追根溯源:細說靶向重測序與擴增子捕獲技術
追根溯源:細說靶向重測序與擴增子捕獲技術 Thermo 與 Illumina合作的消息公布之后,在生物醫學界投下了一顆重磅炸彈,Ion Ampliseq也一下子成為網絡熱搜詞。Ion Ampliseq這個技術究竟是什么?它有什么獨特之處?為什么這個技術會造成轟動性的效應呢?讓我們追根溯源,從NGS說起。 NGS,即下一代測序技術(Next-generation sequencing technology)又稱高通量測序技術(High-throughput sequencing),以能一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定但讀長一般較短為標志。 NGS技術正逐年成熟,這使得全基因組測序的成本越來越低,但是對全基因組進行測序后得到的極其龐大、繁雜的數據量的分析工作并沒有隨之一起變得更加簡單,恰恰相反,更高的測序深度反而導致最后的數據量變得更加龐大了,分析工作也變得更加困難。于是,測序技術的發展出現了兩個極......閱讀全文
基因擴增子的定義
擴增子為基因組的一個DNA片段,當生物接觸某種抑制該片段所含基因的功能的藥物后,該DNA片段可形成多個線性拷貝。例如,哺乳動物中二氫葉酸還原酶可被甲氨喋呤抑制,當哺乳動物接觸該藥物后,則引起二氫葉酸還原酶基因(dihydrofolate reductase)的擴增。擴增片段常會有除被抑制基因序列以外
細胞化學詞匯擴增子
擴增子為基因組的一個DNA片段,當生物接觸某種抑制該片段所含基因的功能的藥物后,該DNA片段可形成多個線性拷貝。例如,哺乳動物中二氫葉酸還原酶可被甲氨喋呤抑制,當哺乳動物接觸該藥物后,則引起二氫葉酸還原酶基因(dihydrofolate reductase)的擴增。擴增片段常會有除被抑制基因序列以外
Nature-Methods:兩輪捕獲+雙重測序-成就史上最精準的測序!
傳統的高通量測序會產生不少錯誤,掩蓋基因組中的罕見突變。前不久科學家們開發了一種新測序法,能夠成功從背景噪音中分離出信號,實現極為準確的測序。 腫瘤是異質性細胞的混合體,測序可以檢測其中的罕見突變,但成本較高而且容易出現錯誤。華盛頓大學的研究團隊為此開發了新測序技術,將靶序列純化與高精度的DN
安捷倫科技和Illumina共同推廣靶向測序解決方案
新產品將Illumina Genome Analyzer的讀長和安捷倫SureSelect平臺有效結合,大大簡化實驗操作流程 ????? 2009年4月30日,北京——Illumina公司(NASDAQ:ILMN)和安捷倫科技(NYSE:A)于日前宣布,他們已經啟動了一個非排他性的合作市場營銷協
基因捕獲技術的概念
基因捕獲技術是最具應用前景的基因克隆方法之一。利用該技術建立的隨機插入突變的突變體文庫,可用于尋找、鑒定和研究大量未知功能和已知功能的活化基因,它是繼自然突變、物理突變和化學突變之后發展起來的新的分子生物學方法。基因捕獲載體是帶有報告基因和/或選擇標記基因的不完整的基因表達載體;這些載體所帶的基因只
基因捕獲技術的定義
基因捕獲技術是最具應用前景的基因克隆方法之一。利用該技術建立的隨機插入突變的突變體文庫,可用于尋找、鑒定和研究大量未知功能和已知功能的活化基因,它是繼自然突變、物理突變和化學突變之后發展起來的新的分子生物學方法。基因捕獲載體是帶有報告基因和/或選擇標記基因的不完整的基因表達載體;這些載體所帶的基因只
中英碳捕獲與封存技術聯合研究項目征集建議
截止日期:2010年4月15日下午4點。 英國工程與自然科學研究理事會(EPSRC)領導下的英國研究理事會能源項目已確定中國為國際合作的優先國家。這項活動根據之前兩個在可再生能源和清潔礦物燃料領域進行合作研究的提議,由EPSRC和中國自然科學基金委員會(NSFC)聯合發布。 我們希望
Paragon-Genomics推廣CleanPlex?-NGS靶點富集產品
Paragon Genomics,Inc.是給新一代測序(NGS)基于擴增子的靶向富集解決方案的佼佼者。Paragon今天宣布已在中國建立子公司,旨在將其CleanPlex?產品推向快速增長的中國市場。根據今年早些時候與MGI Tech Co.,Ltd.(MGI)達成的分銷協議,Paragon推
二代測序雜交捕獲是100%結合嗎
不是 有兩種第二代雜交捕獲檢測技術(HC2)進行...DNA定量分析方法結合HC2檢測篩查宮頸癌的敏感性和特異...度分別是100%、96.49%,HPG方法和DNA直接測序方法
DNA測序技術的研究與發展
70年代末,WalterGilbert發明化學法、FrederickSanger發明雙脫氧終止法手動測序,同位素標記80年代中期,出現自動測序儀(應用雙脫氧終止法原理)、熒光代替同位素,計算機圖象識別90年代中期,測序儀重大改進、集束化的毛細管電泳代替凝膠電泳2001年完成人類基因組框架圖
高通量測序技術總結與展望
第一代測序技術憑借其長的序列片段和高的準確率,適合對新物種進行基因組長距框架的搭建以及后期GAP填補,但是成本昂貴,而且難以勝任微量DNA樣品的測序工作。第二代測序技術中,454序列片段最長,比較適合對未知基因組從頭測序,搭建主體結構,但是在判斷連續單堿基重復區時準確度不高。Solexa較454
2012最受歡迎的測序文章,點滴決定成敗
作為測序生力軍的第三代測序技術能夠大大增加測序的效率和通量,不過很顯然第二代測序技術仍會繼續被廣泛采用。近日BioTechniques雜志評出了今年最受歡迎的兩篇測序文章以饗讀者,而這兩篇文章正是目前技術過渡時期的寫照。 近年來,基因組學、轉錄組學和宏基因組學等領域迎來了爆炸式的增長,這都
基因文庫制備儀簡介
基因文庫制備儀是一種用于基礎醫學領域的分析儀器,于2015年11月1日啟用。 技術指標 通量為10M,100M和1G測序芯片可以任意選擇;標準測序時間為2~3小時;使用無標記的核苷酸及酶進行測序。 主要功能 新一代測序技術,基因組DNA序列測定(微生物基因組測序、線粒體測序、靶向測序)、
Ion-Torrent新一代測序儀介紹
引言 ?? ? 整個或部分基因組測序的研究問題已解決,研究者的研究重點向著遺傳密碼如何編碼調控細胞功能方向轉移。同樣,在分子水平了解人類健康狀況,基因序列數據則顯得更加重要。大多數的測序都是針對部分基因序列或是一段目標區域,提供必需的數據來解釋給定假說。利用PCR技術很容易從基因組中擴增得
安捷倫交付首批中國本土生產的靶向捕獲產品
2021年9月9日,浙江杭州——安捷倫科技公司(紐約證交所:A)今日,安捷倫于杭州生產基地成功交付首批國內生產的SureSelect靶向捕獲探針產品。此次完成的生產交付,標志著近期落成的國內生產線,實現了與安捷倫全球標準一致的生產水平和質量保障。未來,國內生產線將生產供應高質量的SureSele
安捷倫科技推出SureSelect激酶組靶向序列捕獲試劑盒
安捷倫科技推出用于生物標記物發現的表達激酶組研究的靶向序列捕獲系統該系統可幫助研究人員尋找新的癌癥療法和藥物靶標 2010年10月,北京——安捷倫科技公司(紐約證交所:A)今日推出SureSelect激酶組靶向序列捕獲試劑盒,幫助研究者實現針對表達激酶(激酶組)的新一代測序研究
安捷倫科技通過戰略性收購擴張生命科學業務
安捷倫科技通過戰略性收購擴張其在新一代測序和藥物自動分析解決方案領域的生命科學業務 2011 年 12 月 1 日,加利福利亞州圣克拉拉市 – 安捷倫科技公司(紐約證交所:A)前宣布了通過兩項戰略性收購擴張其生命科學業務。其中一項是收購 Halo Genomics 公司,該公司專
擴增子的概念和用途
擴增子(amplicon)為DNA或RNA擴增后的一段核苷酸序列。比如通過PCR擴增得到的某個基因的擴增片段。更簡單地說,擴增子是經過人工擴增的DNA片段或RNA片段的擴增產物。
Nature子刊發布單色靶向測序法
最近,研究人員開發出一種新的邊合成邊測序(sequencing-by-synthesis)方法,這種方法可讓你在非常熟悉的平臺上更快、更劃算地進行靶向臨床測序。相關研究結果發表在最近的《自然通訊》雜志(Nature Communications)。 新一代測序(NGS)技術通過降低測序的成本,
靶向測序:表達譜分析的新選擇
沒有人愿意聽到“癌癥”這個詞。不過在提到前列腺癌時,人們的情緒往往更加復雜:有些人的腫瘤不會擴散,需要積極監控;而有些人就沒那么幸運,需要手術或放療和化療。醫生所面臨的挑戰是正確的診斷,再加上適當的治療。 Carlos S.Moreno是埃默里大學溫希普癌癥研究所(Winship Cancer
Macrogen千年基因應邀赴汕頭國際眼科中心進行學術交流
12月21日,Macrogen千年基因應邀赴汕頭大學?香港中文大學聯合汕頭國際眼科中心進行學術交流,該中心的陳建歡老師、陳浩宇主任等數十名研究人員參加了會議。會議期間,雙方共同探討了眼科疾病的研究進展及基因組學技術在該類疾病研究中的應用。基于汕頭國際眼科中心在眼病基因組學領域取得的科研成果,以及
時空分辨單細胞測序技術與傳統單細胞測序技術有何不同?
時空分辨單細胞測序技術與傳統單細胞測序技術主要有以下幾個方面的不同:空間信息獲取傳統單細胞測序技術通常無法提供細胞在組織中的空間位置信息,只是對分離的單細胞進行獨立分析。時空分辨單細胞測序技術能夠在獲取單個細胞基因表達等信息的同時,明確細胞在組織中的具體位置。細胞間相互作用研究傳統技術難以直接揭示細
西安交大等提出軸平面光學捕獲與成像技術
近日,西安交通大學理學院教授雷銘團隊提出軸平面光學捕獲與成像技術,打破了傳統光學捕獲技術的操控范圍局限在焦平面附近的限制,首次實現了軸平面(X-Z)全息光鑷動態操控多粒子的功能,極大地提升了光鑷在三維空間操控粒子的能力。該研究成果發表在最新的《物理評論快報》。 光鑷利用光與物質相互作用過程中的
安捷倫科技與Covaris公司簽署合作開發市場協議
安捷倫科技公司與Covaris公司簽署合作開發市場協議 將靶向序列富集與DNA剪切技術結合 用于新一代測序分析 2010年1月5日,北京安捷倫科技公司(NYSE: A)與Covaris 公司于今日宣布了一項合作開發市場協議,該協議表明,未來Covaris S2 DNA剪切技術將與安捷倫 S
中國人群甲狀腺乳頭狀癌遺傳圖譜繪就
近日,中國科學院北京生命科學研究院孫中生研究團隊與北京大學腫瘤醫院頭頸外科劉寶國課題組合作,收集了355對甲狀腺乳頭狀癌的癌組織和癌旁組織樣本,運用目標區域擴增子測序技術和RNA目標區域捕獲測序技術對癌癥樣本中的點突變和基因融合作了全面檢測,繪制了中國人群甲狀腺乳頭狀癌的遺傳圖譜。相關研究成果發
中國人群甲狀腺乳頭狀癌遺傳圖譜繪就
本報訊 近日,中國科學院北京生命科學研究院孫中生研究團隊與北京大學腫瘤醫院頭頸外科劉寶國課題組合作,收集了355對甲狀腺乳頭狀癌的癌組織和癌旁組織樣本,運用目標區域擴增子測序技術和RNA目標區域捕獲測序技術對癌癥樣本中的點突變和基因融合作了全面檢測,繪制了中國人群甲狀腺乳頭狀癌的遺傳圖譜。相關研
外顯子捕獲與擴增
? ? ? ? ? ? 實驗材料 大腸桿菌菌株 HB101 質粒 pSPL3 COS-7 細胞 載體 pBluescriptⅡ 大腸桿菌 DH5α
華大在新冠病毒基因組變異監測及研究方法上取得突破
隨著新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)肆虐全球,世界衛生組織(WHO)已經正式宣布其為全球流行病(Pandemic)。WHO最新新冠疫情狀態報告顯示,截至北京時間2020年3月26日10點,新冠肺炎疫情已蔓延至全球198個國家和地區,確診患者超過46萬例,且仍呈現迅速增長態勢。 病毒在傳播過
基因捕獲技術的主要分類
根據報告基因在載體中的位置及報告基因激活表達的方式,基因捕獲分為3種類型。增強子捕獲載體基因捕獲含有一個最小的啟動子和翻譯起始位點,當載體整合到順式增強子元件附近時,此增強子將調控報告基因的表達 。對報告基因在體內表達的ES 細胞系插入位點進行克隆鑒定發現插入位置鄰近編碼序列。關于增強子捕獲的誘變比
基因捕獲技術的優點缺點
用常規方法進行基因打靶研究需耗費大量的時間和人力。研究者必須針對靶位點在染色體組文庫中篩選相關的染色體組克隆,繪制相應的物理圖譜,構建特異性的打靶載體以及篩選中靶ES細胞等。通常一個基因剔除純合子小鼠的獲得需要一年或更長的時間。面對人類基因組計劃產生出來的巨大的功能未知的遺傳信息,傳統的基因剔除方法