法,將大量DNA探針片段有序地固化予支持物的表面,然后與已標記的生物樣品中DNA分子雜交,再對雜交信號進行檢測分析,就可得出該樣品的遺傳信息。基因芯片技術目前國
基因芯片的制備、應用與前景
摘要:基因芯片技術是90年代中期以來快速發展起來的分子生物學高新技術,是各學科交叉綜合的嶄新科學。其原理是采用光導原位合成或顯微印刷等方法,將大量DNA探針片段有序地固化予支持物的表面,然后與已標記的生物樣品中DNA分子雜交,再對雜交信號進行檢測分析,就可得出該樣品的遺傳信息。基因芯片技術目前國內
液相芯片技術的原理與應用
液相芯片,也稱為微球體懸浮芯片(suspension?array,liquid?chip),是基于xMAP(flexible?MultiAnalyte?Profiling)技術的新型生物芯片技術平臺,它是在不同熒光編碼的微球上進行抗原抗體、酶底物、配體受體的結合反應及核酸雜交反應,通過紅、綠
Agilent表達譜芯片研究茉莉酸調控南芥抗冷害反應和作用
中國科學院西雙版納熱帶植物園余迪求課題組致力于研究改良農作物抵抗外源逆境因子脅迫的重要功能基因及其信號分子。最新研究發現,植物激素茉莉酸能夠提高擬南芥抗凍害反應,并利用Agilent表達譜芯片,挖掘茉莉酸通過多條信號通路提高植物的抗凍害反應。該成果發表于頂尖雜志The Plant Cell。
用DNA芯片技術檢測基因的表達
一、芯片制備基因芯片的制備主要有兩種基本方法,一是在片合成法,另一種方法是點樣法。在片合成法是基于組合化學的合成原理,它通過一組定位模板來決定基片表面上不同化學單體的偶聯位點和次序。在片合成法制備DNA芯片的關鍵是高空間分辨率的模板定位技術和固相合成化學技術的精巧結合。目前,已有多種模板技術用于基因