轉錄組學新技術揭露細胞何時崩潰
買房關鍵看位置，細胞在人體內也有類似的生存法則。3月，來自美國得克薩斯大學的癌癥研究者在一場報告會上介紹了團隊新成果：在腫瘤細胞周圍，那些表面看似無恙的細胞，內部已有變化——它們比正常組織表現的更像腫瘤，且更易擴散。 據《科學》報道，這項成果的關鍵是空間轉錄組學技術，該技術能幫助研究者定位細胞內部基因、測量基因活性水平。迄今為止，已有人利用該技術研究阿茨海默癥、跟蹤免疫細胞動態以及人腦發育，甚至有人據此研究新冠肺炎患者的肺部組織。 過去數年間，轉錄組學技術迅速發展。起初研究者只能在完整組織中追蹤幾個選定基因，觀察其活性，但到2010年，研究者的追蹤范圍已經擴大到信使RNA，盡管有關數據只能代表數百萬個細胞內基因的平均活性。 利用空間轉錄組技術，生物學家已能追蹤單個細胞的所有基因，并意識到不同種類的細胞內部，其基因活性也存在巨大差異。這種差異在同種細胞內也可以觀測到。 有研究者利用該技術對比了新冠病毒感染者和健康成年人......閱讀全文
日找到控制細胞分化轉錄因子
日本理化研究所4月20日發表新聞公報說，該所研究人員與文部科學省項目小組通過大規模數據分析，找到一群控制細胞分化狀態的轉錄因子，并解開了其中的具體機制。 公報說，研究人員以白血病患者的人體免疫細胞株THP—1為研究對象，借助先進的基因測序技術，按細胞分化過程中不同時間段收集它們從原單核細胞
原核細胞的RNA轉錄過程
原核細胞的RNA轉錄：原核細胞的RNA聚合酶全酶(a2Bβ'σ)是由4條多肽鏈組成的核心酶加σ因子構成轉錄過程可劃分為開始、延伸和終止三個階段。①開始：σ因子識別DNA分子上的啟動子并與之結合，將DNA雙鏈局部解開，RNA合成開始，σ因子與核心酶分離。②延伸：RNA聚合酶沿模板鏈向前移動，使
玉米單細胞轉錄組測序，11種細胞類型
近日，廣東省科學院南繁種業研究所生物育種研究室在玉米單細胞轉錄組測序研究方面取得新進展。相關研究在線發表于《作物學報》（The Crop Journal）。廣東省科學院南繁種業研究所李旭輝博士為該論文第一作者，齊永文研究員為通訊作者。玉米是全球重要的糧食和能源作物，而其產量形成的基礎依賴其特殊的根系
單細胞轉錄組高級分析之細胞譜系分析
基于單細胞轉錄組數據的細胞軌跡分析常見形式有細胞變化軌跡分析和細胞譜系分析，在上一篇中，我們詳細介紹了常規擬時間序列分析的相關內容（具體內容查看鏈接）。在這里，我們主要就細胞譜系分析進行介紹和解讀。細胞譜系分析，最簡明的理解就是細胞領域的進化樹，通常指的是某類祖源細胞，在特定條件下，有多個發育軌跡和
空間轉錄組和單細胞轉錄組測序聯合應用的典型案例
單細胞轉錄組測序技術的如火如荼，伴隨著空間轉錄組測序技術的蓬勃發展，可以看到，在現有的高通量檢測技術領域，這兩種技術已為科學研究的發展提供了前所未有的技術支撐。從2019年單細胞多組學被評為《Nature Methods》年度技術進展，到2020年空間轉錄組技術也被評為年度技術進展，相信在接
T細胞基因的轉錄激活及其表達
? TCR/CD3復合物與配體結合后，經多種信號轉導途徑傳遞信號，最終導致T細胞活化和增殖。信號轉導中所涉及的基因根據其活化時間可以分為早早期、早期、晚期基因三種類型（表8-5)。早早期基因的轉錄不需蛋白的合成，而早期及晚期基因的轉錄則需蛋白的合成。早早期及早期基因轉錄在有絲分裂期之前，而晚期基因轉
角朊細胞的其他轉錄因子介紹
K17基因的上游啟動子中有γ干擾素激活的STAT因子的結合位點，被稱為γ干擾素活化序列（GAS），在皮膚發生遲發型接觸性過敏時，STAT-91可轉位至角朊細胞核內與啟動子中的GAS元件結合而激活K17的表達[8]。兔K3基因的5’上游序列中則有NFκB的結合位點（5’GGGCTTTCC-3’），
單細胞轉錄組制備儀的功能
fluidigm C1 單細胞自動制備儀用于 mRNA 測序 更完整的流程 ?-首尾相連的流程對單細胞進行全轉錄組分析 最高的通量 ?-每次運行可前所未有的平行處理 96 個單細胞 更容易的操作 ?-直接從單細胞開始，簡化的樣本制備，只需 3 小時手工操作時間，沒有 片段化和純化步驟 更節省的成
人類腦細胞的單細胞轉錄組測序研究成果
人腦是由多種不同類別細胞組成的極其復雜的器官。傳統的細胞分類方法只能根據少數已知的細胞的標記分子（marker）對細胞進行分類，對每一類細胞的認識也非常有限。斯坦福大學的著名學者Stephen Quake及其團隊利用單細胞測序技術，對466個人大腦皮層的單細胞進行了轉錄組測序，通過數據分析發
逆轉錄發生在細胞核還是細胞質
逆轉錄既不發生在細胞核也不發生在細胞質……它是一些RNA病毒繁殖的必要途徑。事實上，逆轉錄是發生在被侵蝕細胞的細胞質基質里噠喵
Nature：T細胞功能調控的關鍵轉錄因子
T細胞是適應性免疫系統的主要組成部分, 它們在病菌感染中被功能活化, 參與宿主防御, 但是遇到自身抗原或者在慢性感染和腫瘤微環境中, 它們會發生命運改變, 進入功能失能命運, 但是調控T細胞功能失能的分子機制會不清楚。 來自清華大學醫學院，陸軍軍醫大學全軍臨床病理學研究所的研究人員發表了題為“
轉錄組學新技術揭露細胞何時崩潰
買房關鍵看位置，細胞在人體內也有類似的生存法則。3月，來自美國得克薩斯大學的癌癥研究者在一場報告會上介紹了團隊新成果：在腫瘤細胞周圍，那些表面看似無恙的細胞，內部已有變化——它們比正常組織表現的更像腫瘤，且更易擴散。 據《科學》報道，這項成果的關鍵是空間轉錄組學技術，該技術能幫助研究者定位細胞
PNAS突破：單個細胞核轉錄組測序
研究人員成功地從單個腦細胞細胞核中分離出全部的信使RNA并對其進行了測序。這項發表在《美國科學院院刊》(PNAS)上的新研究，將幫助研究人員更好地了解一些器官在健康和疾病狀態下的功能機制，為開發出個體化治療提供了又一塊跳板。 動物和植物中的大多數細胞都包含有一個細胞核，里面儲存著細胞的DN
單細胞轉錄組重要研究文獻匯總（一）
1.單細胞測序用于生殖領域研究持續火熱精子生成過程是一個復雜又具有嚴格分化過程的生理過程，繼18年10月份《Cell Research》上的成年人睪丸轉錄組圖譜研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生與成年人睪丸細胞單細胞水平鑒定分類[2]的步伐，本月在《Nature
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
家蠶絲腺單細胞轉錄組圖譜繪成
中新網重慶6月15日電 (記者 鐘旖)記者15日從家蠶基因組生物學國家重點實驗室(西南大學)獲悉，我國家蠶研究又有新進展。該實驗室徐漢福教授課題組近日在國際知名期刊Nature Communications《自然通訊》上發表相關主題研究論文，以單細胞分辨率揭示了家蠶絲腺的全細胞異質性及其基因轉
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞轉錄組重要研究文獻匯總（二）
4.單細胞轉錄組測序在植物領域嶄露頭角相比動物的單細胞研究，由于植物具有細胞壁的特點，使得植物的單細胞研究相比較難，但是繼2月份的擬南芥根組織單細胞轉錄組學研究[8]，本月在《Developmental Cell》上又發表了一篇基于擬南芥根組織的單細胞轉錄組學研究報道[9]。來自德國圖賓根大學植
3月單細胞轉錄組重要研究文獻匯總
1.單細胞測序用于生殖領域研究持續火熱 精子生成過程是一個復雜又具有嚴格分化過程的生理過程，繼18年10月份《Cell Research》上的成年人睪丸轉錄組圖譜研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生與成年人睪丸細胞單細胞水平鑒定分類[2]的步伐，本月在《Nature
Science：構建出真渦蟲細胞類型轉錄組圖譜
真渦蟲是一類相對簡單的動物，具有不同尋常的生物學特征：成年真渦蟲維持著其他有機體僅在胚胎中短暫存在的發育信息和祖細胞（progenitor cell）。真渦蟲獲得人們的大量研究，部分原因在于它們具有再生丟失的或受損的身體部位的獨特能力。圖片來自Christopher Fincher/Whiteh
反轉錄病毒產毒細胞系建立實驗
建立一個能產生高水平的反轉錄病毒構建體的細胞系是一個長期的過程。首先，必須將反轉錄病毒構建體穩定地導入一種適當的包裝細胞系中。當產生了穩定的細胞系后，必須對之進行鑒定，從中選出能產生具有正確結構的高滴度的病毒的細胞系。實驗材料包裝細胞系試劑、試劑盒HEPESCaCl2甘油DMSO儀器、耗材培養皿培養
3月單細胞轉錄組重要研究文獻匯總
1.單細胞測序用于生殖領域研究持續火熱 精子生成過程是一個復雜又具有嚴格分化過程的生理過程，繼18年10月份《Cell Research》上的成年人睪丸轉錄組圖譜研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生與成年人睪丸細胞單細胞水平鑒定分類[2]的步伐，本月在《Nature
高通量單細胞轉錄組測序發展與展望
單細胞轉錄組測序技術這幾年的發展之快，運用之廣已眾所周知。為更好的在國內推廣該技術，也為更好的將該技術運用到廣大科研工作者的實際工作中，上海生物芯片有限公司生物信息團隊通過對該技術的整理和歸納，在《生命科學》雜志上發表了名為“高通量單細胞轉錄組測序發展與展望”綜述文章，希望能進一步提升科研工作者對該
單細胞轉錄組制備儀的技術指標
將 C1 應用于單細胞 mRNA 測序，可以從多個細胞個 體平行處理多達 96 個 cDNA 文庫，在任何 Illumina 測序儀上對 mRNA表達進行相對定量。此系統的主要特征包括： 高通量 ?-可對 96 個單細胞進行大規模平行、連貫的制備， 引入條形碼序列標記（Barcode），可將測序
科學家成功實現活細胞轉錄組測序
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/8/484542.shtm 活細胞測序記錄細胞的變化示意圖? 來源：Duygu Koldere Vilain 在我們呱呱墜地之前，受精卵是如何發育成復雜個體的？為何正常的細胞會慢慢變成癌細胞？ 細胞
反轉錄病毒產毒細胞系建立實驗
反轉錄病毒載體導入包裝細胞系 測定病毒滴度 培養細胞的Xgal染色 ? ? ? ? ? ? 實驗材料 包裝細胞系
反轉錄病毒產毒細胞系建立實驗
實驗材料 包裝細胞系試劑、試劑盒 HEPESCaCl2甘油DMSO儀器、耗材 培養皿培養板離心機實驗步驟 1. ?在轉染前1天，在10 cm 培養皿中接種包裝細胞，接種密度大約相當于10%~20%片的細胞數。2. ?將10 μg 含有藥物抗性基因的反轉錄病毒質粒DNA加入0.5 ml HeBS。再加
關于基因轉錄的轉錄因子介紹
轉錄因子(transcription factor)是起調控作用的反式作用因子。轉錄因子是轉錄起始過程中RNA聚合酶所需的輔助因子。真核生物基因在無轉錄因子時處于不表達狀態，RNA聚合酶自身無法啟動基因轉錄，只有當轉錄因子(蛋白質)結合在其識別的DNA序列上后，基因才開始表達。轉錄因子的結合位點