追根溯源:細說靶向重測序與擴增子捕獲技術
追根溯源:細說靶向重測序與擴增子捕獲技術 Thermo 與 Illumina合作的消息公布之后,在生物醫學界投下了一顆重磅炸彈,Ion Ampliseq也一下子成為網絡熱搜詞。Ion Ampliseq這個技術究竟是什么?它有什么獨特之處?為什么這個技術會造成轟動性的效應呢?讓我們追根溯源,從NGS說起。 NGS,即下一代測序技術(Next-generation sequencing technology)又稱高通量測序技術(High-throughput sequencing),以能一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定但讀長一般較短為標志。 NGS技術正逐年成熟,這使得全基因組測序的成本越來越低,但是對全基因組進行測序后得到的極其龐大、繁雜的數據量的分析工作并沒有隨之一起變得更加簡單,恰恰相反,更高的測序深度反而導致最后的數據量變得更加龐大了,分析工作也變得更加困難。于是,測序技術的發展出現了兩個極......閱讀全文
追根溯源:細說靶向重測序與擴增子捕獲技術
追根溯源:細說靶向重測序與擴增子捕獲技術 Thermo 與 Illumina合作的消息公布之后,在生物醫學界投下了一顆重磅炸彈,Ion Ampliseq也一下子成為網絡熱搜詞。Ion Ampliseq這個技術究竟是什么?它有什么獨特之處?為什么這個技術會造成轟動性的效應呢?讓我們追根溯源,
追根溯源:細說靶向重測序與擴增子捕獲技術
追根溯源:細說靶向重測序與擴增子捕獲技術 Thermo 與 Illumina合作的消息公布之后,在生物醫學界投下了一顆重磅炸彈,Ion Ampliseq也一下子成為網絡熱搜詞。Ion Ampliseq這個技術究竟是什么?它有什么獨特之處?為什么這個技術會造成轟動性的效應呢?讓我們追根溯源,
安捷倫:用于RNA測序的文庫制備與靶向序列捕獲解決方案
簡化的RNA和DNA測序解決方案,用于精簡臨床NGS 2020年9月1日,北京——安捷倫科技公司(紐約證交所:A)今日宣布推出SureSelect XT HS2 RNA試劑盒。該解決方案采用模塊化設計,為RNA 和 DNA樣品提供了一種簡單的平行分析方法,從而確保客戶能夠簡化并整合其工作流程,而無
PCRfree的靶向捕獲技術遇上PCRfree-PacBio-SMRT測序
高通量測序技術已經被廣泛用于疾病基因組特征和分子機制研究,研究策略無非是全基因組測序或是靶向測序,在靶向測序中,常見的靶向富集技術有PCR擴增目的區域或基于探針的靶向捕獲技術,但這兩種方法都很難繞過一個關鍵步驟-PCR擴增,使得研究人員無法對原始的基因組區域進行測序,從而無法保證測序結果的真實性
武大聯合團隊開發納米孔靶向測序-快速“捕獲”新冠病毒
武漢大學聯合團隊創新性開發了納米孔靶向測序檢測方法(NTS),能大幅提升病毒陽性檢出率,并能實現當天同時檢測新冠和其他10大類、40種常見呼吸道病毒并監測病毒突變。 3月7日,該團隊在預印版平臺medRxiv發表題為《納米孔靶向測序精準全面檢測新冠病毒以及其他呼吸道病毒》的研究論文。 既往
安捷倫科技針對新一代測序儀的靶向序列捕獲技術提速四倍
2012 年 3 月 26日,加利福尼亞州圣克拉拉市——安捷倫科技公司(紐約證交所:A)推出了 HaloPlex 靶向序列捕獲系統的加速版本,該版本適用于臺式測序儀。使用該系統后,從前需要大約 24 小時才能完成的實驗方案,現在不到 6 小時便可輕松結束。這就意味著,用戶可在一
澳發明新基因測序技術“捕獲測序”有助快速診斷血癌
澳大利亞科學家發明了一種新的基因測序技術,其精度大大高于現有方法。它就像一臺倍數更高的顯微鏡,可用于對基因組進行精細研究,并幫助快速診斷血癌(即白血病)。 這項技術被稱為“捕獲測序”,由新南威爾士大學和加文醫學研究所的科研人員開發,發表在新一期英國《自然·方法學》雜志上。 新南威爾士大學日前
澳發明新基因測序技術“捕獲測序”有助快速診斷血癌
澳大利亞科學家發明了一種新的基因測序技術,其精度大大高于現有方法。它就像一臺倍數更高的顯微鏡,可用于對基因組進行精細研究,并幫助快速診斷血癌(即白血病)。 這項技術被稱為“捕獲測序”,由新南威爾士大學和加文醫學研究所的科研人員開發,發表在新一期英國《自然·方法學》雜志上。 新南威爾士大學日前
液相序列捕獲系統與高通量測序
Nature Biotechnology 2009年2月封面文章:基于安捷倫寡核苷酸序列合成技術的液相序列捕獲系統 – 高通量平行靶向測序的最佳解決方案來自美國麻省理工學院和哈佛大學Broad研究院的研究人員,利用安捷倫(Agilent Technologies)卓越的寡核苷酸序列合成技術,合成
靶向捕獲讓ctDNA無處遁形
循環腫瘤DNA(ctDNA)是一類具備廣泛應用前景的腫瘤標志物,可用于腫瘤發展及預后狀態的無創測定。現有的ctDNA檢測方法要根據每位癌癥患者的情況來制定繁瑣的檢測步驟,且敏感度低,難以適用于廣泛的臨床應用。近期在Nature Medicine上發表的一篇文章中1,研究人員介紹了一種全新的ctDNA
SageHLS靶向捕獲大片段DNA在測序解析神經精神疾病CNVs結...
SageHLS靶向捕獲大片段DNA在測序解析神經精神疾病CNVs結構研究的應用在2020年的美國AGBT(基因組生物學與技術進展)大會上,由斯坦福大學實驗室的Alexander Urban和Hanlee Ji主導的一項國際合作項目中,研究人員使用SageHLS超大片段核酸回收系統在結構復雜的人類染色
靶向序列捕獲和新一代測序前對石蠟包埋組織及...(一)
靶向序列捕獲和新一代測序前對石蠟包埋組織及新鮮冷凍組織進行DNA質控靶向序列捕獲和新一代測序前對福爾馬林固定石蠟包埋組織及新鮮冷凍組織進行 DNA 質量控制?作者Melissa Huang Liu安捷倫科技有限公司美國加利福尼亞州拉霍亞Maria Celeste Ramirez安捷倫科技有限公司美國
靶向序列捕獲和新一代測序前對石蠟包埋組織及...(二)
捕獲前擴增四個 DNA 樣品按照樣品前處理工作流程(圖 1)進行進一步處理。對捕獲前擴增樣品進行五次 PCR 循環,然后采用 DNA 1000 試劑盒在 2100 生物分析儀上進行分析(圖 3)。?圖3. 使用 Agilent 2100 生物分析儀及安捷倫 DNA 1000 試劑盒分析所得的捕獲前擴
安捷倫推出首款商業化測序外顯子靶向序列捕獲試劑盒
安捷倫科技針對模式生物,推出世界首款 商業化下一代測序外顯子靶向序列捕獲試劑盒???? 2011 年 1 月 19 日,北京——安捷倫科技公司(紐約證交所:A)今日推出 ,這是全球首款可用于模式生物外顯子靶向序列捕獲的商業化系統,用以簡化下一代測序實驗。 ???? 日本 RIKEN
DNA靶向測序panel:七個你不可不知的問答
在之前舉辦的NGS系列講座中,我們邀請專家為您介紹了從樣本制備到數據解讀報告的全面NGS技術應用。講座收到了眾多反饋與咨詢,在此我們總結出最受關注的7大問題,與您分享。1?QIAGEN的靶向基因擴增試劑盒能用在哪些NGS平臺?GeneRead DNAseq Targeted Panels V2適用于
算法輔助的超多重PCR引物設計實現超低的引物二聚體水平
近日,專注于核酸分子雜交底層技術研發和應用轉化的創新型分子診斷公司閱爾基因與同濟大學附屬上海肺科醫院任勝祥教授合作在Nature Communications再次發表重磅研究,介紹了一種多重PCR引物設計的核心算法SADDLE,在大型擴增子法測序panel中首次實現了超低的引物二聚體水平。SADDL
靶向捕獲測序應用于多基因遺傳病銀屑病的致病基因鑒...
靶向捕獲測序應用于多基因遺傳病銀屑病的致病基因鑒定銀屑病,俗稱干癬,是一種常見的具有特征性皮損的慢性易于復發的炎癥性皮膚病,被認為是是遺傳因素與環境因素等多種因素相互作用的多基因遺傳病。 在以往對多基因遺傳病的發病機理探索中,研究者們通過正常與疾病對照樣本的基于SNP芯片的全基因組GWAS實驗,尋找
高質量基因捕獲測序如何實現?
近十幾年來,NGS(二代測序技術)的快速發展使得DNA測序成本大幅降低,然而就現階段而言,全基因組重測序的成本依然很高,且得到的海量數據分析速度緩慢,無法大規模地應用。靶向測序技術可以將感興趣的基因組區域富集出來測序,單個樣本測序數據產出少且分析速度較快,因此更能經濟高效地發揮NGS技術的優勢,廣泛
Predica與華大智造攜手開啟腫瘤精準醫療新紀元:高通量測序平臺賦能靶向RNA測序技術
7月11日,腫瘤診斷領域的領先創新者Predica Diagnostics與華大智造宣布達成合作,共同在華大智造高通量測序平臺上開發Predica的靶向RNA測序技術,助力精準醫療。 此次合作旨在通過實現早期癌癥檢測和促進個性化靶向治療策略,通過將Predica Diagnostics的先進測
國人首創!新型高分辨率多聚SNP技術讓分子檢測不再昂貴
以DNA變異為基礎的分子檢測技術被廣泛應用于生物分子學、基因組學、遺傳學和育種等領域。在動植物遺傳育種方面,DNA變異被開發為SSR和SNP等不同類型的分子標記,用于遺傳圖譜構建、多樣性分析、標記-性狀關聯、圖位克隆、分子育種、指紋鑒定等方面。各種高通量檢測技術設備和高密度DNA芯片的開發,極大
什么是擴增子?
擴增子(amplicon)為DNA或RNA擴增后的一段核苷酸序列。比如通過PCR擴增得到的某個基因的擴增片段。更簡單地說,擴增子是經過人工擴增的DNA片段或RNA片段的擴增產物。
安捷倫推出新產品完善靶向序列捕獲系統
安捷倫科技推出新一代測序樣品制備、靶向富集和自動化方案,完善靶向序列捕獲系統????2010 年 11 月 3 日,北京——安捷倫科技公司(紐約證交所:A)今日發布新一代測序產品的新成員——,繼續保持快速的新產品推出步伐。SureSelect XT 在成熟可靠的 SureS
低頻突變在復雜疾病中的研究——精神疾病
目前的全基因組測序或全外顯子測序的研究重點越來越集中在有害的Rare variant上。相比common variant來說,rare variant對疾病的發病機制更有影響。Rare variant 的頻度遠低于common variant。但Rare variant多表現為致病突變,并且是高
基因捕獲技術介紹
基因捕獲技術是最具應用前景的基因克隆方法之一。利用該技術建立的隨機插入突變的突變體文庫,可用于尋找、鑒定和研究大量未知功能和已知功能的活化基因,它是繼自然突變、物理突變和化學突變之后發展起來的新的分子生物學方法。基因捕獲載體是帶有報告基因和/或選擇標記基因的不完整的基因表達載體;這些載體所帶的基因只
靶向深度測序和單細胞基因測序的區別
1、目標序列靶向測序是一種對感興趣的基因組區域進行富集測序的研究策略。目標區域測序的主要優勢在于可針對特定區域進行測序,有效降低了測序成本,提高了測序深度,能夠更為經濟有效地研究特定區域的遺傳變異。2 單細胞測序是指單個細胞水平上對基因組進行測序。3、靶向測序步驟為 樣品準備、探針/引物設計、目標序
靶向深度測序和單細胞基因測序的區別
1、目標序列靶向測序是一種對感興趣的基因組區域進行富集測序的研究策略。目標區域測序的主要優勢在于可針對特定區域進行測序,有效降低了測序成本,提高了測序深度,能夠更為經濟有效地研究特定區域的遺傳變異。2 單細胞測序是指單個細胞水平上對基因組進行測序。3、靶向測序步驟為 樣品準備、探針/引物設計、目標序
DNA-甲基化測序常用方法
隨著高通量測序技術(NGS)技術的發展,使我們能夠從全基因組水平來分析 5’甲基胞嘧啶及組蛋白修飾等事件,由此能夠發現很多傳統的基因組學研究所不能發現的東西,這就是所謂的“DNA 甲基化測序”!DNA 甲基化測序方法按原理可以分成三大類:?1、重亞硫酸鹽測序;?2、基于限制性內切酶的測序;?3、靶向
LYTAC-與靶向蛋白降解技術講解(三)
到目前為止,除 CRBN/IMiD 分子膠之外,分子膠的設計構想仍依賴偶然的發現,包括通過系統地挖掘數據庫得到的 CDK 抑制劑 ?CR8 ?分子,以及優化 MDM2 雙功能降解劑 MD-222 得到的? MG-277 。?■ 自噬介導的靶向蛋白質降解 (AUTAC):?自噬靶向嵌合體 (AUTAC
LYTAC-與靶向蛋白降解技術講解(一)
近日,溶酶體靶向嵌合體 (LYTAC) 的發現在“江湖”上掀起了風浪,PROTAC 技術也安上了“開關”,到底是怎么回事兒呢?作為 5G 青年的小編又忍不住下手了,借此和大家聊一聊那些靶向蛋白技術~靶向蛋白降解 ?(TPD) ?是一種有效性的,高度選擇性的誘發蛋白降解方式。近年來,以 PROTAC
LYTAC-與靶向蛋白降解技術講解(二)
龐大的蛋白降解家族?當然,“蛋白降解家族”可不止 PROTAC,LYTAC 兩個成員,還有很多其他的新興靶向蛋白技術,如光控靶蛋白降解 (photo-PROTAC)、分子膠 (Molecular Glue),自噬介導的靶蛋白降解 (AUTAC)、利用 TRIM21 E3 連接酶靶向降解蛋白的 Tri