3篇Science文章：大規模人類基因表達差異圖譜
在美國國立衛生研究院基因型-組織表達（GTEx）項目的資金資助下，研究人員構建出了一個萬眾期待的新數據資源，它可以幫助確立個體基因組構成之間的差異對于基因活性的影響以及對疾病的貢獻。借助于這一新資源，科學家們可以同時探究許多不同人類組織和細胞的潛在基因組學，并有望為研究和了解人類生物學開辟新途徑。 GTEx的研究人員將他們為期兩年研究的初步結果發布在5月7日《科學》(Science)和其他期刊的多篇研究論文中。這些研究工作使人們重新認識了在不同的組織中基因組變異是如何控制基因的開啟和關閉方式與時間，表達和沉默基因的數量，以及如何使得人們容易罹患癌癥、心臟病和糖尿病一類的疾病的。 在一篇主要的Science文章中，研究人員分析了來自175名個體和43個不同組織類型的1,600多個組織樣本的基因活性讀值。研究人員通過測量RNA來評估了基因的活性。他們致力分析了9種最容易獲得的組織類型的樣本，包括脂肪、心臟、肺、骨骼肌、皮膚、......閱讀全文
研究人員繪出蘋果基因組草圖
一個國際科研小組8月29日在英國《自然—遺傳學》（Nature Genetics）雜志上報告說，他們繪出了蘋果的基因組草圖，這將有助于從基因水平上分析蘋果性狀，培育更多蘋果新品種。 意大利、美國、新西蘭等國研究人員報告說，他們繪出的是廣受人們喜愛的“金冠蘋果”的基因組草圖。結果
癌癥研究人員聯手匯集腫瘤基因組數據
研究人員希望，數據分享將為利用諸如這些腦部腺癌細胞等腫瘤的基因組信息帶來更好的方法。 這是為大型癌癥研究中心的很多病人提供的最新希望：“讓我們測序你的腫瘤，或許我們能將其同擊敗這種惡性疾病的藥物匹配。”不過，現實是基因組分析仍然僅為癌癥病人提供了一小部分幫助。“我們多半時候不知道如何處理這些
研究人員成功構建首個圭亞那柱花草基因組
在國家自然科學基金等項目的資助下，華南農業大學副教授陳曙團隊成功完成首個圭亞那柱花草染色體水平基因組組裝，從基因組、轉錄組及表觀遺傳組多維度解析其抗逆分子機制，為熱帶牧草分子育種與抗逆研究提供關鍵理論支撐與基因資源。相關成果近日發表于《植物雜志》（The Plant Journal）。圭亞那柱花草比
研究人員破譯香蕉“美食蕉”品種香蕉基因組
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512730.shtm廣東省農業科學院研究員易干軍領銜的香蕉遺傳改良團隊與廣西大學教授陳玲玲團隊合作，破譯了香蕉“美食蕉”品種香蕉基因組，首次在國際上組裝染色體級別的異源三倍體香蕉栽培種（AAB）參考基因
研究人員發現：霍亂正改變人類基因組
生命演化到今天，人類似乎已經進入最完美的狀態。我們的基因組是否已經穩定?改變是否還在發生?科學家們一直在尋找答案。一項新研究表明，當代人類也在進化，而引發這種進化的，竟然是霍亂。研究人員發現的證據證明：在霍亂流行的孟加拉國，人們的基因已經找到了對抗霍亂的辦法。這是發生在當代的人類進化案
研究人員首次破譯艾滋病病毒完整基因組
新華網華盛頓8月6日電 美國北卡羅來納大學6日報告說，該校的一個科研小組成功破譯了艾滋病病毒的完整基因組。這對于人類理解艾滋病病毒感染人體的機制，尋找抗“艾”新療法提供了有力幫助。 相關論文發表在6日出版的英國《自然》雜志上。研究小組負責人凱文·威克斯介紹說，艾滋病病毒的遺傳信息由單鏈核糖
研究人員構建人類陰道微生物基因組庫
6月21日，深圳市寶安中醫院（集團）副院長黃鏈莎、轉化醫學中心助理研究員孫文與大連醫科大學副教授鄢秋龍等課題組的最新合作成果發表于《自然—微生物學》。人類女性陰道是一個包括細菌、真菌和病毒在內的復雜微生態系統，各微生物之間是相互制約、相互作用、相互依賴、對立統一的關系，其間的平衡關乎女性生殖健康及胎
研究人員發布最新版樹鼩基因組注釋
樹鼩是一種與實驗大鼠差不多大小的小型哺乳動物，是靈長類的近親。由于其繁殖周期短（約6周），飼養成本低，單胎產仔數較高（每胎2-5只）等特點，在某些方面有望替代非人靈長類用于生物醫學研究和應用。目前，樹鼩已被用于多種感染性疾病模型創建，是研究視覺系統與功能的很好的動物。中國科學院昆明動物研究所研究
日本研究人員首次成功繪制日本人基因組圖譜
據日本共同社報道，日本理化學研究所基因組醫科學研究中心日前通過新一代DNA測序儀成功繪制出首份日本人基因組圖譜。該成果10月24日發表在美國《自然—遺傳學》雜志網絡版上。 DNA一共有4種堿基排列組合，人類大約有30億對堿基對。新一代測序儀可將DNA進行極其精細的切片，對大量切片同時
研究人員完成棗和酸棗單倍型基因組組裝
近日，西北農林科技大學林學院紅棗團隊黃建研究員課題組以我國制干棗主栽品種‘駿棗’和著名“秦藥”代表清澗酸棗為研究材料，整合了PacBio HiFi、ONT ultra-long和Hi-C等多種先進測序技術以及多種組裝策略完成了棗和酸棗T2T gap-free和T2T gap-free單倍型基因組的組
安捷倫授予臨床基因組研究人員Peter－Robinson“思想領袖獎”
分析測試百科網訊 2016年11月29日，安捷倫科技宣布將安捷倫思想領袖獎授予給Peter Robinson, M.D., MSC，以表彰其對臨床基因組學和計算生物學的貢獻。在今年早些時候，中國中醫科學院中藥研究所所長陳士林（詳見本網報道：中藥研究所所長陳士林獲得“安捷倫思想領袖獎”）和癌癥研究
研究人員成功測序蒙特莫朗西酸櫻桃基因組
密歇根州的酸櫻桃產量在全美名列前茅，密歇根州立大學的一個研究小組啟動了一個項目，旨在確定與酸櫻桃樹晚開有關的基因，以滿足不斷變化的氣候的需要。他們首先將晚開的櫻桃樹的DNA序列與一個相關物種--桃子的基因組測序進行了比較。他們首先將開花遲緩的酸櫻桃樹的DNA序列與它們的親戚桃子的基因組序列進行比較。
研究人員觀測到人類基因組新的“暗物質”
人類對基因組變異的認識又向前推進一大步：西安交通大學日前傳出消息，該校葉凱青年科學家工作室團隊與荷蘭、美國、德國的20個科研機構，通過開發新的計算機算法和分析處理流程，分析并報道了在250個健康家庭的基因組中的所有類型變異，其中包括以前從未觀測到的大量復雜型變異，即基因組中的“暗物質”。 據介
研究人員解析人類基因組計劃的贏利奧秘
人類基因組計劃(genome project)為美帶來1萬億美元經濟增長。 美國巴特爾紀念研究所6月12日發布的一份頗具爭議的報告指出，解碼人類基因組項目的經濟收益持續增長。該項目結束10年后，目前其帶來的收益已接近1萬億美元。 1988~2003 年進行的人類基因組計劃(genom
基因組所小鼠組織新轉錄本鑒定研究取得進展
近日，中國科學院北京基因組研究所胡松年項目組利用新一代測序數據，運用生物信息學方法，在小鼠的幾個組織中發現了幾千個新的轉錄本。該研究成果的完成拓寬了轉錄組數據分析的思路，有利于更全面地認識小鼠的轉錄組組成，并進一步補充了其基因組的注釋，相關成果論文在frontiers in genetics
從動物組織提取基因組DNA
實驗概要本實驗以哺乳動物新鮮組織為材料，學習基因組DNA提取的一般方法。實驗原理基因組DNA的提取通常用于構建基因組文庫、Southern雜交(包括RFLP)及PCR分離基因等。利用基因組DNA較長的特性，可以將其與細胞器或質粒等小分子DNA分離。加入一定量的異丙醇或乙醇，基因組的大分子DNA即沉淀
植物組織制備基因組DNA實驗
實驗方法原理?加入一定量的異丙醇或乙醇，基因組的大分子DNA即沉淀形成纖維狀絮團飄浮其中， 可用玻棒將其取出，而小分子DNA則只形成顆粒狀沉淀附于壁上及底部， 從而達到提取的目的。實驗材料?植物組織試劑、試劑盒?抽提緩沖液十二烷基肌氨酸鈉TE異丙醇溴化乙錠氯化銫儀器、耗材?離心機實驗步驟 ? 收取1
植物組織制備基因組DNA實驗
氯化銫法 CTAB法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 加入一定量的異丙醇或乙醇，基因組的大分子DNA即沉淀形成纖維狀絮團飄浮其中， 可用玻棒將其取出，而小分子DNA則
日研究人員制成細繩狀機體組織
日本東京大學一個研究小組報告稱，他們開發出了一種直徑只有約0.1毫米、但是長度達到1米以上的細繩狀機體組織，這一成果有望應用于移植醫療領域。 東京大學生產技術研究所的研究人員在凝膠狀的細管中裝入混合有實驗鼠神經細胞和骨膠原等的溶液，經過一兩周時間的培養后，細胞開始增殖，到了一定階段研究人員
研究人員提出基因組結構變異檢測和分型新方法
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519653.shtm
全球研究人員致力于創造首個合成真核生物基因組
10年前，當遺傳學家Ronald Davis首次提出，他的同事正在嘗試創造人工酵母染色體，并將其放入活細胞時，Jef Boeke并沒有太多想法。Davis就職于美國加州斯坦福大學醫學院，是一個有遠見的人。他提出，實驗室酵母是當時合成生物學領域的下一個發展方向。不過，Boeke并不理
動物組織細胞基因組DNA提取
一、實驗原理真核生物的一切有核細胞（包括培養細胞）都能用來制備基因組 DNA.真核生物的DNA是以染色體的形式存在于細胞核內，因此，制備DNA的原則是既要將DNA與蛋白質、脂類和糖類等分離，又要保持DNA分子的完整。提取DNA的一般過程是將分散好的組織細胞在含SDS（十二烷基硫酸鈉）和蛋白酶K的溶液
動物組織細胞基因組DNA提取
一、實驗原理真核生物的一切有核細胞（包括培養細胞）都能用來制備基因組 DNA。真核生物的DNA是以染色體的形式存在于細胞核內，因此，制備DNA的原則是既要將DNA與蛋白質、脂類和糖類等分離，又要保持DNA分子的完整。提取DNA的一般過程是將分散好的組織細胞在含SDS（十二烷基硫酸鈉）和蛋白酶K的溶液
日本研究人員培養出類胰島組織
日本橫濱市立大學的研究小組日前宣布，他們通過在模擬微重力環境下培養胰腺β細胞，最終制造出具有立體結構的類胰島組織。 研究人員介紹說，如果在培養皿中培養胰腺β細胞，只能形成平面組織，制造胰島素的能力很低，而他們通過旋轉盛有培養液的容器，讓容器內部出現微重力環境，并在這種環境下培養小鼠的胰腺β
研究人員發布全基因組單核苷酸變異數據庫
10月22日，國際學術期刊Genome Biology 以PGG.SNV： understanding the evolutionary and medical implications of human single nucleotide variations in diverse popul
研究人員從從基因組水平揭示食肉目染色體進化規律
染色體進化是物種形成和演化的重要驅動因素。具有顯著核型差異的食肉目動物為染色體進化研究提供了很好的研究素材。雖然前人通過比較染色體涂色法建立了食肉目內許多物種的染色體比較圖譜，但這些研究的分辨率比較低，尚沒有深入到精細的核苷酸水平，也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物種間的共線性區塊、染色體重排以
北京基因組研究所Plant－cell基因組研究新成果
來自中科院北京基因組研究所、荷蘭瓦赫寧根大學和中科院/馬普學會等10多家機構的研究人員組成的一個研究小組，通過測序及分析醉蝶花(Tarenaya hassleriana)的基因組提供了關于十字花科植物繁殖性狀和基因組進化的新認識。相關研究發表在植物學權威期刊The Plant Cell雜志上
GenomeResearch發表基因組研究新發現基因組
多倫多大學的科學家們發現，作為基因組看門人的C2H2-鋅指蛋白（C2H2-ZF）實際上肩負著更加多樣化的職責。這項發表在Genome Research雜志上的研究，有助于我們更準確地解讀個人基因組。C2H2-ZF有大約七百個成員，是規模最大的一種人類蛋白。然而，人們對這些蛋白一直知之甚少。C2H2-
研究揭示環境對人腸道菌群和耐藥基因組影響
華南農業大學、嶺南現代農業科學與技術廣東省實驗室和國家獸醫微生物耐藥性風險評估實驗室劉雅紅教授團隊與中外合作者，發現人體和環境間存在廣泛的菌株和基因交換，而且環境對人腸道菌群的影響可能會持續4~6個月。相關研究3月18日在線發表于《自然—通訊》。 生物圈中的微生物種類眾多，其分布無處不在。同樣
英農業官員抨擊某些反轉基因組織
英國環境、食品和農村事務大臣歐文·佩特森日前表示，一些組織極力反對轉基因農業技術應用于亞非欠發達地區，這種行為是“不道德的”，這可能導致數百萬人由于食物不足而過早死亡。 據英國媒體10月14日報道，佩特森指出，轉基因技術有助于解決糧食供應危機，但一些非政府組織和個人近年來一直反對使用這種技