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  • cccDNA的定性檢測

    既往絕大多數文獻報道的是用Southern blot對cccDNA進行定性檢測,該方法是分子生物學的經典方法,但技術要求較高,敏感度低。近年來,也有較多文獻報道用PCR技術對cccDNA進行檢測。但是,由于PCR技術靈敏度極高,rcDNA和cccDNA的序列又具有高度的同源性,因此在用PCR技術檢測cccDNA時,必須確保只能擴增cccDNA而rcDNA不被擴增。利用rcDNA和cccDNA結構上的差異可以解決這一問題。由于rcDNA的正鏈和負鏈上均存在缺口,故可以設計跨越兩個缺口的引物,使rcDNA不會被擴增,而cccDNA由于是完整的雙鏈結構則可以被選擇性擴增。同時可設計另一對不跨越缺口的引物或只跨越一條鏈的缺口的引物同時檢測cccDNA和rcDNA。Kock等成功地用這種選擇性PCR的方法在檢測感染細胞內的cccDNA和rcDNA。此外,為進一步提高檢測的靈敏度,可用套式PCR(nested PCR)的方法。但是有報道認為......閱讀全文

    cccDNA的定性檢測

    既往絕大多數文獻報道的是用Southern blot對cccDNA進行定性檢測,該方法是分子生物學的經典方法,但技術要求較高,敏感度低。近年來,也有較多文獻報道用PCR技術對cccDNA進行檢測。但是,由于PCR技術靈敏度極高,rcDNA和cccDNA的序列又具有高度的同源性,因此在用PCR技術檢測

    關于共價閉合環狀DNA(cccDNA)的定性檢測的介紹

      既往絕大多數文獻報道的是用Southern blot對cccDNA進行定性檢測,該方法是分子生物學的經典方法,但技術要求較高,敏感度低。  近年來,也有較多文獻報道用PCR技術對cccDNA進行檢測。但是,由于PCR技術靈敏度極高,rcDNA和共價閉合環狀DNA(cccDNA)的序列又具有高度的

    cccDNA的檢測方法

    cccDNA和rcDNA在結構和理化特性上有三點不同:①rcDNA在正鏈與負鏈上均有缺口或缺刻,只是部分區域互補故能形成環狀結構,但非超螺旋結構;而cccDNA兩條鏈均是完整的,二者共價互補,形成超螺旋結構。②rcDNA能與蛋白質共價結合,cccDNA則不能。③由于缺口或缺刻的存在,rcDNA可以被

    cccDNA的定量檢測

    在定性檢測的基礎上,可以進一步對cccDNA進行定量檢測。仍以PCR定量分析技術中,尤其是競爭PCR技術的敏感性和精確度高。方法是在PCR反應管中加入一種已知量的、能與野生模板等效擴增的內參照,內參照是經過突變處理的,其兩端尤其是引物退火區的序列與野生模板相同。PCR擴增后通過一定的方法將野生片段與

    cccDNA檢測方法及應用價值

    細胞外乙型肝炎病毒DNA是一種松弛環狀的雙鏈DNA(relaxed circularDNA,rcDNA)分子,其兩條鏈均不是閉合的,其中負鏈較長,約3200個堿基,含有乙肝病毒基因組的全長基因,在其5’起始端與3’末端之間有一個數個堿基的“缺刻”(nick);正鏈較短,有較大的“缺口”(gap),其

    簡述共價閉合環狀DNA(cccDNA)的檢測意義

      乙肝病毒不僅僅是一種嗜肝病毒,一些肝外組織中也可檢測到乙肝病毒DNA,如腎臟、胰腺以及外周血單個核細胞(peripheralblood mononuclearcell,PBMC)等。早就有人發現乙肝病毒可以感染白細胞,而這種免疫細胞的感染似乎有利于病毒逃避免疫反應,從而導致機體清除乙肝病毒的能力

    關于共價閉合環狀DNA(cccDNA)的定量檢測介紹

      在定性檢測的基礎上,可以進一步對共價閉合環狀DNA(cccDNA)進行定量檢測。仍以PCR定量分析技術中,尤其是競爭PCR技術的敏感性和精確度高。方法是在PCR反應管中加入一種已知量的、能與野生模板等效擴增的內參照,內參照是經過突變處理的,其兩端尤其是引物退火區的序列與野生模板相同。PCR擴增后

    關于共價閉合環狀DNA(cccDNA)的檢測方法介紹

      共價閉合環狀DNA(cccDNA)和rcDNA在結構和理化特性上有三點不同:  ①rcDNA在正鏈與負鏈上均有缺口或缺刻,只是部分區域互補故能形成環狀結構,但非超螺旋結構;而cccDNA兩條鏈均是完整的,二者共價互補,形成超螺旋結構。  ②rcDNA能與蛋白質共價結合,cccDNA則不能。  ③

    cccDNA的功能和結構特點

    在乙肝病毒的復制過程中,病毒DNA進入宿主細胞核,在DNA聚合酶的作用下,兩條鏈的缺口均被補齊,形成超螺旋的共價、閉合、環狀DNA分子(covalently closed circularDNA,cccDNA)。細胞外乙型肝炎病毒DNA是一種松弛環狀的雙鏈DNA(relaxed circularDN

    共價閉合環狀DNA(cccDNA)的檢測方法及應用價值

      細胞外乙型肝炎病毒DNA是一種松弛環狀的雙鏈DNA(relaxed circularDNA,rcDNA)分子,其兩條鏈均不是閉合的,其中負鏈較長,約3200個堿基,含有乙肝病毒基因組的全長基因,在其5’起始端與3’末端之間有一個數個堿基的“缺刻”(nick);正鏈較短,有較大的“缺口”(gap)

    cccDNA:慢性乙肝持續感染的元兇

      慢性乙型病毒性肝炎影響著全球超過 2.5 億人口,每年約有 65 萬人死于 HBV 相關終末期肝病。共價閉合環狀(ccc)DNA 是慢性乙肝持續感染的元兇,作為病毒復制的中介,其在宿主肝細胞核內以微染色體的形式存在,目前的治療手段難以將其徹底清除,從而達到慢性乙肝的徹底治愈。  Gut 雜志上發

    武漢大學開發新方法,靈敏檢測乙肝病毒cccDNA

      武漢大學中南醫院的研究人員近日利用微滴式數字PCR(ddPCR)技術,開發出一種新型的HBV檢測方法。   201804181524017685822.png   根據世界衛生組織的最新統計,全球約有2.57億人感染乙型肝炎病毒(HBV)。慢性HBV感染會造成肝硬化和肝細胞癌(HCC)等嚴重

    關于共價閉合環狀DNA(cccDNA)的簡介

      在乙肝病毒的復制過程中,病毒DNA進入宿主細胞核,在DNA聚合酶的作用下,兩條鏈的缺口均被補齊,形成超螺旋的共價、閉合、環狀DNA分子(covalently closed circularDNA,cccDNA)。細胞外乙型肝炎病毒DNA是一種松弛環狀的雙鏈DNA(relaxed circular

    細胞內cccDNA的抽提與純化

    最常用的抽提細胞內cccDNA的方法是蛋白質-去污劑沉淀法,其原理是基于rcDNA和cccDNA與蛋白質結合能力的差異。rcDNA能與蛋白質共價結合,與絕大多數細胞染色體DNA一起形成沉淀,而cccDNA不能與蛋白質結合故游離于上清中,用酚氯仿抽提上清即可得到cccDNA。根據筆者的經驗,該方法的主

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    薄層層析的定性檢測

    薄層層析的定性檢測:展開完畢后,把薄層從層析缸中取出,用鉛筆劃出或小針刺出展開劑前緣的位置,隨即進行顯色,以確定各個斑點的位置、Rf值和顯色情況,從而判斷試樣中含有哪些組分。有色物質經展開后呈現明顯的色斑,很易判斷。對于無色物質,可根據化合物的性質,用物理檢出法、化學檢出法、酶與生物檢出法和放射性檢

    關于共價閉合環狀DNA(cccDNA)的展望介紹

      我們對HBVcccDNA的認識有待提高。在檢測技術上有許多問題需要解決,比如,如何進一步提高靈敏度,如何避免rcDNA同時被擴增(國內有些文獻報告的結果可能忽視了這一問題),如何簡化操作步驟,從而能夠被廣泛應用等。檢測或監測cccDNA的臨床意義也有待挖掘,比如,可以通過細胞和動物模型,來評判新

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    ????? 第二軍醫大學長征醫院繆曉輝報告,共價閉合環狀DNA(cccDNA)是乙肝病毒前基因組RNA復制的原始模板,雖然其含量較少,每個肝細胞內只有約5~50個拷貝,但對乙肝病毒的復制以及感染狀態的建立具有十分重要的意義,只有清除了細胞核內的cccDNA,才能徹底消除乙肝患者病毒攜帶狀態,是抗

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    關于HBVDNA定性定量檢測的簡介

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