outhern印跡及基因組DNA雜交技術實驗——Southern印跡
實驗方法原理硝酸纖維膜或尼龍濾膜對單鏈DNA的吸附能力很強,當電泳后凝膠經過DNA變性處理,覆以上述濾膜,再于其上方壓上多層干燥的吸水紙,借助它對深鹽溶液的上吸作用,凝膠上的單鏈DNA將轉移到濾膜上。轉移是原位的,即DNA片段的位置保持不變。轉移結束后,經過80℃烘烤的DNA,將原位地固定于膜上。實驗材料基因組 DNA試劑、試劑盒限制性緩沖液儀器、耗材瓊脂糖凝膠實驗步驟1. 7~20 μg 基因組 DNA 稀釋到 500 μl 合適的限制性緩沖液中。4℃ 過夜。2. 每管加 10~20 單位限制性酶。孵育 4~6 小時。10 μl 消化液在小瓊脂糖凝膠上電泳檢測消化的程度。如果需要,就在消化液中補加酶。3. 用乙醇沉淀消化物:加 50 μl 3 mol/L NaOAc,混勻。然后加 1 ml 100 % 乙醇并混勻,在 -20℃ 至少放 30 分鐘;或在干冰中放 10 分鐘。離心 20 分鐘(在離心機中定好管子的方向,這樣你知道......閱讀全文
關于核酸的雜交介紹
具有互補序列的不同來源的單鏈核酸分子,按堿基配對原則結合在一起稱為核酸雜交(hybridization)。雜交可發生在DNA-DNA、RNA-RNA和DNA-RNA之間。雜交是分子生物學研究中常用的技術之一,利用它可以分析基因組織的結構,定位和基因表達等,常用的雜交方法有Southern印跡法,
核酸雜交的概念和發生條件
具有互補序列的不同來源的單鏈核酸分子,按堿基配對原則結合在一起稱為核酸雜交(hybridization)。雜交可發生在DNA-DNA、RNA-RNA和DNA-RNA之間。雜交是分子生物學研究中常用的技術之一,利用它可以分析基因組織的結構,定位和基因表達等,常用的雜交方法有Southern印跡法,No
Northern印跡和總RNA雜交實驗——雜交和放射自顯影
實驗材料mRNA試劑、試劑盒甲酰胺SSPEDenhardt 試劑SDS儀器、耗材濾膜實驗步驟1. 濾膜進行 1~2 小時預雜交。在 42℃:50% 甲酰胺5x SSPE2 x Denhardt 試劑0.1% SDS或者在 68℃:6x SSC2x Denhardt 試劑0.1% SDS2. 把已變性
如何選擇蛋白印跡實驗中的印跡膜
硝酸纖維素膜(NC膜)是蛋白和核酸雜交zui常用的印跡膜,是蛋白印跡實驗的標準固相支持物。在低離子轉移緩沖液的環境下,大多數帶負電荷的蛋白質會與硝酸纖維素膜發生疏水作用而高親和力的結合在一起,雖然這其中的機制還不是十分清楚,但由于硝酸纖維素膜的這個特性,而且易于封閉非特異性結合,從而得到了廣泛的
如何選擇蛋白印跡實驗中的印跡膜?
硝酸纖維素膜(NC膜)是蛋白和核酸雜交最常用的印跡膜,是蛋白印跡實驗的標準固相支持物。在低離子轉移緩沖液的環境下,大多數帶負電荷的蛋白質會與硝酸纖維素膜發生疏水作用而高親和力的結合在一起,雖然這其中的機制還不是十分清楚,但由于硝酸纖維素膜的這個特性,而且易于封閉非特異性結合,從而得到了廣泛的應用。目
DNA印跡法實驗步驟和注意事項
注意:操作戴手套。凝膠處理1)凝膠照相后切去包括標記帶在內的多余部分。將凝膠的一角(·點第一個樣品的一側)切去作為標記 以便于定位。精確測量凝膠大小然后將凝膠放入一個方形瓷盤中 。2)變性:將凝膠浸泡于適量的堿變性液中,室溫下變性30分鐘。期間更換變性液一次,不斷地輕輕搖動。如果先進行酸變性酸變性,
DNA印跡法實驗步驟轉移的相關介紹
1)取一個較大的方形瓷盤,放一塊玻璃板于盤上,盤內加轉移液(6×SSC或10×SSC)使液面距離玻璃底面約1,2cm,玻璃板表面蓋兩張預先用轉移液浸潤的Whatman 3M ·濾紙(也可用新華濾紙),濾紙兩端浸入SSC轉移液中,用一玻璃棒將濾紙壓平,濾紙與玻璃板間不得有氣泡, 2)將瓊脂糖凝膠
DNA印跡法的實驗的注意事項
1,操作時戴手套,嚴禁用手接觸凝膠和硝酸纖維素膜,2,轉移時,濾紙與膜、膜與凝膠、凝膠與濾紙橋之間均不能有氣泡,否則影響DNA轉移,3,凝膠易碎,操作時應格外小心,4,硝酸纖維素膜上的DNA固定非常重要,固定不好時DNA·在雜交過程中會脫落下來,烤膜溫度過高,膜脆性增加,易碎,5,大片段DNA轉移效
Westernblot法的起源和發展
生物大分子印跡法實際上是凝膠電泳技術、固定化技術及分子親和技術三者融為一體的綜合性技術,其核心在于把凝膠電泳已分離的區帶轉移并印跡于固定化紙上。生物大分子印跡法始創于1975年,內蘇格蘭愛丁堡大學E.M.Southern首先提出。他將限制酶切后的DNA片段先進行瓊脂糖凝膠電泳,把一張硝酸纖維素紙放在
Southern雜交實驗2
③轉移按凝膠的大小剪裁NC膜或尼龍膜并剪去一角作為標記,水浸濕后,浸入轉移液中5min。剪一張比膜稍寬的長條Whatman 3mm濾紙作為鹽橋,再按凝膠的尺寸剪3-5張濾紙和大量的紙巾備用。按下圖所示進行轉移。(轉移過程一般需要8-24hr,每隔數hr換掉已經濕掉的紙巾。轉移液用20×SSC。注
Southern雜交實驗1
[實驗原理] Southern 雜交是分子生物學的經典實驗方法。其基本原理是將待檢測的DNA樣品固定在固相載體上,與標記的核酸探針進行雜交,在與探針有同源序列的固相DNA的位置上顯示出雜交信號。通過Southern雜交可以判斷被檢測的DNA樣品中是否有與探針同源的片段以及該片段的長度。
Northern雜交試驗指導手冊(6)-Northern-印跡雜交
A. 探針準備DIG標記的RNA探針與DNA探針相比,顯示較強的雜交信號和較地的非特異性背景,因此,只要可能選用RNA探針可以比DNA探針獲得更好的雜交結果。如果必須使用DNA探針,建議使用高SDS雜交緩沖液或DIG Easy Hyb以減少背景。在正式雜交試驗之前,優化雜交探針濃度是避免顏色背景所必
DNA、RNA斑點雜交
實驗概要將RNA ?或DNA 變性后直接點樣于硝酸纖維素膜上,同探針進行雜交,用于基因組中特定基因及其表達的定性及定量研究,稱為斑點印跡。與Southern ?及Nouthern ?印跡法相比,其優點是簡單、迅速,可在一張膜上同時進行多個樣品的檢測,特別是對于核酸粗提樣晶的檢測。缺點是不能鑒定所測基
Northern-印跡分析實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 瓊脂糖凝膠 菌落裂解緩沖液 蒸餾水 甲醛 甲酰胺預雜交 雜交液 HotPrime cDNA Labeling Kit
Northern-印跡分析實驗
為了確認所選擇 cDNA 確實是差異表達的,建議使用 Northern 印跡分析,而不要用其他的確認技術,比如反向 Northern 雜交(Zhangetal.1996) 或定量 RT-PCR。本實驗來源于 PCR 實驗指南(第二版),作者:種康,瞿禮嘉。試劑、試劑盒瓊脂糖凝膠菌落裂解緩沖液蒸餾水甲
Northern-印跡分析實驗
試劑、試劑盒 瓊脂糖凝膠菌落裂解緩沖液蒸餾水甲醛甲酰胺預雜交 雜交液HotPrime cDNA Labeling Kit礦物油MOPS 緩沖液MOPS乙酸鈉EDTAPCR 緩沖液SSCNaClSDSNaClNaH2PO4[a-32P]dATPLgh Rgh 引物鮭魚精 DNATaq DNA
Southern-雜交技術1
Southern技術是指以Southern名字命名的DNA轉移雜交技術。它可用于基因組特定DNA序列的定位,可以測定相關片段的同源性、可以從c庫、基因組文庫中篩選完整基因等。用一種或多種限制性內切酶對基因組DNA加以切割,通過瓊脂糖凝膠電泳分離酶切片段,隨后,使DNA在原位變性,并從凝膠轉移至固相膜
Southern-雜交技術2
三:操作(一)轉膜1電泳2切膠 在紫外下,切取凝膠有條帶部分3脫嘌啉0.25NHCL浸泡凝膠10分鐘,蒸餾水洗膠(大于15kb的DNA片段轉移時做此步驟)4變性,變性液(0.5MNaOH、1.5MNaCL)浸泡凝膠2次,每次15分鐘,蒸餾水洗膠5中和,中和液(0.5Mtris-HCL,pH7.0、3
基本方案1-線粒體-DNA-的篩查用-Southern-blot-研究基因重排
實驗材料骨骼或白細胞的基因組 DNA試劑、試劑盒10 X restriction 緩沖液BamHI 和 EcoRV 限制性內切核酸酶NaCl 溶液乙醇6 X 膠聚蔗糖 oading 緩沖液瓊脂糖膠DNA 分子質量標記1 X TBE 緩沖液乙碘氯苯丁酯溶液雜交液2 X SSC(現配)精液 DNA儀器、
Northern雜交、Southern雜交和Western雜交有什么區別
區別:研究的對象不同。southern主要的對象是DNA,northern研究的對象是RNA,而western研究的對象為蛋白質。1、Southern印跡雜交是進行基因組DNA特定序列定位的通用方法。一般利用瓊脂糖凝膠電泳分離經限制性內切酶消化的DNA片段,將膠上的DNA變性并在原位將單鏈DNA片段
Northern雜交、Southern雜交和Western雜交有什么區別
區別:研究的對象不同。southern主要的對象是DNA,northern研究的對象是RNA,而western研究的對象為蛋白質。1、Southern印跡雜交是進行基因組DNA特定序列定位的通用方法。一般利用瓊脂糖凝膠電泳分離經限制性內切酶消化的DNA片段,將膠上的DNA變性并在原位將單鏈DNA片段
Northern雜交、Southern雜交和Western雜交有什么區別
區別:研究的對象不同。southern主要的對象是DNA,northern研究的對象是RNA,而western研究的對象為蛋白質。1、Southern印跡雜交是進行基因組DNA特定序列定位的通用方法。一般利用瓊脂糖凝膠電泳分離經限制性內切酶消化的DNA片段,將膠上的DNA變性并在原位將單鏈DNA片段
什么是分子印跡技術
第八章 分子印跡技術將各種生物大分子從凝膠轉移到一種固定基質上的過程稱為印跡技術(blotting)。Southern在1975年首先提出了分子印漬的概念。他將瓊脂糖凝膠電泳分離的 DNA片段在凝膠中進行變性使其成為單鏈,然后將一張硝酸纖維素(nitrocellulose, NC)膜放在凝膠上,上面
DNA印跡法所需儀器試劑
儀器1電熱真空干燥箱?2硝酸纖維素濾膜或尼龍膜?3大方瓷盤、帶蓋方盤、玻璃板?4濾紙、吸水紙、保鮮膜、蠟膜Parafilm、一次性手套等?5刀片、刻度吸管、鑷子、剪刀、lkg重物?材料電泳分離DNA的瓊脂糖凝膠試劑1 酸變性液:0.25mol/L HCl, 用分析純的鹽酸12Mol/L稀釋?2堿變性
分子印跡技術和基本介紹
將各種生物大分子從凝膠轉移到一種固定基質上的過程稱為印跡技術(blotting)。 Southern在1975年首先提出了分子印漬的概念。他將瓊脂糖凝膠電泳分離的 DNA片段在凝膠中進行變性使其成為單鏈,然后將一張硝酸纖維素(nitrocellulose, NC)膜放在凝膠上,上面放上吸水紙巾
分子印跡技術的概況
Southern在1975年首先提出了分子印漬的概念。他將瓊脂糖凝膠電泳分離的 DNA片段在凝膠中進行變性使其成為單鏈,然后將一張硝酸纖維素(nitrocellulose, NC)膜放在凝膠上,上面放上吸水紙巾,利用毛細管作用原理使凝膠中的DNA片段轉移到 NC膜上,使之成為固相化分子。載有DN
分子雜交方式介紹
1、固相雜交將參加反應的一條核酸鏈先固定在固體支持物上,一條反應核酸游離在溶液中。固體支持物有硝酸纖維素濾膜、尼龍膜、乳膠顆粒、磁珠和微孔板等。由于固相雜交后,未雜交的游離片段可容易地漂洗除去,膜上留下的雜交物容易檢測和能防止靶DNA自我復性等優點,所以最為常用。常用的固相雜交類型有:菌落原位雜交、
分子雜交方式介紹
1、固相雜交將參加反應的一條核酸鏈先固定在固體支持物上,一條反應核酸游離在溶液中。固體支持物有硝酸纖維素濾膜、尼龍膜、乳膠顆粒、磁珠和微孔板等。由于固相雜交后,未雜交的游離片段可容易地漂洗除去,膜上留下的雜交物容易檢測和能防止靶DNA自我復性等優點,所以最為常用。常用的固相雜交類型有:菌落原位雜交、
分子雜交的方式介紹
1、固相雜交將參加反應的一條核酸鏈先固定在固體支持物上,一條反應核酸游離在溶液中。固體支持物有硝酸纖維素濾膜、尼龍膜、乳膠顆粒、磁珠和微孔板等。由于固相雜交后,未雜交的游離片段可容易地漂洗除去,膜上留下的雜交物容易檢測和能防止靶DNA自我復性等優點,所以最為常用。常用的固相雜交類型有:菌落原位雜交、
基因組印跡的分子機理
從目前研究結果來看,基因印跡的發生主要有以下兩種機理: 一方面,研究發現,基因組印跡的分子機理與印跡基因DNA中胞嘧啶甲基化尤其是CpG島的甲基化密切相關,胞嘧啶甲基化是DNA的一種共價修飾。另外還有特殊的染色質結構和反義轉錄產物等可能都是基因印跡產生和維持的重要因素。 基因印跡中,卵子和精