人類組織中m6A修飾的動態變化和進化
文章導讀 m6A是mRNA中普遍存在的一種內部修飾，通過多種機制，比如調控mRNA的剪接、表達、降解、翻譯等對mRNA的命運產生不同影響。為了探究m6A修飾在不同組織之間、不同發育階段的差異，m6A位點在轉錄本上的位置分布，以及這些分布差異可能對基因調控的進化產生怎樣的影響，近期Nucleic Acid Research (IF=11.147)雜志上發表了一篇文章Dynamic landscape and evolution of m6A methylation in human, 通過對9種人類組織的m6A測序，分析了m6A甲基化位點在不同組織中的分布特點、潛在調控機制和進化。 發表期刊：Nucleic Acids Research 影響因子：11.147 發表時間： 2020.5.14 實驗方法: m6A-seq, RNA-seq 文章鏈接：Dynamic landscape and ......閱讀全文
人類組織中m6A修飾的動態變化和進化
文章導讀 m6A是mRNA中普遍存在的一種內部修飾，通過多種機制，比如調控mRNA的剪接、表達、降解、翻譯等對mRNA的命運產生不同影響。為了探究m6A修飾在不同組織之間、不同發育階段的差異，m6A位點在轉錄本上的位置分布，以及這些分布差異可能對基因調控的進化產生怎樣的影響，近期Nucle
人類組織中m6A修飾的動態變化和進化
文章導讀 m6A是mRNA中普遍存在的一種內部修飾，通過多種機制，比如調控mRNA的剪接、表達、降解、翻譯等對mRNA的命運產生不同影響。為了探究m6A修飾在不同組織之間、不同發育階段的差異，m6A位點在轉錄本上的位置分布，以及這些分布差異可能對基因調控的進化產生怎樣的影響，近期Nucle
人類組織中m6A修飾的動態變化和進化（一）
文章導讀m6A是mRNA中普遍存在的一種內部修飾，通過多種機制，比如調控mRNA的剪接、表達、降解、翻譯等對mRNA的命運產生不同影響。為了探究m6A修飾在不同組織之間、不同發育階段的差異，m6A位點在轉錄本上的位置分布，以及這些分布差異可能對基因調控的進化產生怎樣的影響，近期Nucleic Aci
人類組織中m6A修飾的動態變化和進化（二）
5.進化角度分析人類m6A修飾位點作者通過比較人鼠之間保守m6A位點比例和保守對照A比例，來評估CDS區域m6A位點面臨的自然選擇壓力，發現發生于第 一個密碼子處的m6A的周圍序列保守程度低，可能由于此處的m6A會帶來不利的影響比如影響tRNA結合，而發生于第三個密碼子處的m6A則受到進化選
揭示了m6A－RNA修飾的新的進化意義
無義介導的RNA降解（Nonsense-mediated decay, NMD）是真核生物一種重要的mRNA質量控制方式，細胞通過檢驗終止密碼子與最后一個剪接接頭的距離是否超過55nt來判斷該終止密碼子是否為提前終止密碼子（Premature Termination Codon, PTC）從而決
Nature－Aging:揭示調控靈長類器官衰老的表觀轉錄組機制
m6A是目前已知的真核細胞mRNA上最常見的一類化學修飾，其建立、讀取和擦除分別受到相應甲基化酶（writer）、結合蛋白（reader）以及去甲基化酶（eraser）的動態可逆調控。研究表明，m6A能夠通過調節mRNA的剪接、出核、穩定性以及翻譯等生命周期活動，參與調控機體的諸多生理或病理進程，包
持續進化中的現代人類
很多人認為進化需要幾千年甚至上百萬，但生物學家知道，進化也可能會發生的很快。現在，由于基因組操作技術的革命，研究人員可以追蹤種群水平的遺傳變化，這些遺傳變化可能最終會表現出進化的特征。在剛過去的基因組生物學大會上，新的研究指出，人類的基因組在近幾百年來發生了很大變化。這種基因組層面的變化，最終導
Nature：人類早期胚胎發育過程中的染色體結構動態變化
染色體三維結構是重要的表觀遺傳因素，與基因的表達調控密切相關。研究染色體三維結構在人類精子及早期胚胎中的動態變化和調控分子對于深入理解人類胚胎發育有重要的理論和臨床意義。 人類個體發育從精卵結合形成受精卵開始，經歷早期胚胎發育過程，由一個細胞逐漸分裂分化形成一個含有上百種細胞類型、多種器官的
RNA甲基化促進草莓成熟
果實中富含的營養成分是人類膳食結構的重要組成部分，對人體健康不可或缺。果實品質在成熟過程中逐漸形成，受到精確調控。解析果實成熟調控機制，將為果實品質改良和新品種選育提供理論基礎。根據成熟機制的不同，果實可分為兩種類型：呼吸躍變型（如番茄、蘋果、香蕉）和非呼吸躍變型（如草莓、葡萄、柑橘）。植物激素
我國學者發現m6A修飾小腦發育中的新功能
N6-甲基腺嘌呤（m6A）修飾是RNA上分布最廣泛的一種化學修飾，參與調控RNA的翻譯、降解以及可變剪接等多個過程，在胚胎干細胞干性維持、胚胎發育、配子發生等生命活動中均發揮重要作用。m6A修飾是由METTL3、METTL14以及WTAP等構成的m6A甲基轉移酶復合物催化形成的，其中METTL3
首次揭示人類早期胚胎中的染色體三維結構的動態變化
《自然》雜志刊發了中國科學院北京基因組研究所研究員劉江團隊與中國科學院院士、山東大學附屬生殖醫院教授陳子江團隊合作研究成果。 該研究首次揭示了人類早期胚胎中的染色體三維結構的動態變化，并發現CTCF蛋白對于早期胚胎發育中拓撲相關結構域（TAD結構）有著重要的調控功能，為進一步揭示人類胚胎發育機
Cell－Research－腸道菌群調控宿主RNA甲基化和基因表達新機制
腸道菌群微生物組學是近年來研究熱點，腸道菌群在維持宿主生理平衡和健康中發揮著重要作用，在人和動物疾病治療方面具有極大的應用前景。研究表明，腸道菌群及其代謝產物可調節宿主基因表達。隨著研究的深入, 腸道菌群和宿主之間的相互作用機理也越來越多被發現，特別是通過表觀遺傳影響宿主的基因表達。如最新研究發
m6A修飾在頭頸鱗癌免疫微環境調控中的作用機制
N6-甲基腺苷(m6A)修飾是RNA上豐度最高的修飾方式，屬于轉錄后調控的重要機制，在各種生理和病理條件下發揮著關鍵作用，也給疾病治療提供了嶄新的靶點。然而，m6A在頭頸鱗癌中的修飾狀態以及作用模式尚不清楚。2022年4月，張志愿院士/何悅教授團隊在腫瘤學權威期刊《分子癌癥》（IF=41）在線發表題
小小甲基化修飾讓小菜蛾“百毒不侵”
小菜蛾作為一種世界性為害的重大農業害蟲，也是世界上第一個被報道在田間對Bt生物殺蟲劑產生高抗性的農業害蟲。 小菜蛾能在不影響其自身生長發育的前提下對Bt殺蟲劑進化出完美的高抗性。 近日，中國農業科學院蔬菜花卉研究所（以下簡稱蔬菜所）研究員張友軍團隊解析了小菜蛾Bt抗性的適合度代價補償機制，首
Cell－Research發現“勤能補拙”的生物機制
研究人員利用胚后敲除Mettl3（m6A甲基轉移酶）的小鼠模型系統研究了m6A修飾在成體動物高級神經系統中的功能，發現了“勤能補拙”的生物機制。長時記憶的形成是哺乳動物適應環境變化，智力發展所必需的，對于人類社會活動尤其重要。雖然以往研究已經揭示了一些與記憶形成相關的基因，但關于記憶形成效率的調控因
m6A修飾新功能——調控染色質狀態和轉錄活性
m6A是真核生物中最常見的一類化學修飾，能夠在多種生物過程中發揮重要作用，包括癌癥發生發展、細胞分化、壓力應答、免疫反應以及神經發育等方面。目前大部分研究主要探究m6A對蛋白編碼基因的調控——即影響mRNA穩定性或翻譯效率。2020年1月17日，美國芝加哥大學何川，中科院北京基因組研究所韓大力和同濟
草莓通過調節ABA途徑的方式影響果實成熟
近日，中國科學院植物研究所研究員秦國政團隊發現，RNA甲基化（m6A）修飾在不同類型果實的成熟調控中均發揮重要作用，但是作用機制有所不同。在番茄果實中，m6A修飾主要通過反饋調控DNA甲基化來發揮作用，而在草莓果實中，m6A修飾則通過調節ABA途徑的方式影響果實成熟，這為闡明果實成熟調控網絡提供
新型RNA修飾m1A與m7G的物種保守性和動態調控條件
表觀轉錄組學”是通過轉錄后修飾影響RNA的結構和功能，是近幾年來生物學科里最熱門的研究領域之一，目前已知的RNA修飾類型超過150種，其中包括m6A、m5C、m1A、m7G、2’-氧-甲基化、ac4C RNA乙酰化等。近期小編發現在探究RNA修飾領域中，各位m6A研究領域的鼻祖們又有了新的動作。
著名華人科學家Nature發布表觀遺傳重大發現
發表在2月10日《自然》（Nature）雜志上的一項新研究，描繪了可顯著促進基因轉換為蛋白質的一種小化學修飾。這一研究發現與近期其他的研究結果一起，為分子生物學“中心法則”增添了一個關鍵的新層面：表觀轉錄組（epitranscriptome）。 論文的資深作者、芝加哥大學化學系教授、霍華德休斯
研究發現m6A修飾增強長時記憶形成效率
長時記憶的形成是哺乳動物適應環境變化、智力發展所必需的，對于人類社會活動尤其重要。雖然以往研究已經揭示了一些與記憶形成相關的基因，但關于記憶形成效率的調控因素與機制仍然未知。N6-甲基腺嘌呤（m6A）是哺乳動物細胞中mRNA上最為普遍的修飾，自2012年以來逐漸受到廣泛關注。已有多項研究表明m6
植物所揭示萊茵衣藻m6A表觀轉錄組圖譜
m6A是廣泛存在于真核生物mRNA中的表觀修飾，與RNA命運相關。近年來，m6A修飾在植物胚胎發育、莖尖分生組織的命運決定、表皮毛發生、根部發育、葉形態發生、開花轉變、脅迫響應、果實成熟及孢子發生等多個生物學過程中發揮重要功能。然而，m6A在藻類中的功能尚不清楚。藻類包含從單細胞到多細胞的多種細
綜述：化學干預靶向致癌m6A修飾蛋白
RNA表觀遺傳學為基因表達調控提供了一個新的切入點，以RNA m6A甲基化修飾為代表開辟了RNA表觀遺傳的研究新方向。首個m6A去甲基化酶FTO的發現證實了m6A修飾的動態可逆性，成為推動m6A領域發展的標志性事件。m6A修飾影響著RNA代謝的每個環節，在眾多生理病理過程中有著關鍵作用，包括癌癥
云序生物最新“RNA－甲基化”研究匯總擬南芥篇
關于RNA甲基化修飾的研究成果在Nature，Science，Cell等高分期刊上頻頻亮相，并一次次刷新人們對生命科學的認知。擬南芥作為植物界中研究RNA甲基化修飾的先行者，許多學者將它作為研究對象，并與最新m6A、m5C RNA甲基化測序技術結合，證實到RNA甲基化廣泛存在于擬南芥各個發育期，
人類進化過程中諸多難點有望破解
說一個人很“順從”或“溫順”，或許他不會將此看作是一種恭維。不過，我們每個人，無論男人還是女人，可能都不得不適應這種稱呼：一些科學家認為，“自我馴化”是人類進化的關鍵。在最近舉行的一次會議上，他們聲稱“我們擁有縮小的下巴、扁平的面孔和較少的男性攻擊行為，而這和與人類共同生存的很多溫順動物并無二
研究人員揭示了T細胞中m6A修飾的基本功能
由LMU和Helmholtz Munich免疫學家Vigo Heissmeyer和Taku Ito-Kureha組成的研究小組揭示了T細胞中m6A修飾的基本功能。甲基化是核酸的化學修飾，不僅存在于DNA上，也存在于RNA上。這種甲基化對某些類型的細胞是否重要，以及它對體內細胞的相互作用有什么影響，根
核酸進化相關質的變化
生物進化過程中 DNA的質也在發生變化。用分子雜交方法可以分析各種生物的DNA的相似程度（表2）。對于某一類生物來講，例如在靈長類動物和細菌等生物中都可以用同樣的方法來測定它們的親緣關系（圖1）。進化中的保守性 分子雜交測定的結果只能說明兩種生物的DNA的相同或不同程度，通過DNA順序分析才能知道
核酸進化相關量的變化
核酸是遺傳物質，可以明顯地看到在生物進化過程中各種生物每一基因組的核酸的量在總的趨勢上逐漸增加。從總的趨勢來看，愈是低等生物DNA量愈少，愈是高等則愈多。但是這規律對于某些生物顯然并不適用，原因是多方面的。一般生物愈是高等則所需要的基因愈多（見基因），可是進化達到某一階段以后，基因的數目便不再相應地
云序生物最新“RNA－甲基化”研究匯總擬南芥篇
關于RNA甲基化修飾的研究成果在Nature，Science，Cell等高分期刊上頻頻亮相，并一次次刷新人們對生命科學的認知。擬南芥作為植物界中研究RNA甲基化修飾的先行者，許多學者將它作為研究對象，并與最新m6A、m5C RNA甲基化測序技術結合，證實到RNA甲基化廣泛存在于擬南芥各個發育期，
上海生科院發現RNA－m6A修飾和果蠅性別決定新因子
3月19日，中國科學院上海生命科學研究院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所嚴冬研究組，與美國哈佛大學Norbert Perrimon研究組合作，以Xio is a component of the Drosophila sex determination pathway and RNA
揭秘m6A修飾新功能－－－－調控染色質狀態和轉錄活性
m6A是真核生物中最常見的一類化學修飾，能夠在多種生物過程中發揮重要作用，包括癌癥發生發展、細胞分化、壓力應答、免疫反應以及神經發育等方面。目前大部分研究主要探究m6A對蛋白編碼基因的調控——即影響mRNA穩定性或翻譯效率。 2020年1月17日，美國芝加哥大學何川，中科院北京基因組研究所