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  • Cell新文章:癌癥全基因組測序

    根據華盛頓大學醫學院的一項新研究,具有吸煙史的肺癌患者相比于不吸煙的肺癌患者腫瘤中的遺傳突變要多10倍。這一研究在線發表在9月13日的《細胞》(Cell)雜志上。 論文的資深作者、華盛頓大學基因組研究所主任Richard K. Wilson 說:“吸煙者基因組具有比不吸煙的肺癌患者基因組更多的突變,我們中沒有人對此感到驚訝。但令人吃驚的是看到10倍以上的突變,它強化了舊的訊息——不要抽煙。” 總的來說,該分析確定了所有17名非小細胞肺癌患者中大約3,700個突變。12名患者有吸煙史,5人沒有。在每位從不吸煙的患者體內,研究人員發現至少有一個突變基因可用當前市場上用于其他疾病或通過臨床試驗可獲得的藥物靶向。在所有患者中,他們確定了54種與現有藥物相關的突變基因。 文章的第一作者、腫瘤學家Ramaswamy Govindan在華盛頓大學和巴恩斯-猶太醫院的塞特癌癥中心從事患者治療工作。Govindan說......閱讀全文

    白菜甘藍油菜全基因組序列測定

     ? 由中國科學家領銜的白菜、甘藍和油菜全基因組測序項目取得階段性重大成果,獲得了白菜全基因組的精細圖,甘藍和油菜全基因組的框架圖。   研究表明,白菜、甘藍和油菜的基因組大小分別約為5億、6.5億和11億個堿基對,白菜和甘藍含有的基因總數目分別約4.2萬和4.5萬個,油菜基因覆蓋度85%以上。該

    牡蠣全基因組序列圖譜繪制完成

    牡蠣基因組部分序列及其分析牡蠣基因組計劃(OGP)團隊成員在深圳華大基因研究院討論項目中國科學院海洋研究所和深圳華大基因研究院簽約儀式牡蠣是產量最大的海水養殖動物  牡蠣養殖  近日,牡蠣基因組計劃(Oyster Genome Project,OGP)項目組宣布,

    我國獲得輸入性黃熱病毒全基因序列

      國家衛計委13日通報,我國確診一例輸入性黃熱病病例。今日,記者從中國疾控中心獲悉,該中心病毒病預防控制所和北京市疾病預防控制中心合作,獲得了輸入性黃熱病病毒的全基因序列。  據悉,中國疾控中心病毒病預防控制所和北京市疾病預防控制中心合作,在病人血液標本中直接獲得了病毒全基因組序列。該病毒基因組全

    草魚全基因組序列圖譜繪制完成

      近日,記者從中國科學院水生生物研究所獲悉,該所魚類功能基因組學學科組負責的草魚全基因組序列圖譜繪制完成。該成果由水生生物研究所、中國科學院國家基因研究中心和中山大學等機構合作完成,相關研究成果于5月4日在線發表于《自然—遺傳學》雜志。  據該所研究員汪亞平介紹,該研究采用鳥槍法測序策略,分別對一

    科學家完成辣椒全基因組序列測定

      由我國科技人員主導完成的“栽培種和野生種辣椒的全基因組測序揭示辣椒屬的馴化與特異性”研究論文,今年3月在國際著名期刊《美國國家科學院院刊》(PNAS)刊發。該論文的正式發表,標志著辣椒基因組序列成功解碼,我國辣椒基礎性研究取得重大進展,進入分子育種階段。   美國農藝學會主席、新墨西哥州立大學

    我國完成朱鹮全基因組序列圖譜繪制

    ?????? 4月15日,深圳華大基因研究院與西安交通大學聯合在西安公布了瀕危野生動物朱鹮的全基因組序列圖譜,這是繼雞基因組、珍珠鳥基因組、火雞基因組之后,我國完成 的第四個鳥類基因組測序項目和全基因組序列圖譜。朱鹮這種被稱為“東方寶石”的珍稀鳥類目前世界僅存千余只,這一研究成果將對于挽救和保護朱

    Cell新文章:癌癥全基因組測序

      根據華盛頓大學醫學院的一項新研究,具有吸煙史的肺癌患者相比于不吸煙的肺癌患者腫瘤中的遺傳突變要多10倍。這一研究在線發表在9月13日的《細胞》(Cell)雜志上。   論文的資深作者、華盛頓大學基因組研究所主任Richard K. Wilson 說:“吸煙者基因組具有比不吸煙的肺癌患者基因

    益生乳酸菌全基因組序列測定完成

    內蒙古農業大學正式公布,益生乳酸菌的全基因組序列測定分析全部完成,這是我國第一個完成的乳酸菌基因全序列測定。 由內蒙古農業大學“乳品生物技術與工程”教育部重點實驗室主持進行的益生乳酸菌的全基因組序列測定Lb.casei Zhang科技項目是經過6年分離、篩選,并進行系統研究開發的具有完全自主知識產

    我國首次完成寨卡病毒全基因組序列測定

      2月22日,記者從軍事醫學科學院獲悉,該院與廣州市第八人民醫院、出入境檢驗檢疫系統相關單位密切合作,在獲得從委內瑞拉歸國患者臨床標本后,采用高通量測序技術,于2月21日直接從尿液中獲得病毒全基因組序列。  寨卡病毒屬黃病毒科,是一種主要由伊蚊傳播的蟲媒病毒。1947年首次在烏干達寨卡叢林中的恒河

    我國首獲瀕危物種白頭葉猴全基因組序列

      廣西林業局11日提供的信息顯示,中國首次獲得瀕危物種白頭葉猴全基因組序列,揭示了白頭葉猴能夠在富含礦物離子的高堿性喀斯特山地長久生存的基因組遺傳特征秘密。  白頭葉猴是中國特有的生物物種,其體毛以黑色為主,與黑葉猴不同的是頭部高聳著一撮直立的白毛。白頭葉猴僅分布在廣西崇左左江和明江間不足200平

    遺傳發育所等解析鹽芥全基因組序列

      鹽芥是十字花科鹽芥屬的一種鹽生植物,與雙子葉植物研究中所常用的模式植物擬南芥親緣關系較近。鹽芥具有作為模式植物的一系列良好特征,如個體較小、生活周期短、自花授粉、種子量大、基因組較小,而且易于轉化。最重要的是,鹽芥具有對高鹽、干旱和低溫等非生物脅迫極高的耐受能力,這使其成為研究植物耐受非生物脅迫

    加深癌癥了解!新基因工具可按時序編輯DNA序列

      據物理學家組織網23日報道,美國研究人員在最新一期《分子細胞》雜志撰文指出,他們發明了一種新基因編輯技術,可按時間順序對切割點或編輯點進行編輯,有望促進癌癥研究等領域的發展。  基因編輯領域的“當紅炸子雞”CRISPR使科學家能改變細胞內DNA的序列,或添加所需序列或基因。CRISPR使用名為C

    我國完成首部高原瀕危物種全基因組序列圖譜

      12月25日,由青海大學和深圳華大基因研究院共同發起并承擔的藏羚羊基因組序列圖譜在青海大學醫學院宣告繪制完成,這是世界上第一部繪制完成的高原瀕危物種全基因組序列圖譜,也是中國科學家對全球基因組科學的又一重大貢獻。   藏羚羊是我國青藏高原特有的物種,其生存環境高寒、缺氧,自然條件極為嚴酷。在喜

    EBioMedicine:全基因組測序高效識別癌癥相關基因突變

      UT西南醫學中心癌癥研究人員已經證明,全基因組測序可用于識別癌癥的遺傳性風險,其可以潛在地改善癌癥的預防,診斷和治療。  這是首次研究使用了全基因組測序以評估一系列258癌癥患者的基因組,診斷其癌癥傾向性突變情況。這項研究發表在雜志EBioMedicine上。全基因組測序是新的基因工具,能夠確定

    英國擬為癌癥病人繪基因序列圖以研發新藥

      據英國路透社12月10日報道,英國擬為近10萬癌癥或其它罕見疾病的患者繪制基因序列圖,以研發新的藥物。   英國首相卡梅倫10日表示,他希望英國能夠成為第一個將基因排序引入健康服務的國家。   據報道,卡梅倫政府計劃在未來3至5年內投入1億英鎊(約合人民幣10億元)用于基因排序項目。繪制病人

    我國首例輸入性裂谷熱病毒全基因組序列測定完成

      記者從國家質量監督檢驗檢疫總局獲悉:7月24日凌晨,該局和軍事醫學科學院微生物流行病研究所聯合攻關,獲得了我國首例輸入性裂谷熱病例的病毒全基因組序列。  “測序結果確認了該輸入性病例為非洲流行的裂谷熱病毒感染所致。”軍事醫學科學院微生物流行病研究所研究員童貽剛告訴科技日報記者,經測定,該病毒基因

    我國科學家完成鯉魚全基因組序列圖譜繪制

       近日,由中國水產科學研究院首席科學家孫效文牽頭,中國水產科學研究院聯合黑龍江水產研究所、中科院基因組研究所、哈佛大學、奧本大學等單位組建的國際合作研究團隊,完成了鯉魚全基因組序列圖譜繪制,在國際上首個完成全面解析的異源四倍體硬骨魚類基因組圖譜。該研究成果于9月21日在國際生物學權威期刊《自然—

    我國首次完成益生乳酸菌全基因組序列測定

    由內蒙古農業大學“乳品生物技術與工程”教育部重點實驗室主持進行的益生乳酸菌L.casei Zhang的全基因組序列測定分析歷時15個月,近日全部完成。這是我國第一個獨立完成、具有完全自主知識產權的乳酸菌基因全序列測定,標志著我國在乳酸菌基因組學方面的研究達到國際水平。 L.casei Zhang是

    我國繪制完成世界首個鵝全基因組序列圖譜

      6月3日,深圳華大基因研究院和浙江省農業科學院、象山縣浙東白鵝研究所聯合召開新聞發布會,宣布“鵝全基因組序列圖譜繪制完成”。這是我國獨立研究完成的全世界首個鵝全基因組序列圖譜,這一研究成果對于揭示家鵝繁殖、抗逆、生長、肉質、羽色等性狀的遺傳基礎,鵝的馴化、不同鵝種的生物學分類、中國家鵝

    新冠病毒全基因組大小和序列的研究進展

      2月3日,《自然》在線發表論文介紹了上海公共衛生臨床中心和復旦大學公共衛生學院教授張永振等人對2019-nCov的基因組序列的分析。該病毒基因組從就職于出現首批患者的海鮮市場的一名病人身上獲得。基因組分析顯示,該病毒與此前在中國蝙蝠體內找到的一組SARS樣冠狀病毒密切相關。  通過對從患者收集的

    我國科學家繪制完成鯉魚全基因組序列圖譜

      鯉科魚類是我國最重要的水產養殖種類,年產量占我國淡水養殖總產量的70%以上,其中鯉魚不僅是我國也是世界性的重要養殖魚類。5月6日,中國“鯉魚基因組計劃”學術報告會暨新聞發布會在京舉行。由中國水產科學研究院水產生物應用基因組研究中心、黑龍江水產研究所和中科院北京基因組研究所共同實施

    全基因組測序有望改善癌癥預防與診斷

      美國德州大學(UT)西南醫學中心研究人員證明,全基因組測序可識別病人患遺傳性癌癥的風險,有望改善癌癥的預防、診斷和護理。這項研究首次用全基因組測序評估了258個癌癥病人的基因組,提高了診斷出有癌變傾向的基因變異的能力。相關論文在線發表于最近的《E生物醫學》雜志上。  “全基因組測序是一種新的基因

    馬鈴薯單倍型DM基因組全序列完成圖組裝成功

    中國農業科學院蔬菜花卉研究所馬鈴薯遺傳育種與栽培創新團隊和蔬菜分子設計育種創新團隊,對馬鈴薯單倍型DM的基因組進行了全序列組裝,獲得了包含24個端粒和12個著絲粒完整序列的馬鈴薯單倍型DM的端粒到端粒(T2T)的基因組完成圖(DM8.1),并在之前馬鈴薯基因組未能完整組裝的高度重復序列區域中,發現了

    解析斑鱉的全基因組序列及其適應性進化基礎

      斑鱉(Rafetus swinhoei)是目前地球上現存體型最大的鱉類物種,其背甲長度可達1.5米、體重可達115公斤。此外,斑鱉也是全球目前最瀕危的龜鱉類物種。在2019年初,全球已經明確記錄的斑鱉個體僅僅只有4只。然而,2019年4月13日,我國的雌性個體意外死亡(這也是當時全球唯一確定性別

    絨毛狀煙草和林煙草全基因組序列圖譜完成

      絨毛狀煙草和林煙草全基因組序列圖譜已經由中國煙草完成。這是全球第一套煙草全基因組序列圖譜,也是繼馬鈴薯和番茄基因組之后全球完成的第三種茄科植物全基因組序列圖譜。該絨毛狀煙草和林煙草全基因組序列圖譜是目前已知植物基因組序列圖譜中基因組最大、組裝精度最高、組裝結果最好的2個圖譜。絨毛

    關于癌癥全基因組-我們有了全新的認識

      今日,最新一期《自然》雜志如約上線,而登上封面的“癌癥全基因組”則是本期的主題:在本期《自然》雜志上,一共發表了6篇相關的論文。而在Nature Genetics、Nature Biotechnology、以及Nature Communications等子刊上,也有系列論文發表。  那么,是什么

    全基因組測序是癌癥診斷的強有力工具

    ? 一位沒有明顯癌癥家族史的婦女卻罹患了早發性乳腺癌和卵巢癌,以及與治療有關的急性髓細胞樣白血病。研究人員對這名婦女進行了全基因組測序,所用的是從該患者的皮膚和骨髓中獲取的DNA。在許多被懷疑患癌癥可能性增加了的病人中,常規性的候選基因測試(如BRCA1??和??BRCA2突變檢測)無法顯示出有用的

    震驚!全基因組測序還能這樣用在癌癥治療上?

       近年來,隨著全基因組測序所需時間和成本的降低,個體化治療將造福更多的癌癥患者。近日發表于《Nature Medicine》的一項研究表明,開發新的機器學習算法對腫瘤全基因組序列信息進行分析,有助于預測患者的預后,幫助患者選擇最佳的治療方案。  全基因組測序(Whole-genome seque

    重疊基因的調控序列

    ①在5′端轉錄起始點上游約20~30個核苷酸的地方,有TATA框(TATA box)。TATA框是一個短的核苷酸序列,其堿基順序為TATAATAAT。TATA框是啟動子中的一個順序,它是RNA聚合酶的重要的接觸點,它能夠使酶準確地識別轉錄的起始點并開始轉錄。當TATA框中的堿基順序有所改變時,mRN

    我國繪制完成世界首個蒙古族人全基因組序列圖譜

      我國科學家繪制完成了全世界首個蒙古族人全基因組序列圖譜。這是記者12月18日在內蒙古自治區呼和浩特市召開的“世界首例蒙古族人全基因組序列圖譜繪制完成成果發布會”上獲得的消息。   據項目總負責人、內蒙古農業大學生命科學學院動物生物技術重點實驗室主任周歡敏介紹,這一研究成果是我國科學家首次獨立完

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