成都生物所開發新型生物信息學軟件
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/1/472859.shtm 近年來，隨著測序技術的快速發展，動物（尤其是非模式動物）全基因組數據（WGS）獲取變得簡單、便宜，這使得數據庫中全基因組數據量呈指數態勢增長。全基因組測序數據往往同時包含線粒體序列和核基因序列，通過生物信息學的方法從中提取并組裝完整的線粒體基因組，是非常好的技術手段。雖然已有部分學者開發了一些生物信息學軟件用以實現此目的，但是，其大都具有自身的局限性，包括需要人工提供參考序列（“種子”）、數據兼容性差、準確率低等難點，未能高效、準確、便捷地完成相關任務。為克服這一難點，提升研究人員的工作效率，近日，中國科學院成都生物研究所（以下簡稱成都生物所）李家堂課題組開發了一種不依賴“種子&am......閱讀全文
成都生物所開發新型生物信息學軟件
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/1/472859.shtm????? ?近年來，隨著測序技術的快速發展，動物（尤其是非模式動物）全基因組數據（WGS）獲取變得簡單、便宜，這使得數據庫中全基因組數據量呈指數態勢增長。全基因組測序數據往往同時包含
成都生物所成功開發用于非目標型篩查的軟件平臺
食品安全是社會公共安全的重要環節，近年來，食品安全事件中出現的危害物種類逐年增加，從三聚氰胺毒奶粉和蘇丹紅事件，到各種添加劑的使用、農藥殘留、瘦肉精濫用、轉基因作物的種植與安全、塑化劑和地溝油事件，無論深度和廣度，涉及的危害物已不拘泥于食品添加劑和農獸藥殘留物質。 食品危害物種類繁多，如何
常用生物軟件介紹
一、Microarray軟件1. Array Designer 4.25 Build 42501，為微陣列批量設計cDNA引物和寡核苷酸引物的工具，適用于Windows和Linux系統。斯坦福編寫的軟件系列：2. ScanAlyze，Microarray圖像分析軟件，從單一或雙色熒光雜交產生的熒光圖
成都生物所發明利用生物質發酵
-光合藕聯產氫的方法??????? 3月5日，從中科院成都生物研究所科技處獲悉，該所科研人員發明出一種生物質發酵-光合藕聯產氫方法，并獲國家知識產權局發明ZL授權。 該方法具體為：在同一反應器中，利用紅薯、薯蕷等生物質發酵-光合藕聯產氫，該過程先后經過生物質熱處理、接種發酵細
常用生物軟件（windows）全面介紹
常用生物軟件（windows)全面介紹一、基因芯片1、基因芯片綜合分析軟件。?ArrayVision 7.0 一種功能強大的商業版基因芯片分析軟件，不僅可以進行圖像分析，還可以進行數據處理，方便protocol的管理功能強大，商業版正式版：6900美元。?Arraypro 4.0 Media Cyb
世界生物材料大會在成都舉行
有世界生物材料領域“奧運會”之稱的第九次世界生物材料大會今天(6月1日)在成都舉行，這是該大會創辦32年來首度在中國舉辦。在5天的會期中，來自57個國家和地區的3000多名專家學者將以“新型生物材料及其與再生醫學交叉的前沿”為主題，進行廣泛深入的交流研討，推動生物材料的研究和應用。 第九次
成都生物所發現生物啟發的烷基轉移反應
仿生合成即指在分子水平上模擬生物的功能，將生物的功能原理用于化學合成，借以改善現有的和創造嶄新的化學原理和工藝的科學。仿生合成以其反應條件的溫和化、無污染、立體專一性強、快速催化、副產物少、產率高、能耗低等突出特點和優勢成為綠色化學的重要體現。仿生合成的核心內容是酶的利用和化學模擬。NAD(P)
成都生物所發明出公廁除臭生物制劑
??????? 中國科學院成都生物研究所“一種用于公廁除臭的復合生物制劑、制備方法及其應用”獲國家知識產權局發明ZL（ZL號：ZL 201210190627.9）。 隨著我國經濟的快速發展，人口流動日益頻繁，尤其是旅游業的快速發展，城市公廁和景區公廁數量不斷增多，已成為體現城市和景區管理水平和文明
Agilent擴展生物學分析軟件
新增遺傳關聯和拷貝數變異分析功能 2009年12月22日，北京 —安 捷 倫科技公司(紐約證券交易所：A)發布了其廣受歡迎的可用于微陣列數據可視化分析的最新一代桌面軟件產品--GeneSpring GX 11，以及其企業版本-- GeneSpring Workgroup 11。 Gene
第十九屆中國國際軟件合作洽談會在成都舉辦
軟件被認為是信息技術之魂、網絡安全之盾、經濟轉型之擎、數字社會之基。作為中國軟件行業一大盛事，1月12日，在成都世紀城國際會議中心舉辦的國際軟件合作洽談會（以下簡稱：軟洽會）備受關注。 據悉，大會由成都市人民政府、四川省經濟和信息化廳、電子科技大學、中國電子信息產業發展研究院、中國電子信息行業聯
成都生物所微生物除臭菌劑獲ZL
中科院成都生物研究所開發的一種畜禽糞污微生物除臭菌劑近日獲國家知識產權局發明ZL。 目前，針對畜禽糞便惡臭脫除研究可分為化學除臭和生物除臭兩大方面，化學除臭應用范圍小且易引起二次污染。生物除臭能持久消除惡臭，無二次污染，使用方便，成本低廉，成為惡臭控制的研究熱點。成都生物所研究人員針對畜禽
成都“地溝油”將變生物柴油
四川省成都市年內將在龍泉驛開建一個日處理能力300噸的餐廚垃圾處理廠，把餐廚垃圾變成生物柴油、有機肥等產品，預計明年底建成投用。目前該項目的環境影響評價報告書正式獲得批復，該處理廠是成都第二座餐廚垃圾處理廠，該市第三座餐廚垃圾處理廠也已開始選址，預計2016年建成。 據環評報告，該項目采用中溫
成都生物所發明烯糖制備方法
在有機化合成和藥物合成中，乙酰化烯糖、乙酰化二糖烯糖和苯甲酰化烯糖是合成活性天然產物、O-糖苷、C-糖苷、N-糖苷和S-糖苷等化合物的重要原料。但現有制備方法成本高、操作繁瑣、產率低。 5月25日，從中科院成都生物研究所科技處獲悉，國家知識產權局為該所發明的“乙酰化烯糖、乙酰化二糖烯糖和苯
成都生物所發明粉防己生物堿的制備工藝
粉防己生物堿具有抗心律失常，抗心肌、腦、腎缺血，抗高血壓，抗炎，抗腫瘤多藥耐藥性等多種藥理作用，臨床上已經制成多種制劑。現有粉防己生物堿的提取方法存在環境污染嚴重、提取率低、溶劑損耗大、成本高、操作步驟煩瑣等缺點。 9月28日，從中國科學院成都生物研究所科技處獲悉，該所科研人員發明了一種粉
成都生物所在不飽和酮生物催化研究中取得進展
環氧醇/酮由于其高活性的環氧、羥基、羰基官能團而具有廣泛的衍生性，是有機合成中的重要砌塊。 中國科學院成都生物研究所吳中柳課題組研究人員將羰基還原酶READH和苯乙烯單加氧酶StyAB共表達于大腸桿菌E. coli BL21-ΔnemA，構成了一個多酶偶聯體系：首選a,b不飽和酮經羰基還原酶R
成都生物所研究發現動物也有“面子”問題
非洲爪蟾 雄性之間競爭的目的大多是為了獲得資源、領地、配偶，而最終目的則是為了成功交配，以繁殖后代。雄性之間的競爭往往伴隨著高能量消耗和被天敵捕食的巨大風險。然而，雄性是否能獲得配偶，最終決定權卻掌握在雌性手中。因此，可以推測的是：雌性的存在與否以及雌性對雄性的態度有可能影響雄性之
成都生物所酵母耐熱基因研究獲進展
第二代燃料乙醇具有清潔、原料來源廣泛、可再生等諸多優點，有望替代傳統化石能源的使用，緩解當前人類社會面臨的日趨嚴重的能源危機及環境污染等問題，成為目前各國研究的熱點。木質纖維素原料的高效、低成本酶解是纖維素乙醇能否實現產業化的關鍵之一。目前廣泛使用的同步糖化發酵方式(SSF)，能使糖化和發酵在時
成都生物所發現可用于生物還原與生物吸附的假單胞菌
8月23日，據中國科學院成都生物研究所科技處介紹，該所科研人員分離獲得一株假單胞菌，在好氧條件下，既能還原硝酸鹽產生氨，也能吸附金屬離子，還能夠將溶液中金屬離子、非金屬離子還原為單質，可用于含金屬離子廢水的處理以及土壤和水體中有害金屬離子、非金屬離子的去除。該研究成果日前獲國家知識產權局發明ZL
成都生物所發現一種厚樸生物堿的用途
7月12日，從中科院成都生物研究所科技處獲悉，該所“一種厚樸生物堿的用途”獲國家發明ZL授權。 厚樸資源分布廣而豐富，含有較多的能抑制a-葡萄糖苷酶活性的生物堿。成都生物所科研人員采用提取、吸附和洗脫的方法獲得厚樸生物堿，該堿是包含木蘭花堿、鵝掌楸堿、蕃荔枝堿、羅默堿和Lysicamine
成都生物所揭示“飛蛙”滑翔的遺傳機制
動物復雜性狀是動物長期適應演化的結果，是動物多樣性形成的重要基礎。自然界物種采取各種各樣的進化策略以適應不同的棲息地，如高原、海洋、荒漠等。部分類群通過演化出了特殊的表型以適應樹棲生活。樹棲生活拓展了這些物種對垂直空間資源的利用，有助于它們躲避天敵，獲取豐富的食物資源等。而森林環境復雜的立體結構
成都生物所揭示“飛蛙”滑翔的遺傳機制
動物復雜性狀是動物長期適應演化的結果，是動物多樣性形成的重要基礎。自然界物種采取各種各樣的進化策略以適應不同的棲息地，如高原、海洋、荒漠等。部分類群通過演化出了特殊的表型以適應樹棲生活。樹棲生活拓展了這些物種對垂直空間資源的利用，有助于它們躲避天敵，獲取豐富的食物資源等。而森林環境復雜的立體結構
成都生物所舉行野外考察安全知識講座
講座現場 為普及野外安全知識，增強野外安全意識，提高預警和防范處置能力，中國科學院成都生物研究所生態研究中心于6月11日下午在生態中心會議室舉行了野外考察安全知識講座，講座特邀生態研究中心陳慶恒研究員主講，生態中心副主任潘開文主持。該中心近40人參加了會議。 陳慶恒結合自
成都生物所發明精制鴕鳥油的制備方法
鴕鳥油來源于鴕鳥的脂肪，主要由油酸、棕櫚酸、棕櫚油酸、亞油酸和硬脂酸等脂肪酸組成，與人體皮膚的脂肪酸組成相似，鴕鳥油中不含磷脂，對人體皮膚的滲透力和攜藥能力均較強;另外，鴕鳥油還具有促進創面愈合、抗炎鎮痛和保護心血管等作用，所以鴕鳥油在化妝品和醫療保健行業中有著極其廣泛的應用前景。 現有鴕
成都生物所楨楠抗旱機制研究獲進展
楨楠（Phoebe zhennan）為樟科常綠大喬木，分布于亞熱帶常綠闊葉林區西部，國家二級保護漸危種，我國特有，是馳名中外的珍貴用材樹種，又稱金絲楠。由于歷代砍伐利用，其資源近于枯竭。目前尚存的楨楠林多系人工栽培的半自然林和風景保護林，主要在廟宇、公園等處尚有少量大樹，在全球氣候變化的背景下，
AI加持動物行為識別，成都生物所亮“新招”
小鼠行為分類系統。 中科院成都生物所供圖 小鼠、大鼠、猴子等模式動物的行為識別，在醫學研究和藥物開發中都具有重要意義。通過普通視頻技術研究動物對特定刺激的反應，容易受到實驗場所的光照條件和拍攝角度的影響。 為解決這一問題，近日，中國科學院成都生物研究所動物行為與仿生項目的科研人員基于受抑全反
原創]分子生物學軟件集總結
1. DNASIS 2.5?DNASIS for Windows 2.5版是日立軟件公司（Hitachi Sofeware Engineering Co.,Ltd.）97年推出的一個功能強大的序列分析軟件。包含有大部分分子生物學軟件的常用功能，可進行DNA，RNA，蛋白質序列的編輯和分析，甚至還能進
安捷倫收購Cartagenia公司－提供生物軟件解決方案
分析測試百科網訊 2015年5月4日，安捷倫科技宣布將收購Cartagenia公司，收購金額還未披露。 安捷倫診斷和基因組學部總裁Jacob Thaysen在聲明中指出，本次收購將為安捷倫臨床遺傳學和分子腫瘤學用戶提供軟件解決方案，同時為Cartagenia的客戶提供更有力的支持和服
成都生物所高負荷混合厭氧發酵制備生物燃氣研究獲進展
厭氧發酵制備生物燃氣技術，在緩解能源短缺、優化能源結構，減少環境污染、應對氣候變化，緩解三農問題、推進城鎮化建設以及發展循環經濟、建設生態文明方面已顯示出了其不可替代的作用。然而，在技術層面，目前普遍采用的單一原料、低負荷厭氧發酵難以獲得較高的原料產氣率和池容產氣率，從而限制了生物燃氣工程的經濟
成都生物所揭示磷添加對土壤微生物的影響
土壤微生物在森林生態系統中的分解與養分循環中起著重要的作用，而土壤養分（尤其是氮與磷）又能影響微生物量及群落結構。與土壤有效性氮含量對微生物的影響相比，目前關于有效磷含量對土壤微生物影響的研究少且研究結論不一致。這也導致對土壤微生物與有效磷含量之間的關系認識有限，從而在一定程度上限制了科學家對微
成都生物所生物預處理玉米秸稈酶解糖化研究取得新突破
玉米秸稈是我國農業廢棄物主要來源之一，每年大約有2億噸，大部分都直接丟棄或就地焚燒，造成資源的浪費和環境污染。玉米秸稈主要由纖維素、半纖維素和木質素三大組分構成，通過酶水解和生物轉化后，可生成乙醇、丁醇等生物質能源，實現約30%的能源轉化。 中國科學院成都生物研究所應用與環境微生物研究中心