日科學家發現可抑制基因組損傷的蛋白質
日本科學家發表于最新一期《自然》雜志網絡版的論文說，他們經動物實驗發現，人類以及許多動物體內都有的Zuc蛋白質在抑制轉位子造成的基因組損傷過程中發揮著重要作用，這項研究成果將有助于解開不孕癥發病的機制。 日本科學技術振興機構和東京大學15日聯合發表新聞公報介紹了上述成果。公報說，動物基因組中都存在轉位子，這是一種有特定功能的基因片段，它可以自我復制并在基因序列中四處移動。轉位子的移動在許多情況下會造成基因組損傷，進而引發各種疾病，因此，生物體內存在抑制轉位子的機制。 此前的研究顯示，一種由約30個核苷酸組成的小核糖核酸PiRNA能保護基因組不被轉位子損傷，確保生殖細胞中的遺傳信息能正確地傳遞給后代。PiRNA是由一條長鏈RNA演變而來的，但是究竟是如何形成的尚不明確。 東京大學研究人員以果蠅和小鼠為實驗對象，注意到一種名為Zuc的蛋白質擁有可切斷單鏈RNA的分子結構。而生化學分析顯示，這種蛋白質切斷RNA是......閱讀全文
做western轉膜，用濕轉電泳，還是半干轉電泳好
半干轉要用專門的半干轉膜儀，而濕轉用電泳儀配附件即可；半干轉所需時間較短，但控制不好，中間發熱比較大容易把膜和膠烘壞；而濕轉耗時較長，尤其對大分子量的蛋白轉膜效果較好。相對來講，還是濕法轉膜的實驗室多一些。
Western－轉膜時用干轉還是濕轉效果比較好？
關鍵看效果怎么細分，干轉，速度快，效率稍低，濕轉，速度比較慢，轉移效率高。但是最主要看蛋白的分子量大小。如果普通分子量為主，干轉就挺好的，效率非常高，幾分鐘就做完了。分子量特別大，又沒有其他人的方案做參考，可以先試試濕轉。就是幾個小時等得比較痛苦。好幾個人做的話，真是等到花兒也謝了。至于說效果，不是
Western－轉膜時用干轉還是濕轉效果比較好
關鍵看效果怎么細分，干轉，速度快，效率稍低，濕轉，速度比較慢，轉移效率高。但是最主要看蛋白的分子量大小。如果普通分子量為主，干轉就挺好的，效率非常高，幾分鐘就做完了。分子量特別大，又沒有其他人的方案做參考，可以先試試濕轉。就是幾個小時等得比較痛苦。好幾個人做的話，真是等到花兒也謝了。至于說效果，不是
4月29日《自然》雜志精選
????? 封面故事： 尋找同卵雙胞胎的遺傳差別 ? 同卵（或更準確地說“單合子”）雙胞胎被廣泛用來研究遺傳和環境對人們疾病的貢獻。對三對單合子雙胞胎（其中一對有多發性硬化，另外兩對沒有）所作的一項研究，將最新基因組測序和分析方法應用到了這一領域，并且偶然性地發布了首批人類女性基因組序列。
PNAS：特殊蛋白質可控制機體“基因組衛士”
近日，發表在國際雜志PNAS上的一篇研究報告中，來自蒙特利爾臨床研究學院的科學家通過研究鑒別出了免疫反應已知機制的一種新的作用亮點，研究人員發現了一種新型特殊蛋白，其可以控制“基因組衛士”—p53腫瘤抑制蛋白的活性。 文章中，研究者對T細胞和B細胞的發育也進行了深入研究，這兩種細胞均是保護機體
蛋白質組學之逆襲，深度注釋基因組
申請課題缺創新點？撰寫論文沒思路？急著畢業時間緊？別怕，對于吉凱，一切都是套路！更有甚者，對于宇宙終極難題：“屌絲如何逆襲白富美？”老司機黃博也有一套經典案例分享給大家。 從前，在生物學研究領域，有一個白富美叫基因組學（Genomics），她有一項強大的技能：DNA測序，憑借這項技能，她完
蛋白質、基因組與人類疾病有了關聯圖
據《科學》雜志近日發表的一項最新研究，研究人員將人體血液中的數千種蛋白質數據與遺傳數據相結合，繪出了蛋白質、基因組與人類疾病的網絡關系圖，顯示了影響這些蛋白質的遺傳差異如何將多種多樣的相關疾病聯系在一起。通過創建基因組蛋白質組圖，科學家們發現了不同人類疾病之間的數百種新聯系。 蛋白質故障會導
蛋白質、基因組與人類疾病有了關聯圖
據《科學》雜志近日發表的一項最新研究，研究人員將人體血液中的數千種蛋白質數據與遺傳數據相結合，繪出了蛋白質、基因組與人類疾病的網絡關系圖，顯示了影響這些蛋白質的遺傳差異如何將多種多樣的相關疾病聯系在一起。 通過創建基因組蛋白質組圖，科學家們發現了不同人類疾病之間的數百種新聯系。 蛋白質故障會
Nat－Rev－Cancer綜述：腫瘤蛋白質基因組學
導 讀? ? ? ?腫瘤蛋白質基因組學（Cancer proteogenomics）是將基于質譜（MS）的蛋白質豐度和翻譯后修飾（PTM）信息與臨床前腫瘤模型和腫瘤樣本的基因組、表觀基因組和轉錄組數據相結合的組學技術。基因組學和表觀基因組學為解釋可能發生的生物過程提供了基礎知識，蛋白質組學是對已經發
電泳、轉膜
轉膜是把DNA從瓊脂糖凝膠中轉移到固相支持物（一般是尼龍膜）上固定，是進行各種后續研究（如RFLP分析，陽性克隆的篩選驗證等所有涉及分子雜交的研究）的前提。實驗目的：掌握Southern blotting的原理及操作步驟。實驗原理：1. 轉膜的方式： 向上的毛細管轉移 向下的毛細管轉移 同時向
《基因組蛋白質組與生物信息學報》：蛋白質組學技術面臨
《基因組蛋白質組與生物信息學報》：蛋白質組學技術面臨挑戰 2003年4月人類基因組圖譜基本繪制完成，但對基因的調節與功能問題仍未能解讀。由于基因的功能主要是通過其編碼的蛋白質來實現，蛋白質才是生命活動真正的執行者，所以越來越多的科學家致力于蛋白質的研究，試圖找出人類疾病的致病機理，最終解決人類
免疫印跡與免疫檢測實驗——半干轉移系統轉印蛋白質
實驗材料蛋白質試劑、試劑盒轉移緩沖液儀器、耗材半干燥轉移裝置濾紙實驗步驟1. ?制備樣品，并在小型或標準尺寸的單向或雙向凝膠上分離蛋白質。?2. ?準備轉印膜3. ?拆卸凝膠夾層，除去積層膠。4. ?組裝轉印夾層：Mylar聚酯薄膜屏蔽物3張以轉移緩沖液飽和的濾紙已平衡的轉印膜凝膠3張以轉移緩沖液飽
分子生物學實驗基礎知識
分子生物學是在生物化學基礎上發展起來的，以研究核酸和蛋白質結構、功能等生命本質的學科，在核酸、蛋白質分子水平研究發病、診斷、治療和預后的機制。其中基因工程（基因技術，基因重組）是目前分子生物學研究熱點，這些技術可以改造或擴增基因和基因產物，使微量的研究對象達到分析水平，是研究基因調控和表達的方法，也
蛋白質組學不能被基因組和轉錄組取代
基因和蛋白并不存在嚴格的線性關系ORF并不預示一定存在相應的功能性基因mRNA水平并非與蛋白質的表達水平對應翻譯后修飾及同工蛋白質（isforms)等現象在基因水平無從表現
蛋白質組學之逆襲：深度注釋基因組（三）
人類尚未充分認識復雜的癌癥基因組是如何轉化為導致復發和死亡的驅動生物學的，將蛋白質組學與基因組學結合在一起能夠讓我們獲得對癌癥的新認識，同時提供一種有價值的資源以便科學界能夠用來提出關于這些疾病的新假設，以及治療它的手段。蛋白質基因組學終有一天會被證明是一種強大的臨床工具，使得人類能夠橫跨癌癥基因組
蛋白質組學之逆襲：深度注釋基因組（一）
申請課題缺創新點？撰寫論文沒思路？急著畢業時間緊？別怕，對于吉凱，一切都是套路！更有甚者，對于宇宙終極難題：“屌絲如何逆襲白富美？”老司機黃博也有一套經典案例分享給大家。從前，在生物學研究領域，有一個白富美叫基因組學（Genomics），她有一項強大的技能：DNA測序，憑借這項技能，她完成了對多種物
蛋白質組學之逆襲：深度注釋基因組（二）
針對一些乳腺癌亞型和攜帶常見突變如PIK3CA和TP53突變的腫瘤，分析結果揭示出了一些新的蛋白質標記物和信號通路。另外將一些基因中的拷貝數改變與蛋白質水平聯系一起，從而鑒別出了10個新的候選調控因子。其中兩個候選基因SKP1和 CETN3可能與癌基因EGFR有關聯。EGFR是一種特別具有侵
western－blot－試驗中蛋白轉膜總轉不上去
當然，首先要考慮的問題是你轉過頭了，蛋白質跑出去了。其次你的電流有點大，你也沒說轉了多久？用的干轉還是濕轉？是不是拿出來的時候很熱？這種情況有可能使蛋白質降解。我們一般是濕轉用100mA轉2小時， 干轉所需電流更小。
西紅柿基因轉殖
隨著生物科技的發展，利用遺傳工程，藉由 DNA 載體把外來基因導入植物體內，已經成功且高效率地育成傳統育種法無法獲得的作物新品種，改良作物承受逆境的能力，以減少損失或提高單位面積的產量，并減緩土地無限開發及農藥肥料的濫用，省工又省成本。在各種植物基因轉殖法中，比較常用的是基因槍轉植、農桿菌轉殖及電穿
轉決定的概念
一般胚胎細胞一旦決定, 沿著特定類型進行分化的方向是穩定的, 但在果蠅中發現了某種突變體或培養的成蟲盤細胞中有時會出現不按已決定的分化類型發育, 而生長出不是相應的成體結構, 這種現象叫轉決定。
Southern轉膜方法
Southern轉膜方法（毛細管虹吸印跡法、電轉移法與真空轉移法）將凝膠中的DNA進行堿變性并將pH值恢復至中性后，即可將凝膠中的DNA片段轉移到固相支持物上。用于轉膜的固相支持物有多種，包括硝酸纖維素濾膜(NCM)、尼龍膜、化學活性膜和濾紙等，Southern轉膜時可根據需要選擇不同的固相支持物用
Southern－轉印分析
在膠體中的DNA 可利用毛細現象的作用將DNA 牽引轉印至覆蓋在膠片上的濾膜，經烘烤或UV 照射后，可使DNA 固定在膜上，以進行探針的雜合（hybridization） 反應。儀器用具：玻璃缸；玻璃板或吸水海綿；Crosslinker （Stratalinker 1800, Stratagene）
轉肽酶是什么？
轉肽酶(transpeptidase)是一種酶，它參與蛋白質合成過程中的肽鏈轉移反應。在細菌細胞壁的合成過程中，轉肽酶起著至關重要的作用。 具體來說，轉肽酶能夠催化兩個多肽鏈之間的氨基酸殘基之間的化學反應，從而使它們通過肽鍵連接起來形成一個完整的蛋白質分子。在細菌細胞壁的合成過程中，轉肽酶負責
轉肽酶的介紹
轉肽酶（sortase）功能：在蛋白質生物合成過程中肽鍵的形成具有必須的作用。轉肽酶識別特異多肽,催化不同的轉肽反應。 在體內分布很廣，如腎、肝、胰等臟器均有些酶。但血清中GGT主要來自肝臟，具有較強的特異性。所以當肝膽系統病變的時候，GGT活性升高，臨床上測定此酶活性來協助診斷肝膽疾病。
Western轉膜步驟
下面的步驟適用于通過Xcell Ⅱ轉印系統進行蛋白印記的大部分應用。為達到最佳效果，用戶的優化是必要的。I. 所需材料：?Xcell SureLock?或Xcell Ⅱ? Mini-Cell以及Blot Module（Cat. Nos. EI10001, EI9001及EI9051）?電泳后的迷你膠
電泳、轉膜概述
轉膜是把DNA 從瓊脂糖凝膠中轉移到固相支持物（一般是尼龍膜）上固定，是進行各種后續研究（如 RFLP 分析，陽性克隆的篩選驗證等所有涉及分子雜交的研究）的前提。實驗目的：掌握 Southern blotting 的原理及操作步驟實驗原理：1．轉膜的方式：向上的毛細管轉移向下的毛細管轉移同時向兩張膜
轉氨基的作用
大多數氨基酸在進行分解代謝之初，首先通過轉氨基作用將α-氨基轉移給α-酮戊二酸，使其形成谷氨酸和相應的α-酮酸（α-ketoacid）。轉氨基作用是氨基酸在氨基轉移酶(aminotransferase）或稱轉氨酶(transaminase）催化下，可逆地把α-氨基酸的氨基轉移給α-酮戊二酸，使α-氨
大氣“推著”金星轉
金星的“超級旋轉”大氣層也許為其自轉“添了一把柴”。6月18日，《自然—地球科學》在線發表的一項研究報告稱，金星的自轉速度，會隨著其密集、快速流動的大氣與其表面山脈之間的相互作用而發生改變。 金星自轉緩慢，自轉1周需要大約243個地球日。然而，金星探測器的測量尚未就1個金星日的精確長度達成一致
“轉基因”食品標識不明顯－“轉”與“非轉”欲說還休
盡管部分市民對于“轉基因”一詞早有耳聞，但許多人對于食品中是否使用轉基因原料卻不甚清楚。轉基因食品離我們的生活到底多遠呢？昨日，記者走訪中心市區幾家大型商超發現，我們的身邊已有不少轉基因食品，如大豆油、豆奶、豆瓣醬、醬油……那么轉基因食品是否安全？又該如何辨別呢？有市民呼吁，應強制標明是否為轉基
蛋白質N端選擇性仿生轉氨化合成抗HIV藥物取得進展
蛋白質的定點修飾是通過化學反應對蛋白質特定位點進行修飾，從而達到對蛋白質改性或對其進行標記等一系列目的。蛋白質的定點修飾對反應條件嚴格：反應需在水相溶液中進行，同時蛋白質其它側鏈基團不參與反應。近日，上海交通大學特別研究員王平課題組與中國科學院昆明動物研究所研究員鄭永唐課題組合作，發展了一種由仿