必備技能！云序生物教你巧用IGV輕松實現基因組的可視化
Itegrative Genomics Viewer (IGV)是由Broad研究院的研究人員開發的一款功能強大的綜合性基因組學可視化工具，借助于此工具，從事生物信息的科研工作者就可以輕松的分析查看多種基因組數據。除了直觀的查看序列信息及遺傳密碼中的序列變化或突變外，還可以查看拷貝數變化、染色質沉淀數據和表觀遺傳學修飾等。使用者可以選擇多種顯示模式，以heat map、柱狀圖、散點圖或其他形式查看他們的數據。更為吸引人的是IGV的使用是免費的喲！ 測序數據reads通過與參考基因組比對可以直觀的查看序列信息及遺傳密碼中的序列變化或突變，還可以查看拷貝數變化、染色質沉淀數據和表觀遺傳學修飾等。 前期準備工具： IGV軟件 參考基因組：例人參考基因組Homo_sapiens_HG19.sorted.gtf 測序數據文件：例bam、bw等 一、IGV下載及安裝 1.請打開您常用的瀏覽器，在......閱讀全文
必備技能！云序生物教你巧用IGV輕松實現基因組的可視化
Itegrative Genomics Viewer (IGV)是由Broad研究院的研究人員開發的一款功能強大的綜合性基因組學可視化工具，借助于此工具，從事生物信息的科研工作者就可以輕松的分析查看多種基因組數據。除了直觀的查看序列信息及遺傳密碼中的序列變化或突變外，還可以查看拷貝數變化、染色質
教你巧用IGV輕松實現基因組的可視化
Itegrative Genomics Viewer (IGV)是由Broad研究院的研究人員開發的一款功能強大的綜合性基因組學可視化工具，借助于此工具，從事生物信息的科研工作者就可以輕松的分析查看多種基因組數據。除了直觀的查看序列信息及遺傳密碼中的序列變化或突變外，還可以查看拷貝數變化、染
巧用熒光成像，實現腫瘤干細胞的可視化治療
眾所周知，腫瘤由各種不同類型的細胞構成，目前我們還不清楚光動力檢測是否能夠識別腫瘤內部的所有細胞。 腫瘤干細胞（Cancer stem cells ，CSCs）是一種極其重要的、具有自我更新能力的腫瘤細胞。它們是影響腫瘤進程和放/化療抗性的主要細胞類型，也是導致治療后腫瘤復發的主要原因。評估以
云序生物環狀RNA研究文章匯總
環狀RNA“一站式”服務一直以來是云序生物的主打產品，嚴格的質控把關、嚴謹的實驗設計、出色的生信分析以及貼心的售后服務造就了多項世界首篇環狀RNA研究文章，受到了廣大客戶的一致好評。迄今為止，云序已經積累了超過10000例環狀RNA測序的經驗，樣本覆蓋20多個物種以及50多種疾病，客戶發表文章達
云序客戶再發高分文章，教你如何玩轉tRNA機制研究
“忽如一夜春風來，千樹萬樹梨花開！”自然界的花花草草在悄無聲息的感受著大自然的變化。隨著全球氣候的變化，環境溫度也在不斷的變化，那么什么是溫度感受器？AET1是tRNA上鳥苷轉移酶，它是水稻高溫條件下正常生長所必需的。本文研究結果表明，tRNAHis鳥苷轉移酶AET1在植物應對高溫環境中發揮著重
云序客戶再發高分文章，教你如何玩轉tRNA機制研究
文章導讀： “忽如一夜春風來，千樹萬樹梨花開！”自然界的花花草草在悄無聲息的感受著大自然的變化。隨著全球氣候的變化，環境溫度也在不斷的變化，那么什么是溫度感受器？AET1是tRNA上鳥苷轉移酶，它是水稻高溫條件下正常生長所必需的。本文研究結果表明，tRNAHis鳥苷轉移酶AET1在植物應對
如何快速查找LncRNA序列
查找LncRNA序列的網站有很多，包括Genebank，Ensembl，RefSeq，UCSC數據庫等。今天，小編就給大家講講如何通過LncRNA ID號查找LncRNA的序列。 一．根據LncRNA來源數據庫，進入相應鏈接。 1. Genebank：https://www.ncb
教你輕松搞定血氣分析
目前，血氣分析已被廣泛應用于臨床各科，特別是在危重病人搶救中占重要地位。它有助于了解病情、鑒別診斷、觀察療效和估計預后。通過血氣分析，能對病人的通氣功能，換氣功能主要是缺氧和二氧化炭潴留情況,及機體的酸堿狀態，電解質紊亂的程度有一個較全面的了解。同時，PH值是估計預后的主要特征之一，即pH值愈低，糾
揭示eccDNA新功能—驅動神經母細胞瘤基因組重排
在剛剛過去不到一個月的時間，染色體外環狀DNA（eccDNA）重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊，這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖，吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增，極大地促進腫瘤
賽默飛虛擬云展廳，3D－AR－輕松實現
80多年來，賽默飛世爾科技（以下簡稱“賽默飛”）的凍存設備一直都是值得客戶信賴的工作伙伴，為寶貴的樣品與科研成果提供穩定、可靠的保存環境。我們從客戶的實際應用出發，以高品質、可持續的產品和解決方案助力客戶事業的成功。 除了高品質的凍存設備產品和完整的場景解決方案，我們一直重視客戶的數字化體驗，
Nature－Genetics－揭示eccDNA功能—驅動神經母細胞瘤基因組重排
在剛剛過去不到一個月的時間，染色體外環狀DNA（eccDNA）重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊，這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖，吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增，極大地促進腫瘤
云序生物最新“RNA－甲基化”研究匯總擬南芥篇
關于RNA甲基化修飾的研究成果在Nature，Science，Cell等高分期刊上頻頻亮相，并一次次刷新人們對生命科學的認知。擬南芥作為植物界中研究RNA甲基化修飾的先行者，許多學者將它作為研究對象，并與最新m6A、m5C RNA甲基化測序技術結合，證實到RNA甲基化廣泛存在于擬南芥各個發育期，
云序生物最新“RNA－甲基化”研究匯總擬南芥篇
關于RNA甲基化修飾的研究成果在Nature，Science，Cell等高分期刊上頻頻亮相，并一次次刷新人們對生命科學的認知。擬南芥作為植物界中研究RNA甲基化修飾的先行者，許多學者將它作為研究對象，并與最新m6A、m5C RNA甲基化測序技術結合，證實到RNA甲基化廣泛存在于擬南芥各個發育期，
云序生物為你解密ATACseq研究方案
ATAC-seq最近幾年是比較火的一種測序技術。那ATAC-seq技術到底什么呢？ATAC-seq的全稱是Assay for Transposase Accessible Chromatin using sequencing, 運用測序手段研究轉座酶可接近的染色質的一種技術。該技術通過轉座酶對某
教你輕松看懂凝血常規
一、凝血酶原時間（PT） ?1、正常參考值：12-16秒。 ?2、臨床應用：凝血酶原時間是檢查外源性凝血因子的一種過篩試驗，是用來證實先天性或獲得性纖維蛋白原、凝血酶原、和凝血因子Ⅴ、Ⅶ、Ⅹ的缺陷或抑制物的存在，同時用于監測口服抗凝劑的用量，是監測口服抗凝劑的首選指標。據報道，在口服抗凝劑的過程
同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平(下)
又到了一周云序生物課堂開講時間！你，準備好了嗎？ 上一期文章當中，云序通過引用這樣一張表格給大家傳遞了一個重要信息：表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶，而且這些酶在不同疾病當中意義有所不同，例如METTL3在AML、B
多功能植物小RNA分析工具|一站式小RNA分析及可視化
日，《科學通報》在線發表了華南農業大學園藝學院教授夏瑞團隊最新研究成果，他們研究開發出一款多功能植物小RNA分析工具——sRNAminer，可便于研究人員進行一站式小RNA分析及可視化。 據介紹，植物小RNA是植物生長發育和營養繁殖過程的重要調控分子。目前已有的分析工具多數依賴于命令行環境，
科學家開發一款多功能植物小RNA分析工具
近日，《科學通報》在線發表了華南農業大學園藝學院教授夏瑞團隊最新研究成果，他們研究開發出一款多功能植物小RNA分析工具——sRNAminer，可便于研究人員進行一站式小RNA分析及可視化。 sRNAminer軟件整體功能概覽。課題組供圖 據介紹，植物小RNA是植物生長發育和營養繁殖過程的重要
快速檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平(下)
又到了一周云序生物課堂開講時間！你，準備好了嗎？ 上一期文章當中，云序通過引用這樣一張表格給大家傳遞了一個重要信息：表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶，而且這些酶在不同疾病當中意義有所不同，例如METTL3在AML、B
云序生物獨家首發m5C－RNA甲基化測序
m5C RNA甲基化簡介 通過分析近幾年的國自然立項，可以發現RNA甲基化這兩年的基金項目呈指數級增長的趨勢：特別是從2015年的5項到2017年的25項，項目增長尤為顯著。僅2018年1月的RNA甲基化文獻就達到25篇，可以說RNA甲基化的發展已經到了井噴階段，多篇文章榮登CNS級別期刊
云序生物獨家首發m5C－RNA甲基化測序
m5C RNA甲基化簡介 通過分析近幾年的國自然立項，可以發現RNA甲基化這兩年的基金項目呈指數級增長的趨勢：特別是從2015年的5項到2017年的25項，項目增長尤為顯著。僅2018年1月的RNA甲基化文獻就達到25篇，可以說RNA甲基化的發展已經到了井噴階段，多篇文章榮登CNS級別期刊
怎樣巧用離心機呢？小析姐教你幾招。。
目前，實驗室常用的是電動離心機，因其轉動速度快，要注意安全，特別要防止在離心機運轉期間，因不平衡或試管墊老化，而使離心機邊工作邊移動，使其從實驗臺上掉下來，或因蓋子未蓋，離心管因振動而破裂，玻璃碎片旋轉飛出，造成事故。因此，使用離心機時，必須注意如下操作： （1）離心機套管底部要墊棉花或試管墊
教你巧用萬用表測量大值電阻
31/2位和41/2位數字萬用表電阻檔的最大量程一般是20MΩ。對于31/2位數字萬用表而言，使用不同的電阻量程也只能測量0.1Ω～19.99MΩ范圍內的電阻；而對于41/2位數字萬用表，則只能測量0.01Ω～19.999MΩ范圍內的電阻。當被測電阻Rx≥20MΩ時，儀表將顯示溢出符號“
新研究實現脊椎動物基因組復制的可視化分析
近日，中山大學海洋科學學院副教授盧建國團隊成功構建脊椎動物基因組復制數據庫DupScan和一站式分析平臺，實現了脊椎動物基因組復制的的可視化分析。相關研究發表于Nucleic Acids Research。盧建國副教授為該論文第一作者和通訊作者，碩士研究生黃沛霖為第二作者，南開大學計算機學院劉健教授
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—病毒篇
RNA甲基化領域是當前最耀眼的國際科研明星，也是國自然申請的大熱點；究其原因，是因為最近一兩年，RNA甲基化的功能與分子機制方面取得了巨大的進展。RNA甲基化已被證實在癌癥發生發展，病毒感染，神經發育，干細胞分化等過程中發揮著關鍵作用。今天，我們承接上一期的癌癥篇，為您帶來病毒領域的RNA甲基化
最新云序生物m6A“RNA甲基化”研究匯總—癌癥篇
一個月發表30多篇10分以上的文章，到底是何方神圣？答案：RNA甲基化。今天小編先來介紹一下m6A RNA甲基化。 m6A是真核細胞中mRNAs豐度最高的甲基化修飾，在包括組織發育、干細胞自我更新和分化、熱休克以及DNA損傷應答，母本合子(maternal-to-zygotic)轉化等多個
SMAD2/3與TGFβ影響轉錄因子發生m6ARNA甲基化調控干細胞發育
文章導讀： 胚胎干細胞作為一種全能性細胞，通過增殖和分化，產生動物體所有組織和器官的細胞。已有研究表明，胚胎干細胞發生m6A RNA甲基化，大多與細胞增殖[1-2]，免疫應答[4]關系密切。然而，對于m6A修飾在胚胎干細胞向神經內胚層細胞分化過程中的分子機制目前并沒有相關報道。今天，分享一
影響因子高達7.8分的直腸癌轉移肝癌環狀RNA文章思路解析
云序客戶發表首篇直腸癌轉移肝癌環狀RNA文章，影響因子高達7.8分!? 文章導讀： 在非編碼RNA的大家族中，環狀RNA是近年來繼microRNA和lncRNA之后又一個明星成員。因其3’-5’端成環，所以在生物體中具有穩定性高，不易被降解的特性。大部分環狀RNA通過直接或間接調控m
云序生物客戶發表的首篇吉西他濱耐藥胰腺導管癌環狀RNA
本篇文章主要研究的藥物是吉西他濱，其主要應用于晚期胰腺癌病人的治療，可是若病人對此類藥物產生了耐藥反應，那勢必會影響患者的生活質量，甚至生命。目前，對于吉西他濱對胰腺癌耐藥機制研究尚不明朗。作者首先構建了對吉西他濱耐藥細胞系，并通過全轉錄組測序比較了耐藥與正常細胞系之間環狀RNA的表達譜。通過生
實驗分析研究人員必備的100個基礎技能（二）
21.提高分析準確度的方法有那些? 選擇合適的分析方法，增加平行測定的次數，消除測定中的系統誤差。 22.偶然誤差的特點及消除方法? 特點：在一定條件下，有限次測量值中其誤差的絕對值，不會超過一定界限，同樣大小的正負偶然誤差，幾乎有相等的出現機會，小誤差出現機會多，大誤差出現機會少。