科學家繪制人類單細胞染色質可及性圖譜
在人類細胞中，總長約2米的基因組DNA通過與組蛋白纏繞形成核小體，并經過螺旋折疊等方式盤繞形成染色體進而團聚于直徑10微米的細胞核中。在細胞內的DNA需要進行轉錄等活動的時候，DNA才會從組蛋白中釋放出來，裸露出需要與轉錄因子結合的位點從而便于轉錄，染色質的這種特性叫做染色質可及性，暴露的區域被稱為“開放染色質”。作為轉錄調控的核心區域，順式作用元件附近的染色質通常具有較高的可及性，利用全基因組染色質可及性檢測技術可鑒定出潛在的順式作用元件。 近日，發表在《Cell》上的一項題為“A single-cell atlas of chromatin accessibility in the human genome”的研究中，來自美國加州大學圣地亞哥分校的研究團隊利用單細胞測序技術在30個人類組織中分析了約60萬個細胞，并通過與之前數據的集成分析識別了222個細胞亞型并注釋了近120萬個順式作用元件，繪制了目前最大規模的人類單......閱讀全文
新技術分析單細胞的染色質構象
分析染色質構象的技術不少，但有的需要大量細胞，有的則分辨率太低。這阻礙了我們對于單細胞中染色質構象的了解。近日，瑞典卡羅林斯卡學院的研究人員在《Biotechniques》上介紹了一種新方法，能夠高分辨率地分析單細胞中染色質的接近程度。 對于理解基因調控、DNA復制和修復來說，研究染色體的
北京基因組所單細胞中識別染色質類染色質拓撲的算法
基因組DNA和組蛋白以特定的形式高度折疊在細胞核中，這一高級結構即三維基因組學，對細胞核內的諸多生命活動至關重要。基于染色質構象捕獲（3C），尤其是高通量技術（Hi-C，ChIA-PET）的發展推動了三維基因組的研究，發現了包括染色質拓撲相關結構域（TAD），染色質環等一系列層次化的結構特征。近
Cell：繪制人類單細胞染色質可及性圖譜
在人類細胞中，總長約2米的基因組DNA通過與組蛋白纏繞形成核小體，并經過螺旋折疊等方式盤繞形成染色體進而團聚于直徑10微米的細胞核中。在細胞內的DNA需要進行轉錄等活動的時候，DNA才會從組蛋白中釋放出來，裸露出需要與轉錄因子結合的位點從而便于轉錄，染色質的這種特性叫做染色質可及性，暴露的區域被
科學家繪制人類單細胞染色質可及性圖譜
在人類細胞中，總長約2米的基因組DNA通過與組蛋白纏繞形成核小體，并經過螺旋折疊等方式盤繞形成染色體進而團聚于直徑10微米的細胞核中。在細胞內的DNA需要進行轉錄等活動的時候，DNA才會從組蛋白中釋放出來，裸露出需要與轉錄因子結合的位點從而便于轉錄，染色質的這種特性叫做染色質可及性，暴露的區域被
科學家繪制人類單細胞染色質可及性圖譜
在人類細胞中，總長約2米的基因組DNA通過與組蛋白纏繞形成核小體，并經過螺旋折疊等方式盤繞形成染色體進而團聚于直徑10微米的細胞核中。在細胞內的DNA需要進行轉錄等活動的時候，DNA才會從組蛋白中釋放出來，裸露出需要與轉錄因子結合的位點從而便于轉錄，染色質的這種特性叫做染色質可及性，暴露的區域被
科學家繪制人類單細胞染色質可及性圖譜
在人類細胞中，總長約2米的基因組DNA通過與組蛋白纏繞形成核小體，并經過螺旋折疊等方式盤繞形成染色體進而團聚于直徑10微米的細胞核中。在細胞內的DNA需要進行轉錄等活動的時候，DNA才會從組蛋白中釋放出來，裸露出需要與轉錄因子結合的位點從而便于轉錄，染色質的這種特性叫做染色質可及性，暴露的區域被
單細胞染色質圖譜|揭示轉錄因子網絡和細胞譜系關系
2019年10月8日，美國圣地亞哥的Salk研究所的Geoffrey Wahl團隊在Cell Reports雜志上發表文章“Single-Cell Chromatin Analysis of Mammary Gland Development Reveals Cell-State Transcr
Cell：首次構建出哺乳動物單細胞染色質可接近性圖譜
科學家們對DNA纏繞和包裝到所謂的染色質中的方式感興趣，這是因為這會影響每個細胞中可用到的遺傳信息。DNA就像串在一根繩子上的念珠。在這些分子“念珠”移動的地方會有空間形成，這樣蛋白就能夠訪問和“讀取”遺傳信息。這種狀態或者說這種基因組特征就是染色質可接近性（chromatin accessib
單細胞染色質開放性圖譜在器官發生的分子調控機制的...
單細胞染色質開放性圖譜在器官發生的分子調控機制的運用在哺乳動物胚胎發育的過程中，多能細胞迅速分裂分化，但是每個器官細胞譜系的調控程序仍不清楚。近日，中科院動物研究所劉峰課題組與劍橋大學、加州大學圣地亞哥分校的研究人員在《Nature Cell Biology》雜志上合作發表了題為“Single-
高通量單細胞ChIPseq確定了乳腺癌染色質狀態的異質性
近日，法國巴黎文理研究大學等科研人員在Nature Genetics上發表了題為“High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer”的文章，利用高通
異染色質和常染色質的結構差異
染色質可以分為兩種類群，異染色質和常染色質。最開始，這兩種形式是通過其在染色之后的顏色深淺區分的，常染色質一般著色較淺，而異染色質著色很深，表明其緊密聚集。異染色質通常集中在細胞核的邊緣區域。然而，不同于這種早期的二分法，最近的研究表明在動物和植物體內都擁有不止這兩種染色體結構，可能會有四到五種，區
常染色質與異染色質的功能差異
常染色質區域的基因可以被轉錄為信使RNA。常染色質區域非折疊的結構允許基因調控蛋白和RNA聚合酶與其上的DNA序列結合，從而開啟轉錄過程。在轉錄過程中，并非所有的常染色質都會被轉錄，但基本上非轉錄的部分會折疊為異染色質以保護暫時其上不用的基因。因此細胞的活性與細胞核中的常染色質數目有直接關系。常染色
異染色質的主要類型組成性異染色質
組成性異染色質，指除S期以外在整個細胞周期均處于聚縮狀態， DNA包裝比基本不變，可構成多個染色中心。
異染色質的主要類型兼性異染色質
在一定時期的特種細胞的細胞核內, 原來的常染色質可轉變成兼性異染色質。如雄性個體的細胞含有一個瘦小的Y染色體和一個大的X染色體, 由于X和Y染色體上很少有共同的基因, 對于雄性來說, X染色體上的基因就只有一個拷貝。雖然雌性細胞有兩條X染色體, 也只有一條具有轉錄活性, 另外一條X染色體像異染色質一
染色質的分類
間期染色質按其形態特征、活性狀態和染色性能區分為兩種類型：常染色質和異染色質。按功能狀態的不同可將染色質分為活性染色質和非活性染色質。
性染色質檢測
實驗方法原理 在間期細胞核中，女性X染色質和男性Y染色質均可用特殊染色法顯示出來。女性的兩個X染色體中的一個，在間期時的染色質呈異固縮（Heteropyconosis），呈深染的小體稱Barr氏體。Barr氏體位于間期細胞核內面，呈三角形或半月形小體，易為碳酸復紅或硫堇等染料著色。正常女性Barr氏
染色質的定義
染色體在細胞周期的間期時DNA的螺旋結構松散，呈網狀或斑塊狀不定形物，即染色質。以濃集狀態存在者，稱異染色質（1~eterochromatin）；以分散狀態存在者，稱常染色質（euchromatin）。常染色質染色較淺且均勻，異染色質染色深。性染色質與性染色體（x染色體和Y染色體）有關，稱x染色
單細胞分離用于單細胞基因擴增
單細胞分離連接不同管徑大小的毛細玻璃針，可分離捕獲各種非貼壁狀態的單細胞和微粒等，如細菌、酵母、藻類細胞、植物花粉、原生動物單細胞、懸浮細胞、血液細胞、免疫細胞、卵細胞、各種懸液中單細胞及特殊標記的單細胞等。 單細胞分離用于各種類型的細胞分離培養、純化、檢測；獲得單克隆細胞；用于單細胞基因擴增，
單細胞分離用于單細胞基因擴增介紹
單細胞分離連接不同管徑大小的毛細玻璃針，可分離捕獲各種非貼壁狀態的單細胞和微粒等，如細菌、酵母、藻類細胞、植物花粉、原生動物單細胞、懸浮細胞、血液細胞、免疫細胞、卵細胞、各種懸液中單細胞及特殊標記的單細胞等。 單細胞分離用于各種類型的細胞分離培養、純化、檢測；獲得單克隆細胞；用于單細胞基因擴增，用
Namocell單細胞分離儀應用——單細胞測序
2018年11月，Namocell與CZ-Biohub（Chan Zuckerburg Biohub）合作，在單細胞測序領域做出了新的嘗試。CZ-Biohub利用Namocell單細胞分離儀分選出目的B細胞，并且將其進行單細胞測序，為抗體新藥的發現邁出了重要一步。單細胞RNA測序（scRNA-s
Cell－Res重點論文：單細胞表觀多組學測序技術最新突破
2017年6月16日，北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
Cell－Res重點論文：單細胞表觀多組學測序技術最新突破
2017年6月16日，北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
染色質重塑的概念
染色質重塑chromatin remodeling ：基因表達的復制和重組等過程中，染色質的包裝狀態、核小體中組蛋白以及對應DNA分子會發生改變的分子機理。
異染色質的定義
異染色質分為結構異染色質和功能異染色質兩種類型。結構異染色質是指各類細胞在整個細胞周期內處于凝集狀態的染色質，多定位于著絲粒區、端粒區，含有大量高度重復順序的脫氧核糖核酸（DNA），稱為衛星DNA（satellite DNA）。功能異染色質只在一定細胞類型或在生物一定發育階段凝集，如雌性哺乳動物
概述染色質的成分
通過分離胸腺、肝或其他組織細胞的核,用去垢劑處理后再離心收集染色質進行生化分析,確定染色質的主要成分是DNA和組蛋白,還有非組蛋白及少量RNA。大鼠肝細胞染色質常被當作染色質成分分析模型,其中組蛋白與DNA含量之比近于1:1,非組蛋白與DNA之比是0.6:1,RNA與DNA之比為0.1:1。DN
染色質的發現過程
1879年，W. Flemming提出了染色質（chromatin）這一術語，用以描述細胞核中能被堿性染料強烈著色的物質。1888年，Waldeyer正式提出染色體的命名。經過一個多世紀的研究，人們認識到，染色質和染色體是在細胞周期不同階段可以相互轉變的形態結構。
染色質重組的意義
染色質重組過程中，核小體滑動可能是一種重要機制，它不改變核小體結構，但改變核小體與DNA 的結合位置。實驗證明，這種滑動能被核小體上游的“十字形”結構阻斷。但“滑動”機制并不能解釋所有實驗現象。人們推測，在重組過程中，還有其他機制如核小體可能與DNA 分離，然后核小體經過重排，結構變化后，與DNA
異染色質的功能
關于異染色質的功能，還未深入了解。但以下的幾點是明顯的。 1結構型異染色質可以加強著絲點區，使著絲粒穩定，以確保染色體分離。 2可以隔離和保護重要基因（例如NOR區的18S和28S基因），防止或減少基因突變和交換。 3促進物種分化，同源染色體可通過其異染色質區的重復序列在減數分裂時配對，這
什么是常染色質？
常染色質是染色質（由DNA、RNA和蛋白質組成）的一種松散聚集的形式，這種聚集方式在基因中大量存在，并且相應的片段通常處于活躍的轉錄當中（但并非必要，即常染色質部分不一定都是高表達的序列）。常染色質構成了細胞核基因組中表達最活躍的一部分。 人類基因組中92%為常染色質。
異染色質的定義
異染色質分為結構異染色質和功能異染色質兩種類型。結構異染色質是指各類細胞在整個細胞周期內處于凝集狀態的染色質，多定位于著絲粒區、端粒區，含有大量高度重復順序的脫氧核糖核酸（DNA），稱為衛星DNA（satellite DNA）。功能異染色質只在一定細胞類型或在生物一定發育階段凝集，如雌性哺乳動物含一