植生生態所等在水稻馴化起源研究中取得新突破
最近，中國科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所國家基因研究中心韓斌課題組與中國水稻研究所及日本國立遺傳所等單位合作，于10月4日在《自然》雜志在線發表了題為“水稻全基因組遺傳變異圖譜的構建及馴化起源”的論文。 水稻、小麥等農作物的馴化、栽培對人類文明的進程產生過重大的影響，也一直被公認為是人類歷史上最偉大的發明之一。栽培作物的起源研究十分復雜，涉及植物學、遺傳學、生物地理學、考古學和人口學等不同的自然和社會學科。作為一種極其重要的糧食作物，關于水稻起源、馴化過程的研究及馴化基因的鑒定分析一直是學術界的研究熱點。根據已有的證據，目前普遍認為亞洲栽培稻是由亞洲的野生稻人工馴化而來，廣泛分布于中國、東南亞及南亞的普通野生稻是亞洲栽培稻的野生祖先種。但是，亞洲栽培稻最早起源于哪里（中國、東南亞、南亞或是其他地區）？人類最先開始馴化的是同一類野生稻然后逐......閱讀全文
我國科學家完成普通野生稻全基因組框架圖譜繪制
2010年8月，中國科學院昆明植物研究所植物種質資源與基因組學研究中心中科院“百人計劃”和云南省首屆高端科技人才入選者研究員帶領的植物種質資源、基因組學與生物信息學團隊，歷時一年，運用新一代高通量測序技術以及基于高性能超算的生物信息學分析，對野生稻全基因組測序取得了階段性重大成果。日前
植生生態所等在水稻馴化起源研究中取得新突破
?????? 最近，中國科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所國家基因研究中心韓斌課題組與中國水稻研究所及日本國立遺傳所等單位合作，于10月4日在《自然》雜志在線發表了題為“水稻全基因組遺傳變異圖譜的構建及馴化起源”的論文。 水稻、小麥等農作物的馴化、栽培對人類文明的進程產生過重大的影響，
野生稻并不“野”
近日，我國科學家對野生稻的研究取得了新進展，研究成果在線發表于《基因組學研究》雜志。他們發現，野生稻并不“野”，顛覆了之前科學家對野生稻的認知，很多相關理論都要重新思考和修訂，對野生資源的科學保護也已刻不容緩。 普通野生稻一直被認為是亞洲栽培稻的野生祖先，也是水稻改良過程中的重要種質資源。普通
植物所證實水稻是多次起源的產物
亞洲稻又稱水稻（Oryza sativa?L.）。亞洲稻包括粳稻（Japonica）和秈稻（Indica）兩個亞種，不僅是最重要的糧食作物之一，也是理論研究中日益受到重視的模式生物。盡管迄今針對水稻開展了大量研究，但關于水稻起源/馴化的歷史已爭論了半個多世紀，存在各種推論和觀點。目前存在兩種主流假說
迄今分辨率最高的野生稻栽培稻泛基因組圖譜繪就
亞洲栽培稻馴化歷史可追溯至一萬年前的普通野生稻。 面對全球人口增長和氣候變化加劇的雙重壓力，如何將野生稻歷經萬年錘煉的“生存智慧”注入現代品種，培育出兼具高產潛力與抗病抗逆特性的“超級水稻”已成為重要研究課題。然而，傳統依賴單一參考基因組的研究模式譬如以管窺天，僅能捕捉水稻遺傳多樣性的冰山一角。
上海生科所Nature基因組研究新成果
近日來自中科院上海生命科學研究院、日本國立遺傳學研究所和中國農業科學院的研究人員通過繪制水稻基因組變異圖譜揭示栽培稻(cultivated rice)的起源，相關論文“A map of rice genome variation reveals the origin of cultivate
研究發現野生稻并不“野”
中國科學院遺傳發育所研究員儲成才研究組和丹麥哥本哈根大學、美國加州大學伯克利分校研究人員合作開展的一項研究發現，野生稻基因組中有著人工選擇馴化的痕跡，他們巧妙地證實有大量栽培稻基因流入野生稻群體。日前出版的美國《基因組學研究》雜志發表了這一成果。 研究人員通過對已發表的大量野生稻和栽培稻基因組
遺傳發育所等完成短花藥野生稻基因組測序及分析
稻屬是從事植物比較、進化和功能基因組學研究的理想系統。野生稻蘊含著寶貴的基因資源。為了更好地利用稻屬的野生資源，美國亞利桑那大學的Rod Wing教授在2009年發起了國際稻屬基因組計劃(I-OMAP)，旨在構建稻屬所有物種的全基因組序列圖譜，并在此基礎上開展比較、進化和功能基因組學研究。
中科院、華大基因Nature子刊測序新成果
來自中科院遺傳與發育生物學研究所、深圳華大基因研究院和亞利桑那大學等機構的研究人員完成了對短花藥野生稻(Oryza brachyantha)的全基因組測序，并揭示出了稻屬基因組進化的機制。相關成果發表在3月12日的《自然通訊》(Nature Communications)雜志上。
云南建立三種野生稻基因文庫
云南省農科院生物技術與種質資源研究所目前已為該省分布的三種野生稻建立了基因文庫。 云南省農科院生物技術與種質資源研究所副所長程在全博士接受新華社記者專訪時表示，在優異種質基因發掘研究方面，研究所首次構建了普通野生稻、疣粒野生稻和藥用野生稻cDNA文庫，并從中發現和分離獲得一大批野生稻重要功能基因
中國科學家完成水稻5個“近親”基因組測序
中國科學家３日說，他們完成了亞洲栽培稻（一般稱為水稻）５個“近親”的全基因組測序，獲得了高質量的基因組參考序列。這有望進一步推動水稻品種的改良。 中國科學家在美國《國家科學院學報》上報告說，他們從２００７年至今，自主完成了尼瓦拉野生稻、非洲栽培稻、短舌野生稻、展穎野生稻和南方野生
昆明植物所破譯稻屬植物5個物種全基因組
亞洲栽培稻（一般稱為水稻）是世界上最重要的糧食作物之一，是中國第一大糧食作物，養活了80％以上的中國人口。在水稻與其它約23個物種共同組成的稻屬植物中，它和7個稻種（普通野生稻、尼瓦拉野生稻、非洲栽培稻、短舌野生稻、展穎野生稻、長雄蕊野生稻和南方野生稻）都是AA基因組類型，這些水稻近緣物種間斷分
我國首個普通野生稻高通量優異基因發掘平臺發布
近日，中國農業科學院作物科學研究所水稻優異種質資源創新利用創新團隊首次組裝了普通野生稻單倍型無間隙染色體基因組，構建了野生稻種質資源優異基因發掘利用與種質創新的平臺，并鑒定了關鍵的耐鹽與抗稻瘟病基因。相關研究成果發表在《自然通訊》（Nature Communications）上。栽培稻是由二倍體普通
我國首個普通野生稻高通量優異基因發掘平臺發布
近日，中國農業科學院作物科學研究所水稻優異種質資源創新利用創新團隊首次組裝了普通野生稻單倍型無間隙染色體基因組，構建了野生稻種質資源優異基因發掘利用與種質創新的平臺，并鑒定了關鍵的耐鹽與抗稻瘟病基因。相關研究成果發表在《自然通訊》（Nature Communications）上。栽培稻是由二倍體普通
守護東南亞野生動物多樣性
中國西南和東南亞是北半球生物多樣性最豐富的地區，據統計，東南亞涵蓋了全球約20％的植物、動物和海洋物種，全境都是生物多樣性熱點地區。所謂“生物多樣性熱點”指的是生物物種高度集中，且面臨高度破壞威脅的地區。團隊在Zeyardan村駐地處理標本 在中科院昆明動物所，就有這樣一個研究團隊——東南亞野
花生二倍體野生種全基因組測序完成
國際花生基因組計劃(International Peanut Genome Initiative, IPGI)——由多國作物遺傳學家參與的國際團隊，于2014年4月2日宣布，歷經數年努力后成功完成了世界上首個花生全基因組測序。新測定的花生基因組序列將為世界各地的研究人員和植物育種者使用，來促
吃了一輩子的水稻，為何如此多樣？
近日，中國農業科學院作物科學研究所水稻優異種質資源發掘與創新利用創新團隊、作物基因組選擇育種創新團隊和華盛頓圣路易斯大學的肯·奧爾森團隊合作完成了水稻（亞洲栽培稻）及其祖先種（普通野生稻）非編碼區長鏈非編碼RNA（lncRNA）的注釋，研究了水稻lncRNA的進化歷史，并從全基因組水平揭示了ln
作物基因組學研究進展（一）
作物基因組學研究進展農作物基因組學研究的發展，對于有效利用現代分子生物學手段進行物種的遺傳改良發揮了重要作用。隨著測序技術的發展，已經實現對重要農作物，如水稻、小麥、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因組的測序或重測序，在此基礎上完成對控制重要農藝性狀基因的克隆和鑒定。本文綜述了２０１8年度主要農
基因組所合作研究揭開兩種家養水稻起源進化“篇章”
6月9日，在最新一期的PLOS Genetics上，來自中國科學院北京基因組研究所的吳仲義研究員和中山大學施蘇華教授發表了合作研究文章《水稻基因組兩種進化歷史：馴化基因的角色》(Two Evolutionary Histories in the Genome of Rice: the R
浙大教授Nature子刊：水稻基因組重測序及群體遺傳學研究
浙江大學農業與生物技術學院作物科學研究所，中國水稻研究所的研究人員發表了題為“Genomic variation associated with local adaptation of weedy rice during de-domestication” 的文章，以雜草稻群體為材料，通過基因組
花生基因組宣稱花生二倍體野生種全基因組測序完成
國際花生基因組計劃4月2日在美國弗吉尼亞州亞歷山大市宣布，包括中方合作單位在內的多國科研人員已經成功完成花生基因組測序，將為選育更高產、適應性更廣的花生品種提供幫助。 國際花生基因組計劃宣稱，花生全基因組測序取得的重大進展，分別代表花生屬A基因組和B基因組的兩個二倍體野生種的全基因組測序已
中科院合作研究發現野生稻并不“野”
中國科學院遺傳發育所研究員儲成才研究組和丹麥哥本哈根大學、美國加州大學伯克利分校研究人員合作開展的一項研究發現，野生稻基因組中有著人工選擇馴化的痕跡，他們巧妙地證實有大量栽培稻基因流入野生稻群體。日前出版的美國《基因組學研究》雜志發表了這一成果。 研究人員通過對已發表的大量野生稻和栽培稻基因
超級泛基因組助水稻種質資源遺傳變異挖掘利用
?水稻泛NLRs家族基因的共線性位點（左）；基于全基因組SNPs的水稻系統發生樹（右）。中國農科院供圖 近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所與國內多家高校、科研單位合作，組裝了251份高質量的水稻基因組，構建了目前植物中群體規模最大、基因組充分注釋、稻屬中最為系統的超級泛基因組。該圖譜
中國科學家揭示雜草稻遺傳機制，指導精準防控
雜草稻是田間的“山寨版”水稻，直接導致稻田減產，品質下降。浙江大學聯合中國水稻研究所的科研人員通過基因組重測序及分析，揭示了雜草稻的遺傳機制，為雜草稻防治奠定理論基礎。相關論文日前在線發表在《自然·通訊》雜志上。 “雜草稻出現在田間，與正常的栽培水稻爭陽光、水和養分，嚴重影響著水稻產量與品
我科學家參與完成非洲稻基因組測序
最近，美國亞利桑那大學（UA）研究人員帶領的一個國際研究小組，完成了非洲稻（Oryza glaberrima）的全基因組測序。中科院遺傳與發育生物學研究所的陳明生（Mingsheng Chen）和Jinfeng Chen也參與了此項研究工作。相關研究結果，以“The genome sequenc
中國科學家揭示雜草稻遺傳機制，指導精準防控
“雜草稻出現在田間，與正常的栽培水稻爭陽光、水和養分，嚴重影響著水稻產量與品質。雜草稻米粒口感堅硬粗糙，如果農民在收割時混入了雜草稻，大米就賣不出好價錢。” 浙江大學農業與生物技術學院作物科學研究所教授樊龍江說。 在田間，雜草稻是一枚“潛伏者”。從苗期開始，雜草稻就與栽培水稻一同拔節長葉，外形
拯救“植物大熊貓”－云南野生稻研究獲重大進展
記者8月25日從云南省農科院生物技術與種質資源研究所了解到，云南野生稻保護與遺傳特性研究取得重大進展，研究成果被包括中國科學院院士在內的鑒定專家組肯定為“整體成果達到國際先進水平，部分成果達到國際領先水平”。?云南省農科院生物技術與種質資源研究所副所長程在全介紹，野生稻是水稻的原始祖先，被專家稱為“
中國學者10月參與發表多篇Nature文章
進入十月份，中國學者參與的多項研究在Nature雜志及其重要子刊上發表，其中主要包括的是水稻全基因組遺傳變異精細圖譜，利用基因修飾的單倍體胚胎干細胞獲得健康成活的轉基因哺乳動物，以及人的葡萄糖轉運蛋白GLUT1-4在大腸桿菌中的同源蛋白XylE的晶體結構等。 首先，中科院上海生科院植物生理
專家呼吁：用邊際性土地資源發展生物質能源
國家發改委等部門制定的《可再生能源發展“十二五”規劃》提出，到2015年，生物燃料乙醇利用量將達到400萬噸，但2011年我國燃料乙醇產量僅為169萬噸。發展生物燃料如何破解不與民爭糧、不與糧爭地，日前中科院昆明植物研究所中國西南野生生物種質資源庫副主任高立志博士接受采訪時指出，大多數木本油料植
研究發現雜草稻抗旱基因
近日，中國農業科學院作物科學研究所水稻優異種質資源發掘與創新利用創新團隊研究發現，雜草稻與栽培稻之間存在基因滲入，支持了雜草稻起源于栽培稻的去馴化觀點，發掘了雜草稻中的抗旱相關基因PAPH1，并驗證了其功能，為抗旱基因功能的深入研究與雜草稻的有效利用提供了理論支撐。相關研究成果在線發表于《實驗植物學