數據平臺讓水稻更易“讀懂”以水稻為研究對象的數據庫
水稻生物學數據庫眾多、信息量大，但大多是生物學原始數據；國內傳統種質資源數據庫鮮有二次開發功能；國內缺少整合多學科數據的集成性數據庫……如何從海量數據中挖掘有用信息提供給農業科研工作者，一直是個難題。中國水稻研究所鄂志國、王磊、莊杰云等創建了“國家水稻數據中心”（http://www.ricedata.cn/），讓難題迎刃而解。 經過10多年的建設，該平臺已發展成為一個以水稻為研究對象，融貫多學科的綜合性數據庫。其所載內容已被他人引用超過350次，它以網站形式為用戶提供信息，日訪問IP數超過500個，在國內外農學類信息系統中，訪問量名列前茅。 據悉，研究人員開發系譜數，創建中國水稻品種及其系譜數據庫，收錄國內外水稻品種和育種材料等數據近1.5萬份；構建優異稻種資源數據集和大品種指紋數據集，收集優異稻種資源數據共計5379份。 “本數據庫是國內有關水稻品種資料最全，且唯一帶有系譜追溯功能的數據庫。”中國水稻研究所教授鄂志......閱讀全文
數據平臺讓水稻更易“讀懂”－以水稻為研究對象的數據庫
水稻生物學數據庫眾多、信息量大，但大多是生物學原始數據；國內傳統種質資源數據庫鮮有二次開發功能；國內缺少整合多學科數據的集成性數據庫……如何從海量數據中挖掘有用信息提供給農業科研工作者，一直是個難題。中國水稻研究所鄂志國、王磊、莊杰云等創建了“國家水稻數據中心”（http://www.riced
系譜分析
在遺傳病診斷時進行系譜分析有助于區分單基因病和多基因病，以及屬于哪一種遺傳方式；有助于區分某些表型相似的遺傳病以及由于遺傳性而出現的不同遺傳方式。進行系譜分析應注意下列問題：①系譜的系統性、完整性和可靠性。系譜分析時必須有一個系統完整和可靠的系譜，否則可以導致錯誤的結論。完整的系譜應有三代以上有關患
植物生物學研究數據庫
實驗概要植物生物學研究數據庫實驗步驟http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home?英國 Top 植物種的snoRNA基因數據庫。 綜合?http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plant
深圳將建食品安全監管－追溯和信用管理數據庫
9月28日，記者從最新一期政府公報獲悉，深圳市人民政府辦公廳印發的《深圳市信息化發展“十三五”規劃》（以下簡稱《規劃》）顯示，其間深圳將建設統一的食品安全監管與服務信息系統，并將在2020年建成國內基礎設施覆蓋率最廣、綜合服務能力國內領先的寬帶中國示范城市。 據《規劃》顯示， 到2020年，深
基因測定方法系譜分析法
在早期的人類遺傳學研究中，基因所屬染色體的測定一般都通過系譜分析進行。由于女子有兩個X染色體，男子有一個X染色體和一個Y染色體，Y染色體上不存在和X染色體相應的等位基因（也就是說對于?X連鎖基因來講，男子是半合體）。因此男性患者的X連鎖致病基因必然來自母親，以后又必定傳給女兒。這種遺傳方式稱為交叉遺
基因測定方法系譜分析法
非整倍體測交法可以用來測定基因屬于哪一個常染色體。用常染色體隱性突變型純合體（a/a)和野生型二倍體（+/+）雜交，再用子一代雜合體(a/+)和隱性親本回交,在它們的子代中表型是野生型的和表型是突變型的各占50%（見孟德爾定律）。雜交 a/a × +/+↓回交 a/+ × a/a↓回交子代 a/
華中農大建成全球首個水稻基因索引數據庫
華中農業大學作物遺傳改良全國重點實驗室、湖北洪山實驗室張建偉教授課題組近日發表最新研究成果，他們建成世界上首個基于同源基因的水稻泛基因組綜合數據庫——水稻基因索引數據庫。據介紹，這個數據庫如同一本近義詞詞典。在數據庫里，亞洲稻的每一個基因都能輕松找到同源或相近的基因，以及追蹤其演變歷史。目前，數據庫
華中農大建成全球首個水稻基因索引數據庫
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498200.shtm 華中農業大學作物遺傳改良全國重點實驗室、湖北洪山實驗室張建偉教授課題組近日發表最新研究成果，他們建成世界上首個基于同源基因的水稻泛基因組綜合數據庫——水稻基因索引數據庫。 據
基因定位方法介紹系譜分析法
系譜分析法基因定位在早期的人類遺傳學研究中，基因所屬染色體的測定一般都通過系譜分析進行。由于女子有兩個X染色體，男子有一個X染色體和一個Y染色體，Y染色體上不存在和X染色體相應的等位基因（也就是說對于?X連鎖基因來講，男子是半合體）。因此男性患者的X連鎖致病基因必然來自母親，以后又必定傳給女兒。這種
大規模基因比較助力系譜圖研究
Emily和Alan Lemmon希望生物學家可以利用他們的技術繪制系譜圖。 Emily Moriarty Lemmon永遠不會忘記她在讀研究生時，為建立青蛙系譜圖而付出的努力。為了了解不同種類青蛙之間如何彼此相關，她需要評估盡可能多的DNA差異，但是時間和資金大大限制了她可以確定和測試的
分子生物學常用數據庫匯總及推薦
分子生物學主要研究具體生物大分子在某一生物學行為過程中的表達變化、功能和作用方式；主要涉及基因的表達調控、蛋白相互作用、信號分子間的交互對話等。分子生物學實驗常需要我們在具體實驗前對所關注的基因的一些基本信息、可能受哪些因素調控、與哪些分子可能存在潛在的相互作用，可能參與哪些生物學行為等進行一些初步
基因測定的方法系譜分析法介紹
在早期的人類遺傳學研究中，基因所屬染色體的測定一般都通過系譜分析進行。由于女子有兩個X染色體，男子有一個X染色體和一個Y染色體，Y染色體上不存在和X染色體相應的等位基因（也就是說對于?X連鎖基因來講，男子是半合體）。因此男性患者的X連鎖致病基因必然來自母親，以后又必定傳給女兒。這種遺傳方式稱為交叉遺
研究人員建立衰老生物學多組學數據庫
隨著人口老齡化程度加劇，實現健康老齡化是亟待解決的社會問題和科學問題。近年來，隨著衰老相關研究成果的不斷增多和高通量測序技術的日益發展，衰老相關多組學數據層出疊見。然而，目前尚缺乏綜合性的整合衰老生物學多組學數據的數據資源庫。 中國科學院動物研究所劉光慧研究組、曲靜研究組，與北京基因組研究所（
動物所等建立衰老生物學多組學數據庫
隨著人口老齡化程度加劇，實現健康老齡化是目前亟待解決的社會問題和科學問題。近年來，隨著衰老相關研究成果的不斷增多以及高通量測序技術的日益發展，衰老相關多組學數據層出疊見。然而，目前尚缺乏綜合性的整合衰老生物學多組學數據的數據資源庫。 中國科學院動物研究所劉光慧研究組、曲靜研究組，與北京基因組研
科學家合作構建再生生物學多組學數據庫
隨著細胞重編程、基因編輯、合成生物學、高通量測序等技術的快速發展，再生生物學進入前所未有的蓬勃發展時期，助力解決組織替代、功能修復、衰老干預、疾病治療等一系列生命醫學領域的重要科學難題。面對科學數據的爆炸式增長，亟需建立以再生生物學為核心的開放數據庫，以存儲世界范圍內的組學研究數據為基礎，推動再
研究團隊部合作建立衰老生物學多組學數據庫
隨全球人口老齡化程度加劇，實現健康老齡化是目前亟待解決的社會問題和科學問題.近年來，隨衰老相關研究成果不斷增多及高通量測序技術日益發展，衰老相關多組學數據逐漸增多.然而目前，尚缺乏一個綜合性的、整合衰老生物學多組學數據的數據資源庫. 中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）研究員鮑一明研
劉耀光院士等專家打造水稻生物學重磅綜述
近日，華南農業大學生命科學學院劉耀光院士聯合中國科學院遺傳發育所李家洋院士、清華大學謝道昕院士等國內20位專家共同撰寫題為“Rice functional genomics： Decades' efforts and roads ahead” 的水稻生物學研究大綜述，并在線發表于SCIE
基于同源基因簇的水稻泛基因組綜合數據庫建成
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498300.shtm近日，華中農業大學作物遺傳改良全國重點實驗室、湖北洪山實驗室教授張建偉課題組聯合國內外高校與科研機構在《自然—通訊》與《分子植物》連續發表兩篇研究論文。這兩項工作以代表亞洲稻群體結構的
科學家開發完成水稻多組學數據整合和信息共享數據庫
水稻不僅是世界近一半人口的主要糧食作物，同時也是一種重要的模式生物。高通量測序技術的迅速發展促進了水稻組學數據的廣泛積累，使深入研究控制水稻重要農藝性狀、種質資源多樣性以及水稻馴化過程的機制成為可能。為此，研究人員構建了相關的水稻數據庫，主要包括RAP-DB（日本農業生物資源研究所構建的水稻注釋
三校聯合組建玉米水稻小麥生物學協同創新中心
中國農業大學、西北農林科技大學、華中農業大學6月10日在京宣布組建“玉米水稻小麥生物學協同創新中心”，力爭用5到10年，將中心全面建成國際一流的主要糧食作物生物學學術創新高地、良種和新技術研發基地。 據中國農業大學校長柯炳生介紹，中心借國家出臺《高等學校創新能力提升計劃》（2011計
鈣鎂磷肥抑制水稻鎘吸收微生物學機制獲揭示
近日，農業農村部環境保護科研監測所重金屬生態毒理創新團隊首席科學家劉仲齊研究員團隊發現，鈣鎂磷肥對水稻根際土壤微生物群落結構有顯著影響，通過調控菌群驅動的鐵氮耦合循環，顯著抑制水稻對鎘的吸收。相關成果發表于《危險材料雜志》。 土壤鎘污染問題嚴重危害糧食安全生產，施加鈣鎂磷肥能夠有效抑制水稻鎘吸收
中科院上海植物逆境生物學中心發現水稻miRNA新功能
中科院上海植物逆境生物學研究中心朱健康研究組利用STTM技術大規模沉默水稻miRNA，并發現了多種miRNA的新功能，為進一步深化miRNA功能研究和水稻遺傳改良提供了有效資源。相關成果日前發表于美國《國家科學院院刊》。 miRNA是一類在生物體內普遍存在的非編碼、長度約21個核苷酸的小分子R
6月中國學者Nature文章井噴
六月份，國內學者在Nature及其重要子刊上發表文章井噴，不僅在本刊Nature上發表生物類研究成果多篇，而且在Nature重要子刊，比如Nature Genetics(最新影響因子超Cell)上也發表了幾項引入注目的研究成果。 首先上海交通大學醫學院與德克薩斯大學西南醫學中心發表文章
基因組所完成開發RiceWiki數據庫
近日，中國科學院北京基因組研究所章張研究員課題組與北京理工大學、中國林業科學研究院及華中農業大學合作開發完成RiceWiki數據庫。該數據庫是基于維基百科的水稻基因信息平臺，是可編輯且內容公開的公眾注釋系統。研究成果在Nucleic Acids Research雜志發表。 水稻是人類重
種質資源庫管理系統軟件能幫助用戶完善種子管理工作
??? 種質資源庫管理系統軟件是用于種質信息、中間材料信息、設備、設施管理、儲藏管理以及出入庫管理的專用軟件，能夠方便用戶查詢種子信息、錄入種子信息，避免種子信息的混亂，以及流通過程數據的丟失，完善種子管理工作。? ? 種質資源庫管理系統軟件可以對小麥、玉米、水稻等作物種質及中間材料等育種資源進行信
甘肅規劃重要產品追溯體系建設－追溯信息互通共享
甘肅省政府辦公廳18日披露，到2020年，甘肅將基本建成重要產品追溯信息平臺，追溯信息實現互通共享。 據重要產品追溯體系建設的實施意見，甘肅已對群眾生命財產安全和公共安全有重大影響的食用農產品、食品、藥品、農業生產資料、特種設備、危險品、稀土產品等為重點，分類指導，分步實施，推動生產經營企業
重慶將建食品追溯體系
日前，記者從重慶市政府網獲悉：重慶將建重要產品追溯體系。到2020年，重慶市食用農產品、食品、藥品、農業生產資料、特種設備、危險品都將納入重要產品追溯范圍，基本形成追溯數據統一共享交換機制，初步實現有關部門、地區和企業追溯信息的互通共享。 在食用農產品方面，重慶將建立食用農產品質量安全全程追溯
昌平草莓安全可追溯
近期，隨著北京農業嘉年華的舉辦，昌平的草莓迎來了銷售旺季。許多市民在嘉年華園區或在昌平其他景點游玩后，往往會到園區東側的“草莓休閑體驗帶”親自采上幾盒新鮮的草莓，這里有1萬棟草莓溫室大棚供市民進行采摘體驗。 就在不久前，昌平區20家草莓生產基地代表共同宣讀《2016昌平草莓安全生產自律公約》
古老DNA追溯黑死病起源
一項對古代基因組的研究顯示，14世紀在現在的吉爾吉斯斯坦暴發的一場瘟疫中，許多人死于引起鼠疫的耶爾森氏菌菌株，該菌株產生的病原體在幾年后又導致了黑死病。 “這就像找到了所有菌株聚集的地方。”該研究的共同負責人、德國萊比錫馬克斯·普朗克進化人類學研究所的古遺傳學家Johannes Kraus
食品可追溯的作用
A 事后反饋 找出質量問題所在，追責、持續改進； B 監督預防 因為有追溯體系的建立，每個關鍵環節進行監控與記錄，則事后可追查問責到人， 使得壞人不敢肆意為所欲為，一定程度杜絕其壞念頭; C 售后服務 有追溯體系則老百姓購買食品時可進行追溯查詢，判斷食品真假， 既防偽防劣又讓老百姓