北大教授最新文章解析癌癥表觀遺傳學
來自北京市腫瘤防治研究所,北京大學腫瘤醫院病因研究室的研究人員在之前研究的基礎上,展開了胃癌發生發展相關DNA甲基化組掃描,進行了所獲90余個基因的DHPLC大規模研究,在中日韓三國驗證隊列中證明了了GFRA1的去甲基化激活,SRF和ZNF382的甲基化失活可用作胃癌等惡性腫瘤的轉移標志物。就此研究進展,研究人員在《科學通報》上發表了相關評述性文章。 文章的通訊作者是北京大學腫瘤醫院鄧大君教授,鄧教授曾證明人胃內能夠合成亞硝酰胺類致癌物N-甲基亞硝基脲,得到國際同行驗證認可,并且創建靈敏的DHPLC定性和定量檢測DNA甲基化方法,已在國內外推廣應用,還發現了一組早期預測胃癌轉移的DNA甲基化標志物等。 一直以來,科學家們都認為表觀遺傳學與遺傳學是作為兩個獨立的機制,參與癌變過程。癌癥研究領域的科學家們一面忙著尋找致癌基因,分析癌癥發生的遺傳學,一面又在表觀遺傳調控方面進行深入分析,希望了解環境等因素對于癌癥發生發......閱讀全文
表觀遺傳學關于DNA甲基化
表觀遺傳學是研究表觀遺傳變異的遺傳學分支學科從目前的研究來看,X 染色體劑量補償、DNA 甲基化、組蛋白密碼、基因組印記、表觀基因組學和人類表觀基因組計劃等問題都是表觀遺傳學研究的內容。其中甲基化是基因組DNA 的一種主要表觀遺傳修飾形式,是調節基因組功能的重要手段。在脊椎動物中,CpG二核
《科學》推出“表觀遺傳學”專題
10月29日出版的《科學》雜志刊登專題——《表觀遺傳學》(Epigenetics)。專題導言文章《什么是表觀遺傳學》(What Is Epigenetics?)說,多細胞有機體的細胞名義上擁有同樣的DNA序列(因而擁有同樣的遺傳指令系統),但是它們卻維持著不同的顯型。這種記錄了發育和環
甲基化芯片在表觀遺傳學中的應用
表觀遺傳改變可以定義為基因的遺傳性或獲得性改變,但是這種改變和DNA序列改變無關。DNA甲基化是最為常見的表觀遺傳改變;啟動子或第一外顯子CpG島中的甲基化改變將導致基因表達失活;組蛋白的化學修飾也可以作為表觀遺傳改變;組蛋白發生乙酰化改變的基因通常被開啟。 CpG島的異常甲基化是導致基
甲基化芯片在表觀遺傳學中的應用
表觀遺傳改變可以定義為基因的遺傳性或獲得性改變,但是這種改變和DNA序列改變無關。DNA甲基化是最為常見的表觀遺傳改變;啟動子或第一外顯子CpG島中的甲基化改變將導致基因表達失活;組蛋白的化學修飾也可以作為表觀遺傳改變;組蛋白發生乙酰化改變的基因通常被開啟。CpG島的異常甲基化是導致基因沉默和過度表
科學家發現口腔癌組織中的表觀遺傳學生物標志物
在發展中國家,口腔癌因其死亡率高而聞名,近日,一項刊登在國際雜志Epigenomics上的研究報告中,來自奧塔哥大學等機構的科學家們通過研究發現,相比患者口腔癌附近的組織而言,口腔癌組織中的表觀遺傳學標記或許并不相同,這些生物標志物或許與口腔癌患者的生存率存在密切關聯。圖片來源:commons.
北大教授最新文章解析癌癥表觀遺傳學
來自北京市腫瘤防治研究所,北京大學腫瘤醫院病因研究室的研究人員在之前研究的基礎上,展開了胃癌發生發展相關DNA甲基化組掃描,進行了所獲90余個基因的DHPLC大規模研究,在中日韓三國驗證隊列中證明了了GFRA1的去甲基化激活,SRF和ZNF382的甲基化失活可用作胃癌等惡性腫瘤的轉移標志物。就此
表觀遺傳學修飾
組蛋白修飾 表觀遺傳學是指表觀遺傳學改變 (DNA 甲基化、組蛋白修飾和非編碼 RNA 如 miRNA) 對 表觀基因組基因表達的調節,這種調節不依賴基因序列的改變且可遺傳表觀。因素如 DNA 甲基化、組蛋白修飾和 miRNA 是對環境刺激因素變化的反映,這些表觀遺傳學因素相互作用以調節基因
什么是表觀遺傳學
是研究不涉及DNA序列改變的基因表達和調控的可遺傳修飾,即探索從基因演繹為表型的過程和機制的一門新興學科。遺傳學是指基于基因序列改變所 致基因表達水平變化,如基因突變、基因雜合丟失和微衛星不穩定等。而表觀遺傳學則是指基于非基因序列改變所致基因表達水平變化,如DNA甲基化和染色質構象變化等;表觀基因組
甲基化與lncRNA:表觀遺傳學與轉錄組學研究的完美結合
2017年國自然申請的熱點什么?circRNA,lncRNA,外泌體。除了這些大家耳熟能詳的香饃饃之外,現在很多小伙伴們開始了新的玩法,通過多平臺聯用,將不同層面的東西結合起來,比如,表觀遺傳與非編碼RNA的結合,就是一個很好的例證。研究背景肺癌是一種常見的惡性腫瘤,特別在中國,由于環境的污染,肺癌
甲基化與lncRNA:表觀遺傳學與轉錄組學研究的完美結合
2017年國自然申請的熱點什么?circRNA,lncRNA,外泌體。除了這些大家耳熟能詳的香饃饃之外,現在很多小伙伴們開始了新的玩法,通過多平臺聯用,將不同層面的東西結合起來,比如,表觀遺傳與非編碼RNA的結合,就是一個很好的例證。 研究背景 肺癌是一種常見的惡性腫瘤,特別在中國,
表觀遺傳學分子生物學軟件——DNA甲基化分析工具
第一類:基于引物設計功能的軟件。此類軟件主要是針對重亞硫酸鹽序列進行甲基化特異性PCR(methylation-specific PCR, MS-PCR or MSP)和重亞硫酸鹽測序(bisulfite sequencing, BS)引物的設計。由于重亞酸鹽修飾的特殊性,使常規的分子生物學
Nature綜述:表觀遺傳學預測癌癥弱點
由Bellvitge生物醫學研究協會癌癥表觀遺傳與生物學研究組Manel Esteller領導的研究組,發表題為“DNA methylation profiling in the clinic: applications and challenges”的綜述文章,概況了近期在應用表觀遺傳
Nature發表表觀遺傳學重要發現決定性別的RNA甲基化
N6-methyladenosine(m6A)是真核生物mRNA和長非編碼RNA上最普遍的一種RNA修飾,介導了超過80%的RNA堿基甲基化。人們已經陸續鑒定了m6A所需的“讀”、“寫”和“擦除”蛋白,但對其生物學功能還知之甚少。伯明翰大學的科學家們在Nature雜志上發表文章,揭示了m6A在Sxl
Nature發表表觀遺傳學重要發現-決定性別的RNA甲基化
N6-methyladenosine(m6A)是真核生物mRNA和長非編碼RNA上最普遍的一種RNA修飾,介導了超過80%的RNA堿基甲基化。人們已經陸續鑒定了m6A所需的“讀”、“寫”和“擦除”蛋白,但對其生物學功能還知之甚少。 伯明翰大學的科學家們在Nature雜志上發表文章,揭示了m6A
著名遺傳學家表觀遺傳學新成果
可卡因成癮性的一個主要挑戰在于,在戒斷期之后的高復發率。但新的研究表明,在藥物戒斷過程中,我們DNA的變化可能為更有效的成癮療法開發,提供了有希望的方法。 加拿大麥吉爾大學和以色列巴爾依蘭大學的研究人員,將這項研究結果發表在最近的《Journal of Neuroscience》。他們指出,戒
壽命能推算嗎?加州大學科學家提出“預測方法”
從古至今,從國內到國外,從煉丹術到現代科學,長生不老似乎一直是人類樂此不疲的追求。 但若要延緩衰老,首先要弄清是什么造成了衰老。近日,加州大學洛杉磯分校(UCLA)生物統計學家斯蒂夫·霍瓦特(Steve Horvath)發現了一種預測一個人生命周期的方法:基于300~500個DNA甲基化標記,
表觀遺傳學和人類疾病
上個世紀50年代初,Watson和Crick建立了DNA分子結構模型,極大程度地促進了生命科學的發展。自此遺傳學便成為現代醫學研究領域中一個重要的分支。人類已經認識到基因突變可以導致疾病的發生,如慢性進行性舞蹈病(Huntington's chorea, Hc)和囊性纖維化等。近年來
表觀遺傳學名詞解釋
表觀遺傳學(英語:epigenetics)又譯為表征遺傳學、擬遺傳學、表遺傳學、外遺傳學以及后遺傳學,在生物學和特定的遺傳學領域,其研究的是在不改變DNA序列的前提下,通過某些機制引起可遺傳的基因表達或細胞表現型的變化。表征遺傳學是1980年代逐漸興起的一門學科,是在研究與經典的孟德爾遺傳學遺傳法則
Aging:利用DNA甲基化工具或能有效預測機體健康壽命
死神終會降臨在我們每個人頭上,那么知道死神何時降臨不是更好嗎?近日,來自加州大學洛杉磯分校的科學家們通過研究開發出了一種新工具,或能幫助提前計劃好與死神的約會,相關研究刊登于國際雜志Aging上;研究者指出,這種名為DNA甲基化GrimAge的生物標志物能幫助人們預測壽命和健康壽命,并能幫助測試
精準醫療:再吸金€6.7億,4篇Nature奠定臨床新技術
近年來,隨著基因組學技術在醫療領域的廣泛應用,全球范圍內對疾病的診療能力有了很大的提高,各國政府也紛紛制定了相關的醫療計劃,并投入大量的資金。近日法國首次宣布啟動《法國基因組醫療2025》計劃,精準醫療再度吸來重金。疾病診療技術是精準醫療得以實現的關鍵,6月27日,Nature平臺連發四篇文章證
鑒別出與阿爾茲海默病發病相關的表觀遺傳學標記
近日,一項刊登在國際雜志Science Advances上的研究報告中,來自布萊根婦女醫院、中國復旦大學醫學院等機構的科學家們通過研究發現了與阿爾茲海默病相關的表觀遺傳學標志物,同時研究者還描述了阿爾茲海默病患者非阿爾茲海默病患者機體皮膚培養物的甲基化狀況及他們的研究發現。圖片來源:CC0 Publ
南京農業大學國家重點實驗室聯合發表《Genome-Biology》
中國南京農業大學作物遺傳與種質創新國家重點實驗室、美國德州大學和德州A&M大學的科學家們分析了馴養的異源四倍體棉花和其4倍體和2倍體親緣植物的1200萬個差異甲基化胞嘧啶的綜合表觀基因和功能。 生物通報道:中國約有2000年的棉花種植歷史,是世界三大產棉國之一。長絨棉(纖維柔長)是紡高支紗的關
表觀遺傳之DNA甲基化(二)
二 DNA甲基化?DNA甲基化:DNA甲基化是通過DNA甲基轉移酶在胞嘧啶環的第5個碳原子上共價加成甲基而產生的,從而產生5-甲基胞嘧啶(5-mC),在體細胞中,幾乎僅在二核苷酸CpG的對稱甲基化配對中發現了5-mC,而在胚胎干(ES)細胞中,在非CpG中也觀察到了大量的5-mC。5-mC作為表型和
表觀遺傳之DNA甲基化(一)
俗話說,龍生龍,鳳生鳳,老鼠的兒子會打洞。?這句話什么意思呢?想必很多人有不同的看法~~?從傳統的社會認知角度看,就是“出生決定論”,一個人的出生是什么樣的,以后就會有什么樣的作為和成就,家庭決定著個人的前途和發展方向。龍鳳階層的人自出生以來便是龍鳳,若是草根階層,也很難上升到龍鳳圈層,即使有這樣的
利用DNA甲基化工具或能有效預測機體健康壽命
死神終會降臨在我們每個人頭上,那么知道死神何時降臨不是更好嗎?近日,來自加州大學洛杉磯分校的科學家們通過研究開發出了一種新工具,或能幫助提前計劃好與死神的約會,相關研究刊登于國際雜志Aging上;研究者指出,這種名為DNA甲基化GrimAge的生物標志物能幫助人們預測壽命和健康壽命,并能幫助測試
Cell發現表觀遺傳學肥胖開關
世界就是這么不公平,有些人喝涼水都發胖,有些人怎么吃也胖不了。近年來科學家們發現,個體的肥胖傾向是由基因決定的。然而Cell雜志發表的一項最新研究表明,表觀遺傳學調控也在其中起到了關鍵作用。 Max Planck研究所的J. Andrew Pospisilik領導團隊對遺傳背景完全相同的小鼠和
堅持鍛煉的表觀遺傳學意義
眾所周知,體育鍛煉能夠改善包括代謝、肺活量在內的多項身體機能。那么體育鍛煉是怎樣在分子水平上施加影響的呢? 人們發現,鍛煉能促進肌肉重塑,改變肌肉的纖維結構和蛋白組成。“堅持體育鍛煉對健康很有幫助,能夠防治一系列常見疾病,比如心血管疾病和二型糖尿病。理解鍛煉有益健康的具體機制,可以幫助我們進一
Science:表觀遺傳學的“神秘花園”
許多研究者都在探尋各種復雜性狀背后的遺傳學基礎。然而,大家往往忽視了天然表觀遺傳學變化為表型帶來的多樣性。表觀遺傳學突變發生在DNA序列之外,將其與DNA序列突變區分開是一項富有挑戰性的工作。 在本期Science雜志上Cortijo等人向人們展示,表觀等位基因( epialleles
Cancer-Cell專題:癌癥表觀遺傳學
癌癥中的基因調控與反調控一直是人們關注的熱點,現在這一領域已經取得了很大的進展。Cell旗下的Cancer Cell雜志本月特別推出專題,推薦了四篇有代表性的癌癥表觀遺傳學文章。 Vulnerabilities of Mutant SWI/SNF Complexes in Cancer 癌癥
顛覆傳統認知,表觀遺傳學之謎
盡管大多數生物體都是利用基因組上的甲基標記來監控基因表達,淡水原生動物Oxytricha trifallax卻利用這些標記踢走了垃圾DNA(95%的基因組序列)。這一研究發現駁斥了以往研究做出的通常攜帶四個細胞核的單細胞纖毛蟲無甲基化DNA的結論。 論文的第一作者、普林斯頓大學的博士后