Cell新文章：癌癥全基因組測序
根據華盛頓大學醫學院的一項新研究，具有吸煙史的肺癌患者相比于不吸煙的肺癌患者腫瘤中的遺傳突變要多10倍。這一研究在線發表在9月13日的《細胞》(Cell)雜志上。 論文的資深作者、華盛頓大學基因組研究所主任Richard K. Wilson 說：“吸煙者基因組具有比不吸煙的肺癌患者基因組更多的突變，我們中沒有人對此感到驚訝。但令人吃驚的是看到10倍以上的突變，它強化了舊的訊息——不要抽煙。” 總的來說，該分析確定了所有17名非小細胞肺癌患者中大約3,700個突變。12名患者有吸煙史，5人沒有。在每位從不吸煙的患者體內，研究人員發現至少有一個突變基因可用當前市場上用于其他疾病或通過臨床試驗可獲得的藥物靶向。在所有患者中，他們確定了54種與現有藥物相關的突變基因。 文章的第一作者、腫瘤學家Ramaswamy Govindan在華盛頓大學和巴恩斯-猶太醫院的塞特癌癥中心從事患者治療工作。Govindan說......閱讀全文
海洋所科研人員繪制完成牡蠣全基因組序列圖譜
近日，牡蠣基因組計劃（Oyster Genome Project，OGP）項目組宣布，歷時兩年的牡蠣基因組序列圖譜終于繪制完成。這是世界上第一張養殖貝類的全基因組序列圖譜，標志著基于短序列的高雜合度基因組拼接和組裝技術獲得了重大突破。據悉，目前的基因組圖譜已達到國際領先的基因組圖
我國繪制完成世界首個蒙古族人全基因組序列圖譜
我國科學家繪制完成了全世界首個蒙古族人全基因組序列圖譜。這是記者12月18日在內蒙古自治區呼和浩特市召開的“世界首例蒙古族人全基因組序列圖譜繪制完成成果發布會”上獲得的消息。 據項目總負責人、內蒙古農業大學生命科學學院動物生物技術重點實驗室主任周歡敏介紹，這一研究成果是我國科學家首次獨立完
我國繪制并破譯世界首例雙峰駝全基因組序列圖譜
記者17日從內蒙古農業大學獲悉，我國科研人員近日完成了世界首例雙峰駝全基因組序列圖譜繪制和破譯工作。專家表示，這項成果將對野生駱駝保護和家養駱駝品種改良起到重要指導作用，并將進一步推動駱駝產業的健康發展。 據了解，這個研究項目由內蒙古農業大學、上海交通大學、中國科學院上海生命科學研究院、南
我國科學家完成大黃魚全基因組序列圖譜繪制
浙江省科技廳、上海市科委30日在浙江省舟山市共同宣布，來自浙江海洋學院、復旦大學、上海交通大學等院所的科學家已繪制完成大黃魚的全基因組測序、組裝和序列圖譜。 據介紹，這是我國科學家完成的第二個魚類基因組序列圖譜，也是世界上首個石首魚科魚類基因組序列圖譜。 大黃魚屬硬骨魚
斑鱉的全基因組序列解析：其與中華鱉親緣關系密切
記者12日從中國科學院昆明動物研究所獲悉，該所和長沙生態動物園合作，成功組裝出了全球最瀕危龜鱉類物種斑鱉的高質量參考基因組序列，并解析其適應性進化基礎。研究人員發現，斑鱉與中華鱉親緣關系密切，然而在54.4百萬年前開始分道揚鑣。 斑鱉是目前地球上現存體型最大的鱉類物種，其背甲長度可達1.5米、
Illumina助力云南省CDC快速破譯新型冠狀病毒全基因組序列
據云南廣播電視臺《都市條形碼》微信公眾號報道，1月21日，國家衛生健康委確認昆明市首例輸入性新型冠狀病毒感染的肺炎確診病例。云南省疾控中心急性傳染病防制所所長伏曉慶介紹，1月17日中午12點，實驗室收到患者采樣標本，下午3點就完成了核酸檢測，結果呈陽性。 1月18日凌晨1點，實驗室開始病毒全基
南京世和基因：推出可檢出新型冠狀病毒全序列試劑盒
日前，位于南京江北新區的世和基因生物技術有限公司，成功研制出新型冠狀病毒檢測試劑盒，目前正申請進入國家藥監局為此次疫情開辟的應急審批通道，力爭盡快投入抗疫最前線。 世和基因推出的檢測試劑盒較現有產品，能夠檢測出新型冠狀病毒全序列，精準度更高，世和基因首席執行官邵陽介紹，更重要的是，病毒在演化的
蒙古高原四個特色物種全基因組序列圖譜繪制完成
內蒙古農業大學和深圳華大基因研究院8月9日在呼和浩特市聯合宣布，蒙古羊、蒙古牛、蒙古馬和阿拉善雙峰駝全基因組序列圖譜繪制完成。這是我國科學家首次獨立完成蒙古高原物種全基因組序列圖譜，標志著我國地方畜種研究進入基因組水平。 蒙古羊、蒙古牛、蒙古馬、阿拉善雙峰駝是我國古老的原始品種和畜牧
中國農科院特產所首次破譯鹿科動物全基因組序列
近日，由中國農業科學院特產研究所研究員李光玉帶領創新團隊在國際上首次破譯鹿科動物全基因組序列。馴鹿全基因組測序的完成，不僅為研究人員從基因組水平挖掘馴鹿生長、代謝和抗寒等重要性狀的分子機制提供了科學指導，而且為馴鹿馴化歷史、基因組演化、群體遺傳及鹿類動物的進化等理論研究奠定了重要基礎。相關研究成
全基因組測序可識別癌癥相關變異－有助預防護理
美國德州大學(UT)西南醫學中心研究人員證明，全基因組測序可識別病人患遺傳性癌癥的風險，有望改善癌癥的預防、診斷和護理。這項研究首次用全基因組測序評估了258個癌癥病人的基因組，提高了診斷出有癌變傾向的基因變異的能力。相關論文在線發表于最近的《E生物醫學》雜志上。 “全基因組測序是一種新
Nature子刊：對年輕癌癥患者進行全基因組測序勢在必行
相關研究最近以“Clinical cancer genomic profiling by three-platform sequencing of whole genome, whole exome and transcriptome”為題發表在《Nature Communications》雜志
基因序列儀的分類介紹
根據電泳類型分為平板型電泳和毛細管電泳兩類： 1. 平板型電泳：平板型電泳的凝膠灌制在兩塊玻璃板中，聚合后厚度一般小于0.4mm或更薄，因此又稱為超薄片層凝膠電泳。是經典的電泳技術，具有樣品判讀序列長（600-900bp）、一塊凝膠板上可同時進行多個樣品測序的優點。 2. 毛細管電泳：將凝膠高
什么是基因的核心序列？
中文名稱核心序列英文名稱core sequence定 義重復序列共有的核苷酸序列。應用學科遺傳學（一級學科），分子遺傳學（二級學科）
功能基因cDNA序列的分析
（一） cDNA序列的測定一．原理DNA 序列測定技術，目前主要是根據Sanger 等提出的酶法和Maxam和Gilber 提出的化學降解法，這兩種方法的原理大致相同。這里主要介紹Sanger 的酶法——雙脫氧鏈終止法。雙脫氧鏈終止法是Sanger 等人于1977 年建立起來的。它是利用了2'
構建單細胞癌癥基因組時間序列模型，可預測乳腺癌細...
構建單細胞癌癥基因組時間序列模型，可預測乳腺癌細胞克隆適應性不同生物會隨著時間的推移不斷進化，環境壓力可促使具有某些特征的個體在群體中變得更加普遍。癌癥也不例外，在不斷增殖的腫瘤中，具有最佳競爭資源和抵御環境壓力的癌細胞會逐漸占據主導地位。癌細胞的適應性（fitness）并不是一成不變的。在化療藥物
上海生科院合作完成世界首例雙峰駝全基因組序列圖譜
11月13日，中國科學院上海生命科學研究院/中國科學院系統生物學重點實驗室李亦學研究員課題組與內蒙古農業大學、上海交通大學、南開大學等研究機構的科研人員合作完成了世界首例雙峰駝全基因組序列圖譜繪制和破譯工作，成果在Nature Communications（DOI: 10.103
昆明植物所完成六種木本竹子葉綠體基因組全序列的測定
竹亞科（Bambusoideae）隸屬于禾本科（Poaceae），全世界共分布有一千余種。木本竹子因種類數目多，形態性狀復雜多變及多年生一次性開花等原因而成為系統發育學研究難點。隨著新一代測序技術的興起，系統發育基因組學為解決這類困難類群的系統發育關系帶來了曙光。 中國科學院昆明植物研究所李德
什么是基因的間插序列？
中文名稱間插序列英文名稱intervening sequence;IVS定 義基因間或基因內的非編碼序列。應用學科遺傳學（一級學科），分子遺傳學（二級學科）
割裂基因的調控序列種類介紹
①在5′端轉錄起始點上游約20～30個核苷酸的地方，有TATA框(TATA box)。 TATA框是一個短的核苷酸序列，其堿基順序為TATAATAAT。TATA框是啟動子中的一個順序，它是RNA聚合酶的重要的接觸點，它能夠使酶準確地識別轉錄的起始點并開始轉錄。當TATA框中的堿基順序有所改變時，
解析現代月季基因組序列
科學家研究現代月季基因。圖片來源：monticelloshop.org 近日，法國農業科學研究院、里昂大學、法國國家科學研究中心的研究人員解密了現代月季的基因組序列。現代月季擁有獨特的顏色與香味，廣受稱贊，這項研究幫助人們從分子角度了解這背后的基因和代謝流程。4月30日，相關論文在線刊登于《自然
基因組序列草圖的概念
中文名稱基因組序列草圖英文名稱draft genome sequence定 義已測定序列占到90%以上、測序精度在1%的基因組序列圖。應用學科遺傳學（一級學科），基因組學（二級學科）
全表型關聯研究將遺傳性癌癥基因與其他表型聯系起來
一項新的全表型關聯研究發現，遺傳性癌癥基因的致病變異可以影響其他惡性但也非惡性的特征。 美國國家人類基因組研究所和其他地方的研究人員表示，檢查與遺傳性癌癥基因相關的其他表型可以更好地了解疾病病因并改進治療方法。 正如他們周四在 JAMA Oncology 上報道的那樣，研究人員對超過 214
癌癥基因檢測標準
據世界癌癥預防組織機構統計，現今社會每100人就有1人因患癌癥而死亡, 每年死亡的人數中，1/5是死于癌癥。未來20年里，癌癥將繼續位居人類死因首位。 癌癥的新認識 癌癥只是慢性病，一類與冠心病、糖尿病有所類似的慢性病 癌癥是生活方式疾病，80%與不良生活方式有關。 遺傳、疾病、環境與職
安捷倫推出最新人全外顯子靶向序列富集工具
安捷倫科技公司與維康信托基金會桑格研究院和 Gencode 研究團隊合作開發了用于新一代測序的最新人全外顯子靶向序列富集工具? ?? ?? 2010 年 8 月 4 日，加利福尼亞州圣克拉拉市和英國劍橋市 — 安捷倫科技公司（NYSE：A）今日推出用于新一代 DNA 測序的?SureSel
我國科研人員繪制和破譯世界首例雙峰駝全基因組序列圖譜
記者11月17日從內蒙古農業大學獲悉，我國科研人員近日完成了世界首例雙峰駝全基因組序列圖譜繪制和破譯工作。專家表示，這項成果將對野生駱駝保護和家養駱駝品種改良起到重要指導作用，并將進一步推動駱駝產業的健康發展。 據了解，這個研究項目由內蒙古農業大學、上海交通大學、中國科學院上海生命科學研究
DNA微陣列檢測基因表達水平及識別基因序列
Schena等1996年用擬南芥光調基因微陣列，以不同器官中的mRNA為探針，檢測其基因表達水平，結果表明葉mRNA的表達水平是根的500倍。Shelon等1996年將釀酒酵母基因組DNA克隆制成微陣列，用6條最大染色體和10條最小染色體DNA探針分別標記上紅，綠熒光標記進行雜交檢測，結果表明9
基因序列揭示非洲人早期歷史
人類在非洲的早期歷史正日益成為人們關注的焦點。一項新的研究對源自這片大陸的十幾個族群的180個基因組進行了研究，其中一些基因組之前從未被分析過。 初步研究結果表明，在4萬多年前，其中兩個族群（桑人和巴卡人）的規模相當于當時其他族群的兩倍，并且這兩個族群生活在中東部非洲或南部非洲。 研究人員在
首次測定玉米蛇基因組序列
在現有的5000種哺乳動物中，有超過100種已經進行了基因組測序，但是，只有9種爬行動物（在10000個物種當中）的基因組對科學界來說是可用的。最近，瑞士日內瓦大學（UNIGE）的一個研究小組，構建了一個大的數據庫，其中就包括一種爬行動物——玉米蛇的新基因組測序，這種蛇越來越多地被用來了解爬行動
3000株水稻基因序列公開發表
近日，3000株水稻基因組測序文章在GigaScience正式發表，且整套水稻基因序列以可引用形式在該雜志的附屬開放獲取數據庫GigaDB中公開。 該項目產生的數據是目前已公開水稻序列數據量的四倍。該成果標志著3000株水稻基因組項目第一階段的完成，主要由中國農業科學院、國際水稻研究
結構基因的側翼序列的介紹
1、前導區和尾部區 此二區被轉錄并參與成熟mRNA的組成，但不被翻譯，前者位于轉錄起始點和第一外顯子之間，相當于mRNA5’端的非翻譯區(5’UT)；后者位于最末外顯子和終止子之間，相當于mRNA3’端非翻譯區(3'UT)。前導區和尾部區轉錄后的相應序列在mRNA中起維持mRNA穩定性的