lncRNA功能機制研究（二）
實驗路線（1）LINC00346調控胃癌發展的上游機制結果：轉錄因子KLF5和MYC可與LINC00346啟動子結合，并增強其表達a. 轉錄因子MYC、KLF5和 LINC00346的Oncoprint分析；b. 在含有或未含有胃癌KLF5/ MYC / LINC00346 SCNAs的轉錄因子KLF5、MYC、LINC00346基因表達；c. GSE51705數據庫的分析顯示，KATO-III GC細胞中KLF5與LINC00346基因啟動子結合；d. UCSC基因組生物信息學網站顯示， MYC高度富集在LINC00346的啟動子上；e. GSE51575數據庫顯示LINC00346的表達與KLF5或MYC正相關；f. qPCR顯示LINC00346的表達與KLF5或MYC 正相關；g. ChIP實驗顯示，內源性MYC和KLF5與LINC00346基因啟動子區結合。h. WB顯示干擾或過表達LINC00......閱讀全文
lncRNA功能機制研究（二）
實驗路線（1）LINC00346調控胃癌發展的上游機制結果：轉錄因子KLF5和MYC可與LINC00346啟動子結合，并增強其表達a. 轉錄因子MYC、KLF5和 LINC00346的Oncoprint分析；b. 在含有或未含有胃癌KLF5/ MYC / LINC00346 SCNAs的轉錄因子
lncRNA功能機制研究（一）
文章導讀LncRNA是長度大于200nt的長鏈非編碼RNA，在調控不同的分子過程中發揮著重要作用。其主要功能不僅可以與功能蛋白結合，并在轉錄或轉錄后水平調控基因表達，而且lncRNA也可以作為誘餌，吸附miRNA，調節miRNA調控的靶基因表達。但是，目前關于lncRNA在胃癌中的表達譜和生物學功能
lncRNA促進胃癌進展的新機制研究思路分析（二）
2. GC細胞中FOXD2-AS1富集高的患者預后較差在芯片數據GSE51575基礎上，以正常組織作為對照，來評估FOXD2-AS1的診斷效果。ROC曲線下面積為0.919（95%置信區間[CI] 0.809-0.976; P < 0.0001）;特異性和敏感性分別為0.885和0.885。
lncRNA在農業領域的研究成果（二）
【思路及相應結果】內容與圖片源：（王立方，2015）【結論】通過全轉錄組測序、lncRNA測序和實時熒光定量的方法發現和鑒定了與家蠶產絲相關的lncRNA和其在不同產絲階段的表達量變化，挑出了與家蠶產絲調控緊密相關的非編碼RNA和lncRNA。例如位于P25基因下游互補鏈的lncR2034，與P25
外泌體lncRNA介導的淋巴轉移機制的揭秘（二）
（5）外泌體LNMAT2上調PROX1的表達有研究報道，PROX1通過調節內皮細胞的分化和轉移，對淋巴管系統發育至關重要。因此作者通過qPCR和WB實驗發現，HLECs中上調LNMAT2能夠促進PROX1的表達；為了探究LNMAT2調控PROX1表達的分子機制，作者進行核質分離PCR，發現LNMAT
lncRNA促進胃癌進展的新機制研究思路分析
近日，南京醫科大學第一附屬醫院的束永前團隊將最新的研究成果，以題為“Upregulation of the long noncoding RNA FOXD2-AS1 promotes carcinogenesis by epigenetically silencing EphB3 through
lncRNA促進胃癌進展的新機制研究思路分析
Nature子刊|聯合南京醫科大發表重要研究成果：揭示lncRNA促進胃癌進展的新機制 近日，南京醫科大學第一附屬醫院的束永前團隊將最新的研究成果，以題為“Upregulation of the long noncoding RNA FOXD2-AS1 promotes carcinoge
Nature－子刊：研究lncRNA功能的新方法
長非編碼RNA（lncRNA）是長達兩百個核苷酸以上的轉錄本。雖然lncRNA沒有編碼任何蛋白質，但它們在不同組織和發育階段的表達依然具有特異性，這說明lncRNA具有重要的生物學意義。細胞中絕大多數lncRNA位于細胞核，它們對應的DNA區域有的與蛋白編碼基因重疊，有的位于基因間或者內含子中。
云序客戶8.0分成果揭秘還愁lncRNA功能機制如何研究嗎？
LncRNA是長度大于200nt的長鏈非編碼RNA，在調控不同的分子過程中發揮著重要作用。其主要功能不僅可以與功能蛋白結合，并在轉錄或轉錄后水平調控基因表達，而且lncRNA也可以作為誘餌，吸附miRNA，調節miRNA調控的靶基因表達。但是，目前關于lncRNA在胃癌中的表達譜和生物學功能的了
云序客戶8.0分成果揭秘：還愁lncRNA功能機制如何研究嗎？
文章導讀 LncRNA是長度大于200nt的長鏈非編碼RNA，在調控不同的分子過程中發揮著重要作用。其主要功能不僅可以與功能蛋白結合，并在轉錄或轉錄后水平調控基因表達，而且lncRNA也可以作為誘餌，吸附miRNA，調節miRNA調控的靶基因表達。但是，目前關于lncRNA在胃癌中的表達譜
lncRNA促進胃癌進展的新機制研究思路分析（一）
近日，南京醫科大學第一附屬醫院的束永前團隊將最新的研究成果，以題為“Upregulation of the long noncoding RNA FOXD2-AS1 promotes carcinogenesis by epigenetically silencing EphB3 throu
lncRNA研究策略與技術
研究背景：長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA，lncRNA)是一類不編碼蛋白的RNA分子，長度在200 bp以上，起初被認為是RNA聚合酶II轉錄的副產物，不具有生物學功能；近期的研究表明lncRNA具有保守的二級結構，可以與蛋白、DNA和RNA相互作用，參與多種生物學過程的調控
circRNA機制研究匯總（二）
結合蛋白：（2）CircNfix與Ybx1結合并促進其降解：circNfix和對照組的蛋白質譜分析（A）。采用Ybx1、Nedd4l或陰性IgG抗體進行RIP實驗（云序生物提供該服務）（B）。P0 CMs中過表達circNfix后Ybx1蛋白表達水平（C-D）。qRT-PCR檢測P0 CMs中Y
新機制：lncRNA可調控小麥開花
冬小麥開花需要長時間低溫環境的誘導，該過程稱之為春化作用。這一過程受到外部環境因子和植物內在發育狀態的雙重復雜精準的調控。冬小麥不同品種的春化特性與其產量直接相關。在六倍體小麥中，TaVRN1是受低溫誘導、可加速開花轉換的關鍵調控因子。然而，目前對于在春化過程中TaVRN1逐步激活的分子機制尚不
lncRNA甲基化如何研究？
lncRNA分子通過海綿機制結合microRNA發揮生物學功能，這個ceRNA機制已經讓大家心生厭倦了。可大牛就是大牛，引入甲基化就能輕松的變廢為寶，竟然能讓lncRNA的ceRNA思路變得瞬間高大上發表10分以上的文章，你一定和小編我一樣很好奇他是怎么做到的。RNA甲基化，作為最新的國自然熱點受到
lncRNA助力葉酸研究新成果
LncRNA研究發表的成果五花八門，然而借助于lncRNA芯片，挖掘其中的高通量數據，發表5分影響因子的文章，還是可行的。本研究是以葉酸處理肥胖模型為基礎，讓我們來看看到底怎么樣就可以在《Cellular Physiology and Biochemistry》（IF=5.104）上發表。研究背
LncRNA芯片應用于胃癌研究
研究背景 在全世界分范圍內，每年因肝癌死亡的病例超過50萬人，是主要的致死惡性腫瘤之一。在過去的十年中，隨著影像學的進步以及健康體檢的普及，越來越多的肝癌病人在患病早期被發現。但由于肝臟捐贈者的短缺，外科肝臟切除術仍然是治療早期肝癌病人的最主要方法。目前對于術后患者缺乏準確
LncRNA芯片應用于胃癌研究
上海交通大學附屬仁濟醫院房靜遠教授主要從事消化系統腫瘤發生的分子機制、早期診斷和分子治療等相關研究。近期，該課題組應用美國Arraystar公司的lncRNA芯片分析了胃癌組織的lncRNAs表達情況，篩選到可預測胃癌發生的分子標志物GClnc1，并且闡明了GClnc1在胃癌的發生和發展中是如何發揮
教你如何玩轉tRNA機制研究（二）
4.AET1而不是RACK1A以及eIF3h直接和OsARF mRNA結合AET1與RACK1A以及eIF3h的結合是否和mRNA相關？RIP測序（云序生物提供）幫助研究者快速的明確哪些mRNA能夠和蛋白AET1結合，分析結果顯示高溫條件下545個mRNA分子只在野生型水稻株當中和AET1結合，而僅
上海交大LncRNA研究刊登國際期刊
長非編碼RNA（lncRNA）不編碼蛋白質，最初被認為是基因組“暗物質”的一部分。最近，有研究表明，lncRNAs在染色質修飾復合物的招募過程中發揮作用，并能影響基因的表達。然而，是否lncRNAs以類似的方式在癌癥中發揮作用，尚不明確。延伸閱讀：中美學者JBC解析lncRNA在EMT中的作用。
長鏈非編碼－RNA（lncRNA）研究策略
長鏈非編碼 RNA（long noncoding RNA，lncRNA）指的是轉錄本長度在 200-100000 nt 之間的 RNA 分子，它們不編碼蛋白，位于細胞核或胞質內，具有保守的二級結構。研究顯示，lncRNA 并非以前所認識的那樣沒有功能，它可與蛋白質、DNA 和 RNA 相互作
lncRNA在農業領域的研究成果
miRNA的好Homie，非編碼RNA界的NewStar --沒想到在農業上大展身手啦 你沒看錯！不是標題黨。說到miRNA的好Homie，非編碼RNA界的NewStar，想必聰明博學的你就已經猜到了是lncRNA。今天大閱哥要給大家挖一挖lncRNA在農業上的研究進展。為了寫這篇主題
華裔學者Cell發表lncRNA研究的利器
長非編碼RNA（lncRNA）是長達兩百個核苷酸以上的轉錄本，絕大多數位于細胞核內。雖然lncRNA沒有編碼任何蛋白質，但它們在不同組織和發育階段的表達依然具有特異性，這說明lncRNA具有重要的生物學意義。在測序技術的幫助下，人們已經發現了數千種lncRNA，但這些lncRNA的生物學功能依然
第二軍醫大學Hepatology聚焦lncRNA
來自第二軍醫大學的研究人員在新研究中證實，在肝再生過程中一種稱之為lncRNA-LALR1(Long noncoding RNAs associated with liver regeneration 1)的長鏈非編碼RNA通過激活Wnt/β-Catenin信號促進了肝細胞增殖。相關論文
外泌體lncRNA介導的淋巴轉移機制的揭秘
外泌體是指包含多種RNA（環狀RNA、miRNA、LncRNA和mRNA等）和蛋白質的盤狀囊泡（30-200nm）。幾乎所有類型的細胞均可分泌外泌體，且外泌體天然存在于各種體液中，包括血液、唾液、尿液、腦脊液和乳汁等。外泌體被視為特異性分泌的膜泡，能夠參與細胞間通訊。目前，有關外泌體分泌、攝取、
外泌體lncRNA介導的淋巴轉移機制的揭秘
外泌體是指包含多種RNA（環狀RNA、miRNA、LncRNA和mRNA等）和蛋白質的盤狀囊泡（30-200nm）。幾乎所有類型的細胞均可分泌外泌體，且外泌體天然存在于各種體液中，包括血液、唾液、尿液、腦脊液和乳汁等。外泌體被視為特異性分泌的膜泡，能夠參與細胞間通訊。目前，有關外泌體分泌、攝取、
Cell子刊：超保守lncRNA的重要功能
談到遺傳物質，我們往往指的是從父母那兒繼承到的DNA（脫氧核糖核酸）。這些DNA會轉錄成為RNA，進而指導各種蛋白質的合成，例如血紅蛋白或胰島素。除了這些RNA之外，細胞中還存在著大量神秘的非編碼RNA。 MicroRNA是最廣為人知的一種非編碼RNA，這種微小的分子控制著眾多基因的啟動和關閉
共表達分析挖掘lncRNA的生物學功能
lncRNA研究是目前生命科學領域的研究熱點，但是，目前對于lncRNA的功能理解還處于初級階段。據不完全統計，目前已知功能的lncRNA不超過1000條。因此，怎么在現有基礎上去挖掘lncRNA的生物學功能呢？針對lncRNA和mRNA的共表達研究，為我們理解lncRNA在疾病中的生物學功能提
共表達分析挖掘lncRNA的生物學功能
lncRNA研究是目前生命科學領域的研究熱點，但是，目前對于lncRNA的功能理解還處于初級階段。據不完全統計，目前已知功能的lncRNA不超過1000條。因此，怎么在現有基礎上去挖掘lncRNA的生物學功能呢？針對lncRNA和mRNA的共表達研究，為我們理解lncRNA在疾病中的生物學功能提
共表達分析挖掘lncRNA的生物學功能
lncRNA研究是目前生命科學領域的研究熱點，但是，目前對于lncRNA的功能理解還處于初級階段。據不完全統計，目前已知功能的lncRNA不超過1000條。因此，怎么在現有基礎上去挖掘lncRNA的生物學功能呢？針對lncRNA和mRNA的共表達研究，為我們理解lncRNA在疾病中的生物學功能提供了