中國科學家NatureGenetics發布西瓜基因組草圖
來自北京農林科學院、康奈爾大學、深圳華大基因研究院、復旦大學等10多家機構的研究人員組成的一個國際研究小組成功破譯了西瓜的遺傳密碼，繪制出世界上第一張西瓜(watermelon)基因組序列草圖。相關論文發表在11月25日的《自然遺傳學》(Nature Genetics)雜志上 北京農林科學院蔬菜研究中心主任許勇(Yong Xu )、北京農林科學院院長李云伏(Yunfu Li)、美國康奈爾大學費章君(Zhangjun Fei )博士以及華大基因研究院的王俊(Wang Jun)博士共同領導了這一研究。 西瓜一種雙子葉開花植物,屬葫蘆科，原產于非洲。被稱為“瓜中之王”，味道甘味多汁，清爽解渴，含有豐富的礦物鹽、脂肪、膽固醇、以及大量葡萄糖、蘋果酸、果糖、蛋白氨基酸、番茄素及豐富的維生素C等物質，是一種富有營養、純凈、食用安全的食品。西瓜全球年產量大約為9000萬噸，為全球第五大水果消費品，同時也是中國重要的經濟......閱讀全文
染色體的結構序列
染色體要確保在細胞世代中保持穩定，必須具有自主復制、保證復制的完整性、遺傳物質能夠平均分配的能力，與這些能力相關的結構序列是： 自主復制 20世紀70年代末首次在酵母菌中發現。自主復制DNA序列具有一個復制起始點，能確保染色體在細胞周期中能夠自我復制，從而保證染色體在世代傳遞中具有穩定性和連
研究人員從從基因組水平揭示食肉目染色體進化規律
染色體進化是物種形成和演化的重要驅動因素。具有顯著核型差異的食肉目動物為染色體進化研究提供了很好的研究素材。雖然前人通過比較染色體涂色法建立了食肉目內許多物種的染色體比較圖譜，但這些研究的分辨率比較低，尚沒有深入到精細的核苷酸水平，也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物種間的共線性區塊、染色體重排以
基因組序列草圖的概念
中文名稱基因組序列草圖英文名稱draft genome sequence定 義已測定序列占到90%以上、測序精度在1%的基因組序列圖。應用學科遺傳學（一級學科），基因組學（二級學科）
解析現代月季基因組序列
科學家研究現代月季基因。圖片來源：monticelloshop.org 近日，法國農業科學研究院、里昂大學、法國國家科學研究中心的研究人員解密了現代月季的基因組序列。現代月季擁有獨特的顏色與香味，廣受稱贊，這項研究幫助人們從分子角度了解這背后的基因和代謝流程。4月30日，相關論文在線刊登于《自然
概述釀酒酵母的基因組序列
1996年6月，在國際互聯網的公共數據庫中公布了釀酒酵母的完整基因組順序，它被稱為遺傳學上的里程碑。因為首先，這是人們第一次獲得真核生物基因組的完整核苷酸序列；其次，這是人們第一次獲得一種易于操作的實驗生物系統的完整基因組。 [10] 在釀酒酵母測序計劃開始之前，人們通過傳統的遺傳學方法已確定
首次測定玉米蛇基因組序列
在現有的5000種哺乳動物中，有超過100種已經進行了基因組測序，但是，只有9種爬行動物（在10000個物種當中）的基因組對科學界來說是可用的。最近，瑞士日內瓦大學（UNIGE）的一個研究小組，構建了一個大的數據庫，其中就包括一種爬行動物——玉米蛇的新基因組測序，這種蛇越來越多地被用來了解爬行動
新軟件按需組裝無縫基因組序列
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494014.shtm 科技日報北京2月16日電?（記者張夢然）美國國立衛生研究院研究人員發布了一種創新的軟件工具，用于組裝來自各種物種的真正完整（即無縫）的基因組序列。這種名為Verkko的軟件在芬蘭
馬鈴薯基因組序列框架圖全球發布
中國科學家的創新性思路助推測序工作提前完成 9月23日，由14國科學家組成的“國際馬鈴薯基因組測序協作組”分別在北京、阿姆斯特丹、倫敦、紐約、利馬等地同時宣布了馬鈴薯基因組序列框架圖的完成。此次公布的馬鈴薯基因“藍圖”繪制工作的中國參與單位主要來自中國農業科學院蔬菜花卉所和深圳華大基因研究院。
胡蘿卜基因組序列草圖成功繪出
來自美國的一個研究小組稱，他們完成了對30余種胡蘿卜樣品的測序，繪制出了胡蘿卜基因組序列草圖。這很可能是迄今最完整的蔬菜基因組序列草圖。研究人員稱，這一研究闡明了胡蘿卜的起源和演化過程，對改善胡蘿卜和其他農作物的營養價值提供了可能。相關論文在線發表在《自然·遺傳學》雜志網站上。 胡蘿卜和生菜
白菜甘藍油菜全基因組序列測定
? 由中國科學家領銜的白菜、甘藍和油菜全基因組測序項目取得階段性重大成果,獲得了白菜全基因組的精細圖,甘藍和油菜全基因組的框架圖。 研究表明，白菜、甘藍和油菜的基因組大小分別約為5億、6.5億和11億個堿基對,白菜和甘藍含有的基因總數目分別約4.2萬和4.5萬個,油菜基因覆蓋度85%以上。該
－震驚！Genbank參考基因組序列多處錯誤！
?震驚！Genbank參考基因組序列多處錯誤！ 隨著基因組測序技術的飛速發展以及測序成本的快速降低，全基因組數據也在急速增加。盡管參考基因組數據是非常有價值的資源，但是由于測序過程中的外源污染或者研究者對數據組裝方法的誤用，使得基因組數據面臨很多問題。 近日，約翰霍
非人靈長類動物完整染色體序列首次發布
科技日報北京5月29日電?（記者張佳欣）由美國賓夕法尼亞州立大學和美國國家人類基因組研究所領導的國際合作小組首次生成了非人靈長類動物的完整染色體序列，相關論文發表在29日的《自然》雜志上。這些序列揭示了不同物種Y染色體之間的顯著差異，顯示出它們快速進化的歷史，還揭示了以前未被研究過的類人猿基因組區域
非人靈長類動物完整染色體序列首次發布
由美國賓夕法尼亞州立大學和美國國家人類基因組研究所領導的國際合作小組首次生成了非人靈長類動物的完整染色體序列，相關論文發表在29日的《自然》雜志上。這些序列揭示了不同物種Y染色體之間的顯著差異，顯示出它們快速進化的歷史，還揭示了以前未被研究過的類人猿基因組區域，為物種多樣性和進化提供了重要見解。
中國科學家NatureGenetics發布西瓜基因組草圖
來自北京農林科學院、康奈爾大學、深圳華大基因研究院、復旦大學等10多家機構的研究人員組成的一個國際研究小組成功破譯了西瓜的遺傳密碼，繪制出世界上第一張西瓜(watermelon)基因組序列草圖。相關論文發表在11月25日的《自然遺傳學》(Nature Genetics)雜志上 北京農林
哺乳動物“共同祖先”基因組重建完成
從鴨嘴獸到藍鯨，每一種現代哺乳動物都是生活在大約1.8億年前的“共同祖先”的后裔。人們對“共同祖先”知之甚少，現在，一個國際研究小組通過計算重建了其基因組。該成果將發表在《美國國家科學院院刊》上，對理解哺乳動物的進化和保護工作具有重要意義。 研究人員利用了來自32個活物種的高質量基因組序列，這
PacBio構建目前最高質量的植物基因組參考序列
來自中科院遺傳與發育生物學研究所，四川農業大學的研究人員發表了題為“Sequencing and de novo assembly of a near complete indica rice genome”的文章，對一個秈稻基因組蜀恢498（R498）進行PacBio單分子測序，結合遺傳圖譜和
中國新型冠狀病毒的基因組序列
《自然》雜志2月3日發表了新型冠狀病毒的基因組序列（論文：A new coronavirus associated with human respiratory disease in China），病毒樣本系從一名曾在最先爆發疫情的海鮮市場工作過的患者體內分離得到。基因組分析顯示，該病毒與此前在
牡蠣全基因組序列圖譜繪制完成
牡蠣基因組部分序列及其分析牡蠣基因組計劃（OGP）團隊成員在深圳華大基因研究院討論項目中國科學院海洋研究所和深圳華大基因研究院簽約儀式牡蠣是產量最大的海水養殖動物 牡蠣養殖 近日，牡蠣基因組計劃（Oyster Genome Project，OGP）項目組宣布，
四篇Science文章公布最新基因組序列
小麥是全球最重要的糧食作物之一，提供了20%人類所需的熱量。2010年英國科學家宣布他們繪制出了小麥基因組草圖，但這一序列并不完整。在7月17日Science雜志上，兩個研究組分別公布了Chinese Spring小麥品種的每個染色體臂的基因組序列，以及小麥染色體3B基因組序列，另外兩個研究小組
《Genome－Research》：根據基因組序列預測MRSA毒性
微生物毒力一直是一個復雜的多因素表型，與病原體的進化軌跡有著復雜的關聯。毒性，破壞宿主細胞膜和粘附的能力，粘附到人體組織的能力，是許多細菌病原體的主要毒力因子，包括金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)。 金黃色葡萄球菌是臨床上常見的毒性較強的細菌，自從上世紀40
草魚全基因組序列圖譜繪制完成
近日，記者從中國科學院水生生物研究所獲悉，該所魚類功能基因組學學科組負責的草魚全基因組序列圖譜繪制完成。該成果由水生生物研究所、中國科學院國家基因研究中心和中山大學等機構合作完成，相關研究成果于5月4日在線發表于《自然—遺傳學》雜志。 據該所研究員汪亞平介紹，該研究采用鳥槍法測序策略，分別對一
史上最全小麥基因組序列圖集問世
??據最新一期《自然》雜志報道，加拿大薩斯喀徹溫大學領導的國際團隊在一項對全球小麥生產具有里程碑意義的研究——10+基因組計劃中，對代表全球育種計劃的15個小麥品種的基因組進行了測序。這將使科學家和育種人員能夠更快地識別出具有影響力的基因，從而提高小麥產量、害蟲抗性和其他重要的農作物性狀。 小麥
研究人員繪出蘋果基因組草圖
一個國際科研小組8月29日在英國《自然—遺傳學》（Nature Genetics）雜志上報告說，他們繪出了蘋果的基因組草圖，這將有助于從基因水平上分析蘋果性狀，培育更多蘋果新品種。 意大利、美國、新西蘭等國研究人員報告說，他們繪出的是廣受人們喜愛的“金冠蘋果”的基因組草圖。結果
破譯農業害蟲粘蟲染色體級基因組密碼：為害蟲防治策略升級提供關鍵助力
研究背景在廣袤的農田里，有一種害蟲正悄無聲息地威脅著農作物的生長，它就是粘蟲（Mythimna separata）。粘蟲堪稱農業界的 “破壞大王”，憑借著強大的遷飛能力和不挑食的習性，所到之處，水稻、玉米、小麥等眾多農作物都難逃厄運。在亞洲和澳大利亞的大片農田中，常常能看到它肆虐的身影，給農業生產帶
象腿蕉染色體級別基因組組裝研究獲進展
中國科學院華南植物園海外知名學者John Seymour Heslop Harrison教授領導的研究團隊，在象腿蕉染色體級別基因組組裝研究方面取得新進展。相關研究發表于Gigascience。王梓維為該文第一作者，John Seymour Heslop Harrison和劉青副研究員為通訊作者，華
解析四倍體攸茶（Camellia－meiocarpa－Hu）單倍型基因組
在植物的奇妙世界里，油茶作為重要的木本食用油料植物，有著超 2300 年的栽培歷史，其用途廣泛，在全球糧食危機的大背景下愈發受到關注。攸茶（Camellia meiocarpa?Hu）是其中一員，它葉茂花大果豐，極具農業利用潛力。然而，四倍體攸茶的染色體水平基因組數據匱乏，且多倍體油茶物種高質量基因
新算法TRFill解決生物基因組重復序列組裝難題
近日，中國農業科學院農業基因組研究所農業基因組學技術研發與應用創新團隊開發出了一種新算法——TRFill，解決了現有工具無法完全填補基因組間隙的難題，顯著提升了基因組質量。相關研究成果發表在《基因組生物學》（Genome Biology）上。 動植物基因組的許多區域存在大量高度重復的DNA片段
日本研究人員制成植物人工染色體
日本岡山大學資源植物研究所教授村田稔率領的研究小組25日宣布，他們成功在植物細胞內人工制造出了帶有遺傳信息的染色體。這一成果將有助于開發新的作物品種。 研究小組使用擬南芥，利用“自頂向下分析法”，通過操控細胞內原有的染色體，并進行改編，制作出了比通常染色體要小的環狀人工染色體。即使是自花授
日本研究人員制成植物人工染色體
日本岡山大學資源植物研究所教授村田稔率領的研究小組25日宣布，他們成功在植物細胞內人工制造出了帶有遺傳信息的染色體。這一成果將有助于開發新的作物品種。 研究小組使用擬南芥，利用“自頂向下分析法”，通過操控細胞內原有的染色體，并進行改編，制作出了比通常染色體要小的環狀人工染色體。即使是自花授
解析斑鱉的全基因組序列及其適應性進化基礎
斑鱉（Rafetus swinhoei）是目前地球上現存體型最大的鱉類物種，其背甲長度可達1.5米、體重可達115公斤。此外，斑鱉也是全球目前最瀕危的龜鱉類物種。在2019年初，全球已經明確記錄的斑鱉個體僅僅只有4只。然而，2019年4月13日，我國的雌性個體意外死亡（這也是當時全球唯一確定性別