葉綠體基因組遺傳信息獲取技術體系建立
記者日前從中科院昆明植物所獲悉,該所種質資源庫多年來致力于葉綠體基因組學研究,并建立了較為完善的葉綠體基因組遺傳信息獲取技術體系。該技術體系解決了葉綠體基因組獲取方法需要大量新鮮材料以及一些物種因個體微小須通過二代測序方法獲取葉綠體基因組的難題。 2012年以來,科研人員利用二代測序技術研究了蘭屬和山茶屬的葉綠體比較基因組學。在此基礎上,利用GenBank現有被子植物葉綠體基因組數據,他們自主設計了新穎的通用引物,結合長片段PCR和二代測序技術,從少量總DNA中快速獲取被子植物葉綠體基因組。 研究人員介紹,該體系將葉綠體基因組測序通量提高了5~10倍,為被子植物葉綠體基因組學研究開辟了新途徑;并進一步揭示基于葉綠體基因組的系統發育基因組學是解決植物系統發育的有效手段。 據介紹,在分子生物學和基因組時代,葉綠體基因組為植物分類、系統發育和物種鑒定等提供了不可或缺的遺傳信息。......閱讀全文
藍藻和葉綠體基因組的比較研究
原核的藍藻和真核植物(包括其他藻類)中的葉綠體,都同樣進行放氧的光合作用,這為人類和整個生物界提供了賴以生存的食物、氧氣、能源和原料。對葉綠體和藍藻的細胞結構和分子生物學特性作分析,證明真核生物的葉綠體可能起源于藍藻祖先的內共生。這使藍藻在20多年來已成為光合作用研究的模式生物。 藍藻基因組的
藍藻和葉綠體基因組的比較研究
原核的藍藻和真核植物(包括其他藻類)中的葉綠體,都同樣進行放氧的光合作用,這為人類和整個生物界提供了賴以生存的食物、氧氣、能源和原料。對葉綠體和藍藻的細胞結構和分子生物學特性作分析,證明真核生物的葉綠體可能起源于藍藻祖先的內共生。這使藍藻在20多年來已成為光合作用研究的模式生物。藍藻基因組的作圖和測
藍藻和葉綠體基因組的比較研究
原核的藍藻和真核植物(包括其他藻類)中的葉綠體,都同樣進行放氧的光合作用,這為人類和整個生物界提供了賴以生存的食物、氧氣、能源和原料。對葉綠體和藍藻的細胞結構和分子生物學特性作分析,證明真核生物的葉綠體可能起源于藍藻祖先的內共生。這使藍藻在20多年來已成為光合作用研究的模式生物。 藍藻基因組的
關于葉綠體基因組--cpDNA的基本介紹
葉綠體基因組在很多方面與線粒體基因組的結構是相似的。葉綠體DNA(cpDNA)是雙鏈環狀,缺乏組蛋白和超螺旋。cpDNA中的GC含量與核DNA及mtDNA有 很大的不同。因此可用CsCl密度梯度離心來分離cpDNA。 每個葉綠體中cpDNA的拷貝數隨著物種的不同而不同。但都是多拷貝的。這些拷貝
藍藻和葉綠體基因組的比較研究
原核的藍藻和真核植物(包括其他藻類)中的葉綠體,都同樣進行放氧的光合作用,這為人類和整個生物界提供了賴以生存的食物、氧氣、能源和原料。對葉綠體和藍藻的細胞結構和分子生物學特性作分析,證明真核生物的葉綠體可能起源于藍藻祖先的內共生。這使藍藻在20多年來已成為光合作用研究的模式生物。藍藻基因組的作圖和測
藍藻和葉綠體基因組的比較研究
藍藻和葉綠體基因組的比較研究原核的藍藻和真核植物(包括其他藻類)中的葉綠體,都同樣進行放氧的光合作用,這為人類和整個生物界提供了賴以生存的食物、氧氣、能源和原料。對葉綠體和藍藻的細胞結構和分子生物學特性作分析,證明真核生物的葉綠體可能起源于藍藻祖先的內共生。這使藍藻在20多年來已成為光合作用研究的模
葉綠體基因組--cpDNA的結構功能特點
葉綠體基因組在很多方面與線粒體基因組的結構是相似的。葉綠體DNA(cpDNA)是雙鏈環狀,缺乏組蛋白和超螺旋。cpDNA中的GC含量與核DNA及mtDNA有 很大的不同。因此可用CsCl密度梯度離心來分離cpDNA。每個葉綠體中cpDNA的拷貝數隨著物種的不同而不同。但都是多拷貝的。這些拷貝位于類核
煙草和水稻葉綠體cpDNA基因組成特點
1.基因組由兩個反向重復序列(IR)和一個短單拷貝序列(short single copy sequence, SSC)及一個長單拷貝序列(long single copy sequence, LSC)組成;2.IRA和IRB長各10-24Kb,編碼相同,方向相反。3.cpDNA啟動子和原核生物的相
武漢植物園在獼猴桃葉綠體基因組研究中獲得新進展
獼猴桃(Actinidia chinensis)是一種富含Vc的經濟水果,目前在全世界越來越受到消費者歡迎。盡管我國學者對中華獼猴桃的全基因組進行了測序,然而對獼猴桃葉綠體基因組并未進行組裝和注釋。 中國科學院武漢植物園獼猴桃資源與育種學科組副研究員姚小洪在研究員黃宏文的指導下,完成了不同倍性
我國學者利用32種樟科植物的葉綠體基因組確定山胡椒屬
樟科山胡椒屬樹種經濟用途廣泛。山胡椒屬多數種類的種子富含脂肪,可供制皂及工業油用,如油料植物山胡椒(Lindera glauca);不少種類富含芳香油,可制香料及藥用,如中草藥三椏烏藥(Lindera obtusiloba);一些種類的木材有香氣,可供家具及文體用品等用,如緬甸著名木材黃金樟的樹
昆明植物所完成六種木本竹子葉綠體基因組全序列的測定
竹亞科(Bambusoideae)隸屬于禾本科(Poaceae),全世界共分布有一千余種。木本竹子因種類數目多,形態性狀復雜多變及多年生一次性開花等原因而成為系統發育學研究難點。隨著新一代測序技術的興起,系統發育基因組學為解決這類困難類群的系統發育關系帶來了曙光。 中國科學院昆明植物研究所李德
武漢植物園在昆欄樹目葉綠體基因組研究方面取得新進展
真雙子葉植物基部類群昆欄樹目(Trochodendrales)僅包含兩個單種屬,水青樹屬(Tetracentron)和昆欄樹屬(Trochodendron),是研究被子植物系統與進化的重要和關鍵類群之一。 與大多數被子植物相比,昆欄樹目植物葉綠體DNA的反向重復區(IRs)包含了更多的基因
武漢植物園等在金豆的葉綠體全基因組解析研究中獲進展
金豆【Fortunella venosa(Champ. ex Benth.) C.C.Huang】是蕓香科中一種多年生常綠灌木。此物種為我國特有,分布區域與金柑【《中國植物志》 Fortunella hindsii (Champ. ex Hook.) Swingle】略有重疊,且范圍狹窄,主要分
葉綠體和線粒體基因組變異檢測獲突破
近日,《公共科學圖書館―綜合》發表了中國農業科學院油料作物研究所博士后曾長立與合作導師伍曉明研究建立的能高通量檢測葉綠體和線粒體基因組遺傳變異的新方法。 據曾長立介紹,葉綠體和線粒體基因組作為植物細胞質基因組,對光合作用、呼吸作用等重要生命過程具有重要意義。 研究葉綠體和線粒體基因組
榕屬葉綠體基因組比較研究獲進展
近年來,葉綠體基因組因基因組小、突變率和重組率低的特點,被廣泛用于植物系統發育、分子進化、譜系地理學的研究。榕屬(Ficus)作為桑科的最大屬,且是熱帶雨林的關鍵物種,而其系統發育關系仍需進一步研究。榕屬物種具有多樣的生態型,體現了對不同生境的高度適應性。盡管近年來關于榕屬葉綠體基因組的研究有所
關于葉綠體基因組的基本特點的介紹
葉綠體基因組在很多方面與線粒體基因組的結構是相似的。葉綠體DNA(cpDNA)是雙鏈環狀,缺乏組蛋白和超螺旋。cpDNA中的GC含量與核DNA及mtDNA有 很大的不同。因此可用CsCl密度梯度離心來分離cpDNA。 每個葉綠體中cpDNA的拷貝數隨著物種的不同而不同。但都是多拷貝的。這些拷貝
植物所揭示葉綠體蛋白轉運馬達新功能
葉綠體是植物進行光合作用的細胞器。正常發育過程受到核基因組和葉綠體基因組在多個層次的協同調控。核質互作的分子機理是葉綠體生物發生的核心科學問題之一。光合膜蛋白復合體的反應中心亞基通常由葉綠體基因編碼,而外周蛋白和天線蛋白由核基因組編碼。這些核基因組編碼的葉綠體蛋白,在細胞質中合成,而后通過葉綠體被膜
科學家揭示德保蘇鐵葉綠體基因組特征
廣西大學植物生理生態與進化課題組在蘇鐵植物的基因組學研究方面取得新進展,首次用蘇鐵的葉綠體全基因組重建了蘇鐵植物的系統進化樹,揭示托葉鐵科為非單系起源,該研究成果近日發表在《科學報告》上。 據介紹,研究人員通過對德保蘇鐵展開二代測序,獲得了德保蘇鐵基因組幾百萬條的短片段,用先進的算法進行組裝,
細胞質雄性不育與葉綠體基因組
CMS 與葉綠體的關系還存在很大的爭議。相對于植物線粒體而言,葉綠體基因組較為保守也較小(120~160 kb),因此對它的認識要比對線粒體深入的多。研究發現植物葉綠體一般分為4個區:兩個反向重復區,大單拷貝區和小單拷貝區。已有多種植物葉綠體的物理圖譜被構建。對高粱的 CMS 系及相應保持系的葉綠體
葉綠體、葉綠素植物光合作用的工作車間
植物體是一個進行光合作用、生產有機物質的綠色工廠,葉片就是車間,葉綠體和葉綠素是把光能轉換成化學能,生產有機物質的能量轉換器,因此葉面積與葉綠素是影響光合產量的又一主要因子。葉面積的測量可以使用便攜式葉面積測定儀來進行操作,而葉綠素含量的測量可以使用葉綠素計是一款專業的測量葉綠素的儀器,下面就來進行
雙生病毒致病蛋白抑制植物葉綠體免疫通路
葉綠體不僅是植物光合作用的重要場所,也在植物免疫中發揮關鍵作用。其中特異性定位于葉綠體的ALD1通過合成免疫信號分子哌啶甲酸 (Pip) 在局部與系統免疫中扮演重要角色。然而,ALD1的穩定性調控機制以及病原體如何與該免疫通路互作尚未被系統解析。近日,《植物學報(英文版)》(Journal of I
細胞化學基礎藍藻和葉綠體基因組的比較研究
原核的藍藻和真核植物(包括其他藻類)中的葉綠體,都同樣進行放氧的光合作用,這為人類和整個生物界提供了賴以生存的食物、氧氣、能源和原料。對葉綠體和藍藻的細胞結構和分子生物學特性作分析,證明真核生物的葉綠體可能起源于藍藻祖先的內共生。這使藍藻在20多年來已成為光合作用研究的模式生物。藍藻基因組的作圖和測
葉綠體基因組遺傳信息獲取技術體系建立
記者日前從中科院昆明植物所獲悉,該所種質資源庫多年來致力于葉綠體基因組學研究,并建立了較為完善的葉綠體基因組遺傳信息獲取技術體系。該技術體系解決了葉綠體基因組獲取方法需要大量新鮮材料以及一些物種因個體微小須通過二代測序方法獲取葉綠體基因組的難題。 2012年以來,科研人員利用二代測序技術研究了
關于藍藻和葉綠體基因組的比較研究介紹
原核的藍藻和真核植物(包括其他藻類)中的葉綠體,都同樣進行放氧的光合作用,這為人類和整個生物界提供了賴以生存的食物、氧氣、能源和原料。對葉綠體和藍藻的細胞結構和分子生物學特性作分析,證明真核生物的葉綠體可能起源于藍藻祖先的內共生。這使藍藻在20多年來已成為光合作用研究的模式生物。 藍藻基因組的
葉綠體基因組樹優化森林大樣地群落構建獲揭示
群落構建是生態學家廣泛關注的核心問題之一。1月2日,記者從中國科學院華南植物園獲悉,該園分子生態學團隊及其合作者,基于中國森林監測網絡(CForBio)平臺,揭示了葉綠體基因組樹優化我國森林大樣地群落構建認知。相關研究發表于《分子生態資源》。 據悉,系統發育群落生
花葉芋葉片關聯分析和葉綠體基因組研究獲進展
廣東省農業科學院環境園藝研究所特色花卉研究室在花葉芋葉片重要觀賞性狀關聯分析和葉綠體基因組研究方面取得新進展。相關研究分別發表于Physiologia Plantarum和Genes。 花葉芋(Caladium)是天南星科花葉芋屬多年生草本植物,被譽為“觀葉皇后”。花葉芋資源豐富,表型性狀變異豐
我國學者闡述重樓葉綠體基因組結構特征與進化
重樓屬植物主要生物活性物質為甾體皂苷,具有消炎、止血、抗腫瘤等功效,是云南白藥、宮血寧等86種著名中成藥的重要原料。重樓屬花葉組包括花葉重樓與祿勸花葉重樓兩種,與屬內其它植物相比,葉具斑塊,植株矮小,果實很小且產量低。花葉組重樓植物含有中國藥典規定的四種重樓皂苷。然而,花葉組重樓生長十分緩慢,對
葉綠體基因組樹優化森林大樣地群落構建獲揭示
群落構建是生態學家廣泛關注的核心問題之一。1月2日,記者從中國科學院華南植物園獲悉,該園分子生態學團隊及其合作者,基于中國森林監測網絡(CForBio)平臺,揭示了葉綠體基因組樹優化我國森林大樣地群落構建認知。相關研究發表于《分子生態資源》。 據悉,系統發育群落生
版納園等自主開發出葉綠體全基因組分析比較基因組程序包
高通量測序(High-throughput sequencing),又稱“下一代”測序(Next-generation sequencing),是近年來在測序技術發展史中具有革命性改變的新突破,能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子同時測序,因此能對物種的轉錄組和基因組進行比以往較細致全貌的
葉綠體亞分級實驗——葉綠體亞分級
實驗材料葉綠體試劑、試劑盒裂解緩沖液儀器、耗材微量離心管小型離心機實驗步驟1. 將含 1 mg 葉綠素的葉綠體懸液吸至一微量離心管中。2. 在小型離心機中 14000 r/min 離心 30 秒鐘,棄去上清。3. 加 1 ml 裂解緩沖液,振蕩,冰浴 5 分鐘。裂解緩沖液:10 mmol/L HEP