細胞化學基礎β折疊鏈結構
肽平面之間呈手風琴狀折疊,股與股之間會通過氫鍵固定,但氫鍵主要在股間而不是股內。氨基酸殘基的R側鏈分布在片層的上下。β折疊層并不是平的,因為側鏈的存在使得它看上去像手風琴一樣波紋起伏。(英語pleated)這樣每一股會更緊密排列,氫鍵更容易建立。氫鍵的距離為7埃。在蛋白質結構中β折疊通常會用箭頭表示。肽鏈的氮端在同側為順式,兩殘基間距為0.65nm;不在同側為反式,兩殘基間距為0.70nm。反式較順式平行折疊更加穩定。......閱讀全文
細胞化學基礎β折疊鏈
在β折疊中,兩條以上氨基酸鏈(肽鏈),或同一條肽鏈之間的不同部分形成平行或反平行排列,成為“股”。
細胞化學基礎β折疊鏈作用
能形成β折疊的氨基酸殘基一般不大,而且不帶同種電荷,這樣有利于多肽鏈的伸展,如甘氨酸、丙氨酸在β折疊中出現的幾率最高。免疫球蛋白有大量的β折疊層。另一種常見的蛋白質模序是α螺旋和三種不同的β轉角。不屬于一個模序的蛋白質一級結構部分被稱之為不規則螺旋。這些部分對蛋白質的空間構象非常重要。
細胞化學基礎β折疊鏈結構
肽平面之間呈手風琴狀折疊,股與股之間會通過氫鍵固定,但氫鍵主要在股間而不是股內。氨基酸殘基的R側鏈分布在片層的上下。β折疊層并不是平的,因為側鏈的存在使得它看上去像手風琴一樣波紋起伏。(英語pleated)這樣每一股會更緊密排列,氫鍵更容易建立。氫鍵的距離為7埃。在蛋白質結構中β折疊通常會用箭頭表示
鏈折疊的結構
鏈折疊,是指凱勒(Keller)提出的折疊鏈模型。即分子鏈頃向于聚集在一起形成鏈束,分子鏈規整排列的鏈束細而長,表面能很大,不穩定。會自發的折疊成帶狀結構。也有一種說法是鏈折疊是直接以單根分子鏈(而不是鏈束)進行的。單晶的電子衍射圖研究認為分子鏈的方向是垂直于晶片表面,鏈在晶片厚度范圍內來回折疊。
細胞化學基礎鋅指結構
定義指的是在很多蛋白中存在的一類具有指狀結構的結構域,這些具有鋅指結構的蛋白大多都是與基因表達的調控有關的功能蛋白。共同特征鋅指結構的共同特征是通過肽鏈中氨基酸殘基的特征基團與Zn2+的結合來穩定一種很短的,可自我折疊成“手指”形狀的的多肽空間構型。發現鋅指蛋白最初在非洲爪蟾的卵母細胞中發現,已知廣
細胞化學基礎βαβ結構域
中文名稱:β-α-β結構域英文名稱:β-α-β motif;betaalpha-beta motif定 義:蛋白質超二級結構之一,由β折疊-α螺旋-β折疊所構成的功能結構域。應用學科:細胞生物學(一級學科),細胞化學(二級學科)
細胞化學基礎α螺旋的結構
α螺旋是一種最常見的二級結構,最先由Linus Pauling和Robert Corey于1951年提出,其主要內容是:①肽鏈骨架圍繞一個軸以螺旋的方式伸展;②螺旋形成是自發的,肽鏈骨架上由n位氨基酸殘基上的-C=O與n+4位殘基上的-NH之間形成的氫鍵起著穩定的作用;被氫鍵封閉的環含有13個原子,
鏈折疊性質
鏈折疊現象對結晶聚合物的行為非常重要,因而必須仔細考察鏈折疊結晶的情況。首先,一般認為,在許多聚合物中,鏈折疊沒有多大的困難。對聚合物分予模型的麥察表明,大多數聚合物分子都會折疊起來,比較容易形成一種很致密的足以嵌砌到晶體表面的折疊,但是,化學結構比較復雜的聚合物,如主鏈上有龐大側基或環以及分子鏈為
細胞化學詞匯?RNA折疊
中文名稱:RNA折疊英文名稱:RNA folding定 義:新合成的或變性的RNA轉變為特定的、成熟的三維結構構象的過程。應用學科:生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)
細胞化學基礎線粒體DNA組成結構
研究人員發明了轉換卵細胞基因材料的方法,用擁有健康線粒體的卵細胞取代攜帶錯誤線粒體DNA的卵細胞。結果是,胚胎會攜帶來自母親和父親的核DNA,以及卵細胞捐獻者的線粒體DNA。mtDNA雖能合成蛋白質,但其種類十分有限。迄今已知,mtDNA編碼的RNA和多肽有:線粒體核糖體中2種rRNA(12S及16
細胞化學基礎各類DNA結構對比
幾種主要的DNA二級結構對照表DNA模型螺旋方向直徑(nm)堿基數/螺旋螺距(nm)旋轉角度/堿基其它結構特征存在情況B-DNA右手2.37103.5436o平滑旋轉梯形螺旋結構92%RH,鈉鹽,溶液和細胞中天然狀態中的DNA多以此狀態存在A-DNA右手2.55112.5332.7o堿基不與中心軸垂
細胞化學基礎腺苷分子結構數據
摩爾折射率:59.95摩爾體積(cm3/mol):128.1等張比容(90.2K):412.8表面張力(dyne/cm):107.6極化率(10-24cm3):23.76
細胞化學基礎HMG框結構域
高速泳動族非組蛋白HMG1和HMG2有A、B和C 3個結構域:A、B結構相似,C含有酸性的羧基端尾部,與H1結合。RNA聚合酶Ⅰ相關的轉錄分子UBF的DNA結合結構域是85個氨基酸殘基的重復區,與HMG1和HMG2的A、B結構相似,所以這種特征性結構被命名為“HMG"結構域。中文名稱:HMG框結構域
細胞化學基礎鳥嘌呤分子結構
鳥嘌呤是嘌呤類有機化合物,是由一個嘧啶環和一個咪唑環稠和而成的,是嘌呤的一種,由碳和氮原子組成具有特征性雙環結構,并與胞嘧啶以三個氫鍵相連。在生物體內起著重要的作用,鳥嘌呤不僅自身可以有多種異構體,還具有4種DNA堿基中最小的絕熱電離勢,以游離或結合態存在于海鳥糞中,是五種不同核堿中的其中之一,并同
細胞化學基礎結構域的性質
又稱基元。蛋白質分子的一種折疊單位,是較大的蛋白質分子或亞基三維折疊中的一個層次或一種相對獨立的三維實體。一條長鏈多肽鏈最后一步折疊就是結構域締合(association),而成一個有活性的蛋白質分子或亞基。在一級(維)結構中的氨基酸序列的某些區域相鄰的氨基酸殘基形成有規則的二級(維)結構(如α-螺
細胞化學基礎核糖核酸的組成結構
RNA和DNA一樣,也是由各種核苷酸通過3′,5′-磷酸二酯鍵連接構成的多核苷酸鏈,但與DNA有一系列差異。1.在化學組成方面,RNA含核糖而不含脫氧核糖。含尿嘧啶而不含胸腺密啶。例外的是,每個tRNA分子含有一個胸腺嘧啶,這是在RNA鏈合成后由尿嘧啶甲基化生的,此外,前面已提到,少數DNA含有少量
細胞化學基礎鳥嘌呤分子結構數據
1、摩爾折射率:35.462、摩爾體積(cm3/mol):68.83、等張比容(90.2K):229.64、表面張力(dyne/cm):124.05、極化率(10-24cm3):14.06
細胞化學基礎黃嘌呤分子結構數據
1、摩爾折射率:33.292、摩爾體積(m3/mol):92.83、等張比容(90.2K):276.24、表面張力(dyne/cm):78.25、極化率(10-24cm3):13.20
細胞化學基礎螺旋轉角螺旋結構域
中文名稱:螺旋-轉角-螺旋結構域英文名稱:helix-turnhelix motif定 義:由兩個α螺旋間隔以一定角度的轉角構成的結構域。其中一個α螺旋可插入DNA大溝中與專一DNA序列結合。應用學科:細胞生物學(一級學科),細胞化學(二級學科)
細胞化學基礎螺旋袢螺旋結構域
中文名稱:螺旋-袢-螺旋結構域英文名稱:helix-loophelix motif定 義:存在于轉錄因子的DNA結合結構域中的一種蛋白質結構域。由兩個α螺旋和中間的一個袢組成,識別并結合特異的DNA序列。應用學科:細胞生物學(一級學科),細胞化學(二級學科)
細胞化學基礎結構域的定義和分類
結構域(domain)是位于超二級結構和三級結構間的一個層次。結構域是在蛋白質的三級結構內的獨立折疊單元,通常都是幾個超二級結構單元的組合。在較大的蛋白質分子中,由于多肽鏈上相鄰的超二級結構緊密聯系,進一步折疊形成一個或多個相對獨立的致密三維實體,即結構域。結構域與分子整體以共價鍵相連,一般難以分離
細胞化學基礎結構域的基本分類
為了研究蛋白質分子結構的基本規律,人們用不同的方法從不同的角度對已知的蛋白質結構進行分類,有些是基于生物功能,有些是基于結構自身,有些是將二者結合在一起進行分類研究。例如,鋅金屬蛋白酶是一類可催化肽鏈內部肽鍵水解的肽鏈內切酶,盡管所屬的各個亞家族成員的整體空間結構差異顯著,但催化活性部位的結構非常類
細胞化學基礎腺苷一磷酸分子結構數據
摩爾折射率:69.90摩爾體積(m3/mol):149.6等張比容(90.2K):515.5表面張力(dyne/cm):140.9極化率(10-24cm3):27.71
β折疊的結構
肽平面之間呈手風琴狀折疊,股與股之間會通過氫鍵固定,但氫鍵主要在股間而不是股內。氨基酸殘基的R側鏈分布在片層的上下。β折疊層并不是平的,因為側鏈的存在使得它看上去像手風琴一樣波紋起伏。這樣每一股會更緊密排列,氫鍵更容易建立。氫鍵的距離為7埃。在蛋白質結構中β折疊通常會用箭頭表示。肽鏈的氮端在同側為順
β折疊的結構
肽平面之間呈手風琴狀折疊,股與股之間會通過氫鍵固定,但氫鍵主要在股間而不是股內。氨基酸殘基的R側鏈分布在片層的上下。β折疊層并不是平的,因為側鏈的存在使得它看上去像手風琴一樣波紋起伏。(英語pleated)這樣每一股會更緊密排列,氫鍵更容易建立。氫鍵的距離為7埃。在蛋白質結構中β折疊通常會用箭頭表示
細胞化學基礎堿基
堿基,在化學中本是“堿性基團”的簡稱。有機物中大部分的堿性基團都含有氮原子,稱為含氮堿基,氨基(-NH2)是最簡單的含氮堿基。堿基,在生物化學中又稱核堿基、含氮堿基,是形成核苷的含氮化合物,核苷又是核苷酸的組分。堿基、核苷和核苷酸等單體構成了核酸的基本構件。核堿基間可以形成堿基對,且彼此堆疊,所以,
細胞化學基礎鋅指
鋅指是一種常出現在DNA結合蛋白質中的一種結構基元。鋅螯合在氨基酸鏈中形成鋅的指狀結構。鋅是某些酶的活性輔助因子,也是某些蛋白質,包括RNA聚合酶的轉錄因子,如TFIIIA(transcription factor III,Asubtype)、類固醇受體等能結合脫氧核糖核酸(DNA)的蛋白質亦含有鋅
細胞化學基礎腺苷
腺苷,是指由腺嘌呤的N-9與D-核糖的C-1通過β糖苷鍵連接而成的化合物,化學式為C10H13N5O4,其磷酸酯為腺苷酸。腺苷是一種遍布人體細胞的內源性核苷,可直接進入心肌經磷酸化生成腺苷酸,參與心肌能量代謝,同時還參與擴張冠脈血管,增加血流量。腺苷對心血管系統和肌體的許多其它系統及組織均有生理作用
細胞化學基礎嘌呤
嘌呤(Purine),分子式C5H4N4,是一種雜環芳香有機化合物,是新陳代謝過程中的一種代謝物。
細胞化學基礎β轉角
β-轉角是一種常見的蛋白質二級結構,它通常出現在球狀蛋白表面,因此含有極性和帶電荷的氨基酸殘基。