研究揭示RNA甲基化調控Rloop形成及轉錄終止機制
R-loop是一種由RNA:DNA雜合鏈和單鏈DNA組成的特殊核酸結構,在原核和真核生物的基因組中分布廣泛且普遍存在。R-loop在很多關鍵的生物學過程中發揮重要功能,包括染色質修飾、轉錄調控、DNA損傷修復以及基因組穩定性等,但其如何被精確調控的機制尚不清楚。m6A修飾作為信使RNA上豐度最高的修飾類型,廣泛參與哺乳動物的發育、免疫、干細胞更新、脂肪分化以及腫瘤生成和轉移等生命過程。然而,目前尚不清楚m6A是否能作為R-loop中RNA組分的本源特征來調控R-loop水平,進而發揮各種生物學功能。 中國科學院北京基因組研究所楊運桂、任捷與清華大學生科院孫前文團隊合作研究,發現m6A能穩定R-loop的形成,進而調控基因轉錄的有效終止。這一成果以m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination 為題于10月12日在線發表于《細胞研究》......閱讀全文
研究揭示RNA甲基化調控Rloop形成及轉錄終止機制
R-loop是一種由RNA:DNA雜合鏈和單鏈DNA組成的特殊核酸結構,在原核和真核生物的基因組中分布廣泛且普遍存在。R-loop在很多關鍵的生物學過程中發揮重要功能,包括染色質修飾、轉錄調控、DNA損傷修復以及基因組穩定性等,但其如何被精確調控的機制尚不清楚。m6A修飾作為信使RNA上豐度最高
利用ssDRIPseqRNA揭示甲基化調控Rloop形成及轉錄終止機制
R-loop是一種由RNA:DNA雜合鏈和單鏈DNA組成的特殊核酸結構,在原核和真核生物的基因組中分布廣泛且普遍存在。R-loop在很多關鍵的生物學過程中發揮重要功能,包括染色質修飾、轉錄調控、DNA損傷修復以及基因組穩定性等,但其如何被精確調控的機制尚不清楚。m6A修飾作為信使RNA上豐度最高
RNA甲基化調控基因出核新機制
中國科學院北京基因組研究所精準基因組醫學重點實驗室及遺傳與發育協同創新中心楊運桂研究組和鄭州大學第一附屬醫院生殖與遺傳專科醫院孫瑩璞研究組、中國科學院生態環境研究中心汪海林研究組合作研究,揭示了m5C(5-甲基胞嘧啶)修飾在mRNA的分布圖譜規律及其對調控mRNA出核作用新機制。該研究成果以5-
Nature-Plants文章:精準高通量檢測Rloop分布的新方法
來自清華大學生科院,清華-北大生命科學聯合中心的研究人員發表了題為“The R-loop is a common chromatin feature of the Arabidopsis genome”的文章,首次報道了精準、高效、高通量檢測R-loop的方法,并利用此方法首次揭示模式植物擬南芥
研究發現RNA甲基化調控果實成熟的作用機制
8月7日,《國家科學評論》(National Science Review)在線發表了中國科學院上海營養與健康研究所——馬普計算生物學研究所徐書華團隊的研究成果“Prioritizing natural selection signals from the deep-sequencing gen
植物所解析RNA甲基化調控果實成熟的作用機制
DNA甲基化(5mC)和RNA甲基化(m6A)是兩種重要的核酸修飾,在基因表達調控中發揮重要作用并參與諸多生物學過程。然而,這兩種核酸修飾之間是否存在內在關聯性卻不清楚。近日,中國科學院植物研究所秦國政研究組和田世平研究組合作,揭示了DNA甲基化可通過調節m6A去甲基化酶基因表達的方式影響番茄果
RNA甲基化研究
近期華人科學家辛辛那提大學陳建軍教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修飾在正常和惡性造血過程中的重要作用,表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信號軸在髓系分化以及白血病發生過程中的作用。該研究于2018年1月發表在干細胞頂級期刊《Cell Steam Cell》(影響因子:
RNA甲基化測序
1、NSUN2影響m5C在HEK293細胞中整體分布情況NSUN2被報道是RNA甲基轉移酶,能使tRNAs和mRNA發生m5C甲基化修飾。為了探究NSUN2對HEK293細胞mRNA m5C甲基化修飾的影響。作者利用CRISP/Cas9技術敲減NSUN2(NSUN2-/-HEK293細胞)后進行
我國首次發現RNA甲基化修飾可調控脊椎動物配子成熟
我國科研人員在國際上首次發現脊椎動物的配子成熟需要甲基轉移酶mettl3催化的m6A甲基化修飾,從而揭開了該甲基化修飾可調控脊椎動物配子成熟這一此前尚未為人所知的秘密。(2018(第二屆)模式動物與重大疾病動物模型研究與應用研討會) 記者13日從中國科學院水生生物研究所了解到,該所科研人員以模
研究揭示RNA甲基化調控實體瘤膀胱癌發生機制
m5C修飾是mRNA上分布廣泛的堿基修飾形式之一,但對于進入細胞質內的含有m5C修飾的mRNA的命運決定及其在生理和病理中的調控作用目前尚不清楚。 中國科學院北京基因組研究所楊運桂團隊聯合中山大學腫瘤醫院周芳堅團隊、謝丹團隊和中科院生物化學與細胞生物學研究所黃旲團隊合作研究,發現m5C通過細胞
北京基因組所揭示RNA甲基化調控基因剪接機制
中國科學院北京基因組研究所精準基因組醫學重點實驗室及遺傳與發育協同創新中心楊運桂課題組在研究m6A甲基化修飾調節mRNA選擇性剪接規律過程中,發現了讀碼器YTHDC1通過招募前體mRNA剪接因子SRSF3同時抑制剪接因子SRSF10與RNA的結合,促進外顯子被保留的分子機制。該研究結果于2016
同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平
RNA甲基化作為云序生物的主打科研產品,已經幫助多個研究團隊展開了RNA甲基化研究。作為國內RNA甲基化研究的領跑者,云序生物是國內RNA甲基化10分文章發表的成熟服務商,首發推出了非編碼RNA甲基化測序研究,首發推出了超微量RNA甲基化測序技術,首發推出RNA甲基化研究一站式系統性解決方案,云
快速檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平
占領C位!云序生物解析如何做到快速同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶&RNA甲基化水平 RNA甲基化作為云序生物的主打科研產品,已經幫助多個研究團隊展開了RNA甲基化研究。作為國內RNA甲基化研究的領跑者,云序生物是國內RNA甲基化10分文章發表的成熟服務商,首發推出了非編碼RNA
檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平(下)
又到了一周云序生物課堂開講時間!你,準備好了嗎? 上一期文章當中,云序通過引用這樣一張表格給大家傳遞了一個重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且這些酶在不同疾病當中意義有所不同,例如METTL3在AML、B
檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平(上)
云序生物解析如何做到快速同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶&RNA甲基化水平(上) RNA甲基化作為云序生物的主打科研產品,已經幫助多個研究團隊展開了RNA甲基化研究。作為國內RNA甲基化研究的領跑者,云序生物是國內RNA甲基化10分文章發表的成熟服務商,首發推出了非編碼RNA甲基化測
dna甲基化與rna甲基化的區別
DNA甲基化和組蛋白修飾的相同點:都有包含甲基化修飾;不同點:修飾對象不同,一個是對DNA修飾,一個是對蛋白:組蛋白修飾。而RNA干擾是對RNA的降解,與前兩者差異較大。
研究揭示RNA甲基化調控斑馬魚母源mRNA穩定性機制
斑馬魚母源-合子轉換 (maternal-to-zygotic transition, MZT)過程伴隨著母源RNA和蛋白質的降解以及合子基因組的激活(maternal-to-zygotic transition, ZGA)。已有研究表明多種關鍵因素通過母源和合子途徑促進母源mRNA降解,其中包
同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平(下)
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解析檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平(上)
云序生物解析如何做到快速同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶&RNA甲基化水平(上) RNA甲基化作為云序生物的主打科研產品,已經幫助多個研究團隊展開了RNA甲基化研究。作為國內RNA甲基化研究的領跑者,云序生物是國內RNA甲基化10分文章發表的成熟服務商,首發推出了非編碼RNA甲基化測
快速檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平(下)
又到了一周云序生物課堂開講時間!你,準備好了嗎? 上一期文章當中,云序通過引用這樣一張表格給大家傳遞了一個重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且這些酶在不同疾病當中意義有所不同,例如METTL3在AML、B
RNA甲基化研究深度剖析
一、聽說最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣? 1、高分文章頻現 說起近來的科研熱點,RNA甲基化修飾的相關研究可以說是當前整個生命科學領域最熱門的方向之一,亮點文章頻出,著實讓人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月發表的文章影響因子為10分以上的,就有高達 17 篇。
RNA甲基化促進草莓成熟
果實中富含的營養成分是人類膳食結構的重要組成部分,對人體健康不可或缺。果實品質在成熟過程中逐漸形成,受到精確調控。解析果實成熟調控機制,將為果實品質改良和新品種選育提供理論基礎。根據成熟機制的不同,果實可分為兩種類型:呼吸躍變型(如番茄、蘋果、香蕉)和非呼吸躍變型(如草莓、葡萄、柑橘)。植物激素
研究揭示RNA甲基化修飾調控哺乳動物細胞微環境維持機制
近期,中國科學院西北生態環境資源研究院西北高原生物研究所研究員楊其恩課題組以小鼠為模型,揭示RNA甲基化修飾調控哺乳動物精原干細胞微環境維持的新機制。 成體干細胞命運決定受到特殊微環境調控,在大多數組織中,微環境的形成和維持機制并不明確。精原干細胞是一類經典的成體干細胞,是哺乳動物精子發生的基
Cell-Research-腸道菌群調控宿主RNA甲基化和基因表達新機制
腸道菌群微生物組學是近年來研究熱點,腸道菌群在維持宿主生理平衡和健康中發揮著重要作用,在人和動物疾病治療方面具有極大的應用前景。研究表明,腸道菌群及其代謝產物可調節宿主基因表達。隨著研究的深入, 腸道菌群和宿主之間的相互作用機理也越來越多被發現,特別是通過表觀遺傳影響宿主的基因表達。如最新研究發
精氨酸甲基化在RNA剪接和翻譯全局調控中的關鍵作用
7月15日,中國科學院上海營養與健康研究所研究員王澤峰課題組在Science Bulletin上發表了題為A systematic survey of PRMT interactomes reveals the key roles of arginine methylation in the g
科學家揭示RNA甲基化調控實體瘤膀胱癌發生機制
m5C修飾是mRNA上分布廣泛的堿基修飾形式之一,但對于進入細胞質內的含有m5C修飾的mRNA的命運決定及其在生理和病理中的調控作用目前尚不清楚。 中國科學院北京基因組研究所楊運桂團隊聯合中山大學腫瘤醫院周芳堅團隊、謝丹團隊和中科院生物化學與細胞生物學研究所黃旲團隊合作研究,發現m5C通過細胞
北京基因組所揭示共轉錄m6A修飾建立機制及功能
4月2日,中國科學院北京基因組研究所(國家生物信息中心)任捷團隊和楊運桂團隊,在《分子細胞》(Molecular?Cell)上在線發表了題為DDX21 mediates co-transcriptional RNA m6A modification to promote transcription
北京基因組所RNA-m6A甲基化調控mRNA剪切研究獲進展
6-甲基腺嘌呤【N6-methyl-adenosine(m6A)】是高等生物mRNA中含量最為豐富的甲基化修飾形式之一,發生于保守序列RRACH(R=G ,A; H=A,C or U)中,富集在mRNA的外顯子編碼區及3’-非編碼區。類似于DNA甲基化修飾,RNA的m6A甲基化修飾也是可逆的,由
北京基因組所等發現RNA甲基化調控基因出核新機制
中國科學院北京基因組研究所精準基因組醫學重點實驗室及遺傳與發育協同創新中心楊運桂研究組和鄭州大學第一附屬醫院生殖與遺傳專科醫院孫瑩璞研究組、中國科學院生態環境研究中心汪海林研究組合作研究,揭示了m5C(5-甲基胞嘧啶)修飾在mRNA的分布圖譜規律及其對調控mRNA出核作用新機制。該研究成果以5-
研究揭示RNA去甲基化酶的氧化還原修飾調控番茄果實成熟機制
活性氧作為重要的信號分子,在植物抵御病原菌侵染、響應逆境脅迫以及維持正常生長發育的多個生物學過程中發揮重要的調控作用。在多種活性氧分子中,過氧化氫具有較長的半衰期,可調控干細胞分化、花粉管伸長、氣孔發育、果實成熟等植物發育過程,但過氧化氫如何與其他信號途徑協同作用,共同調控植物發育過程卻不甚清楚。中