陳玲玲研究員CellRes解析癌相關lncRNA
報道 來自中科院上海生命科學研究院、第二軍醫大學的研究人員在新研究中證實,人類結直腸癌特異性的CCAT1-L lncRNA調控了MYC基因位點的遠程染色質相互作用。這一研究發現在線發表在3月25日的《細胞研究》(Cell Research)雜志上。 論文的通訊作者是中科院上海生命科學院生物化學與細胞生物學研究所陳玲玲(Ling-Ling Chen)研究員。其主要研究方向為長非編碼RNA和干細胞。 長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類轉錄本長度超過200nt的RNA分子,它們并不編碼蛋白,因此起初被認為是基因組轉錄的“噪音”,不具有生物學功能。然而,近年來的研究發現,實際上lncRNA以RNA的形式在多種層面上(表觀遺傳調控、轉錄調控以及轉錄后調控等)影響了各種重要的生物過程,且與癌癥的發生存在密切的關系。盡管這些研究的結果表明,lncRNAs有可能在腫瘤形成中充當了重要的調控因子,對于lncRNAs在特......閱讀全文
基因調控的研究方法
篩選突變型 這是在原核生物中廣泛應用的方法,例如在乳糖操縱子的研究中篩選失去了基因調控能力的組成型,包括調節基因發生突變和操縱基因發生突變的突變型,以及篩選即使有乳糖或其他誘導物存在的情況下仍然不能合成β-半乳糖苷酶的超阻遏型等等。 激素誘導 在高等的真核生物中,除了離體培養的體細胞以
專家指南:如何研究基因調控(一)
隨著基因組學研究的深入,人們已經不再滿足于了解基因的功能,而是對基因調控表現出愈加濃厚的興趣。現在,我們知道,DNA甲基化和組蛋白修飾可調控基因,microRNA和非編碼RNA也可以。基因調控的研究工具也越來越多,包括RNA-seq、ChIP-seq、ChIP-chip等。究竟該采用哪種方法來測定m
專家指南:如何研究基因調控(三)
Q5:在定位蛋白-DNA相互作用時,為降低DNA污染和片段化所引起的假陽性,同時也避免太嚴格的數據過濾所引起的假陰性,您的主要方法是什么? Marc Facciotti(加州大學戴維斯分校): 首先,從微生物的角度來看,我們選擇對天然表達的轉錄因子開展ChIP實驗。我們認為,這能夠將
關于基因調控的研究方法介紹
1、篩選突變型 這是在原核生物中廣泛應用的方法,例如在乳糖操縱子的研究中篩選失去了基因調控能力的組成型,包括調節基因發生突變和操縱基因發生突變的突變型,以及篩選即使有乳糖或其他誘導物存在的情況下仍然不能合成β-半乳糖糖苷酶的超阻遏型等等。 2、激素誘導 在高等的真核生物中,除了離體培養的體
植物激素調控基因研究獲進展
中科院上海藥物研究所徐華強與中科院遺傳與發育生物學研究所李家洋、美國溫安洛研究所Karsten Melcher等合作,在植物中發現了一個與人體中特定信號機制非常相似的重要的分子機制,該機制與人類早期胚胎發育和癌癥等疾病有著密切聯系。相關研究日前在線發表于《科學進展》。 植物中復雜的分子網絡調控
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式。轉
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式。轉
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式。轉
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式
中國科大基因轉錄調控研究取得進展
近日,中國科學技術大學生命科學學院教授單革實驗室研究發現,秀麗線蟲中兩個高度保守的轉錄因子UNC-30和UNC-55,共調控包括cAMP通路、微小RNA(microRNA)和長鏈非編碼RNA(lncRNA)等在內的數以千計的靶基因的表達,從而調控D型運動神經元的發育和可塑性。研究論文近日發表在《
PNAS:基因調控網絡建模研究獲進展
近日,國際學術期刊《美國科學院院刊》(PNAS)在線發表了由中國科學院數學與系統科學研究院和美國斯坦福大學、清華大學等單位的科研人員合作的基因調控網絡建模的研究成果,提出了利用匹配的基因表達和染色質可及性數據刻畫順式調控元件和反式調控元件相互作用的數學模型,將基因調控網絡的建模研究從編碼基因推進
JCI:研究發現調控骨密度的關鍵基因
近日,遺傳學家們確定了在調節骨密度中發揮關鍵作用的兩個基因,在對抗骨質疏松癥戰斗中邁出了重要一步。通過靶向這些基因,醫生可能有一天能夠操縱骨密度,以??預防或治療骨質脆弱。 該研究為了解骨質疏松癥的發展提供了重要的依據。在美國,目前有超過1200萬人被診斷患有骨質疏松癥,另有3000萬成為骨質
研究發現調控黃瓜低溫高產的關鍵基因
近日,中國農業科學院蔬菜花卉研究所葫蘆科蔬菜遺傳育種創新團隊發現調控黃瓜耐低溫性和雌花形成的“樞紐”基因,首次闡明其協同馴化的分子機制,發掘出優異等位基因,為黃瓜耐低溫高產分子育種提供重要理論依據和技術支撐。相關研究成果發表在《植物生物技術雜志》(Plant Biotechnology Journa
研究發現調控日本血吸蟲生殖發育基因
3月20日,記者從復旦大學獲悉,該校生命科學學院胡薇團隊,繪制了日本血吸蟲從合抱至性成熟產卵過程的動態表達譜,解析了整個發育過程的基因表達特征和分子事件,發現了雌蟲與雄蟲在合抱后的發育過程中功能分化明顯,到成熟階段達到完美的功能互補,并鑒定了調控雄蟲合抱的芳香族氨基酸脫羧酶及控制雌蟲生殖系統發育
關于植物葉綠體基因組基因表達調控的研究的介紹
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式
細胞化學基礎植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式。轉
六倍體小麥調控組和亞基因組的分化調控研究
普通小麥(Triticum aestivum L.)是經兩次遠緣雜交而形成的一種異源六倍體作物,含有A、B和D三個亞基因組。亞基因組分化對多倍體小麥基因組可塑性具有重要貢獻,且成為其成功馴化的關鍵因素之一。然而,決定小麥亞基因組分化的時空特異性調控機制尚不清楚。中國科學院遺傳與發育生物學研究所研
研究發現基因調控水稻細胞死亡新機制
近日,中國水稻研究所(以下簡稱水稻所)種質創新課題組研究發現病斑突變體基因ELL1通過影響葉綠體的發育來調控水稻中活性氧的穩態,進而觸發由活性氧介導的細胞死亡。該項研究豐富了對植物中細胞程序性死亡產生與活性氧穩態之間聯系的理解。相關研究成果在線發表在《植物學報》上。 水稻所副研究員任德勇介紹,細
聯合研究發現調控棉花纖維伸長的新基因
利用基因編輯技術鑒定到影響棉花纖維伸長的GhMAH1基因。中國農科院供圖 棉花是世界上重要的天然纖維作物。陸地棉和海島棉(又稱長絨棉)是棉花的兩個主栽四倍體棉種,陸海種間雜交為棉花纖維長度性狀改良提供重要資源,但關于陸海群體纖維動態伸長的遺傳機理卻鮮有報道。因此,研究棉花纖維快速伸長時期表達基因的
如何利用CRISPRdCas9來研究基因調控
順式調控元件(TRE)和反式調控元件(CRE)一直是人們感興趣的對象,通常利用染色質免疫沉淀(ChIP)和染色質捕獲技術來研究。不過,德克薩斯大學西南醫學中心的研究人員最近開發出一種新方法,結合CRISPR的靶定能力以及生物素-鏈霉親和素的互作優勢來鑒定TRE和CRE。 這種名為CAPTURE
西南大學研究人員發現調控壽命新基因
科技日報訊?(記者雍黎)記者9月9日從西南大學獲悉,該校資源昆蟲高效養殖與利用全國重點實驗室教授代方銀團隊發現了調控壽命的新基因OSER1,并在家蠶、線蟲、果蠅等多物種中進行研究,揭示了其調控機制。作為長壽基因FOXO(叉頭框蛋白O)的靶基因,OSER1對壽命的影響得到人類受試者研究結果支持。相關論
什么是基因表達調控?基因表達調控有什么意義
意義:1.適應環境、維持生長和增殖:生物體賴以生存的外環境是在不斷變化的,為了生存,所有活細胞都必須對外環境變化作出適當反應,調節代謝,以適應環境變化。生物體適應環境、調節代謝的能力與蛋白質分子的生物學功能有關。而蛋白質的水平又受基因表達的調控。2.維持個體發育與分化:多細胞生物調節基因的表達除為適
基因表達的調控
轉錄調控可分為三種主要途徑:1)遺傳調控(轉錄因子與靶標基因的直接相互作用);2)調控轉錄因子與轉錄機制相互作用,3)表觀遺傳調控(影響轉錄的DNA結構的非序列變化)。通過轉錄因子直接調控靶標DNA表達是最簡單和最直接的轉錄調控改變轉錄水平的方法。基因的編碼區周圍通常都具有幾個蛋白質結合位點,具有調
基因調控的介紹
基因表達的主要過程是基因的轉錄和信使核糖核酸(mRNA)的翻譯。基因調控主要發生在三個水平上,即①DNA水平上的調控、轉錄控制和翻譯控制;②微生物通過基因調控可以改變代謝方式以適應環境的變化,這類基因調控一般是短暫的和可逆的;③多細胞生物的基因調控是細胞分化、形態發生和個體發育的基礎,這類調控一
基因調控的簡史
1900年F.迪納特發現在含有乳糖和半乳糖的培養液中培養的酵母菌細胞中有分解半乳糖的酶,但是在葡萄糖的培養液中培養的酵母菌細胞中沒有相應的酶。1930年H.卡爾斯特倫在關于細菌的研究中也發現類似的現象,并把生物細胞中的酶區分為組成酶和適應酶(亦稱誘導酶)兩類,前者是在任何情況下都存在的酶,后者是
研究揭示蓮霧果實成熟發育最重要的調控基因
蓮霧,又名水蓊果,屬桃金娘科蒲桃屬熱帶常綠喬木果樹。廣泛種植在我國廣西、海南、廣東、云南、臺灣等地。蓮霧果實口感脆嫩、味道清甜,水分充足熱量低,富含膳食纖維,具有較高的營養價值。蓮霧作為新興的熱帶水果,因其栽培歷史較短,分布較局限,以致相關的基礎研究較落后。由于缺乏栽培蓮霧基因組序列以及相關遺傳研究
研究發現調控桃樹桃蚜抗性的關鍵候選基因
近日,中國農業科學院鄭州果樹研究所核果類栽培生理創新團隊發現了調控桃樹桃蚜抗性的關鍵候選基因 PpRm3 ,該研究為桃樹抗蚜性狀篩選提供了可靠的分子標記,并為桃樹抗蚜機制的研究提供借鑒。相關研究成果發表在《實驗植物學雜志(Journal of Experimental Botany)》上。 桃
生物學家轉移研究重點-開始關注基因調控
隨著人類和許多其他物種基因組測序工作的完成,生物學家開始將研究重點轉移到調控基因如何開啟和關閉功能基因的表達上,該類研究的進行需要依靠新技術和新工具的發明應用。近期在《自然—方法學》(Nature Methods)雜志上發表的相關文章表明,美國佛羅里達州立大學國家高磁實驗室研究人員與加拿大阿爾伯塔大
甘薯重要性狀的基因劑量調控研究獲突破
廣東省農業科學院作物研究所甘薯研究團隊同合作者,通過成功構建甘薯等位基因劑量變異圖譜,首次揭示了23個關鍵農藝性狀相關的劑量QTL,明確了劑量QTL對性狀變異的貢獻,闡明了等位基因劑量調控參與甘薯性狀改良的遺傳規律。相關成果12月12日發表于《自然-植物》(Nature Plants)。論文共同通訊