基因編輯工具的開發
基因編輯已經被越來越廣泛的用于生物學的研究和應用當中,例如合成生物學,基因治療,藥物靶點發現,mRNA剪接,蛋白定向進化等等。我們在使用各種各樣的基因編輯工具時,不禁感嘆這些工具是多么的精巧絕倫。但科研人員發現基因編輯工具,改進這些工具的功能、效率并非易事。高效、精準、便捷的基因編輯工具,一直是人們夢寐以求的科研神器。我們熟知的CRISPR系統,最常聽到、見到的是Cas9蛋白,但Cas蛋白并不是只有Cas9,下圖中為Cas蛋白的分類。Cas蛋白功能分類圖[1]在如此多的Cas蛋白中,發現如Cas9、Cas12a、Cas13a等可以作為基因編輯工具的,可謂鳳毛麟角,少之又少。從1987年報道CRISPR重復序列,到2002年發現Cas4基因具有核酸外切酶功能,直到2012年發現Cas9可以通過RNA介導控制基因組編輯,歷經20余年。在CRISPR風靡全球后,對于該系統的開發并未停止,技術大牛們又開發出: 基于......閱讀全文
基因編輯工具的開發
基因編輯已經被越來越廣泛的用于生物學的研究和應用當中,例如合成生物學,基因治療,藥物靶點發現,mRNA剪接,蛋白定向進化等等。我們在使用各種各樣的基因編輯工具時,不禁感嘆這些工具是多么的精巧絕倫。但科研人員發現基因編輯工具,改進這些工具的功能、效率并非易事。高效、精準、便捷的基因編輯工具,一直是人們
科學家開發高活性迷你基因編輯工具
華東師范大學生命科學學院研究員李大力團隊,開發了一種全新的高活性迷你基因編輯工具,可在小鼠體內實現高效編輯,豐富了基因編輯工具的應用場景,為將來用于體內基因治療提供了高效的候選技術。相關研究發表于《分子細胞》,并被選為封面文章。以CRISPR/Cas9為代表的基因編輯技術,為基礎生物學和疾病治療帶來
AI指導空間結構優化-開發小型基因編輯工具
近日,南方醫科大學基礎醫學院教授榮知立團隊通過空間結構優化和AI結構預測,顯著提升了小型CRISPR-Cas12f系統的基因編輯效率,為精準高效的基因治療提供了新的技術手段。相關成果發表于《自然-通訊》(Nature Communications)。CRISPR-Cas系統作為一種基因編輯工具,因其
香港大學開發全球首個篩選精確基因編輯工具平臺
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503146.shtm
新基因編輯工具SeekRNA面世
“基因剪刀”CRISPR技術已徹底改變了醫學、農業和生物技術領域的面貌。如今,澳大利亞悉尼大學生命與環境科學學院團隊成功開發出一種比CRISPR更準確、更靈活的基因編輯工具SeekRNA。該工具利用可編程RNA鏈,能直接識別基因序列中的插入位點,從而簡化編輯過程并減少錯誤。相關論文發表于新一期《自然
新基因編輯工具SeekRNA面世
科技日報北京6月23日電?(記者劉霞)“基因剪刀”CRISPR技術已徹底改變了醫學、農業和生物技術領域的面貌。如今,澳大利亞悉尼大學生命與環境科學學院團隊成功開發出一種比CRISPR更準確、更靈活的基因編輯工具SeekRNA。該工具利用可編程RNA鏈,能直接識別基因序列中的插入位點,從而簡化編輯過程
DNA堿基編輯:基因編輯工具“升級版”
美國哈佛大學14日宣布,將授予光束療法(Beam Therapeutics,下稱BT)公司全球ZL許可,對可用于治療人類疾病的一套革命性DNA堿基編輯技術進行開發和商業化。 BT公司同日宣布,已經籌集了高達8700萬美元由F-Prime資本和ARCH風投牽頭的A輪融資。BT公司由基因編輯技
DNA堿基編輯:基因編輯工具“升級版”
美國哈佛大學14日宣布,將授予光束療法(Beam Therapeutics,下稱BT)公司全球ZL許可,對可用于治療人類疾病的一套革命性DNA堿基編輯技術進行開發和商業化。 BT公司同日宣布,已經籌集了高達8700萬美元由F-Prime資本和ARCH風投牽頭的A輪融資。BT公司由基因編輯技術領
湯瑋欣/可愛龍團隊開發基于IscB的微型基因編輯工具
近年來,劉如謙團隊等在CRISPR-Cas系統的基礎上,開發了新一代基因編輯系統——堿基編輯(BE)、先導編輯(PE)。其中,堿基編輯能夠在基因組靶位點有效地轉換單個堿基,而不會引起DNA雙鏈斷裂。目前,研究人員已經開發了CBE、ABE、CGBE、AYBE等多種堿基編輯器。 IscB被認為是C
我國科學家開發更高精度的單堿基基因編輯工具
單堿基編輯技術是一種是自2012年CRISPR/Cas9技術被發現以來最寄予厚望的高精度基因編輯技術,其中一種單堿基編輯技術BE3可以在不切斷DNA雙鏈的情況下精確地引入由C/G到T/A的點突變,另外一項單堿基編輯技術ABE7.10可以由T/A突變成C/G的技術,對于基因突變導致的遺傳疾病的治療
科學家開發出簡便高效的多基因編輯工具包
近日,中科院植物研究所研究員劉春明團隊與合作者開發出一個簡便高效的多基因編輯工具包Customized Assembly and Simplified Editing(CASE),極大地簡化了基因編輯載體構建過程,方便了后期篩選不攜帶CRISPR構建的多基因編輯植物。相關研究成果發表于《植物生理
科學家開發能鎖定小型癌癥相關突變的新型基因編輯工具
構成促癌基因的代碼中只要改變一個字母就會明顯影響腫瘤的侵襲性或癌癥患者對特定療法的反應,近日,一篇發表在國際雜志Nature Biotechnology上題為“Generation of precision preclinical cancer models using regulated in
改良CRISPR工具-產前編輯致病基因
科學家們首次在實驗動物體內進行產前基因編輯試圖阻止致命的代謝紊亂疾病,為出生前治療人類先天性疾病提供了可能。費城兒童醫院(CHOP)和賓夕法尼亞大學醫學院的研究發表在今天出版的《Nature Medicine》上,證明了產前基因編輯的低毒性。 使用CRISPR-Cas9和堿基編輯器3(BE3)
中山大學等開發RNA編輯新工具
CRISPR-Cas9系統使用一段引導RNA(其與Cas9蛋白結合起來才能發揮作用)來靶定一段DNA,并裂解雙鏈DNA。這一現象提出了一個問題:由一個Dicer結合RNA元件和一段反義RNA組成的一種人造小RNA(asRNA,是否也能用來誘導Dicer處理和降解一段特定的RNA呢? 為此,5月
人工智能設計的基因編輯工具來了
在不斷探索以前未知的CRISPR基因編輯系統的過程中,研究人員從溫泉、泥炭沼澤、糞便甚至酸奶中搜尋各種微生物。現在,由于生成式人工智能的進步,他們可能只需按一下按鈕就可以設計出這些系統。據《自然》報道,日前,研究人員公布了他們如何使用一種名為蛋白質語言模型的生成式人工智能工具設計CRISPR基因編輯
設計基因編輯工具的AI大模型問世
記者27日從中國農業科學院獲悉,該院農業基因組研究所農業基因編輯技術研發與應用創新團隊構建了全球規模最大的實驗驗證數據集,并基于此開發出人工智能(AI)大模型AlphaCD。該模型不僅能高效預測超過2萬余種胞嘧啶脫氨酶的酶活特征,還能設計出新型高性能堿基編輯工具。相關成果日前發表于國際期刊《細胞
Science解析熱點基因組編輯工具
近來,Cas9酶作為一種有力的新基因組編輯工具,引起了人們極大的研究熱情。現在加州大學伯克利分校的研究人員,首次成像了這種酶的精細三維結構,這一成果無疑會進一步提高Cas9的應用價值。文章于二月六日發表在Science雜志上。 加州大學的生化學家Jennifer Doudna和生物物理學家
單堿基基因編輯技術之工具篇
今年5月,David R. Liu教授與張鋒教授等人聯合創立Beam Therapeutics公司,再一次將“單堿基編輯技術”送上了熱搜榜,趁著熱度還未散去,我們繼上一期“單堿基編輯技術淺談”后,又為大家準備了一篇超級實用性的深度分析,帶你一起看看單堿基編輯的前世今生及如何一步步發展壯大的歷程!
單堿基基因編輯技術之工具篇
前言 今年5月,David R. Liu教授與張鋒教授等人聯合創立Beam Therapeutics公司,再一次將“單堿基編輯技術”送上了熱搜榜,趁著熱度還未散去,我們繼上一期“單堿基編輯技術淺談”后,又為大家準備了一篇超級實用性的深度分析,帶你一起看看單堿基編輯的前世今生及如何一步步發展
單堿基基因編輯技術之工具篇
前言今年5月,David R. Liu教授與張鋒教授等人聯合創立Beam Therapeutics公司,再一次將“單堿基編輯技術”送上了熱搜榜,趁著熱度還未散去,我們繼上一期“單堿基編輯技術淺談”后,又為大家準備了一篇超級實用性的深度分析,帶你一起看看單堿基編輯的前世今生及如何一步步發展壯大的歷程!
我國科研團隊研發新型通用基因編輯工具
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/497104.shtm 3月26日,記者從武漢科技大學獲悉,該校姚凱團隊設計出新型通用基因編輯工具,并首次應用于失明小鼠的治療,讓小鼠重見光明。相關科研成果日前在《實驗醫學雜志》上發表。 許多先天性
基因編輯工具CRISPR“動物園”歡迎你
Timothy Doran的11歲女兒對雞蛋過敏。全球約有2%的兒童患有這種病癥。像他們一樣,Doran的女兒無法接受很多常規疫苗接種,因為它們是利用雞蛋生產出來的。 身為澳大利亞聯邦科學和產業研究組織(CSIRO)分子生物學家的Doran覺得,他能通過強大的基因編輯工具CRISPR-Cas9
AI輔助創新蛋白聚類方法開發新型堿基編輯工具
中國科學院遺傳與發育生物學研究所高彩霞研究組開創性地運用AI輔助結構預測,建立起基于三級結構的蛋白聚類方法,并擴展為全新的脫氨酶挖掘體系,開發了一系列具有中國自主知識產權的新型堿基編輯工具。該工作為蛋白功能分析、新功能元件挖掘提供了全新策略。新研發的堿基編輯系統具有我國自主知識產權的精準基因編輯
基因編輯工具CRISPR的十大神奇用途
僅在過去一年里,幾十位世界各地的研究人員就發布科學論文詳細闡述自己的研究結果,他們利用CRISPR剪斷和取代不需要的DNA來開發治療癌癥、HIV、失明、慢性疼痛、肌肉萎縮癥和亨廷頓癥等疾病的療法。加州Caribou Biosciences公司(專為醫療、農業以及生物研究領域開發基于CRISPR解
學者開發出基因結構注釋“拋光”工具
華南農業大學園藝學院教授夏瑞團隊在國家自然科學基金等項目的資助下,開發了一種基于基因共線性進行物種基因組基因結構注釋矯正的工具——SynGAP(Synteny-based Gene structure Annotation Polisher)。相關成果近日在線發表于《基因組生物學》(Genome
學者開發出基因結構注釋“拋光”工具
華南農業大學園藝學院教授夏瑞團隊在國家自然科學基金等項目的資助下,開發了一種基于基因共線性進行物種基因組基因結構注釋矯正的工具——SynGAP(Synteny-based Gene structure Annotation Polisher)。相關成果近日在線發表于《基因組生物學》(Genome B
基因編輯工具SpCas9變體作用機制揭示
記者從哈爾濱工業大學獲悉,該校生命學院教授黃志偉課題組完成的一項課題《高保真SpCas9變體的結構基礎》,日前發表在最新一期國際期刊《細胞研究》上。該成果不僅首次揭示了高保真的Cas9基因編輯系統的分子機制,而且為改造SpCas9以及其他Cas核酸內切酶,使之成為更高效、更特異的基因編輯工具夯實
基因編輯工具CRISPRCas9遭遇新挫折!
在一項新的研究中,來自德國明斯特大學的研究人員發現,在小鼠進行常規的CRISPR-Cas9基因插入過程中,不必要的DNA重復頻率很高。相關研究結果發表在2020年2月21日的Science Advances期刊上,論文標題為“Pervasive head-to-tail insertions o
高彩霞團隊開發出不依賴CRISPR的全新堿基編輯工具
基因組編輯可以對生物體遺傳信息進行精準、高效的修飾,已成為生命科學領域的一項顛覆性技術。通過融合nCas9(切口酶形式的Cas9)與脫氨酶,美國哈佛大學David Liu團隊先后開發出胞嘧啶堿基編輯系統(Cytosine base editor,CBE)和腺嘌呤堿基編輯系統(Adenine ba
科學家開發出基因編輯新工具對DNA和RNA進行有針對性改變
科學家開發出基因編輯新工具。 如今,基因編輯的工具箱又增添了兩樣新工具。兩個美國研究小組宣布的新技術使研究人員能夠對脫氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)進行有針對性的改變。 在一項研究中,在10月25日出版的美國《科學》雜志上,美國布羅德研究所張鋒團隊報告說,他們在CRISPR工具基礎上開