遺傳發育所揭示水稻RNA識別結構域蛋白抑制外源基因沉默的機制
植物是復雜的生物系統。植物體內基因的表達受到多種水平的調控，如轉錄水平、轉錄后水平、DNA甲基化/去甲基化等，從而對基因表達進行精密高效的調控。中國科學院遺傳與發育生物學研究所張勁松研究組篩選OsEIN2過表達材料的抑制子，鑒定到一個包含RNA識別結構域（RRM）的蛋白SOE。SOE可以與剪接復合體組分互作，并結合到DNA去甲基化酶基因DNG701 mRNA上促進其剪接和穩定，從而維持DNG701介導的啟動子去甲基化與轉基因表達。基于水稻三千份測序數據的分析發現，SOE基因啟動子及編碼區的核苷酸多態性可分為7個單倍型，且Hap 1單倍型與粒重顯著正相關。此外，研究發現SOE基因突變能夠使水稻籽粒增大并提高單株產量。這一研究揭示了基因表達調控新機制，并為促進水稻和其他作物產量提升提供了優異的候選等位基因。3月20日，相關研究成果在線發表在《新植物學家》（New Phytologist，DOI：10.1111/nph.19686）上......閱讀全文
類轉錄化學藥物誘導型基因組編輯和轉錄激活系統
生物學變化多受到高度動態的分子事件調控，為了更精確的理解并研究這些過程，應用條件性可誘導的技術手段是十分必要的。此前，得到廣泛應用的藥物誘導技術之一是通過配體結合激發雌激素受體蛋白（ER）從細胞質到細胞核的轉運。在沒有激素配體的情況下，ER與熱激蛋白（hsp90）結合定位于細胞質中；一旦與配體結
DNA分析系統：基因甲基化研究的最佳工具
甲基化研究對于基因的 調控和腫瘤的發生有非常密切的關系。在一般正常的細胞中，基因調控區CpG島處于非甲基化的狀態。而當細胞發生癌變后，這些CG區域往往呈現甲基化狀態。英國醫學刊物《the Lancet》報道奧地利因斯布魯克醫學院的專家們早就可以通過檢測大便中DNA的甲基化變化，把健康人的大便
基因組所等RNA甲基化表觀轉錄組學研究獲進展
2014年1月，中國科學院北京基因組研究所基因組變異與精準生物醫學實驗室“百人計劃”研究員楊運桂研究組，與中國科學院動物研究所“百人計劃”研究員劉峰研究組合作開展的“m6A甲基轉移酶復合物鑒定”研究，發現了WTAP(wilms'tumour 1-associating protein)
關于基因轉錄的轉錄因子介紹
轉錄因子(transcription factor)是起調控作用的反式作用因子。轉錄因子是轉錄起始過程中RNA聚合酶所需的輔助因子。真核生物基因在無轉錄因子時處于不表達狀態，RNA聚合酶自身無法啟動基因轉錄，只有當轉錄因子(蛋白質)結合在其識別的DNA序列上后，基因才開始表達。轉錄因子的結合位點
Pyrosequencing－DNA分析系統：基因甲基化研究的最佳工具
甲基化研究對于基因的調控和腫瘤的發生有非常密切的關系。在一般正常的細胞中，基因調控區CpG島處于非甲基化的狀態。而當細胞發生癌變后，這些CG區域往往呈現甲基化狀態。英國醫學刊物《the Lancet》報道奧地利因斯布魯克醫學院的專家們早就可以通過檢測大便中DNA的甲基化變化，把健康人的大便與結腸癌患
關于真核生物的基因調控—真核基因的轉錄分類介紹
幾乎所有的真核生物的 mRNA都有一個5′帽端，但并不是所有基因的mRNA都有3′多聚A尾部，也不是所有基因的mRNA都必須經過拼接。根據這后兩種加工過程的有無和復雜程度，可將真核基因的轉錄單位分為兩大類型：一類是簡單的只編碼產生一種蛋白質的基因，另一類是復雜的編碼兩種或更多種蛋白質的轉錄單位。
基因轉錄后調控方式
真核生物的RNA被翻譯之前需要通過核孔輸出，因此核輸出對基因表達有著顯著影響。所有進出細胞核的mRNA的運輸都是通過核孔進行的，受到各種輸入蛋白和輸出蛋白的控制。攜帶遺傳密碼的mRNA需要存活足夠長的時間才能被翻譯，因為mRNA在翻譯之前必須經過很長距離的運輸。在典型的細胞中，RNA分子僅在特異性保
基因轉錄調控的途徑
可分為三種主要途徑：1）遺傳調控（轉錄因子與靶標基因的直接相互作用）；2）調控轉錄因子與轉錄機制相互作用，3）表觀遺傳調控（影響轉錄的DNA結構的非序列變化）。
真核生物RNA的轉錄與原核生物RNA的轉錄的區別
真核生物RNA的轉錄與原核生物RNA的轉錄過程在總體上基本相同，但是，其過程要復雜得多，主要有以下幾點不同： 1、真核生物RNA的轉錄有的是在細胞核內進行的，而蛋白質的合成則是在細胞質內進行的。且真核生物線粒體和葉綠體的遺傳信息系統被稱為真核細胞的第二遺傳信息系統，或核外基因及其表達體系。這是
揭露CG甲基化的遺傳性和相互作用
將表觀遺傳標記（例如DNA甲基化）靶向特定位點的能力在基礎研究和作物植物工程中都很重要。但是，靶向DNA甲基化的遺傳性，其如何影響基因表達以及正確建立所需的表觀遺傳特征尚不清楚。 2021年5月25日，浙江大學劉琬璐及加利福尼亞大學洛杉磯分校Steven E. Jacobsen共同通訊在Nat
真核生物的轉錄終止
真核生物的轉錄終止，是和這類轉錄后修飾密切相關的。真核mRNA3’端在轉錄后發生修飾，加上多聚腺苷酸(polyA)的尾巴結構。大多數真核生物基因末端有一段AATAAA共同序列，再下游還有一段富含GT序列，這些序列稱為轉錄終止的修飾點。真核RNA轉錄終止點在越過修飾點延伸很長序列之后，在特異的內切核酸
關于基因轉錄的基本介紹
基因轉錄是在細胞核和細胞質內進行的。它是指以DNA的一條鏈為模板，按照堿基互補配對原則，在RNA聚合酶作用下合成RNA的過程。基因轉錄有正調控和負調控之分。 如細菌基因的負調控機制是當一種阻遏蛋白(repressor protein)結合在受調控的基因上時，基因不表達；而從靶基因上去除阻遏蛋白
基因轉錄因子的相關介紹
轉錄因子(transcription factor)是起調控作用的反式作用因子。轉錄因子是轉錄起始過程中RNA聚合酶所需的輔助因子。真核生物基因在無轉錄因子時處于不表達狀態，RNA聚合酶自身無法啟動基因轉錄，只有當轉錄因子(蛋白質)結合在其識別的DNA序列上后，基因才開始表達。轉錄因子的結合位點
關于基因轉錄的過程介紹
(1)基因轉錄— 轉錄的啟動 DNA上存在著轉錄的起始信號，它是特殊的核苷酸序列，稱為啟動子。 轉錄是由RNA聚合酶全酶結合于啟動子而被啟動的。 其機理是：s因子能識別啟動子，并識別有義鏈，它與核心酶結合，引導核心酶定位到啟動子部位。 (2)基因轉錄—?轉錄的起始 當聚合酶結合到啟動子
基因表達的轉錄機制介紹
轉錄過程由RNA聚合酶（RNAP）進行,以DNA為模板,產物為RNA。RNA聚合酶沿著一段DNA移動,留下新合成的RNA鏈。 基因組DNA由兩條反向平行和反向互補鏈組成,每條鏈具有5'和3'末端。這兩條鏈分別稱為“模板鏈”（產生RNA轉錄物的模板）和“編碼鏈”（含有轉錄本序列的
什么是轉錄依賴的擴增系統？
轉錄依賴的擴增系統(Transcript-basedamplification system，TAS)，是Kwen等人于1989年研究報道的，主要用于擴增RNA.合成A、B引物，引物A的3‘末端與待擴增RNA互補，其5’端有T7RNA多聚酶的啟動子信息.逆轉錄酶以A引物為起點合成cDNA;引物B與此
真核生物RNA的轉錄與原核生物RNA的轉錄過程差異
⒈ 真核生物RNA的轉錄有的是在細胞核內進行的，而蛋白質的合成則是在細胞質內進行的。且真核生物線粒體和葉綠體的遺傳信息系統被稱為真核細胞的第二遺傳信息系統，或核外基因及其表達體系。這是因為研究發現，線粒體和葉綠體中除有DNA外，還有RNA（mRNA、tRNA、 RNA）、核糖體、氨基酸活化酶等。說明
研究發現TNFα會刺激炎癥基因響應，誘發DNA主動去甲基化
近期，中國科學院生物物理研究所生物大分子國家重點實驗室研究員朱冰課題組在eLife上，在線發表題為Sustained TNF-α stimulation leads to transcriptional memory that greatly enhances signal sensitivit
中國學者發表RNA甲基化重要成果
基因組DNA和組蛋白上存在可逆的表觀遺傳學修飾，這些修飾可以調控基因的表達，由此決定細胞的狀態，影響細胞的分化和發育。近年來人們發現，mRNA和其他RNA也存在類似的表觀遺傳學調控，比如m6A（N6-methyladenosine）。 西北農林科技大學、中科院上海植物逆境生物學研究中心和美國普
中國學者發表RNA甲基化重要成果
基因組DNA和組蛋白上存在可逆的表觀遺傳學修飾，這些修飾可以調控基因的表達，由此決定細胞的狀態，影響細胞的分化和發育。近年來人們發現，mRNA和其他RNA也存在類似的表觀遺傳學調控，比如m6A（N6-methyladenosine）。 西北農林科技大學、中科院上海植物逆境生物學研究中心和美國普
m5C－RNA修飾表達譜文章教您如何另辟蹊徑快速發文
文章導讀隨著RNA修飾在生物領域的持續火熱，關于m6A修飾的研究已經廣 泛開展并發表，至今已覺不新鮮；5-甲基胞嘧啶RNA甲基化（m5C）是一類新的修飾方式，參與調控細胞應激、發育和基因表達等方面，目前m5C研究正處 方興未艾之際，大量的科學研究工作也亟待開展，非常適合有探索性和新穎性需求的老師。這
真核生物RNA的轉錄與原核生物RNA的轉錄過程的區別
⒈ 真核生物RNA的轉錄有的是在細胞核內進行的,而蛋白質的合成則是在細胞質內進行的。且真核生物線粒體和葉綠體的遺傳信息系統被稱為真核細胞的第二遺傳信息系統,或核外基因及其表達體系。這是因為研究發現,線粒體和葉綠體中除有DNA外,還有RNA(mRNA、tRNA、 RNA)、核糖體、氨基酸活化酶等。說明
云序生物獨家首發m5C－RNA甲基化測序
m5C RNA甲基化簡介 通過分析近幾年的國自然立項，可以發現RNA甲基化這兩年的基金項目呈指數級增長的趨勢：特別是從2015年的5項到2017年的25項，項目增長尤為顯著。僅2018年1月的RNA甲基化文獻就達到25篇，可以說RNA甲基化的發展已經到了井噴階段，多篇文章榮登CNS級別期刊
研究揭示水稻RNA識別結構域蛋白抑制外源基因沉默的機制
植物是復雜的生物系統。植物體內基因的表達受到多種水平的調控，如轉錄水平、轉錄后水平、DNA甲基化/去甲基化等，從而對基因表達進行精密高效的調控。 中國科學院遺傳與發育生物學研究所張勁松研究組篩選OsEIN2過表達材料的抑制子，鑒定到一個包含RNA識別結構域（RRM）的蛋白SOE。SOE可以與剪
遺傳發育所揭示水稻RNA識別結構域蛋白抑制外源基因沉默的機制
植物是復雜的生物系統。植物體內基因的表達受到多種水平的調控，如轉錄水平、轉錄后水平、DNA甲基化/去甲基化等，從而對基因表達進行精密高效的調控。中國科學院遺傳與發育生物學研究所張勁松研究組篩選OsEIN2過表達材料的抑制子，鑒定到一個包含RNA識別結構域（RRM）的蛋白SOE。SOE可以與剪接復合體
Cancer－Cell首次揭示lncRNA在20種癌癥中的DNA甲基化改變圖譜
近日，匹茲堡大學楊達課題組在Cancer Cell雜志上發表了最新研究論文，系統地揭示了20種癌癥中長非編碼RNA（lncRNA）的DNA甲基化改變圖譜。 image.png 論文題為“lncRNA Epigenetic landscape analysis identifies E
外源基因在真核細胞中的表達系統
1. 真核生物表達的優越性和必要性① 真核生物具有轉錄后加工系統，可識別并刪除基因中的內含子，剪切加工為成熟mRNA.②具備完善的翻譯后加工系統，可進行糖基化、乙酰化等修飾，使蛋白形成正確的天然構型，因而真核生物表達系統產生的蛋白更接近天然狀態，有利于其功能、生物活性的研究。③某些真核細胞可將基因表
m5C－RNA甲基化測序介紹
m5C RNA甲基化簡介通過分析近幾年的國自然立項，可以發現RNA甲基化這兩年的基金項目呈指數級增長的趨勢：特別是從2015年的5項到2017年的25項，項目增長尤為顯著。僅2018年1月的RNA甲基化文獻就達到25篇，可以說RNA甲基化的發展已經到了井噴階段，多篇文章榮登CNS級別期刊。RNA甲基
dna甲基化抑制劑－aza和dec的區別
DNA甲基化在諸如胚胎發育、基因轉錄、染色質的結構和穩定性、X染色體的失活、基因組印記、細胞的癌變和衰老等生物過程中起到關鍵作用。DNA甲基化模式和水平取決于DNA甲基轉移酶和去甲基化酶的作用。DNA去甲基化包括DNA主動去甲基化和被動去甲基化。其中,DNA去甲基化酶在DNA主動去甲基化中起關鍵作用
華大基因再出手－單細胞轉錄組學測序技術的系統分析
單細胞轉錄組測序(Single-cell RNA-seq)是在單細胞水平對轉錄組（mRNA）進行測序的一項新技術，可發現細胞群體中真正起作用的細胞，特別適合對高度異質性的干細胞、腫瘤細胞及胚胎發育早期的細胞群體進行研究，認識細胞分子機制和基因調控網絡。單細胞RNA-seq技術需要在測序前制備文庫