昆明動物所等在人類大腦進化遺傳機制研究中取得進展
表觀遺傳修飾的重要性越來越被人所認識，但是表觀遺傳的變化如何對表型的進化產生影響，特別是表觀遺傳調控在人類大腦進化中的作用仍然不是很清楚。美國喬治亞理工大學教授Soojin V.Yi 曾經對人和黑猩猩大腦進行了全基因組甲基化測序，發現了很多物種間甲基化差異區域，但這些甲基化差異區域是否屬于人類特異的甲基化變化仍然不是很清楚。中國科學院昆明動物研究所宿兵實驗室之前對小頭癥基因CENPJ甲基化模式的比較研究表明，該基因在人類大腦中存在人類特異的低甲基化變化，但缺少對全基因組水平人類特異性甲基化變化的認識。 有鑒于此，宿兵實驗室助理研究員石磊以及碩士生虎恩志、張哲與Soojin V.Yi開展合作，對人類、黑猩猩和獼猴3個物種的大腦前額葉進行了大腦全基因組甲基化測序，發現了85個人類特異的甲基化變化區域（DMR）。同時，他們通過對多個靈長類代表物種（人類、黑猩猩、長臂猿、獼猴和食蟹猴）大腦樣本的甲基化重測序對發現的人類特異的DMR......閱讀全文
甲基化測序捕捉三陰性乳腺癌表觀遺傳特性
近日，一篇刊登在國際雜志Nature Communications上的研究報告中，來自澳大利亞悉尼加文醫學研究所（Garvan Institute of Medical Research）的科學家們通過將乳腺癌患者機體的乳腺癌甲基化組同健康個體進行比較從而繪制出了一種新型的基因組圖譜，其可以幫助
表觀遺傳之DNA甲基化（一）
俗話說，龍生龍，鳳生鳳，老鼠的兒子會打洞。?這句話什么意思呢？想必很多人有不同的看法~~?從傳統的社會認知角度看，就是“出生決定論”，一個人的出生是什么樣的，以后就會有什么樣的作為和成就，家庭決定著個人的前途和發展方向。龍鳳階層的人自出生以來便是龍鳳，若是草根階層，也很難上升到龍鳳圈層，即使有這樣的
表觀遺傳之DNA甲基化（二）
二 DNA甲基化?DNA甲基化：DNA甲基化是通過DNA甲基轉移酶在胞嘧啶環的第5個碳原子上共價加成甲基而產生的，從而產生5-甲基胞嘧啶（5-mC），在體細胞中，幾乎僅在二核苷酸CpG的對稱甲基化配對中發現了5-mC，而在胚胎干（ES）細胞中，在非CpG中也觀察到了大量的5-mC。5-mC作為表型和
表觀遺傳學關于DNA甲基化
表觀遺傳學是研究表觀遺傳變異的遺傳學分支學科從目前的研究來看,X 染色體劑量補償、DNA 甲基化、組蛋白密碼、基因組印記、表觀基因組學和人類表觀基因組計劃等問題都是表觀遺傳學研究的內容。其中甲基化是基因組DNA 的一種主要表觀遺傳修飾形式,是調節基因組功能的重要手段。在脊椎動物中,CpG二核
甲基化芯片在表觀遺傳學中的應用
表觀遺傳改變可以定義為基因的遺傳性或獲得性改變，但是這種改變和DNA序列改變無關。DNA甲基化是最為常見的表觀遺傳改變；啟動子或第一外顯子CpG島中的甲基化改變將導致基因表達失活；組蛋白的化學修飾也可以作為表觀遺傳改變；組蛋白發生乙酰化改變的基因通常被開啟。CpG島的異常甲基化是導致基因沉默和過度表
甲基化芯片在表觀遺傳學中的應用
表觀遺傳改變可以定義為基因的遺傳性或獲得性改變，但是這種改變和DNA序列改變無關。DNA甲基化是最為常見的表觀遺傳改變；啟動子或第一外顯子CpG島中的甲基化改變將導致基因表達失活；組蛋白的化學修飾也可以作為表觀遺傳改變；組蛋白發生乙酰化改變的基因通常被開啟。 CpG島的異常甲基化是導致基
表觀遺傳研究熱點：RNA－甲基化（m6A）研究
隨著表觀遺傳學研究的不斷深入，組蛋白修飾（甲基化，乙酰化，磷酸化…）和 DNA 甲基化修飾相關的高水平研究成果如雨后春筍般涌現，遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊雜志。在分子生物學的中心法則中，遺傳信息從 DNA、RNA 流向蛋白。基因組 DNA 和組蛋白上都存
表觀遺傳研究熱點：RNA－甲基化（m6A）研究
隨著表觀遺傳學研究的不斷深入，組蛋白修飾（甲基化，乙酰化，磷酸化…）和?DNA?甲基化修飾相關的高水平研究成果如雨后春筍般涌現，遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊雜志。在分子生物學的中心法則中，遺傳信息從 DNA、RNA 流向蛋白。基因組 DNA 和組蛋白上都存在可逆的表觀遺
DNA甲基化參與調控大豆等表觀遺傳研究新進展
大豆胞囊線蟲（Soybean cyst nematode, SCN； Heteroderaglycines）病是引起大豆減產的病害之一，研究大豆-線蟲互作機制對提出新的病害防控策略、培育抗胞囊線蟲病的大豆新品種具有重要意義。DNA甲基化（DNA methlation）是一種表觀遺傳標記，在植物生
多項表觀遺傳研究成果被質疑：甲基化的真實作用
本周來自瑞士和美國的研究人員指出，目前一般認為DNA甲基化之間的差異會決定社會性昆蟲是成為繁殖蟻（也就是蟻后），還是工蟻的這種觀點并不可靠，他們認為DNA甲基化作用并未得到已有數據的充分支持。這一研究成果公布在Current Biology雜志上。 “這一發現表明，并沒有證據證明甲基化會造成兩
新型納米孔器件有望用于表觀遺傳學快捷測序
新華社布魯塞爾５月９日電（記者潘革平）比利時校際微電子中心（ＩＭＥＣ）９日發表公報說，該中心成功開發出一種能直接讀取單分子ＤＮＡ（脫氧核糖核酸）堿基的新型光學納米孔器件，有望用于遺傳學研究快捷測序。 據介紹，新型器件結合了表面增強拉曼光譜和納米孔流體技術，能以超高分辨率，實現無標記檢測ＤＮ
新型納米孔器件有望用于表觀遺傳學快捷測序
比利時校際微電子中心（ＩＭＥＣ）９日發表公報說，該中心成功開發出一種能直接讀取單分子ＤＮＡ（脫氧核糖核酸）堿基的新型光學納米孔器件，有望用于遺傳學研究快捷測序。 據介紹，新型器件結合了表面增強拉曼光譜和納米孔流體技術，能以超高分辨率，實現無標記檢測ＤＮＡ中的遺傳編碼以及表觀遺傳變異。研究近期發
RNA甲基化（m6A）研究：最前沿表觀遺傳研究熱點（二）
那么如何檢測RNA的甲基化水平呢？Epigentek推出市場上唯一一款RNA甲基化定量檢測試劑盒：·EpiQuik M6A RNA Methylation Quantification Kit（比色法）是一組優化的、完整的的試劑組合，可以通過比色的方法定量RNA中N6-甲基腺嘌呤（m6A）。它可以直
RNA甲基化（m6A）研究：最前沿表觀遺傳研究熱點（一）
隨著表觀遺傳學研究的不斷深入，組蛋白修飾（甲基化，乙酰化，磷酸化…）和DNA甲基化修飾相關的高水平研究成果如雨后春筍般涌現，遍布Nature, Cell和Science等期刊雜志。在分子生物學的中心法則中，遺傳信息從DNA、RNA流向蛋白。基因組DNA和組蛋白上都存在可逆的表觀遺傳學修飾，這
什么是表觀遺傳？
表觀遺傳學是研究基因的核苷酸序列不發生改變的情況下，基因表達的可遺傳的變化的一門遺傳學分支學科。表觀遺傳的現象很多，已知的有DNA甲基化（DNA methylation），基因組印記（genomic imprinting），母體效應（maternal effects），基因沉默（gene silen
PacBio三代單分子測序獲表觀遺傳研究新發現
來自福建農林大學海峽聯合研究院林學中心等處的研究人員發表了題為“Comprehensive profiling of rhizome-associated alternative splicing and alternative polyadenylation in moso bamboo (P
表觀遺傳學測序技術助力三陰性乳腺癌患者分層
一組澳大利亞的研究員使用甲基化特異性測序技術發現了三陰性乳腺癌中某些甲基化的差異，這些差異可能具有預后價值。 如果患者缺乏雌激素、孕激素受體，并且HER2基因沒有過表達或者擴增，則認為乳腺癌是“三陰性”的。具有三陰性乳腺癌（或TNBC）的患者，可以分成兩部分，即癌癥進展非常迅速或者進展非常緩慢
RNA甲基化測序
1、NSUN2影響m5C在HEK293細胞中整體分布情況NSUN2被報道是RNA甲基轉移酶，能使tRNAs和mRNA發生m5C甲基化修飾。為了探究NSUN2對HEK293細胞mRNA m5C甲基化修飾的影響。作者利用CRISP/Cas9技術敲減NSUN2（NSUN2-/-HEK293細胞）后進行
表觀遺傳研究指南（二）
今年九月，對于基因組研究者們來說是一個具有紀念意義的月份，因為美國人類基因組研究院(NHGRI)資助的ENCODE項目在Nature，Genome Biology，Genome Research等雜志上公布了三十多份論文，還有在Science，Cell，以及the Journal of Bi
表觀遺傳學修飾
組蛋白修飾 表觀遺傳學是指表觀遺傳學改變 (DNA 甲基化、組蛋白修飾和非編碼 RNA 如 miRNA) 對 表觀基因組基因表達的調節，這種調節不依賴基因序列的改變且可遺傳表觀。因素如 DNA 甲基化、組蛋白修飾和 miRNA 是對環境刺激因素變化的反映，這些表觀遺傳學因素相互作用以調節基因
什么是表觀遺傳調節？
中文名稱表觀遺傳調節英文名稱epigenetic regulation定 ?義與DNA排列順序的變化無關的,調節基因表達的頻率、速度或者表達度的過程。如DNA甲基化、組蛋白修飾等。這種調節不能通過種系或生殖細胞傳遞,但可通過細胞分裂傳給子代,在靜止細胞的細胞質中也能穩定地自我繁殖。這種調節的失誤或減
甲基化與lncRNA：表觀遺傳學與轉錄組學研究的完美結合
2017年國自然申請的熱點什么？circRNA，lncRNA，外泌體。除了這些大家耳熟能詳的香饃饃之外，現在很多小伙伴們開始了新的玩法，通過多平臺聯用，將不同層面的東西結合起來，比如，表觀遺傳與非編碼RNA的結合，就是一個很好的例證。 研究背景 肺癌是一種常見的惡性腫瘤，特別在中國，
甲基化與lncRNA：表觀遺傳學與轉錄組學研究的完美結合
2017年國自然申請的熱點什么？circRNA，lncRNA，外泌體。除了這些大家耳熟能詳的香饃饃之外，現在很多小伙伴們開始了新的玩法，通過多平臺聯用，將不同層面的東西結合起來，比如，表觀遺傳與非編碼RNA的結合，就是一個很好的例證。研究背景肺癌是一種常見的惡性腫瘤，特別在中國，由于環境的污染，肺癌
表觀遺傳學分子生物學軟件——DNA甲基化分析工具
第一類：基于引物設計功能的軟件。此類軟件主要是針對重亞硫酸鹽序列進行甲基化特異性PCR（methylation-specific PCR, MS-PCR or MSP）和重亞硫酸鹽測序（bisulfite sequencing, BS）引物的設計。由于重亞酸鹽修飾的特殊性，使常規的分子生物學
羅氏甲基化捕獲試劑創新甲基化研究方法
自2004年美國批準Vidaza (azacitidine)可用于血液疾病( 如MDS)的治療以來，通過改變致病基因的表觀遺傳學特征進行疾病治療的方法，為人們帶來了疾病的新治療策略。然而，由于表觀遺傳檢測方法的局限，要確定基因的堿基在何處以何種程度被甲基化一直以來困擾著研究者，從而難以確定基
Nature發表表觀遺傳學重要發現－決定性別的RNA甲基化
N6-methyladenosine（m6A）是真核生物mRNA和長非編碼RNA上最普遍的一種RNA修飾，介導了超過80%的RNA堿基甲基化。人們已經陸續鑒定了m6A所需的“讀”、“寫”和“擦除”蛋白，但對其生物學功能還知之甚少。 伯明翰大學的科學家們在Nature雜志上發表文章，揭示了m6A
Nature發表表觀遺傳學重要發現決定性別的RNA甲基化
N6-methyladenosine（m6A）是真核生物mRNA和長非編碼RNA上最普遍的一種RNA修飾，介導了超過80%的RNA堿基甲基化。人們已經陸續鑒定了m6A所需的“讀”、“寫”和“擦除”蛋白，但對其生物學功能還知之甚少。伯明翰大學的科學家們在Nature雜志上發表文章，揭示了m6A在Sxl
Nature－Methods發表單細胞重亞硫酸鹽測序技術
Babraham研究所和Wellcome Trust Sanger研究所的科學家們開發了一個單細胞表觀遺傳學檢測技術，并將其發表在七月二十日的Nature Methods雜志上。這一成果可以幫助人們解讀，環境怎樣影響人類的發育和遺傳性狀。 “表觀遺傳學標志”是指DNA上的化學或蛋白標簽，它們在
揭示全基因組DNA甲基化、半甲基化與遺傳突變的新方法
5月31日，中國科學院北京生命科學研究院研究員孫中生團隊與北京大學腫瘤醫院合作，在Briefings in Bioinformatics上，發表了題為A new approach to decode DNA methylome and genomic variants simultaneousl
Nature發布表觀遺傳重要發現
營養繁殖是無性繁殖的一種形式，常用于商業化大規模生產園林植物和樹，因為它能夠實現高性能、基因相同個體的快速繁殖。然而對于某些物種，營養繁殖有著嚴苛的要求，需要技術先進的無菌培養來生成可以發育為苗木的克隆胚胎。而有一部分以這種方式繁殖的植物會因遺傳變異或表觀遺傳改變顯示出發育異常。 在9月9日的